- •Биосинтез рнк: строение промоторов, взаимодействие рнк-полимеразы с промоторами.
- •Характеристика рнк-полимераз у про- и эукариот.
- •Этапы биосинтеза рнк: инициация, элонгация, терминация.
- •Инициация
- •Элонгация.
- •Терминация.
- •Компоненты белоксинтезирующей системы у прокариот: мРнк, рРнк, тРнк; белковые факторы инициации, элонгации и терминации; 70s рибосомы.
- •Компоненты белоксинтезирующей системы эукариот (мРнк, рРнк, тРнк; мяРнк, белковые факторы инициации, элонгации и терминации; 80s рибосомы).
- •Строение рибосом, характеристика функциональных центров.
- •Биосинтез белка: активация аминокислот. Характеристика аминоацил-тРнк-синтетаз.
- •Инициация трансляции в прокариотических клетках.
- •46. Элонгация и терминация трансляции прокариот.
- •47. Генетический код. Основные характеристики.
- •Характеристика этапов трансляции в эукариотических клетках.
- •Сворачивание (фолдинг) полипептидной цепи. Роль ферментов и шаперонов в этом процессе.
- •Посттрансляционные модификации белков (из интернета).
- •1.Динамическая биохимия. Характеристика метаболических путей
- •1.1 Характеристика метаболических путей
- •2. Распад углеводов в желудочно-кишечном тракте. Роль амилолитических ферментов.
- •2.1 Расщепление углеводов в пищеварительном тракте
- •5. Трегалаза (не давала в лекции)
- •В последующей реакции, катализируемой ферментом фосфоенолпируваткарбоксикиназой, из оксалоацетата образуется фосфоенолпируват. Реакция Mg2-зависимая и донором фосфата служит gtp.
- •5. Окислительное декарбоксилирование пирувата. Строение пируватдегидрогеназного комплекса, регуляция активности.
- •6.Цикл лимонной кислоты. Регуляция цикла.
- •7.Дыхательная цепь: организация компонентов в виде 4-х белковых комплексов. Характеристика дыхательных переносчиков (fmn, железосерные белки, убихиноны, цитохромы).
1.Динамическая биохимия. Характеристика метаболических путей
Динамическая биохимия изучает превращения химических соединений и энергии в процессе жизнедеятельности живых организмов.
Метаболизм (обмен веществ) – совокупность ферментативных реакций в клетке.
Ф-и:
1) снабжение хим. энергией
2) превращение молекул пищевых веществ в строительные блоки, которые в дальнейшем используются клеткой для построения макромолекул;
3) сборка белков, нуклеиновых кислот, липидов, полисахаридов и прочих клеточных компонентов из этих строительных блоков;
4) синтез и разрушение тех биомолекул, которые необходимы для выполнения каких-либо специфических функций.
Выделяют:
Внешний обмен веществ – внеклеточное переваривание веществ на путях их поступления и выделения из организма.
Промежуточный обмен веществ ‒ превращение в-в внутри клеток с момента их поступления до образования конечных продуктов.
Попав внутрь клетки, питательное вещество метаболизируется, т.е. претерпевает ряд химических изменений, катализируемых ферментами. Определённая последовательность таких химических изменений называется метаболическим путём, а образующиеся промежуточные продукты – метаболитами.
Линейные метаб. пути
В циклических метаб. путях обычно есть разветвления – продукты реакций выходят из цепи реакций или, наоборот, вливаются в нее (пример: окисление ацетильных групп до СО2 и Н2О в цикле лимонной кислоты)
Метаболические пути: центральные и специальные (вторичные).
1. Центральные – превращение основных пищевых в-в в клетке (Б, Ж, У и нукл. кислот). Потоки метаболитов внушительны (ех: окисление неск. сотен г глюкозы ежесуточно). Последовательности хим. превращений на центр. метаб. путях, в принципе, у всех живых форм едины.
Специальные метаболические пути (вторичный метаболизм) – образование специализированных веществ, требующихся в малых количествах (ежесуточный синтез/распад измеряется миллиграммами); (ех: биосинтез коферментов, гормонов, нуклеотидов, пигментов, токсинов, антибиотиков и алкалоидов).
1.1 Характеристика метаболических путей
(Катаболические, анаболические, амфиболические пути)
Промежуточный метаболизм состоит из двух фаз: катаболизма и анаболизма.
1. Катаболизм – расщепление сложных орг. молекул до более простых конечных продуктов. БЖУ распадаются до малата, СО2 и аммиака. Высвобождается свободная энергия, заключенная в сложной структуре больших органических молекул. Значительная часть свободной энергии запасается в форме АТР, NАDН (NАDPН) (в восст. форме).
Катаболические пути поставляют химическую энергию в виде АТP и NАDPH, к-я используется на анаболических путях для биосинтеза макромолекул из небольших молекул – предшественников.
Ферментативное расщепление БЖУ идет через ряд последовательных реакций.
В аэробном катаболизме есть три главные стадии
1. макромолекулы распадаются на «строительные блоки»: полисахариды ‒ до гексоз или пентоз, жиры ‒ до жирных кислот, глицерола и других компонентов, белки – до аминокислот.
2. «строительные блоки» превращаются в один общий продукт ‒ ацетильную группу ацетил-СоА
3. различные катаболические пути сливаются в один общий – цикл лимонной кислоты; в результате всех превращений образуются только 3 конечных продукта (аммиак, вода, СО2)
2. Анаболизм (биосинтез) – из малых молекул-предшественников синтезируются белки, нуклеиновые кислоты и др. макромолекулярные компоненты клеток. Требует затраты энергии (источник - распад АТP до АDP и неорг. фосфата).
Анаболизм начинается с малых молекул-предшественников, протекает также в три стадии. В отличие от катаболизма для анаболизма характерно расхождение метаболических путей. Из сравнительно небольшого числа простых молекул-предшественников образуется огромное количество разнообразных макромолекул (на центральных путях анаболизма много ответвлений).
Катаболический путь и соответствующий ему, но противоположный по направлению анаболический путь между данным предшественником и данным продуктом обычно не совпадают (различаются промежуточные продукты, отдельные стадии). НО их связывает общая стадия, которая включает цикл лимонной кислоты и некоторые вспомогательные ферментативные реакции. Общая стадия - амфuболuческая стадия метаболизма, выполняет двойную функцию. В катаболизме на этой стадии завершается распад сравнительно небольших молекул, образовавшихся на второй стадии, а в анаболизме поставляет небольшие молекулы-предшественники для биосинтеза аминокислот, ж. к-т и углеводов.
Катаболические и анаболические реакции протекают одновременно, однако их скорости регулируются независимо, они часто локализованы в разных участках клетки.
Регуляция метаболизма осуществляется: 1) при помощи аллостерических ферментов, 2) при помощи гормонов; 3) путем регулирования синтеза ферментов.