- •2) Разделение индивидуальных белков
- •1, Строение и функции коллагенов
- •1. Общие структурные особенности аминокислот, входящих в состав белков
- •2. Классификация аминокислот
- •3. Классификация аминокислот
- •1. Строение пептида
- •2. Характеристика пептидной связи
- •1. Определение аминокислотного состава белка
- •2. Определение аминокислотной последовательности в белке
- •1. Супервторичная структура типа б-бочонка
- •2. Структурный мотив "а-спираль-поворот-а-спиралъ"
- •3. Супервторичная структурав виде "цинкового пальца"
- •4. Супервторичная структура в виде "лейциновой застёжки-молнии"
- •11.Амфотерность
- •19.Четвертичная структура белков
- •2.Кооперативность
- •20.Взаимосвязь функции и особенностей строения структурных фибриллярных белков.
- •1. Строение и функции коллагенов
- •21.Взаимосвязь структуры и функции иммуноглобулинов
- •23.Понятие холофермент, апофермент, кофактор, субстрат, продукт реакции, ингибитор,активатор.Примеры.
- •31.Регуляция каталитической активности ферментов путём фосфорилирования/дефосфорилирования
- •32.Ассоциация и ассоциация регулярных протеинов как способ регуляции ферментативной активности
- •33.Регуляция каталитической активности ферментов частичным (ограниченным) протеолизом
- •34.Кофакторы ферментов: ионы металла и коферменты.
- •1. Роль металлов в присоединении субстрата в активном центре фермента
- •3. Роль металлов в ферментативном Катализе.Участие в электрофильном катализе
- •35.Витамин рр (никотиновая кислота, никотинамид, витамин b3)
- •38 Специфичность действия ферментов и ее вида
- •1. Субстратная специфичность
- •2. Каталитическая специфичность
- •2. Последовательность событий в ходе ферментативного катализа
1, Строение и функции коллагенов
механические свойства связаны с их первичной и пространственной структурами. Молекулы коллагена состоят из трёх полипептидных цепей,. В состав коллагенов могут входить три одинаковые или разные цепи.
каждая третья аминокислота в полипептидной цепи представлена глицином, около 1/4 аминокислотных остатков составляют пролин или 4-гидроксипролин, около 11 % — аланин. В коллагене отсутствуют такие аминокислоты, как цистеин и триптофан, а ги-стидин, метионин и тирозин находятся лишь в очень небольшом количестве. В составе первичной структуры а-цепи коллагена содержится также— гидрокси-лизин. Полипептидную цепь коллагена можно представить как последовательность триплетов Гли-X-Y, где X и Y могут быть любыми аминокислотами, но чаще в положении X стоит пролин, а в положении Y — гидроксипролин или гидроксилизин.
Пролин благодаря своей структуре вызывает изгибы в полипептидной цепи, стабилизируя левозакрученную спиральную конформацию. На один виток спирали приходится 3 аминокислотных остатка, а не 3,6. Спираль пептидной цепи коллагена стабилизирована не за счёт водородных связей (так как пролин их не образует), а силами стерического отталкивания пирролидиновых колец в остат ках пролина. В результате расстояние межд аминокислотными остатками увеличивается, и она оказывается более развёр нутой Спирализованные полипептидные цепи, пе ревиваясь друг около друга, образуют трехце почечную правозакрученную суперспиральную молекулу
«Жёсткие» аминокислоты — пролин и гидроксипролин — ограничивают вращение полипеп тидного стержня и увеличивают тем самым стабильность тройной спирали. Глицин, всегда находите в месте пересечения цепей; отсутствие радика ла позволяет цепям плотно прилегать
А. Структура и функции миоглобина
Миоглобин относят к классу гемсодержа-щих белков, т.е. он содержит простетическую группу — гем, довольно прочно связанную с белковой частью. Миоглобин относят к глобулярным белкам; он имеет только одну полипептидную цепь.Миоглобин содержится в красных мышцах и участвует в запасании кислорода. Апомиоглобин — белковая часть миоглобина; первичная структура представлена последовательностью из 153 аминокислот, которые во вторичной структуре уложены в 8 а-спи-ралей. а-Спирали содержат от 7 до 23 аминокислот. Третичная структура имеет вид компактной глобулы (внутри практически нет свободного места), образованной за счёт петель и поворотов в области неспирализованных участков белка. Внутренняя часть молекулы почти целиком состоит из гидрофобных радикалов, за исключением двух остатков Гис располагающихся в активном центре.
Белки — высокомолекулярные соединения, но могут сильно отличаться по молекулярной массе, которая колеблется от 6000 до 1 000 000 Д и выше. Молекулярная масса белка зависит от количества аминокислотных остатков в полипептидной цепи, а для олигомерных белков — и от количества входящих в него протомеров
методами определения молекулярной массывсе еще остаются физико-химические методы
наиболее часто используются методы седиментационного анализа, гель-хроматография и гель-электрофорез.методами седиментационного анализапроводят вультрацентрифугах, в которых удается создать центробежные ускорения (g), превышающие в 200000 и более раз ускорение земного притяжения. Обычно вычисляютмолекулярную массупо скоростиседиментациимолекулбелкаили седиментационномуравновесию. По мере перемещениямолекулот центра к периферии образуется резкая граница растворитель-белок (регистрируется автоматически
Определение молекулярной массыбелковметодомультрацентрифугированиятребует много времени и сложной и аппаратуры. разработаны 2 простых метода (гель-хроматография иэлектрофорез. гель-хроматография, преимущество: не требуется выделятьбелокв чистом виде, так как примеси другихбелковне мешают определению, поскольку каждый из них проходит через колонку со свойственной ему скоростью, определяемоймолекулярной массой. Это обстоятельство широко используется в энзимологииЭлектрофорез-прямая пропорциональная зависимость междумолекулярной массойи подвижностьюбелков.
6) В составе белков в организме человека встречают только 20 а-аминокислот.