
- •Глава 1. Структурная организация и принципы функционирования белков Основные проявления жизни - результат функционирования белков
- •Аминокислоты - главные составные части белков
- •Свойства аминокислот - основа свойств белков
- •Спектроскопические свойства аминокислот
- •Химические реакции
- •Методы разделения аминокислот
- •Аминокислота, полипептид, белок
- •Свойства белков определяются свойствами аминокислот
- •Знание иэт важно для разделения белков методом электрофореза
- •Гель-электрофорез
- •Белки выполняют роль буферных систем
- •Белки в воде образуют растворы с особыми свойствами
- •В пространственой структуре белков выделяют четыре уровня организации
- •Исследование первичной структуры белков и пептидов
- •Искусственный синтез белков и пептидов
- •Пространственная структура белковой молекулы
- •Вторичная структура белков
- •Третичная структура белков
- •Четвертичная структура белков
- •Белки чувствительны к внешним воздействиям
- •Для определения количества белков используют разные подходы
- •Белки классифицируются разными способами
- •Простые белки построены только из аминокислот
- •Сложные белки содержат небелковые компоненты
- •Глава 2. Ферменты Клинико-лабораторное значение
- •Немного истории
- •В основе классификации ферментов - тип катализируемой реакции
- •Элементы химической логики
- •В основе химических реакций лежит образование и разрыв химических связей
- •У химической реакции есть скорость и порядок
- •На пути к пониманию механизма действия фермента
- •Ферменты – биологические катализаторы белковой природы
- •Методы выделения и очистки ферментов - это методы выделения и очистки белков.
- •Пример вычисления активности фермента:
- •Для работы некоторых ферментов необходимы дополнительные небелковые соединения
- •Белковая природа определяет многие свойства ферментов
- •Повышение температуры неоднозначно влияет на активность фермента
- •Ферменты характеризуются высокой специфичностью
- •Активность фермента зависит от концентрации субстратов.
- •Важной качественной характеристикой фермента является константа Михаэлиса
- •Уравнение Михаэлиса и Ментен графически – прямоугольная гипербола
- •Примеры использования данных кинетических исследований ферментов в медицине
- •Кинетика мультисубстратных реакций
- •Скорость реакции зависит от концентрации фермента
- •Химические реакции протекают медленно
- •Ферменты превосходят другие катализаторы своей молекулярной активностью. Почему?
- •Группы активного центра фермента используют обычные химические принципы катализа
- •Реакции, катализируемые ферментами – основной объект, на который направлено действие регуляторов процессов жизнедеятельности
- •Активность ферментов можно тормозить (ингибировать)
- •Ингибиторы бывают разные: обратимые и необратимые
- •Обратимые ингибиторы могут быть конкурентными и неконкурентными
- •Конкурентные ингибиторы не всегда структурно подобны субстрату.
- •Конкурентные ингибиторы не влияют на Vmax, они понижают Км.
- •Принципы конкурентного торможения находят применение в медицинской практике.
- •Смешанные неконкурентные ингибиторы
- •Кинетика смешанных неконкурентных ингибиторов
- •Неконкурентные ингибиторы не могут связаться со свободным ферментом.
- •Неконкурентных ингибиторы неактивны при низких концентрациях субстрата.
- •Торможение продуктом реакции- пример конкурентного торможения.
- •Субстрат может быть ингибитором фермента
- •Кинетика многих ферментов не подчиняется принципам кинетики Михаэлиса и Ментен
- •У аллостерических ферментов особые свойства
- •Две модели объясняют механизмы аллостерии.
- •В основе связывания субстрата - индуцированное взаимодействие.
- •Изменение конформации одной субъединицы индуцирует изменения структуры другой
- •Какая гипотеза является правильной?
- •Ферменты неравномерно распределены внутри клеток
- •Доступность субстрата или кофактора - важный элемент регуляции активности ферментов
- •Нарушение функции фермента вызывает болезнь.
- •Энзимопатии следствие ошибок в синтезе белков.
- •Исследование активности ферментов помогает врачу в диагностике болезней.
- •Некоторые примеры использования измерения активности ферментов в диагностике
- •Определение концентрации субстратов возможно при помощи ферментов.
- •Ферменты можно использовать как лекарственные препараты.
- •Рибозимы –исключение , подтверждающее правило.
- •Методы молекулярной инженерии позволяют конструировать новые ферменты
- •Глава 3. Витамины
- •Классификация витаминов
- •Нарушение баланса витаминов в организме
- •Потребность организма человека в витаминах.
- •Причины дисбаланса витаминов в организме.
- •Межвитаминные взаимоотношения
- •Витамин в1 (Tиамин. Антиневритный витамин)
- •Витамин в2(Рибофлавин).
- •Пантотеновая кислота (витамин в3).
- •Витамин рр (Витамин в5 , никотиновая кислота, никотинамид, ниацин). Антипеллагрический витамин.
- •Гомоцис- Серин Цистатионин α-кетобутират Цистеин
- •Фолиевая кислота (Фолацин. Витамин в9. Витамин вс).
- •Фолиевая кислота
- •Метилен-тгфк- Метилен-тгфк-
- •Биотин (витамин н).
- •Пропионил-КоА метилмалонил-КоА
- •Метилмалонил-КоА пируват пропионил-КоА оксалацетат
- •Витамин с (аскорбиновая кислота), антицинготный
- •Остаток глутаминовой кислоты Остаток γ-карбоксиглутаминовой кислоты
- •Рибосомы на мембране эндо-
- •Сигнальный пептид
- •Витаминоподобные соединения Витамин f (эссенциальные жирные кислоты)
- •Инозит(Витамин в8)
- •Карнитин
- •Липоевая кислота (витамин n)
- •Пара-Аминобензойная кислота.
- •Витамин u
- •Холин (витамин в4).
- •Ацетилхолинэстераза н2о
- •Глава 4. Введение в термодинамику Биомедицинское значение.
- •Биоэнергетика- составная часть термодинамики
- •Функции состояния системы.
- •Первый закон термодинамики утверждает энергия вселенной не исчезает
- •Второй закон термодинамики указывает на вероятность и направление процесса
- •Свободная энергия и концентрация. Стандартное состояние в биологических реакциях.
- •Изменение свободной энергии и константа равновесия.
- •Примеры вычисления констант равновесия и изменений свободной энергии
- •Сопряженные реакции лежат в основе многих химических процессов в клетке.
- •«Энергетической валютой» клетки является атф
Нарушение функции фермента вызывает болезнь.
Энзимопатии
- заболевания, которые возникают при
отсутствии или нарушении активности
ферментов. Если фермент полностью
отсутствует, то цепь реакции в таком
месте разрывается. Следствием этого
является накопление продуктов А и
В, их концентрация в крови повышается.
В результате через почки они попадают
в мочу. Существует вероятность, что
избыточно накопленный субстрат может
перейти на побочный путь метаболизма
с образованием необычного вещества В1,
которое также может попадать в мочу.
Если выделение невозможно, то эти
продукты накапливаются в органах и
тканях (болезни накопления). Такой исход
еще более вероятен если процесс распада
блокируется, а синтез не нарушен.
Клинические симптомы появляются в
случаях, если избыточно накапливаемые
вещества становятся токсичны в высоких
концентрациях, если накапливаемые
вещества препятствуют нормальному
проявлению функции или если продукты
С, Д чрезвычайно необходимы для дальнейшего
использования. Частым следствием
ферментных дефектов являются тяжелые
нарушения центральной нервной системы
с ограничением умственного развития.
При диагностике подобных дефектов
в клинической лаборатории доказательством
является обнаружение необычно высоких
концентраций веществ, возникающих при
блоке (А, В) и (или) моче или ненормальных
продуктов метоболического процесса
(В). Более значимым доказательством
служит обнаружение отсутствия самой
ферментативной активности. Получить
его значительно сложнее. Для этого
используют доступные для получения
клетки (кожа, кровь) пациентов. Обсуждение
конкретных ферментопатий будет проведено
в соответствующих разделах учебника.
Энзимопатии следствие ошибок в синтезе белков.
Эти ошибки связаны с изменением участков ДНК, кодирующих структуру ферментов. Такие изменения называются мутациями. Так как дефект при репликации ДНК сохраняется,
в дальнейшем он становится врожденным,
Энзимопатии довольно редкие заболевания. Важно их диагностировать как можно раньше, поскольку на современном этапе восстановление повреждения ДНК невозможно и врачебная тактика сводится к устранению последствий. Можно, например, предупредить нарушение умственного развития при фенилкетонурии, исключив аминокислоту фенилаланин из питания ребенка в первые месяцы его жизни. Если упустить этот период времени, в дальнейшем лечение становится не эффективным.
Исследование активности ферментов помогает врачу в диагностике болезней.
Наступающие изменения активности ферментов в сыворотке крови, клеточном соке или моче могут использоваться для диагностики целого ряда заболеваний. На рис 2-16 показаны возможные причины ведущие к появлению тканевых ферментов в крови или моче
Рис 2-18. Причины появления и источники тканевых ферментов в плазме крови
Энзимодиагностика может быть эффективной в двух основных группах заболеваний:
заболевания, которые связаны с нарушением функции или гибелью клеток,
заболевания, при которых нарушается выделение (секреция) фермента.
В случае, если заболевание связано с повреждением клеток, начиная с ограничения функций мембран до тяжелейших повреждений органелл или всей клетки (некроз), то из клеток и поврежденных органелл специфические ферменты поступают через капилляры и лимфу в общий кровоток. Тогда их активность можно определять в крови. Если при заболевании заблокированы пути выведения ферментов, то такие ферменты накапливаются сначала в клетках и органах, где они синтезируются, и затем могут проникать в кровь. В норме активность таких ферментов в крови незначительна. Поэтому всякое повышение ее наводит на мысль о повреждении. Все вышесказанное позволяет выделить две группы ферментов, важные с точки зрения диагностики заболеваний:
-клеточные ферменты,
-секретируемые ферменты.
Под секретируемыми понимают такие ферменты, которые образуются в определенных органах, и затем выделяются из них в кровь, желчь и/или в кишечник, где они выполняют свои функции. Типичным примером являются ферменты, принимающие участие в переваривании пищи (липаза, амилаза), которые образуются поджелудочной железой и выделяются в просвет кишечника. Аналогично, ферменты, катализирующие процессы свертывания крови, образуются в печени и выделяются в плазму крови. Острое воспаление поджелудочной железы может привести к тому, что ферменты, катализирующие в норме переваривание компонентов пищи, через поврежденные воспалением капилляры могут попасть в кровь. С другой стороны, перекрытие, в силу различных причин, просвета ходов, связывающих поджелудочную железу с кишечником, может сопровождаться возвратом ферментов в железу и уменьшением их поступления в кишечник. Хронические заболевания различных органов зачастую сопровождаются нарушением в них биосинтетических процессов. Вследствие этого снижается активность секреторных ферментов в местах их действия. Учитывая органную специфичность секретируемых ферментов, определение их активности в ряде случаев помогает в диагностике органной локализации заболеваний. В случае определения активности клеточных ферментов имеется сложность в интерпретации полученных результатов. Она вызвана низкой их специфичностью, поскольку эти ферменты есть в каждом органе. Этот недостаток может быть устранен при определении изоферментов, которые имеют большую органоспецифично-
сть. В качестве примера можно привести определение активности изоферментов лактатде-
Рис
2-19.Изменения активности КФК
(креатинфосфокиназы), АсАТ (аспарагиновая
трансаминаза), ЛДГ (лактатдегидрогеназы),
ГБДГ (гидроксибутират дегидрогеназы)
у больного инфарктом миокарда в разные
сроки после начала заболевания.
гидрогензы (ЛДГ). Повышение активности ЛДГ в крови указывает на поражение сердечной мышцы, а увеличение - ЛДГ5 без существенного повышения ЛДГ, свидетельствует о поражении клеток печени. Повысить диагностическую ценность помогает также параллельное определение активности нескольких клеточных ферментов с последующим подсчетом их соотношения. Дело в том, что спектр активности клеточных ферментов в крови зависит от рода и места заболевания. Измерение активности ферментов имеет значение не только для постановки диагноза и ранней диагностики (к примеру, при инфекционном гепатите оно проявляется уже в день появления клинических симптомов).
Повторное исследование активности в процессе болезни позволяет следить за ходом патологического процесса и прогнозировать исход заболевания. При инфаркте миокарда вероятность возникновения рецидивов можно установить не только с помощью ЭКГ, но и используя определение активности ферментов.
Энзимодиагностические тесты при гепатитах, позволяют предсказать превращение острых проявлений заболеваний в хронические, как и появление клинически бессимптомных рецидивов.
При определении активности ферментов в сыворотке крови исключительное значение имеет время исследования, так как повышение активности в сыворотке происходит только в тот период развития заболевания, когда фермент появляется в крови. Обычно происходит быстрое повышение активности и медленное возвращение ее к норме. На рисунке 2-19 показаны результаты наблюдения за активностью ферментов у больного инфарктом миокарда. Естественно, в данном разделе невозможно перечислить все возможности и особенности энзимной диагностики. Здесь упомянуты лишь принципиальные положения этого метода. При последующем обсуждении процессов обмена веществ, представления об энзимодиагностике будут расширены. В таб. 2-4 приведена информация об отдельных ферментах, которые нашли применение в медицинской практике.