Вирусология / Coronavirus-2011-5
.pdfОтряд/порядок Nidovirales:
Roniviridae
Coronaviridae
Arteriviridae
С.В.Нетесов
Новосибирский Государственный Университет
КОРОНАВИРУСЫ и
Тяжелый острый респираторный синдром
(ТОРС), вызываемый новым ТОРС-
коронавирусом:
характеристика возбудителя, методы диагностики,
перспективы профилактики и лечения
С.В.Нетесов
Новосибирский Государственный Университет
Морфология коронавируса ТОРС
(100-120 нм в диаметре)
Вирионы вируса ТОРС вне клетки, стрелка указывает на типичный вирион с оболочкой (масштаб =100 нм)
[Zhang Q.F. et al., Acta Biochim. Biophys. Sin.- 2003.- V. 35 (6).- P. 587-591]
Коронавирусы (класс Nidovirales, семейство Coronaviridae, род Coronavirus) – крупные вирусы, имеющие оболочку, положительную одноцепочечную РНК, размножаются в цитоплазме клеток хозяина. Коронавирусы подразделяют на три основные серологические подгруппы
Серо- |
Вирус |
Хозяин |
группа |
|
|
|
|
|
1 |
Коронавирус человека 229E (HCoV-229E) |
Человек |
|
Вирус трансмиссибельного гастроэнтерита |
Свиньи |
|
свиней (TGEV) |
|
|
Респираторный коронавирус свиней |
Свиньи |
|
(PRCoV) |
|
|
Коронавирус собак (CCoV) |
Собаки |
|
Кишечный коронавирус кошачьих (FECoV) |
Кошки |
|
Вирус инфекционного перитонита |
Кошки |
|
кошачьих (FIPV) |
|
|
Коронавирус кроликов (RbCoV) |
Кролики |
|
|
|
Серотипы и хозяева коронавирусов (2)
Серо- Вирус |
Хозяин |
группа |
|
2 |
Коронавирус человека OC43 |
Человек |
(HCoV-OC43) |
|
|
|
|
|
|
Вирус гепатита мышей (MHV) |
Мыши |
|
Вирус сиалодакриоаденита |
Крысы |
|
(SDAV) |
|
|
Вирус гемагглютинирующего |
Свиньи |
|
энцефаломиелита свиней (HEV) |
|
|
Бычий коронавирус (BCoV) |
Крупный рогатый |
|
|
скот |
|
Коронавирус индюков (TCoV) |
Индюки |
Серотипы и хозяева коронавирусов
серотип 3
Серогруппа |
Вирус |
Хозяин |
|
|
|
3 |
Вирус инфекционного |
Курицы |
бронхита птиц (IBV) |
|
|
|
|
|
|
Коронавирус индюков |
Индюки |
|
|
|
|
(TCoV) |
|
|
|
|
Fields Virology. Ed.D.M.Knipe, P.M.Howley. Lippincott-Williams &
Wilkins. Philadelphia-New York. 2001.
Этиология респираторных заболеваний в штате Мичиган, США
[A.S. Monto/Am.J.Med.-2002.-V.112.-4S-12S.]
неизвестные и/или неинфекц.
23%
аденовирус
2%
бактерии
8%
респират. синцит. вирус
4%
коронавирус другие 14%
2%
грипп А и В
9%
парагрипп
4%
риновирус
34%
Недавно
идентифицированы
ТОРС-коронавирус
и метапневмовирус
человека. Последний обнаружен у 12%
больных
респираторными
заболеваниями
нижних
дыхательных
путей [Williams J.V. et al. // N. Engl. J.
Med.- 2004.- V. 350, N
5.- P. 443-450]
Модель структуры коронавируса
• Модель структуры
коронавируса, показывающая организацию шипов (S), гликопротеинов мембраны (M) и оболочки (E). РНК защищена спиральным капсидом из мономеров белка (N)
• [K.V. Holmes, L. Enjuanes. Science, 2003. V.
300. P. 1377-1378]
Организация геномов коронавируса человека 229E и вируса гепатита мышей
HCoV- |
5’ |
|
|
|
3’ |
|
229E |
|
|
|
S - a b E M |
||
L |
1a |
1b |
N |
|||
|
||||||
MHV 5’ |
|
|
|
|
3’ |
|
|
|
|
|
|
||
|
L 1a |
1b |
|
2 HE S 4 5 E M N |
||
Длина генома – более 29 000 оснований. 5’-конец состоит из кэпа и лидерной последовательности (L) длиной от 65 до 98 основания. Цветные прямоугольники представляют открытые рамки считывания (ORFs), кодирующие структурные белки; белые прямоугольники – гены, кодирующие неструктурные белки. Вертикальные линии представляют межгенные последовательности. Геномы полиаденилированы на 3’-конце
(Fields Virology. 4th ed. Lippincott-Williams & Wilkins. Philadelphia-New York. 2001).
Филогенетическое дерево семейства
коронавирусов на основе частичной (215 а-к) аминокислотной последовательности белка полимеразы
• Филогенетическое древо частичной белковой последовательности (215 аминокислот) ТОРС-коронавируса в сравнении с аналогичными последовательностями
других коронавирусов
• [Peiris J.S. et al. // Lancet. 2003. V.
361, N 9366. P. 1319-1325]