![](/user_photo/89530_i5QY2.jpg)
- •1. Геномы основных групп организмов: размеры, число генов и их организация. Взаимосвязь организации генома со сложностью организма и особенностями базовых молекулярно-биологических процессов.
- •2. Организация хромосом различных организмов.
- •7. Вилка репликации днк: ферменты и их свойства.
- •8. Стадии репликации.
- •9. Механизм репликации у e.Coli.
- •10. Особенности репликации у эукариот. Ori у дрожжей, их структурно-функциональная организация. Принципы контроля инициации репликации днк эукариот.
- •11. Синтез теломер.
- •12. Повреждения днк в клетке.
- •13. Прямая репарация оснований.
- •14.Механизмы эксцизионной репарации днк (эксцизия нуклеотидов, оснований).
- •15. Репарация ошибок репликации днк (мисмэтч репарация).
- •17.Роль рекомбинационных процессов в репарации повреждений днк. Арест, реверсия и рестарт репликационной вилки.
- •19.Основные типы мобильных генетических элементов эукариот: структура, гены и их продукты.
- •20.Механизм транспозиции ретровирусоподобных ретротранспозонов.
- •21. Общая, или гомологичная, рекомбинация.
- •22.Рекомбинация у бактерий.
- •24.Сайтспецифическая рекомбинация. Молекулярный механизм действия рекомбиназ. Интеграция фага 1 Типы хромосомных перестроек,mосуществляемых при сайтспецифической рекомбинации.
- •26.Промотор прокариот и механизм его распознавания рнк-полимеразой. Альтернативные s-факторы(этого калла нет, но есть не s факторы а сигма, что и описаны ниже). Стадии транскрипционного цикла.
- •27.Промоторы эукариот: размеры, положение, структура и механизм
- •28.Регуляция процесса транскрипции прокариот. Лактозный и триптофановый опероны. Про опероны (изучите как они работают в различных ситуациях, здесь такого нет!!!!)
- •29. Нематричный синтез рнк.
- •30. Информационная рнк, ее структура и функциональные участки, различия у про-и эукариот. Модификация 5'- и 3'-концов транскриптов и ее значение.
- •31. Интроны. Особенности структуры и механизмы сплайсинга. Аутосплайсинг.
- •32. Сплайсинг пре-тРнк.
- •34. Транс-сплайсинг и альтернативный сплайсинг: механизмы, роль, распространение, примеры.
- •35. Процессинг тРнк
- •37. Транспортные рнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль модифицированных нуклеотидов.
- •38. Аминоацилирование тРнк. Аминоацил-тРнк-синтетазы, их структура и механизм действия. Специфичность аминоацилирования, механизмы ее контроля.
- •41. Последовательность событий при инициации трансляции эукариот. Белковые факторы, взаимодействующие с рибосомой и с мРнк.
- •42. Механизм элонгации полипептидной цепи в процессе трансляции.
- •44. Ингибиторы синтеза белка
- •45. Молекулярные шапероны семейства Hsp60. Рабочий цикл шаперонина GroEls
- •46. Классы генов теплового шока у b. Subtilis. Рабочий цикл шаперонного комплекса DnaKj-GrpE
- •47. Деградация белка: атф-зависимые протеазы прокариот и 26s-протеасома эукариот. Насчет атф-зависимые протеазы не точно!!!
- •48. Механизм распознавания аномальных белков. Система убиквитинирования белков эукариот
- •49. Секреция белков прокариот: Sec-аппарат и сигнальный пептид (лекция)
- •50. Принципы распределения белков по компартментам клетки эукариот.
- •51. Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты, контроль локализации белков внутри этих органелл.
- •52. Устройство и принципы действия бактериальных систем секреции белков.
- •53. Котрансляционная транслокация белка в полость эндоплазматического ретикулума. Srp-частица и ее рецептор.
- •54. Механизм транспорта белков через ядерные поры.
- •5 5. Структура белков-регуляторов транскрипции и механизм их взаимодействия с днк.
- •56. Сенсорные механизмы бактерий. Двухкомпонентные регуляторные системы: принцип действия и примеры. Сигнальные каскады у бактерий.
- •59. Сенсорные механизмы эукариот. Общие принципы детекции и передачи сигнала. Сигнальный путь jak-stat.
- •60.Типы рецепторных протеинкиназ. Механизмы их активации и дальнейшей передачи сигнала. Контроль специфичности сигнализации. Сигнальный путь Ras/mapk в клетка млекопитающих.
- •61.Регуляция экспрессии генов на уровне организации днк. Регуляция активности генов обусловленная метилированием днк
- •62.Регуляция экспрессии генов на уровне транскрипции. Ответ говно выучить надо когда выйчишь лактозный и триптофановый оперон
- •63.Регуляция экспрессии генов на уровне созревания рнк. Регуляция экспрессии генов на уровне трансляции.
- •Редактирование рнк
28.Регуляция процесса транскрипции прокариот. Лактозный и триптофановый опероны. Про опероны (изучите как они работают в различных ситуациях, здесь такого нет!!!!)
Лактозный оперон – данный оперон кодирует белки катаболизма лактозы, менее предпочтительного по сравнению с глюкозой источника энергии для данной бактерии. В связи с этим транскрипция lac-оперона происходит только в том случае, если в среде отсутствует глюкоза и присутствует лактоза. В состав lac-оперона входят: три структурных гена, кодирующих белки, участвующих в метаболизме лактозы: βгалактозидазу (гидролизует лактозу), пермеазу (ответственна за транспорт галактозы в клетку), белок А (β-галактозидтрансацетилаза – функция до конца не выяснена); промотор (40 п.н.); оператор (27 п.н.); область связывания комплекса белка САР (белок активатор катаболитических оперонов) с цАМФ – САР•цАМФ (38 п.н.).
+Триптофановый оперон содержит 5 генов, ответственных за синтез триптофана, промотор, оператор.
Триптофановый оперон должен транскрибироваться при недостаточном содержании триптофана в клетке. При высоком же содержании этой аминокислоты его экспрессия должна быть слабо выраженной или полностью отсутствовать. В клетках E.coli присутствует репрессор, образующийся в результате экспрессии соответствующего гена. При высоком содержании в клетке триптофана этот репрессор образует комплекс с данной аминокислотой. Образовавшийся комплекс обладает сродством к оператору и, взаимодействуя с ним, не позволяет РНК-полимеразе начать синтез РНК. Белки, ответственные за синтез триптофана, не образуются. Соответственно не происходит и синтез аминокислоты.
Как только содержание триптофана в клетке снижается, комплекс триптофан-репрессор распадается. В результате репрессор теряет сродство к оперону. РНК-полимераза приобретает доступ к промотору и начинает транскрипцию структурных генов. Синтезируется иРНК, которая транслируется с образованием белков, ответственных за синтез триптофана. Концентрация этой аминокислоты в клетке постепенно возрастает.
29. Нематричный синтез рнк.
Существуют
ферменты способные синтезировать РНК
в отсутствие матрицы. К ним относится
полинуклеотидполимераза и
полиаденилатполимераза. Полинуклеотидполимераза
– встречается у бактерий и использует
в качестве субстратов рибонуклеозид-5’-дифосфаты
(НДФ) – АДФ, ЦДФ, ГДФ и УДФ. Этот фермент
катализирует реакцию, которую в общем
виде можно представить так:
Реакция обратима.. Полиаденилатполимераза обеспечивает синтез полиА-последовательности на 3’-конце иРНК. В качестве субстрата использует АТФ и РНК..
30. Информационная рнк, ее структура и функциональные участки, различия у про-и эукариот. Модификация 5'- и 3'-концов транскриптов и ее значение.
иРНК (или матричные РНК) – это одноцепочечные молекулы. Они содержат информацию о первичной структуре белка и служат матрицами для биосинтеза полипептидных цепей.
Молекула иРНК может кодировать одну или несколько полипептидных цепей. иРНК, кодирующая информацию об одной полипептидной цепи, называется моноцистронной, о двух или более – полицистронной.
Информационная РНК прокариот
иРНК
прокариот – это короткоживущие молекулы,
их время полужизни составляет всего
около 2 мин. иРНК прокариот в большинстве
случаев являются полицистронными, и
только некоторые из них – моноцистронными.
Полицистронные иРНК содержат
нетранслируемые межцистронные области,
которые разделяют участки, кодирующие
полипептидные цепи (цистроны). Со стороны
5’ располагается лидерная не кодирующая
последовательность, содержащая в своем
составе Шайна-Дальгарно, определяет
правильную ориентацию на рибосомах, со
стороны 3’ кольцевая последовательность
- трейлер.
иРНК эукариот
иРНК эукариот являются моноцистронными . На их 5’-конце имеется кэп. Кэп представляет собой 7-метилгуанозин, связанный трифосфатной связью 5’-5’со следующим нуклеотидом. Присоединение кэпа происходит посттранскрипционно. Кэп играет важную роль в инициации синтеза белка.
На
3’-конце большинства иРНК эукариот
имеется полиАпоследовательность. ПолиА-
последовательность не закодирована в
генах, поэтому полиаденилирование
осуществляется после транскрипции (в
ядре) ферментом полиаденилатполимеразой.
ПолиА-последовательность имеет размер
около 50 – 400 нуклеотидов. В цитоплазме
она постепенно укорачивается и определяет
время жизни иРНК. Таким образом, эта
последовательность защищает иРНК от
деградации последовательности. Кроме
того, она способствует транспорту иРНК
из ядра в цитоплазму. На 5’-и 3’- флангах
иРНК располагаются нетранслируемые
области. Период полужизни иРНК эукариот
значительно больше, чем у прокариот, и
составляет от нескольких часов до
нескольких суток.