- •1) Уровни структурной организации белка. Первичная структура белка и связи, её стабилизирующие.
- •2) Строение ферментов. Кофакторы и коферменты.
- •3) Регуляция активности ферментов частичным протеолизом.
- •Фолдинг белков. Шапероны. Денатурация и ренативация белков. Прионы и прионовые болезни.
- •Ингибирование ферментативной активности. Конкурентное обратимое ингибирование. Кинетические зависимости. Примеры.
- •Поняти об энзимопатиях. Примеры.
- •Уровни организации белков. Вторичная структура белка. Связи, её стабилизирующие
- •Ингибирование ферментативной активности. Неконкурентное обратимое ингибирование. Кинетические зависимости. Примеры
- •1. Особенности фетального гемоглобина. Понятие о гемоглобинопатиях. Серповидно-клеточная анемия. Талассемя.
- •2. Классификация и номенклатура ферментов.
- •3. Регуляция активности ферментов частичным протеолизом
- •1.Функция белков в организме человека:
- •2.Ингибирование ферментативной активности. Конкурентное обратимое ингибирование. Кинетические зависимости. Примеры.
- •3. Энзимодиагностика.
- •Кооперативный эффект. Гомотропный аллостерический кооперативный эффект проявляется в системе с идентичными лигандами, гетеротропный — при взаимодействии между разными лигандами.
- •Ассоциация-диссоциация фермента.
1.Функция белков в организме человека:
1) каталитическая. Все ферменты — это белки, обладающие специфическими каталитическими свойствами, то есть каждый фермент катализирует одну или несколько сходных реакций.
2) структурная. Глобулины и альбумины в крови; актин и миозин в мышцах; гемоглобин в эритроцитах; коллаген, креатин, эластин, ретикулин в соединительной ткани, из них состоят покровы тела (кожи, волосы, ногти), сосуды, белковые комплексы с липидами участвуют в образовании биомембран клеток.
3) транспортная. Трансферрин – белок плазмы крови, который транпортирует железо; альбумины транспортируют жирные кислоты и билирубин; гемоглобин – кислород и углекислый газ.
4) защитная. Антитела (иммуноглобулины) защищают от вирусов, бактерий и чужеродных веществ; белки крови, в частности фибриноген, образовывает сгусток крови (сворачивается), это защищает организм от потери крови при ранениях;
5) регуляторная. Гормоны имеют белковое происхождение.
6) сократительная. Сокращение мышц ( актин и миозин); движение ресничек и жгутиков; активный и направленный внутриклеточный транспорт (кинезин, динеин).
7) рецепторная. Белки-рецепторы
8) энергетическая. (1грамм=4ккал)
2. Ингибирование ферментативной активности. Конкурентное обратимое ингибирование. Кинетические зависимости.
2.Ингибирование ферментативной активности. Конкурентное обратимое ингибирование. Кинетические зависимости. Примеры.
Ингибиторы – вещества, снижающие каталитическую активность ферментов. Ингибиторы способны взаимодействовать с ферментами с разной степенью прочности.
Обратимое конкурентное ингибирование.
Э то обратимое снижение скорости ферментативной реакции, вызванное ингибитором, связывающимся с активным центром фермента и препятствующим образованию фермент-субстратного комплекса. В этом случае ингибитор – структурный аналог субстрата, и в результате возникает конкуренция молекул субстрата и ингибитора за место в активном центре фермента. При образовании комплекса фермента и ингибитора продукт реакции не образуется.
Пример: ингибирование сукцинатдегидрогеназной реакции малоновой кислотой. Малоновая кислота – структурный аналог сукцината и может также взаимодействовать с активным центром сукцинат дегидрогеназы. Однако отщипление двух атомов от малоновой кислоты невозможно, следовательно скорость реакции снижается. (см. Рис.)
Кинетические зависимости.
Конкурентные ингибиторы уменьшают скорость химической реакции. Ингибитор повышает Км для данного субстрата (чменьшает сродство субстрата ферменту). Это означает, что в присутствии конкурентного ингибитора необходима большая концентрация субстрата для достижения ½ Vmax.
Увеличение соотношения концентрации субстрата и ингибитора снижает степень ингибирования. При значительно более высоких концентрациях субстрата ингибирование полностью исчезает.
3. Энзимодиагностика.
Энзимодиагностика заключается в постановке диагноза заболевания на основе определения активности ферментов в биологических жидкостях человека. Все ферменты плазмы крови делятся на 2 группы: а) функциональная (эти ферменты находятся там постоянно и выполняют определенные функции, они не несут для врача никакой информции) и б) нефункциональная или экскреторная (в норме этих ферментов нет, они появляются только из поврежденного организма, поэтому и представляют ценную информацию для врача)
Аспартатаминотрансфераза (АСТ) – Вызывает заболевание сердца (инфаркт миокарда)
Аланинаминотрансфераза (АЛТ) – Вызывает заболевание печени (вирусный гепатит)
Амилаза – Вызывает заболевание поджелудочной железы (острый панкреатит)
Креатинкиназа – Вызывает инфаркт миокарда
Гамма-глутамилтранспептидаза (ГГТП) – Вызывает различные заболевания печени
Лактатдегидрогеназа (ЛДГ) – Вызывает инфаркт миокарда
Липаза – Вызывает заболевание поджелудочной железы
Кислая фосфатаза – Вызывает опухоль предстательной железы
Щелочная фосфатаза – Вызывает заболевания костей, закупорку протоков печени
Билет 13
Аллостерические эффекты гемоглобина: 2,3-бифосфоглицерат.
Ингибирование ферментативной активности. Неконкурентное обратимое ингибирование. Кинетические зависимости. Примеры.
Энзимотерапия. Использование ферментов в качестве лекарственных средств. Понятие об абзимах.
2,3-бифосфоглицерат – вещество, синтезируемое в эритроцитах из промежуточного продукта окисления глюкозы – 1,3-бифосфоглицерата. БФГ обладает возможностью регулировать сродство гемоглобина к кислороду. В нормальных условиях он присутствует в цитоплазме эритроцита в количестве равном количеству гемоглобина. Он присоединяется в центральную полость между четырьмя мономерами гемоглобина, куда не присоединяется кислород (аллостерический центр). Поступая в молекулу дезоксигемоглобина, он понижает сродство молекулы к кислороду, но существенно повышает количество О2, транспортируемого в ткани. В легких, где парциальное давление кислорода гораздо выше, между мономерами гемоглобина происходит разрыв ионных связей, БФГ высвобождается из молекулы, и она вновь принимает кислород для последующей транспортировки в ткани. БФГ имеет решающее значение при приспособлении людей к высокогорному климату. Когда человек поднимается на высоту около 4000 метров над уровнем моря, содержание БФГ в его крови уже на второй день возрастает почти в два раза (потому что парциальное давление кислорода и его концентрация в горах гораздо выше), что способствует снижению сродства гемоглобина к О2 и увеличению транспортировки кислорода в ткани.
Конкурентное ингибирование – такой вид ингибирования, при котором вещество-ингибитор по своей структуре очень схоже с субстратом и имеет возможность конкурировать с ним за присоединение к активному центру. То есть, фермент взаимодействует либо с субстратом, в таком случае образуется продукт реакции, либо с ингибитором – и реакции не происходит. Это можно выразить следующими уравнениями: а) E + S = ES = E + P б) E + I = EI
К
онкурентные
ингибиторы снижают скорость реакции.
Ингибитор повышает Km
(константа Михаэлиса, численно равная
половине максимальной скорости р-ции)
для данного субстрата (уменьшает сродство
субстрата к ферменту), то есть в его
присутствии необходима большая
концентрация для достижения 1/2Vmax.
При
значительно более высоких концентрациях
субстрата, ингибитор не сможет
конкурировать с ним за активные центры,
и эффект ингибирования исчезнет.
Механизм конкурентного ингибирования
лежит в основе действия многих
лекарственных средств. Например,
четвертичные аммониевые основания
ингибируют ацетилхолинэстеразу,
катализирующую реакцию гидролиза
ацетилхолина. В результате, активность
ацетилхолинэстеразы падает =>
концентрация ацетилхолина (субстрата)
увеличивается => усиливается проведение
нервного импульса. Этот эффект используют
при мышечных дистрофиях. Лекарственные
препараты: прозерин, эндрофоний и т.д.
Также, по механизму конкурентного
ингибирования действуют антиметаболиты
– вещества по своей структуре сходные
с веществами природными, участвующими
в метаболизме живых существ. Таковы,
например, сульфаниламидные препараты.
По своей структуре они схожи с
пара-аминобензойной кислотой, которая
используется бактериями при синтезе
фолиевой кислоты. Вступая в реакцию они
могут:
а) Конкурентно ингибировать
ферменты синтеза фолиевой кислоты
б)
Выступать как псведосубтраты, из-за
относительной субстратной специфичности
ферментов. В этом случае синтезируются
соединения, похожие по структуре на
фолиевую к-ту, но не обладающие ее
свойствами.
В любом из данных случаев
в бактериальной клетке нарушается обмен
одноуглеродных фрагментов, затухает
синтез нуклеиновых кислот.
Использование ферментов в качестве лекарственных средств имеет некоторые ограничения вследствие их высокой иммуногенности (то есть, способны вызывать иммунный ответ). Однако энзимотерапия активно развивается по следующим направлениям: а) Заместительная терапия – использование ферментов в случае их недостаточности. б) Комплексная терапия – применение ферментов в сочетании с другой терапией. Заместительная терапия эффективна при заболеваниях ЖКТ, связанных с недостаточностью секреции пищеварительных соков. Например, пепсин используется при ахилии, гипоацидных и анацидных гастритах. В кач-ве дополнительных лекарственных средств ферменты используют при ряде заболеваний. Протеолитические ферменты (трипсин, химотрипсин) применяют при местном воздействии для обработки гнойных ран с целью расщепления белков погибших клеток, для удаления сгустков крови или вязких секретов при воспалительных заболеваниях дыхательных путей. Ферментные препараты рибонуклеазу и дезоксирибонуклеазу используют в качестве противовирусных препаратов при лечении аденовирусных конъюнктивитов, герпетических кератитов. Ферментные препараты также стали широко использоваться при тромбозах и тромбоэмболиях (фибринолизин, стрептолиаза, стрептодеказа, урокиназа). Абзимы – моноклональные (то есть выделяются иммунными клетками, произошедшими от одной клетки-предшественницы и приспособленые к специфическому связыванию с определенным веществом) антитела, обладающие каталитической активностью. Их особенность в том, что они способны катализировать любую реакцию, даже если у нее уже существует специфический фермент.
Билет 14
1.
Строение и функции гемоглобина
Гемоглобины –родственные белки , находятся в эритроцитах . Сложный белок
*Состав: 4 м-лы белка Глобина (каждая из них связана с 1 м-лой Гема)
Ф-ции:
Перенос О2 из легких к тканям
Перенос СО2 из тканей в легкие
Виды:
Гемоглобин А –основной (98%) Состав- 2 полипептидные цепи а и 2в-цепей
Гемоглобин А2 – (2%) от общего. Состав- 2 а- и 2 б -цепей
Гемоглобин А1с - Гемоглобин А модифицированный ковалентным присоединением к нему глюкозы
Гемоглобин F – в костном мозге и печени, более насыщен О2 чем обычный Гемоглобин А. Имеет тетрамерную структуру – 2 а- и 2 v– цепей.
Т- и R- формы гемоглобина
Hb может находиться в двух состояниях (конформациях): обозначаемых как Т- и R-формы соответственно. Т-Форма (напряженная от англ. tense) обладает существенно более низким сродством к O2 по сравнению с R-формой. Связывание O2 с одной из субъединиц Т-формы приводит к локальным конформационным изменениям, которые ослабляют связь между субъединицами. С возрастанием парциального давления O2 увеличивается доля молекул Hb в высокоаффинной R-форме (от англ. relaxed). Благодаря кооперативным взаимодействиям между субъединицами с ростом концентрации кислорода повышается сродство Hb к O2, в результате чего кривая насыщения имеет сигмоидальный вид.
2.
Общая характеристика ферментов
Ферменты-это белковые молекулы или молекулы РНК
Роль-увеличивают скорость протекания химической реакции
Обладают всеми свойствами характерными для белков и имеют особенности строения , характеризующие их как катализаторы
Реагенты в реакции, катализируемой ферментами, называются субстратами, а получающиеся вещества — продуктами. Ферменты специфичны к субстратам (АТФ-аза катализирует расщепление только АТФ, а киназа фосфорилазы фосфорилирует только фосфорилазу).
Ферментативная активность может регулироваться активаторами и ингибиторами (активаторы — повышают, ингибиторы — понижают).
Специфичность ферментов
Специфичность – наиболее важное свойство ферментов , определяющее биологическую значимость этих молекул. Способность каждого из ферментов катализировать одну или несколько близких по природе химических реакций.
Виды специфичности , примеры
Субстратная
Способность каждого фермента взаимодействовать с одним или несколькими определенными субстратами
Абсолютная
Комплементарен только одному субстрату (очень мало)
Пример: Аргиназа , катализирующая реакцию расщепления аргинина до мочевины и орнитина
Групповая
Большинство ферментов катализирует однотипные реакции с небольшим количеством структурно похожих субстратов .
Пример: фермент панкреатическая липаза катализирует гидролиз жиров в двенадцатиперстной кишке человека.
Любая молекула жира (триацилглицерол) м-ла моноацилглицерол + 2 м-лы высших жирных кислот
Стереоспецифичность
При наличии у субстрата нескольких стереоизомеров (имеющие одинаковое строение, но отличающиеся пространственным расположением атомов) фермент проявляет абсолютную специфичность к одному из них.
Специфичность :
К D-сахарам – большинство моносахаридов и продуктов их обмена
(
над
стрелочкой гексокиназа)
К L-аминокислотам - белки человека ; большинство ферментов, обеспечивающих превращение аминокислот
К цис- транс- изомерам
Фермент фумараза оказывает действие только на фумарат
К a- и b- гликозидным связям
Фермент амилаза действует на а-гликозидные связи гидролиз крахмала и гликогена(полимеры глюкозы, остатки имеют данную связь) .
Целлюлоза (полимер глюкозы) остатки глюкозы связаны b- гликозидными связями (гидролиз) источник глюкозы в кишечнике
Каталитическая
Фермент катализирует превращение присоединенного субстрата по одному из возможных путей его превращения
Глюкозо-6-фосфат (ф-т: Фосфоглюкомутаза) Глюкозо-1-фосфат
(ф-т: Глюкозо-6-фосфатаза) Глюкоза
(ф-т:Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа)6фосфоглюконолактон
(ф-т: Фосфоглюкоизомераза) Фруктозо-6-фосфат
3.
Регуляция активности ферментов путем фосфорилирования-дефосфорилирования
В биологических системах часто встречается механизм регуляции активности ферментов с помощью ковалентной модификации аминокислотных остатков. Быстрый и широко распространённый способ химической модификации ферментов - фосфорилирование/дефосфорилирование. Модификации подвергаются ОН-группы фермента. Фос-форилирование осуществляется ферментами протеинкиназами, а дефосфорилирование- фосфопротеинфосфатазами. Присоединение остатка фосфорной кислоты приводит к изменению конформации активного центра и его каталитической активности. При этом результат может быть двояким: одни ферменты при фосфорилировании активируются, другие, напротив, становятся менее активными.
Изменение активности фермента, вызванное фосфорилированием, обратимо. Отщепление остатка фосфорной кислоты осуществляется ферментами фосфопротеинфосфатазами. Активность протеинкиназ и фосфопротеинфосфатаз регулируется гормонами, что позволяет быстро изменять активность ключевых ферментов метаболических путей в зависимости от условий внешней среды. Антагонистичные по функции гормоны противоположным образом влияют на фосфо-рилирование/дефосфорилирование ферментов, вызывая противоположные эффекты изменения метаболизма клетки.
Например, под действием глюкагона (в период между приёмами пищи) в клетках происходит уменьшение синтеза энергетического материала - жира, гликогена и усиление его распада (мобилизация), вызванного фосфо-рилированием ключевых ферментов этих процессов. А под действием инсулина (во время пищеварения), наоборот, активируется синтез гликогена и ингибируется его распад, так как взаимодействие инсулина с рецептором активирует сигнальный путь, приводящий к дефосфорилированию тех же ключевых ферментов.
Билет 15
1 Аллостерический эффект (allosteric effect) [греч. allos — другой и stereos —пространственный; лат. effectus — действие] — изменение конформации аллостерического фермента в результате взаимодействия его определенного участка с ингибитором или активатором (аллостерическим эффектором). А.э. часто встречается у белков, состоящих из более чем одной субъединицы. В таких случаях связывание лиганда с аллостерическим сайтом одной из субъединиц вызывает изменения, которые облегчают связывание лигандов с аллостерическими сайтами других субъединиц.
Гемоглобин относится к аллостерическим белкам, его молекулы могут обратимо переходить из одной конформации в другую. При этом изменяется сродство белка к лигандам. Конформация, обладающая наименьшим сродством к лиганду, называется напряжённой, или Т-конформацией. Конформация, обладающая наибольшим сродством к лиганду, называется релаксированной, или R-конформацией.
R- и Т-конформации молекулы гемоглобина находятся в состоянии динамического равновесия:
Различные факторы среды могут сдвигать это равновесие в ту или иную сторону. Аллостерическими регуляторами, влияющими на сродство Hb к O2, являются: 1) кислород; 2) концентрация Н+ (рН среды); 3) углекислота (СO2) ; 4) 2,3-дифосфоглицерат (ДФГ) . Присоединение молекулы кислорода к одной из субъединиц гемоглобина способствует переходу напряжённой конформации в релаксированную и повышает сродство к кислороду других субъединиц той же молекулы гемоглобина. Это явление получило название кооперативного эффекта.
