- •1. Геномы основных групп организмов: размеры, число генов и их организация. Взаимосвязь организации генома со сложностью организма и особенностями базовых молекулярно-биологических процессов.
- •2. Организация хромосом различных организмов.
- •7. Вилка репликации днк: ферменты и их свойства.
- •8. Стадии репликации.
- •9. Механизм репликации у e.Coli.
- •10. Особенности репликации у эукариот. Ori у дрожжей, их структурно-функциональная организация. Принципы контроля инициации репликации днк эукариот.
- •11. Синтез теломер.
- •12. Повреждения днк в клетке.
- •13. Прямая репарация оснований.
- •14.Механизмы эксцизионной репарации днк (эксцизия нуклеотидов, оснований).
- •15. Репарация ошибок репликации днк (мисмэтч репарация).
- •17.Роль рекомбинационных процессов в репарации повреждений днк. Арест, реверсия и рестарт репликационной вилки.
- •19.Основные типы мобильных генетических элементов эукариот: структура, гены и их продукты.
- •20.Механизм транспозиции ретровирусоподобных ретротранспозонов.
- •21. Общая, или гомологичная, рекомбинация.
- •22.Рекомбинация у бактерий.
- •24.Сайтспецифическая рекомбинация. Молекулярный механизм действия рекомбиназ. Интеграция фага 1 Типы хромосомных перестроек,mосуществляемых при сайтспецифической рекомбинации.
- •26.Промотор прокариот и механизм его распознавания рнк-полимеразой. Альтернативные s-факторы(этого калла нет, но есть не s факторы а сигма, что и описаны ниже). Стадии транскрипционного цикла.
- •27.Промоторы эукариот: размеры, положение, структура и механизм
- •28.Регуляция процесса транскрипции прокариот. Лактозный и триптофановый опероны. Про опероны (изучите как они работают в различных ситуациях, здесь такого нет!!!!)
- •29. Нематричный синтез рнк.
- •30. Информационная рнк, ее структура и функциональные участки, различия у про-и эукариот. Модификация 5'- и 3'-концов транскриптов и ее значение.
- •31. Интроны. Особенности структуры и механизмы сплайсинга. Аутосплайсинг.
- •32. Сплайсинг пре-тРнк.
- •34. Транс-сплайсинг и альтернативный сплайсинг: механизмы, роль, распространение, примеры.
- •35. Процессинг тРнк
- •37. Транспортные рнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль модифицированных нуклеотидов.
- •38. Аминоацилирование тРнк. Аминоацил-тРнк-синтетазы, их структура и механизм действия. Специфичность аминоацилирования, механизмы ее контроля.
- •41. Последовательность событий при инициации трансляции эукариот. Белковые факторы, взаимодействующие с рибосомой и с мРнк.
- •42. Механизм элонгации полипептидной цепи в процессе трансляции.
- •44. Ингибиторы синтеза белка
- •45. Молекулярные шапероны семейства Hsp60. Рабочий цикл шаперонина GroEls
- •46. Классы генов теплового шока у b. Subtilis. Рабочий цикл шаперонного комплекса DnaKj-GrpE
- •47. Деградация белка: атф-зависимые протеазы прокариот и 26s-протеасома эукариот. Насчет атф-зависимые протеазы не точно!!!
- •48. Механизм распознавания аномальных белков. Система убиквитинирования белков эукариот
- •49. Секреция белков прокариот: Sec-аппарат и сигнальный пептид (лекция)
- •50. Принципы распределения белков по компартментам клетки эукариот.
- •51. Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты, контроль локализации белков внутри этих органелл.
- •52. Устройство и принципы действия бактериальных систем секреции белков.
- •53. Котрансляционная транслокация белка в полость эндоплазматического ретикулума. Srp-частица и ее рецептор.
- •54. Механизм транспорта белков через ядерные поры.
- •5 5. Структура белков-регуляторов транскрипции и механизм их взаимодействия с днк.
- •56. Сенсорные механизмы бактерий. Двухкомпонентные регуляторные системы: принцип действия и примеры. Сигнальные каскады у бактерий.
- •59. Сенсорные механизмы эукариот. Общие принципы детекции и передачи сигнала. Сигнальный путь jak-stat.
- •60.Типы рецепторных протеинкиназ. Механизмы их активации и дальнейшей передачи сигнала. Контроль специфичности сигнализации. Сигнальный путь Ras/mapk в клетка млекопитающих.
- •61.Регуляция экспрессии генов на уровне организации днк. Регуляция активности генов обусловленная метилированием днк
- •62.Регуляция экспрессии генов на уровне транскрипции. Ответ говно выучить надо когда выйчишь лактозный и триптофановый оперон
- •63.Регуляция экспрессии генов на уровне созревания рнк. Регуляция экспрессии генов на уровне трансляции.
- •Редактирование рнк
61.Регуляция экспрессии генов на уровне организации днк. Регуляция активности генов обусловленная метилированием днк
Метилирование ДНК осуществляется в результате обратимого метилирования цитозина, катализируемого ДНК-метилтрансферазой:
Не все остатки цитозина в ДНК метилируются. Метилированию подвергаются только те остатки цитозина, которые находятся рядом с гуанинином – ЦГ.
Метилирование ДНК осуществляется после репликации, поэтому сразу же после удвоения молекула ДНК является полуметилированной – одна цепь метилирована, другая – неметилированная. Через определенное время ДНК-метилтрансфераза восстанавливает исходный рисунок метилирования
Метилирование необходимо для нормального развития организма. Если инактивировать ген метилтрансферазы у мышей, то развитие эмбриона приостановится на ранних стадиях развития. Тем не менее, наличие в составе ДНК метилцитозина опасно для организма, так как при его дезаминировании образуется тимин
В геноме млекопитающих ЦГ-пары образуют островки, которые часто встречаются в районе промоторов. Метилирование промоторов препятствует образованию транскрипционного комплекса. При этом степень репрессии гена пропорциональна степени метилирования цитозинов. В некоторых случаях метилирование может препятствовать связыванию репрессорного белка с сайленсером. В результате произойдет усиление экспрессии гена.
62.Регуляция экспрессии генов на уровне транскрипции. Ответ говно выучить надо когда выйчишь лактозный и триптофановый оперон
Транскрипция у прокариот может регулироваться на стадиях инициации, элонгации и терминации. Наиболее часто транскрипция регулируется на стадии инициации транскрипции.
63.Регуляция экспрессии генов на уровне созревания рнк. Регуляция экспрессии генов на уровне трансляции.
иРНК прокариот, как правило, процессингу не подвергается. Кроме того, трансляция и транскрипция у них сопряжены. Еще не завершился синтез иРНК, а процесс ее трансляции уже начался.
Только в единичных случаях иРНК прокариот подвержена созреванию. В связи с этим регуляция экспрессии генов у них на уровне созревания иРНК не выражена.
У эукариот в отличие от прокариот иРНК подвергается многочисленным модификациям. К 5’-концу присоединяется кэп, 3’-конец – полиаденилируется. Кэп способствует правильному протеканию инициации трансляции. ПолиА-последовательность защищает 3’-конец иРНК от деградации кодирующих последовательностей, увеличивая ее продолжительность существования.
Особое значение в регуляции экспрессии генов на уровне созревания иРНК принадлежит альтернативному сплайсингу. В случае альтернативного сплайсинга из единого предшественника образуются несколько иРНК, отличающиеся друг от друга составом экзонов. Белки, образующиеся при трансляции таких иРНК имеет с одной стороны идентичные элементы организации, а с другой будут отличаться фрагментами полипептидных цепей
Альтернативный сплайсинг имеет большое биологическое значение. От его направления зависит формирование пола у дрозофилы. Случаи альтернативного сплайсинга достаточно широко представлены в мышечной ткани, нервной ткани, при синтезе факторов транскрипции и т.д..