- •1. Определение понятия фермент. Ферменты - это белки (установлено в 1922г), которые действуют как катализаторы в биологических системах.
- •2. Химическую природу, физико-химические свойства и биологическая роль ферментов.
- •3. Особенности ферментативного катализа. Сравнение каталитического действия ферментов и неорганических катализаторов
- •4.Строение простых, сложных ферментов: активный и аллостерический центры. Определение понятий: холофермент, апофермент, кофермент, кофактор, субстрат, метаболит, продукт.
- •5. Изоферменты. Строение, биологическую роль, диагностическое значение определения. Изоферменты лактатдегидрогеназы (лдг), креатинкиназы (кк)
- •6. Локализация и компартментализация ферментов в клетке и тканях: ферменты общего назначения, органоспецифические и органеллоспецифические (маркерные) ферменты.
- •7. Механизм и стадии ферментативного катализа: теории Фишера, Кошланда, переходных состояний.
- •9..Ингибирование активности ферментов, виды ингибирования: обратимое, необратимое, конкурентное, неконкурентное, определение вида ингибирования с использованием Км.
- •10. Механизмы специфической регуляции активности ферментов: аллостерический, ковалентная модификация, на генетическом уровне (индукция, репрессия)
- •1). Аллостерическая регуляция каталитической активности ферментов
- •III. Механизмы регуляции количества ферментов
- •Вторичные посредники (мессенджеры)
- •12.Классификацию и номенклатуру ферментов: систематические и рабочие названия. Коферментный состав ферментов различных классов
- •1. Оксидоредуктазы
- •2. Трансферазы
- •4. Лиазы
- •5. Изомеразы
- •6. Лигазы (синтетазы)
- •13.Энзимопатии: понятие, классификация, молекулярные причины возникновения и механизмы развития, последствия, биохимическая диагностика.
- •I. Энзимопатология
- •1. Наследственные энзимопатии
- •Наследственные энзимопатии по типу нарушений метаболизма делят на:
- •2. Приобретенные энзимопатии
- •14.Принципы, направления и объекты энзимодиагностики: а) энзимологическое определение количества метаболитов, б) определение активности ферментов. Причины и механизмы развития ферментемий.
- •1) Определение активности органо-, органеллоспецифических ферментов и их изоферментов.
- •2) Определение активности ферментов и их констант (Km, t, pH).
- •3) Определение концентрации органических веществ с помощью ферментов.
- •15. Основные принципы и методы энзимотерапии. Биохимические основы энзимотерапии: особенности применения, пути введения.
- •16. Биологическое окисление (бо) совокупность окислительно-восстановительных реакций, которые протекают во всех живых клетках.
- •17. Оксидазный путь потребления кислорода протекает в митохондриях, потребляет 90% о2 и обеспечивает процесс окислительного фосфорилирования.
- •18. Этапы унифицирования энергии пищевых веществ и образования субстратов тканевого дыхания
- •19. Митохондрии - органеллы клеток. Они имеют 2 мембраны наружную гладкую и внутреннюю с многочисленными складками – кристами, внутреннее пространство митохондрий заполнено матриксом.
- •20. Цикл Кребса
- •21. Состав, локализацию, последовательность расположения дыхательных комплексов в электронтранспортной цепи (этц). Хемиосмотическую теорию Митчелла
- •Хемиосмотическая теория Митчелла
- •22. Механизмы сопряжения и разобщения окисления и фосфорилирования. Коэффициент р/0. Понятие - дыхательный контроль. Эндогенные и экзогенные разобщители.
- •Дыхательный контроль
- •Коэффициент окислительного фосфорилирования
- •Диоксигеназные реакции
- •Использование активных форм кислорода в организме
- •Повреждающее действие активных форм кислорода в организме
- •25. Биохимические механизмы ферментативной и неферментативной антиоксидантной защиты (аоз), возрастные особенности. Природные и синтетические прооксиданты и антиоксиданты, понятия.
- •1. Ферментативная антиоксидантная защита
- •2. Неферментативная антиоксидантная защита
10. Механизмы специфической регуляции активности ферментов: аллостерический, ковалентная модификация, на генетическом уровне (индукция, репрессия)
Регуляция каталитической активности ферментов. Бывает:
1). Неспецифическая регуляция. В связи с лабильностью всех ферментов, их каталитическая активность зависит от температуры, рН и давления.
2). Специфическая регуляция. Под действием специфических активаторов и ингибиторов изменяется активность регуляторных ферментов, которые контролируют интенсивность метаболических процессов в организме.
Механизмы специфической регуляции каталитической активности ферментов:
1). Аллостерическая регуляция;
2). Регуляция с помощью белок-белковых взаимодействий;
3). Регуляция через ковалентную модификацию.
а). Регуляция путем фосфорилирования/дефосфорилирования фермента;
б). Регуляция частичным протеолизом.
1). Аллостерическая регуляция каталитической активности ферментов
Аллостерическими ферментами называют ферменты, активность которых регулируется обратимым нековалентным присоединением модулятора (активатора и ингибитора) к аллостерическому центру. Ингибиторами аллостерических ферментов часто являются конечные продукты метаболических путей, активаторами – их начальные субстраты.
Активирование происходит по принципу прямой положительной связи, а ингибирование - по принципу отрицательной обратной связи.
Аллостерические ферменты играют важную роль в регуляции т.к. чрезвычайно быстро реагируют на изменения среды.
Например, конечный продукт катаболизма глюкозы АТФ ингибирует аллостерически ферменты гликолиза фосфофруктокиназу и пируваткиназу. Накапливаемая в гликолизе фруктоза-1,6-ф активирует пируваткиназу, что ускоряет реакции гликолиза.
2). Регуляция каталитической активности ферментов с помощью белок-белковых взаимодействий. Выделяют 2 механизма:
а). Активация ферментов в результате присоединения регуляторных белков. Например, аденилатциклаза (Ац), которая катализирует превращение АТФ в цАМФ, активируется присоединением α-субъединицы G-белка. Этот механизм регуляции обратим.
б). Регуляция каталитической активности ферментов ассоциацией/диссоциацией протомеров. Например, протеинкиназа А, активируется при диссоциации ее тетрамера на 4 субъединицы и инактивируется при обратном соединении 4 субъединиц в тетрамер.
3). Регуляция каталитической активности ферментов путем их ковалентной модификации. Регуляция активности фермента осуществляется в результате ковалентного присоединения или отщепления от него фрагмента.Она бывает 2 видов:
а). путем фосфорилирования и дефосфорилирования ферментов;
б). путем их частичного протеолиза.
а). Регуляция каталитической активности ферментов путем их фосфорилирования и дефосфорилирования. Фосфорилирование осуществляется протеинкиназами (ПК) по ОН-группе серина, треонина или тирозина регуляторный белков и ферментов. Дефосфорилирование в этих же положениях осуществляется фосфопротеинфосфатазами (ФПФ).
Введение отрицательно заряженной фосфорной группы приводит к обратимому изменению конформации и активности фермента.
Например, под действием глюкагона и адреналина в клетках печени происходит фосфорилирование ключевых ферментов гликогенеза (гликогенсинтаза) и гликогенолиза (гликогенфосфорилаза), при этом распад гликогена активируется, а синтез ингибируется.
Инсулин наоборот вызывает в клетках печени дефосфорилирование тех же ключевых ферментов, в результате синтез гликогена активируется, а распад ингибируется.
б). Регуляция каталитической активности ферментов путем их частичного протеолиза. При участии активаторов и протеолитических ферментов происходит отщепление части молекулы фермента и его необратимая активация. Такой фермент функционирует короткий период, а затем разрушается. Подобная схема активации характерна для внеклеточных ферментов ЖКТ (пепсин, трипсин, химотрипсин и др.) и ферментов свертывающей и противосвертывающей системы крови (тромбин, фибрин, плазмин др.).Например, трипсиноген, синтезируемый в поджелудочной железе, поступает в двенадцатиперстную кишку, где энтеропептидаза кишечника отщепляет у него с N-конца гексапептид. В результате в оставшейся части молекулы фермента формируется активный центр.