V направление – иммуногистохимическая уточняющая диагностика фенотипа и степени злокачественности солидных новообразований:

1. Диагностика молекулярных маркеров неблагоприятного прогноза и ответа на проводимое лечение при онкологических заболеваниях (р53, HER-2/neu, bcl-2, Ki-67, EGFR, VEGF, ER, PR, AR, BRCA1, Вax, PCNA, CD117, SMA, S100, Des, CK17, CK18, CK19, CK5/6, CK8, HLA-А2, E-cadherin, р63, CK7, Vim, NSE и др.).

VI направление – флуоресцентная гибридизация in situ в первичной и уточняющей диагностике и определении тактики лечения онкологических больных:

1. Определение уровня амплификации генов: Her-2/neu, ТОР2А у больных раком молочной железы;

2. Дифференциальная диагностика лимфом: t(14,18)(q32,q21), t(11,14)(q13,q32), t(8,14)(q24,q32), 18q21 (MALT1), t(11,18)(q21,21) (API2/MALT1) и t(14,18)(q21,q21), t(11,22)(q24,q12), t(21,22)(q22,q12);

3. Дифференциальная диагностика высокозлокачественных глиальных опухолей головного мозга: амплификация генов С-myc, EGFR, транслокаций 1р и 19q с применением высокочувствительного флуоресцентного микроскопа и пакета прикладных программ (Германия).

4. Синовиальная саркома – определение транслокации t(18q11.2).

VII направление – молекулярная онкогеномика в профилактике, ранней и уточняющей диагностике, оценке лекарственной устойчивости и выборе стратегии лечения больных солидными новообразованиями:

1. Изучение генетического полиморфизма и соматических молекулярных нарушений, которые потенциально могут использоваться в клинической практике в качестве молекулярных маркеров для формирования групп высокого онкологического риска для ранней диагностики и прогнозирования течения ряда онкозаболеваний;

2. Сравнительный анализ структурных и эпигенетических повреждений и экспрессии ключевых генов, обеспечивающих работу процесса деления, а также некоторых белков, вовлеченных в систему передачи сигналов, клеточную адгезию и апоптоз;

3. Анализ молекулярных нарушений генов, контролирующих пролиферацию (в частности p16, p15, Rb, p53, ARF, DAPK, bcl-2 и т.д.) на разных стадиях развития злокачественных опухолей. Оценка степени выраженности молекулярных нарушений в доброкачественных и злокачественных опухолях, молекулярный скрининг при раке молочной железы, мочевого пузыря, поджелудочной железы и желудка и др. неоплазиях;

4. Исследования генетических детерминант и структурных нарушений в различных локусах хромосом, ассоциированных с развитием и прогрессией неоплазий. Идентификация генов в наименьших районах перекрывания делеций в локусе 1р32-36, связанных с опухолевой прогрессией и потерей гетерозиготности маркеров из этих локусов, достоверно коррелирующая с низкой постоперационной выживаемостью больных, что дает основание для широкого внедрения разрабатываемых тестов в практику индивидульного прогнозирования течения процесса в клинике.

5. Диагностика минимальной остаточной болезни при раке предстательной железы, молочной железы, мочевого пузыря, яичников, толстой кишки

6. Выявление генетических нарушений в свертывающей системе крови: мутации в генах гемостаза (мутация G 1691A/Leiden) фактора свертывания V; мутация G 20210А протромбина (фактор свертываемости II); С 677Т полиморфизм в гене метилентетрагидрофолатредуктазы (МTHFR), АроЕ (антифосфолипидный синдром) с использованием метода полимеразной цепной реакции в режиме «реального времени» (приборное обеспечение ведущих производителей США, Франции, Австрии).

VIII направление – молекулярно-генетический сиквенс в исследовании механизмов развития и прогрессирования злокачественных новообразований и оценке молекулярных мишеней для индивидуализации тактики лечения онкологических больных:

1. Диагностика генетических маркеров, ассоциированных с наследственной предрасположенностью к развитию злокачественных опухолей (рак молочной железы, яичников, семейный аденоматозный полипоз, наследственный неполипозный рак толстой кишки и других локализаций – BRCA1,2; APC; MSH2,6; MLH1, MSI и др.);

2. Определение мутаций в генах, предрасполагающих к развитию первично-множественных неоплазий;

4. Выявление точечных полиморфизмов в генах, ассоциированных с развитием множественной лекарственной устойчивости при лечении онкологических пациентов: первичной и вторичной.