- •Часть 1. Компьютерное моделирование электронной структуры фуллерена с60
- •Введение
- •Лабораторная работа №1 «Основы работы в редакторе GaussView пакета Gaussian03»
- •1.1 Теоретическая часть
- •1.1.1 Программный комплекс Gaussian03
- •1.1.2 Редактор GaussView
- •1.2 Практическая часть
- •1.2.1 Построение молекул c использованием библиотек редактора GaussView
- •1.2.2. Примеры задания конфигурации молекул в редакторе GaussView
- •Вопросы
- •Лабораторная работа №2 «Численное моделирование электронной структуры молекул с использованием пакета Gaussian03»
- •2.1 Теоретическая часть
- •2.1.1 Основные методы расчета молекулярных структур
- •2.1.2 Неэмпирические методы расчета
- •2.1.2.1 Метод Хартри-Фока
- •2.1.2.2 Метод теории функционала плотности
- •2.1.3 Основные квантово- механические базисы
- •2.2 Практическая часть
- •2.2.1 Использование Gaussian Calculation Setup для установки параметров расчетов
- •2.2.2 Контрольный пример. Расчет характеристик молекулы кислорода o2
- •2.2.2.1 Визуализация электронной структуры атома кислорода
- •2.2.2.2 Зависимость полной энергии двух атомов кислорода от расстояния между ними
- •2.2.2.3 Расчет равновесного расстояния молекулы кислорода
- •Лабораторная работа №3 «Молекулярное строение и электронная структура молекулы фуллерена с60»
- •3.1 Теоретическая часть
- •3.1.1 Молекулярное строение фуллеренов c60
- •3.1.2 Получение фуллеренов
- •3.1.3 Свойства фуллеренов
- •3.1.4 Применение фуллеренов
- •3.1.5 Фуллериты
- •3.1.6 Электронная структура фуллеренов с60
- •3.2 Практическая часть
- •3.2.1 Электронная структура молекулы фуллерена с60
- •Вопросы
- •Лабораторная работа №4 «ик- спектр изолированной молекулы фуллерена с60»
- •4.1 Теоретическая часть
- •4.1.2 Колебательный спектр двухатомной молекулы
- •4.1.3 Колебания многоатомных молекул
- •4.2 Практическая часть
- •4.2.1 Расчет нормальных колебательных мод в Gaussian
- •4.2.2 Расчет структуры и колебательного спектра молекулы воды
- •Вопросы:
- •Лабораторная работа №5 «ик- спектр молекулы фуллерена с60 в растворах»
- •5.1 Теоретическая часть
- •5.1.1 Типы растворов
- •5.1.2 Растворимость фуллеренов
- •5.2 Практическая часть
- •5.2.1 Учет эффектов сольватации при расчетах в Gaussian03
- •Вопросы:
- •Литература
- •Глоссарий терминов.
- •Приложение 1. Панель меню и панель команд редактора GaussView.
- •Приложение 2. Настройки параметров расчетов Gaussian03.
- •Приложение 3. Справочная информация о неорганических молекулах
- •Приложение 4. Справочная информация об органических молекулах
- •Приложение 5. Правила оформления лабораторных работ
2.2.2 Контрольный пример. Расчет характеристик молекулы кислорода o2
КИСЛОРОД, O (oxygenium), химический элемент VIA подгруппы периодической системы элементов. 168O наиболее распространенный из трех изотопов кислорода (99,76%). Электронная структура кислорода (1s22s22p4) такова, что в молекуле кислорода образуется прочная ковалентная неполярная связь за счет спаривания p- электронов. По табличным данным расстояние между атомами 0,122 нм. Основное состояние является триплетным 3P2.
2.2.2.1 Визуализация электронной структуры атома кислорода
Основным состоянием атома кислорода, также как и молекулы, является триплет, т.е. число полный спин S=1. Электронная конфигурация атома кислорода:
1s2 |
↑↓ |
2s2 |
↑↓ |
2p4 |
↑↓ |
↑ |
↑ |
Создаем новое активное окно. В библиотеке элементов выбираем атом кислорода и переносим его активное окно. На панели меню редактора GaussView выбираем Calculate → Gaussian Calculation Setup. Устанавливаем следующие параметры расчетов: Job Type- energy, Method – DFT B3LYP 6-31(d)G, Spin – triplet, Job Title – (например, O_DFT_B3LYP_6-31dG_triplet_energy). Нажимаем Submit, при сохранении файла для удобства лучше указывать то же имя файла, что и во вкладке Title. При запуске расчетов появится окно Gaussian03 (рис.2.2), в окне которого отображается текущее состояние расчетов.
Рис.2.2 Окно Gaussian 03
Информация о распределение электронной плотности атомных и молекулярных орбиталей (АО и МО) содержится в output файле с расширением *.chk. После окончания расчетов открываем файл расширением O_DFT_B3LYP_6-31dG_triplet_energy.chk. На панели команд GaussView выбираем редактор молекулярных орбиталей (табл.1.1). В окне редактора МО отображена диаграмма уровней - распределение электронов по энергетическим уровням молекулярных орбиталей (рис.2.3). Энергия выражена в атомных единицах энергии 1a.u.= 1Хартри=27.2эВ. Alpha и Beta электроны соответствуют противоположным ориентациям электронных спинов.
Рис.2.3 Диаграмма уровне атома кислорода в триплетном состоянии.
Переходим во вкладку Visualize, выделяем мышью интересующие орбитали на диаграмме уровней (выбранные МО подсвечиваются желтым цветом) и нажимаем Update. Визуализированные АО представлены на рис.2.4. Для отображения декартовой системы координат, на панели команд выбираем View → Cartesian Axes.
Одной из характеристик атомов и молекулярных структур является потенциал ионизации- минимальная энергия, необходимая для удаления электрона с внешней оболочки на бесконечность. По теореме Купманса, потенциал ионизации определяется как энергия электронов на высшей занятой орбитали HOMO (High Occupied Molecular Orbital), взятая с противоположным знаком.
(2.12)
Поскольку энергия электрона на 2p↓ орбитали выше, чем на 2p↑, то потенциал ионизации атома кислорода, рассчитанный методом DFT B3LYP 6-31(d)G составляет 0.317 a.u.=8.622 эВ.
Задание 1. Визуализировать электронную плотность атомных орбиталей и соотнести с электронной конфигурацией атома (1s22s12p3) углерода, используя метод DFT B3LYP 6-31(d)G.
№ АО |
α-орбиталь |
EАО↑, a.u. |
β-орбиталь |
ЕАО↓, a.u. |
4 |
|
-0.369 |
|
|
3 |
|
-0.446 |
|
|
2 |
|
-0.446 |
|
-0.317 |
1 |
|
-1.006 |
2s↓ |
-0.848 |
|
|
-19.291 |
1s↓ |
-19.241 |
Рис. 2.4 Атомные орбитали атома кислорода. Масштаб сохранен

2p↑
2p↑
2p↑
2p↓
2s↑
1s↑