![](/user_photo/89530_i5QY2.jpg)
- •1. Геномы основных групп организмов: размеры, число генов и их организация. Взаимосвязь организации генома со сложностью организма и особенностями базовых молекулярно-биологических процессов.
- •2. Организация хромосом различных организмов.
- •7. Вилка репликации днк: ферменты и их свойства.
- •8. Стадии репликации.
- •9. Механизм репликации у e.Coli.
- •10. Особенности репликации у эукариот. Ori у дрожжей, их структурно-функциональная организация. Принципы контроля инициации репликации днк эукариот.
- •11. Синтез теломер.
- •12. Повреждения днк в клетке.
- •13. Прямая репарация оснований.
- •14.Механизмы эксцизионной репарации днк (эксцизия нуклеотидов, оснований).
- •15. Репарация ошибок репликации днк (мисмэтч репарация).
- •17.Роль рекомбинационных процессов в репарации повреждений днк. Арест, реверсия и рестарт репликационной вилки.
- •19.Основные типы мобильных генетических элементов эукариот: структура, гены и их продукты.
- •20.Механизм транспозиции ретровирусоподобных ретротранспозонов.
- •21. Общая, или гомологичная, рекомбинация.
- •22.Рекомбинация у бактерий.
- •24.Сайтспецифическая рекомбинация. Молекулярный механизм действия рекомбиназ. Интеграция фага 1 Типы хромосомных перестроек,mосуществляемых при сайтспецифической рекомбинации.
- •26.Промотор прокариот и механизм его распознавания рнк-полимеразой. Альтернативные s-факторы(этого калла нет, но есть не s факторы а сигма, что и описаны ниже). Стадии транскрипционного цикла.
- •27.Промоторы эукариот: размеры, положение, структура и механизм
- •28.Регуляция процесса транскрипции прокариот. Лактозный и триптофановый опероны. Про опероны (изучите как они работают в различных ситуациях, здесь такого нет!!!!)
- •29. Нематричный синтез рнк.
- •30. Информационная рнк, ее структура и функциональные участки, различия у про-и эукариот. Модификация 5'- и 3'-концов транскриптов и ее значение.
- •31. Интроны. Особенности структуры и механизмы сплайсинга. Аутосплайсинг.
- •32. Сплайсинг пре-тРнк.
- •34. Транс-сплайсинг и альтернативный сплайсинг: механизмы, роль, распространение, примеры.
- •35. Процессинг тРнк
- •37. Транспортные рнк: первичная, вторичная и третичная структура, роль модифицированных нуклеотидов.
- •38. Аминоацилирование тРнк. Аминоацил-тРнк-синтетазы, их структура и механизм действия. Специфичность аминоацилирования, механизмы ее контроля.
- •41. Последовательность событий при инициации трансляции эукариот. Белковые факторы, взаимодействующие с рибосомой и с мРнк.
- •42. Механизм элонгации полипептидной цепи в процессе трансляции.
- •44. Ингибиторы синтеза белка
- •45. Молекулярные шапероны семейства Hsp60. Рабочий цикл шаперонина GroEls
- •46. Классы генов теплового шока у b. Subtilis. Рабочий цикл шаперонного комплекса DnaKj-GrpE
- •47. Деградация белка: атф-зависимые протеазы прокариот и 26s-протеасома эукариот. Насчет атф-зависимые протеазы не точно!!!
- •48. Механизм распознавания аномальных белков. Система убиквитинирования белков эукариот
- •49. Секреция белков прокариот: Sec-аппарат и сигнальный пептид (лекция)
- •50. Принципы распределения белков по компартментам клетки эукариот.
- •51. Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты, контроль локализации белков внутри этих органелл.
- •52. Устройство и принципы действия бактериальных систем секреции белков.
- •53. Котрансляционная транслокация белка в полость эндоплазматического ретикулума. Srp-частица и ее рецептор.
- •54. Механизм транспорта белков через ядерные поры.
- •5 5. Структура белков-регуляторов транскрипции и механизм их взаимодействия с днк.
- •56. Сенсорные механизмы бактерий. Двухкомпонентные регуляторные системы: принцип действия и примеры. Сигнальные каскады у бактерий.
- •59. Сенсорные механизмы эукариот. Общие принципы детекции и передачи сигнала. Сигнальный путь jak-stat.
- •60.Типы рецепторных протеинкиназ. Механизмы их активации и дальнейшей передачи сигнала. Контроль специфичности сигнализации. Сигнальный путь Ras/mapk в клетка млекопитающих.
- •61.Регуляция экспрессии генов на уровне организации днк. Регуляция активности генов обусловленная метилированием днк
- •62.Регуляция экспрессии генов на уровне транскрипции. Ответ говно выучить надо когда выйчишь лактозный и триптофановый оперон
- •63.Регуляция экспрессии генов на уровне созревания рнк. Регуляция экспрессии генов на уровне трансляции.
- •Редактирование рнк
53. Котрансляционная транслокация белка в полость эндоплазматического ретикулума. Srp-частица и ее рецептор.
Трансляционный транспорт белков в ЭПР осуществляется по мере их синтеза так как рибосомы синтезирующие белки с сигнальной последовательностью садятся на специализированные транслокационные комплексы на мембране ЭПР
Сигнальная последовательность включает 5-10 гидрофобных аминокислот на N-конце белка. Эта сигнальная последовательность опознаётся специальным комплексом SRP опознающий сигнальные частицы. В состав SRP входит шесть белков и короткая молекула РНК. Один участок SRP связывает сигнальную последовательность белка другая соединяется с рибосомой и блокирует трансляцию.
Вместе с SRP рибосомы перемещается к ЭПР и связывается с рецептором SRP.
Этот комплекс (рибосома, SRP, рецептор) связывается с транслоконом.
Белок проникает в ЭПР через Водный канал трансплакатора. Имеющий воротный механизм и сформированный из четырёх субъединиц комплекса SEC-61. Этот канал вместе со связанными белками называют транслоконом.
Бактериальная "частица, распознащая сигналы" (SRP) является упрощенным аналогом эукариотической частицы с таким же названием.
У прокариот SRP состоит всего из двух компонентов: белка Ffh - гомолога SPR54 и более короткой (около 100 нуклеотидов) РНК (4.5S РНК), а SR (рецептор SRP) состоит только из гомолога α-субъединицы эукариотического SR - белка FtsY.
S
RP
котрансляционно распознает трансмембранные
сегменты как секреторные маркеры.
Системы SecB и SRP узнают каждый свою часть секретируемых белков. Функция SRP наиболее существенна при экспорте интегральных мембранных белков.
Выбор SRP или системы SecA/SecB пути происходит "на выходе" синтезирующейся белковой цепи из рибосомы.
54. Механизм транспорта белков через ядерные поры.
В ядро белки попадают через ядерные поры. Через ядерную пору может одновременно транспортироваться до 500 макромолекул в обоих направлениях.
Из
более крупных белков в ядро попадают
только белки, обладающие сигнальной
последовательностью для ядра (это один
или два коротких участка белка, богатых
остатками положительно заряженных
аминокислот - аргинина или лизина). С
этой последовательностью связываются
специальные белки- рецепторы импорта
в ядро (иногда с помощью дополнительных
адаптерных белков). Рецепторы импорта
в ядро связываются также с компонентами
ядерных пор. Энергию для транспорта
обеспечивает гидролиз ГТФ, осуществляемый
малыми мономерными ГТФ-азами - Ran-белками.
В цитоплазме Ran-белок находится в
связанном с ГДФ виде, так как в цитоплазме
локализованы Ran-GAP белки (белки-активаторы
ГТФ-азной активности Ran), а в ядре Ran-белок
находится в связанном с ГТФ виде, так
как в ядре локализован белок, обеспечивающий
обмен ГДФ на ГТФ. Ran-ГТФ, связываясь на
внутренней стороне ядерной поры с
"нагруженным" рецептором импорта
в ядро, обеспечивает его прохождение
внутрь ядра и разгрузку. Затем рецептор
с присоединенным Ran-ГТФ выходит в
цитоплазму, где GAP-белок в
ызывает
гидролиз ГТФ и отделение Ran-ГДФ от
рецептора импорта в ядро.