- •Белки и их биологическая функция
- •19 Из 20 аминокислот содержат в α -положении асимметричный атом углерода, с которым связаны 4 разные замещающие группы. В результате эти аминокислоты
- •Пептидная связь. Строение и биологические свойства пептидов
- •Структурные белки
- •Механизм действия ферментов
- •Энергия активации
- •Способность ферментов к регуляции
Структурные белки
Некоторые белки, расположенные определённым образом в тканях, придают им форму, создают опору, определяют механические свойства данной ткани. Коллаген и эластин являются главными фибриллярными белками соединительной ткани. Главным компонентом хрящей и сухожилий является белок коллаген, имеющий высокую прочность. Другой структурный белок-эластин благодаря своему уникальному строению обеспечивает определённым тканям свойство растягиваться во всех направлениях (сосуды, лёгкие). Кератин является составной частью волос, перьев, шерсти, рогов, панцыря черепахи и т.д. ( наружный слой кожи, - защитные покровы позвоночных).
Сократительные белки
Некоторые белки при выполнении своих функций наделяют клетку способностью либо сокращаться, либо передвигаться. К таким белкам относят актин и миозин — фибриллярные белки, участвующие в сокращении скелетных мышц. Другой пример таких белков — тубулин, из которого построены клеточные органеллы — микротрубочки. Микротрубочки в период деления клетки регулируют расхождение хроматид. Микротрубочки — важные элементы ресничек и жгутиков, с помощью которых клетки передвигаются. https://www.youtube.com/watch?v=ren_IQPOhJc (сокращение скелетных мышц)
Транспортные белки
Многие белки крови участвуют в переносе специфических веществ из одного органа к другому. Часто в комплексе с белками переносятся молекулы, плохо растворимые в воде. Так, белок плазмы крови альбумин переносит жирные кислоты и билирубин (продукт распада гема), а гемоглобин эритроцитов участвует в переносе 02 от лёгких к тканям. Стероидные гормоны переносятся в крови специфическими транспортными белками.
Транспортные белки участвуют также в переносе гидрофильных веществ через гидрофобные мембраны. Так как транспортные белки обладают свойством специфичности взаимодействия с лигандами, их набор в клеточной мембране определяет, какие гидрофильные молекулы могут пройти в данную клетку. С помощью белков-переносчиков в клетку проникают глюкоза, аминокислоты, ионы и другие молекулы.
Защитные белки
В организме иммунные реакции осуществляются с помощью антител. Антитела или иммуноглобулины, обладают способностью узнавать и связывать чужеродные молекулы, вирусные частицы и бактерии, в результате чего происходит их нейтрализация. Кроме того, комплекс чужеродной частицы с иммуноглобулином легко узнаётся и уничтожается клетками иммунной системы.
Защитными свойствами обладают белки свёртывающей системы крови, например фибриноген, тромбин. Они участвуют в формировании тромба, который закупоривает повреждённый сосуд и препятствует потере крови.
Рецепторные белки
Сигнальные молекулы (гормоны, нейромедиаторы) действуют на внутриклеточные процессы через взаимодействие со специфическими белками-рецепторами. Так, гормоны, циркулирующие в крови, находят клетки-мишени и воздействуют на них, специфично связываясь с белками-рецепторами, обычно встроенными в клеточную мембрану. Для гидрофобных регуляторных молекул, проходящих через клеточную мембрану, рецепторы локализуются в цитоплазме клеток.
Ферменты
Основу жизнедеятельности любого организма составляют химические процессы. Практически все реакции в живом организме протекают с участием природных биокатализаторов, называемых ферментами, или энзимами. Ферменты, как было установлено ещё в 1922 г, являются белками. Их роль уникальна: они увеличивают скорость протекания химической реакции, однако при этом не расходуются.
Субстратом называется химическое соединение, подвергающееся превращению под действием фермента. ферменты избирательно преобразуют субстраты по физиологически полезному пути и фактически управляют всеми метаболическими процессами организма.
Кофакторы – неорганические ионы, требуемые ферменту для осуществления каталитичесой активности (Zn2+, Fe2+, Mn2+, Mg2+).
Кофермент – органическое или металлорганическое комплексное соединение, необходимое для ферментативной активности. Коферменты служат переносчиками различных функциональных групп.
Биологическая функция фермента, как и любого белка, обусловлена наличием в его структуре активного центра. В активном центре фермента есть аминокислотные остатки, функциональные группы которых обеспечивают связывание субстрата, и аминокислотные остатки, функциональные группы которых осуществляют химическое превращение субстрата. Условно эти группы обозначают как участок связывания субстрата и каталитический участок.
В участке связывания субстрат при помощи нековалентных связей взаимодействует (связывается) с ферментом, формируя фермент-субстратный комплекс. В каталитическом участке субстрат претерпевает химическое превращение в продукт, который затем высвобождается из активного центра фермента. Схематично процесс катализа можно представить следующим уравнением:
Е + S <-> ES <-> ЕР <-> Е + Р,
где Е — фермент (энзим), S — субстрат, Р — продукт.
Специфичность — наиболее важное свойство ферментов, определяющее биологическую значимость этих молекул.
Каждый фермент имеет 2 названия. Первое — короткое, так называемое рабочее, удобное для повседневного использования. Второе (более полное) — систематическое, применяемое для однозначной идентификации фермента.
В названии большинства ферментов содержится суффикс «аза», присоединённый к названию субстрата реакции, например уреаза, сахараза, липаза, нуклеаза или к названию химического превращения определённого субстрата, например лактатдегидрогеназа, аденилатциклаза, фосфо-глюкомутаза, Однако в употреблении сохранился ряд тривиальных, исторически закреплённых названий ферментов, которые не дают представления ни о субстрате, ни о типе химического превращения, например трипсин, пепсин, ренин, тромбин.
1961 г. разработана систематическуя номенклатура, согласно которой все ферменты разбиты на 6 основных классов в зависимости от типа катализируемой химической реакции.
1. Оксидоредуктазы
Катализируют различные окислительно-восстановительные реакции с участием 2 субстратов (перенос е~ или атомов водорода с одного субстрата на другой).
2. Трансферазы
Катализируют перенос функциональных групп от одного соединения к другому. Подразделяют в зависимости от переносимой группы.
3. Гидролазы
Катализируют реакции гидролиза (расщепления ковалентной связи с присоединением молекулы воды по месту разрыва).
4. Лиазы
К лиазам относят ферменты, отщепляющие от субстратов негидролитическим путём определённую группу (при этом могут отщепляться С02, Н20, NH2, SH2 и др.) или присоединяющие чаще всего молекулу воды по двойной связи.
ЛИАЗЫ, класс ферментов, катализирующих реакции, в результате которых происходит разрыв связи С—С, С—О, С—N или др., сопровождающийся образованием двойных связей, а также обратные реакции-присоединения по двойным связям. Разрыв связи в этих реакциях не сопряжен с гидролизом или с окислит.-восстановит. превращениями.
5. Изомеразы
Катализируют различные внутримолекулярные превращения.
6. Лигазы (синтетазы)
Катализируют реакции присоединения друг к другу двух молекул с образованием ковалентной связи. Этот процесс сопряжён с разрывом фосфоэфирной связи в молекуле АТФ (или других нуклеозидтрифосфатов) или с разрывом макроэргических связей других соединений. В первом случае (при использовании энергии гидролиза АТФ) такие ферменты называют лигазами, или синтетазами
В случае, когда источником энергии служит любое другое макроэргическое соединение (не АТФ), ферменты называют синтазами.
Большинство ферментов для проявления ферментативной активности нуждается в низкомолекулярных органических соединениях небелковой природы (коферментах) и/или в ионах металлов (кофакторах).