Функции не изолированных мембранами ядерных компартментов
3. места депонирования временно не используемых белков
speckles (сосредоточение различных факторов сплайсинга)
атформой для сборки ядерного компартмента может б лок или регуляторная РНК
Paraspeckles Расположены рядом с Sc35 спеклами. Структурной основой является некодирующая РНК. Одной из функций является удержание в ядре транскриптов, содержащих инвертированный повторы, составе которых A заменен на I в результате редактирования
Откуда берутся компартменты?
Сборка не ограниченных мембранами ядерных компартментов
В качестве центра нуклеации для сборки компартмента часто может выступать РНК (например Men e/b ncRNA в
параспеклах.
В некоторых компартментах Центрами нуклеации могут быть Белки, например PML
Macromolecular crowding and depletion attraction force
isotonic |
low salt |
low salt + PEG |
|
buffer |
|||
|
|
phase contrast
nucleolin
Pol I
coilin
Взаимодействие различных участков генома с компартментами модулирует форму хромосомных территорий и поддерживает межхромосомные контакты
Активные гены часто располагаются на границах SC35 компартментов. При этом разные гены, кодирующие функционально-связанные белки могут оказаться пространственно сближены. Первичные транскрипты этих генов вообще оказываются в одном и том же SC35 компартменте.
бета-глобиновый ген |
альфа-глобиновая и |
|
|
|
|
|
|
бета-глобиновая РНК |
|
альфа-глобиновый ген |
|
|
|
|
SC35 компартменты