
- •Глава 1. Структурная организация и принципы функционирования белков Основные проявления жизни - результат функционирования белков
- •Аминокислоты - главные составные части белков
- •Свойства аминокислот - основа свойств белков
- •Спектроскопические свойства аминокислот
- •Химические реакции
- •Методы разделения аминокислот
- •Аминокислота, полипептид, белок
- •Свойства белков определяются свойствами аминокислот
- •Знание иэт важно для разделения белков методом электрофореза
- •Гель-электрофорез
- •Белки выполняют роль буферных систем
- •Белки в воде образуют растворы с особыми свойствами
- •В пространственой структуре белков выделяют четыре уровня организации
- •Исследование первичной структуры белков и пептидов
- •Искусственный синтез белков и пептидов
- •Пространственная структура белковой молекулы
- •Вторичная структура белков
- •Третичная структура белков
- •Четвертичная структура белков
- •Белки чувствительны к внешним воздействиям
- •Для определения количества белков используют разные подходы
- •Белки классифицируются разными способами
- •Простые белки построены только из аминокислот
- •Сложные белки содержат небелковые компоненты
- •Глава 2. Ферменты Клинико-лабораторное значение
- •Немного истории
- •В основе классификации ферментов - тип катализируемой реакции
- •Элементы химической логики
- •В основе химических реакций лежит образование и разрыв химических связей
- •У химической реакции есть скорость и порядок
- •На пути к пониманию механизма действия фермента
- •Ферменты – биологические катализаторы белковой природы
- •Методы выделения и очистки ферментов - это методы выделения и очистки белков.
- •Пример вычисления активности фермента:
- •Для работы некоторых ферментов необходимы дополнительные небелковые соединения
- •Белковая природа определяет многие свойства ферментов
- •Повышение температуры неоднозначно влияет на активность фермента
- •Ферменты характеризуются высокой специфичностью
- •Активность фермента зависит от концентрации субстратов.
- •Важной качественной характеристикой фермента является константа Михаэлиса
- •Уравнение Михаэлиса и Ментен графически – прямоугольная гипербола
- •Примеры использования данных кинетических исследований ферментов в медицине
- •Кинетика мультисубстратных реакций
- •Скорость реакции зависит от концентрации фермента
- •Химические реакции протекают медленно
- •Ферменты превосходят другие катализаторы своей молекулярной активностью. Почему?
- •Группы активного центра фермента используют обычные химические принципы катализа
- •Реакции, катализируемые ферментами – основной объект, на который направлено действие регуляторов процессов жизнедеятельности
- •Активность ферментов можно тормозить (ингибировать)
- •Ингибиторы бывают разные: обратимые и необратимые
- •Обратимые ингибиторы могут быть конкурентными и неконкурентными
- •Конкурентные ингибиторы не всегда структурно подобны субстрату.
- •Конкурентные ингибиторы не влияют на Vmax, они понижают Км.
- •Принципы конкурентного торможения находят применение в медицинской практике.
- •Смешанные неконкурентные ингибиторы
- •Кинетика смешанных неконкурентных ингибиторов
- •Неконкурентные ингибиторы не могут связаться со свободным ферментом.
- •Неконкурентных ингибиторы неактивны при низких концентрациях субстрата.
- •Торможение продуктом реакции- пример конкурентного торможения.
- •Субстрат может быть ингибитором фермента
- •Кинетика многих ферментов не подчиняется принципам кинетики Михаэлиса и Ментен
- •У аллостерических ферментов особые свойства
- •Две модели объясняют механизмы аллостерии.
- •В основе связывания субстрата - индуцированное взаимодействие.
- •Изменение конформации одной субъединицы индуцирует изменения структуры другой
- •Какая гипотеза является правильной?
- •Ферменты неравномерно распределены внутри клеток
- •Доступность субстрата или кофактора - важный элемент регуляции активности ферментов
- •Нарушение функции фермента вызывает болезнь.
- •Энзимопатии следствие ошибок в синтезе белков.
- •Исследование активности ферментов помогает врачу в диагностике болезней.
- •Некоторые примеры использования измерения активности ферментов в диагностике
- •Определение концентрации субстратов возможно при помощи ферментов.
- •Ферменты можно использовать как лекарственные препараты.
- •Рибозимы –исключение , подтверждающее правило.
- •Методы молекулярной инженерии позволяют конструировать новые ферменты
- •Глава 3. Витамины
- •Классификация витаминов
- •Нарушение баланса витаминов в организме
- •Потребность организма человека в витаминах.
- •Причины дисбаланса витаминов в организме.
- •Межвитаминные взаимоотношения
- •Витамин в1 (Tиамин. Антиневритный витамин)
- •Витамин в2(Рибофлавин).
- •Пантотеновая кислота (витамин в3).
- •Витамин рр (Витамин в5 , никотиновая кислота, никотинамид, ниацин). Антипеллагрический витамин.
- •Гомоцис- Серин Цистатионин α-кетобутират Цистеин
- •Фолиевая кислота (Фолацин. Витамин в9. Витамин вс).
- •Фолиевая кислота
- •Метилен-тгфк- Метилен-тгфк-
- •Биотин (витамин н).
- •Пропионил-КоА метилмалонил-КоА
- •Метилмалонил-КоА пируват пропионил-КоА оксалацетат
- •Витамин с (аскорбиновая кислота), антицинготный
- •Остаток глутаминовой кислоты Остаток γ-карбоксиглутаминовой кислоты
- •Рибосомы на мембране эндо-
- •Сигнальный пептид
- •Витаминоподобные соединения Витамин f (эссенциальные жирные кислоты)
- •Инозит(Витамин в8)
- •Карнитин
- •Липоевая кислота (витамин n)
- •Пара-Аминобензойная кислота.
- •Витамин u
- •Холин (витамин в4).
- •Ацетилхолинэстераза н2о
- •Глава 4. Введение в термодинамику Биомедицинское значение.
- •Биоэнергетика- составная часть термодинамики
- •Функции состояния системы.
- •Первый закон термодинамики утверждает энергия вселенной не исчезает
- •Второй закон термодинамики указывает на вероятность и направление процесса
- •Свободная энергия и концентрация. Стандартное состояние в биологических реакциях.
- •Изменение свободной энергии и константа равновесия.
- •Примеры вычисления констант равновесия и изменений свободной энергии
- •Сопряженные реакции лежат в основе многих химических процессов в клетке.
- •«Энергетической валютой» клетки является атф
Доступность субстрата или кофактора - важный элемент регуляции активности ферментов
Межклеточная концентрация многих
метаболитов - значительно ниже значений
Kmдля субстрата данного
фермента. КонцентрацияD-глицеральдегид-З-фосфата
в мышце -Змкмоль/л. Это - значительно
ниже значенияKm, составляющего
для дегидрогеназы 70 мкмолль/л. Учитывая,
что концентрация субстрата низкая,
скорость реакции будет определяться
концентрацией субстрата. Там, где
концентрация субстрата - выше значенийKm, концентрация субстрата
не будет оказывать сильного влияния на
скорость реакции. Например,
фруктоза-1-6-дифосфат альдолаза.
Концентрация субстрата для этого
фермента в клетках - 200 мкмоль/л, а Км
фермента - 12. Эти данные указывают на
значение локальной концентрации
субстратов и кофакторов и определение
локальной концентрации субстратов
позволило бы решить является ли
концентрация ограничивающим фактором
для активности фермента. Разделение
клетки на отдельные компартменты может
приводить к созданию высоких локальных
концентраций и фермента и субстрата. К
сожалению, большинство методов
исследования дают лишь представление
об общей концентрации субстрата в
клетке. Значение
концентраций субстратов и Км ферментов
особую значимость приобретает и для
понимания межорганных различий. Это
хорошо можно увидеть на следующем
примере. Различия в значениях Км и Vmax,
клетками используются для регуляции
ключевых процессов и влияют на
распределение различных метаболитов
в тканях. Примером могут служить два
схожих фермента гексокиназа и
глюкокиназа, которые катализируют
превращение глюкозы в глюкозо-6-фосфат
- промежуточное соединение на пути
окисления глюкозы. Как только глюкоза
попадает в клетку и превращается в
глюкоза-6-фосфат, она уже не может
покинуть клетку и используется только
в метаболизме данной клетки. Это важно
для мозга, клетки которого не могут
синтезировать глюкозу, и нуждаются в
прямом поступлении глюкозы из крови.
Хотя гексокиназа и глюкокиназа
катализируют
одну и ту же реакцию, они значительно
различаются между собой.
Гексокиназа обнаружена в мозге и в скелетной мышце, и является регуляторным ферментом (т.е. ингибируется высокими концентрациями продукта). Она также имеет более высокое сродство к глюкозе, со значением Km 5X10-5М. Наоборот, глюкокиназа найдена в печени и отсутствует в мозге и мышцах. Она не является регуляторным ферментом и имеет более низкое сродство к глюкозе-(Км - 2X10-2М). Для сравнения, следует отметить, что нормальная концентрация глюкозы в крови находится между этими двумя значениями. При нормальном уровне глюкозы в крови гексокиназа работает вблизиVmax, гарантируя получение мозгом вполне достаточного количества глюкозы. Глюкокиназа работает значительно ниже своейVmaxв этих условиях. Если повышение глюкозы крови значительно, гексокиназа может слегка ускориться, но активность глюкокиназы резко повышается . Таким образом, избыточная глюкоза крови принимается печенью и преобразовывается в гликоген и липиды. Если уровень глюкозы крови падает ниже нормы, гексокиназа все еще работает околоVmax, в то время как глюкокиназа по существу неактивна. Таким образом, постоянная поставка глюкозы обеспечена для мозга всегда.
Рис 2-17.Схема образования генетически детерминированных множественных форм фермента (подробности в тексте)
Отдельные компартменты клетки отличаются условиями микроокружения, что стало предпосылкой образования множественных форм ферментов. Это ферменты, которые катализируют одинаковые реакции, но отличаются между собой по аминокислотному составу и физико-химическим свойствам. Разновидностью таких ферментов являются изоферменты. Это генетически детерминированные множественные формы ферментов. Принцип их формирования показан на рис 2-17. Тетрамерный фермент, состоящий из двух кодируемых генетически субъединиц А и В может быть представлен пятью изоферментами А4, АЗВ1, А2В2, А1ВЗ и В4. Каждый из изоферментов может катализировать одинаковую реакцию, но отличается по своим свойствам, что важно при использовании этих ферментов в разных условиях. Таким путем Природа «экономит» генетический материал, создавая многообразие.