МЕТОДИЧЕСКАЯ РАЗРАБОТКА № 10
ТЕМА: Экологическая микробиология. Нормальная микрофлора организма человека. Генетика и изменчивость микроорганизмов, ее формы, генная инженерия, практическое использование. Плазмиды и их выявление.
МОТИВАЦИОННАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА двояка. Она предполагает, с одной стороны, знакомство с микробами - обитателями организма человека (нормальная микрофлора) и окружающей среды (экология), оказывающими взаимное влияние друг на друга. С другой стороны, необходимость познания наследственной основы микробов с формированием различных вариантов изменчивости и роли последней для медицинской науки.
Важное фундаментальное и прикладное значение имеет изучение управляемости наследственной основой микроорганизмов и вопросы генной инженерии.
УЧЕБНАЯ ЦЕЛЬ: знакомство с экологической микробиологией, особенностями наследственности и видами изменчивости микробов, их теоретическим и практическим значением, использованием в современной медицинской науке и практике.
ВОПРОСЫ ДЛЯ САМОСТОЯТЕЛЬНОГО И ВВОДНОГО КОНТРОЛЯ ЗНАНИЙ
-
Экологическая микробиология. Нормальная микрофлора организма человека и окружающей среды.
-
Наследственность микробов и ее материальная основа.
-
Особенности нуклеоида бактерий.
-
Понятие о генотипе и фенотипе микробов.
-
Структура генома бактерий и прочих микроорганизмов.
-
Контроль экспрессии генов (на примере lас-оперона).
-
Виды изменчивости микробов и факторы их вызывающие.
-
Модификационная изменчивость, ее механизмы и значение.
-
Мутационный процесс: мутации, мутанты, мутагены. Классификация мутаций.
-
Диссоциация бактерий на S- и R - формы, их различие, значение.
-
Выявление ауксотрофных и антибиотико-резистентных мутантов.
-
Репарации поврежденной ДНК, механизм и значение.
-
Генетические рекомбинации у бактерий, механизмы, формы и значение.
-
Трансформация, ее основные этапы, значение.
-
Трансдукция и лизогенная конверсия.
-
Конъюгация, роль F - фактора, особенности Hfr- клеток.
-
Сходство и различия хромосом и плазмид.
-
Классификация и функции плазмид.
-
Транспозоны, строение и функции, значение.
-
Генная инженерия, ее фундаментальное и прикладное значение.
-
Практическое применение методов генетики бактерий в народном хозяйстве, биологии, медицине.
-
Полимеразная цепная реакция (ПЦР), ДНК - зонды, их применение.
-
Мутагенная активность химических соединений и физических факторов, методы их изучения.
МЕТОДИЧЕСКИЕ УКАЗАНИЯ ПО ВЫПОЛНЕНИЮ ПРАКТИЧЕСКОЙ РАБОТЫ С ПОЛНЫМ РЕГЛАМЕНТОВ ПРОТОКОЛА
№ п/п |
Наименование учебного элемента |
Методическое решение |
Регламент протокола |
1. |
Нормальная микрофлора человека |
Борисов Л.Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология. М., 2005. С. 137-146 |
Составить список основных микробиоценозов организма человека |
2. |
Микрофлора окружающей среды (экология) |
С.131-136 |
Составить перечень основных видов микрофлоры воды, воздуха, почвы и пр. |
3. |
Генетический аппарат микробов |
С.93-99 |
Зарисовать, подписать элементы |
4. |
Классификация форм изменчивости микробов |
С.100-114 |
Составить схему |
5. |
Перечень основных достижений генной инженерии в микробиологии |
Приложение 1 |
Вписать в протокол и составить схему |
6. |
Модификационная изменчивость (временная и длительная) |
Приложение 2, 2а |
Записать в протокол |
7. |
Фильтрующиеся формы и их реверсия |
Приложение 3 |
Записать в протокол, зарисовать |
8. |
Генотипическая изменчивость |
Приложение 4 |
Записать в протокол и заполнить |
9. |
Рекомбинационная изменчивость |
Приложение5 |
Записать в протокол и заполнить |
10. |
Плазмиды бактерий |
Приложение 6 |
Заполнить таблицу в протоколе |
11. |
Применение методов генетики микроорганизмов в медицине |
Домашнее задание |
Составить перечень в протоколе |
12. |
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) |
Приложение 7 |
Переписать в протокол |
13. |
Определение мутагенной активности химических веществ |
Приложение 8 |
Записать в протокол |
14. |
Итоговый тест-контроль усвоения темы |
Приложение 9 |
Сложное записать в протокол. |
Приложение 1
ПЕРЕЧЕНЬ ОСНОВНЫХ ДОСТИЖЕНИЙ ГЕННОЙ ИНЖЕНЕРИИ В МИКРОБИОЛОГИИ
Бактериальный объект |
Донорный ген-материал |
Достигнутый эффект 1 |
Е. coli |
Ген инсулиносинтеза человека |
Синтез человеческого инсулина эшерихиями |
Е. соli |
Ген синтеза интерферонов человеческими лейкоцитами |
Синтез человеческого интерферона эшерихиями (реаферон) |
Е. coli |
Ген синтеза прочих гормонов человека |
Синтез человеческих гормонов эшерихиями |
Приложение 2
МОДИФИКАЦИОННАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ БАКТЕРИЙ (ВРЕМЕННАЯ)
Объект - бактерии |
Изменяющий фактор и контроль |
Получаемый эффект изменчивости |
Vibrio cholerae |
10% р-р NaCl |
Полиморфизм: шарообразные клетки в контроле извитые, в виде «запятой» |
Proteus vulgaris |
МПБ с 0,2% карболовой кислоты, посев в конденсат |
Потеря подвижности, ползучего роста нет (в отличие oт контроля) |
Serratia marcescens |
Рост при разных температурах: 22, 37 С0 |
Пигментообразование только при низкой температуре +22 С0 |
При переводе в оптимальные условия наступает реверсия - полное восстановление исходных характеристик.
Приложение 2а
Модификационная изменчивость (длительная)
Вид изменчивости
|
Действующий фактор |
Возможность реверсии |
Лекарственная резистентность. Фильтрующаяся форма Диссоциация на S-и R- формы L- формы бактерий
|
Лекарственный препарат (антибиотик). Массивная антибиотикотерапия. Экстремальные условия. Антибиотики и прочие препараты |
После многократных пересевов на оптимальную среду.
- « -
После прекращения действия индуцирующего фактора (не всегда) |
Приложение 3
ЭКСПЕРИМЕНТ ПО ВОССТАНОВЛЕНИЮ (РЕВЕРСИИ) ФИЛЬТРУЮЩИХСЯ ФОРМ БАКТЕРИЙ
- Приготовить фильтрат патологического материала (например, мочи), использовав бактериологический фильтр Зейтца,
-
засеять чашки с МПА культурой Sarcina lutea,
- нанести фильтрат пипеткой или петлей на посев сарцины. Поставить в термостaт на 1-3 суток при +39 С0,
- учесть готовые результаты посева. Зарисовать колонии ревертанты на сарциновом газоне.
Приложение 4
Виды генотипической изменчивости
Вид изменчивости |
Микробная модель компонента |
Результат |
Трансформация |
Пневмококки в голодной среде: серотип I - живой, III- убитый ДНК пневмококка серотип III и живой пневмококк I серотипа |
Выделены из среды живые серотипы I и III - « - |
Трансдукция с лизогенной конверсией |
Бактерии нетоксичные, бактериофаг из токсичных |
Выделены токсичные бактерии |
Генетическая половая рекомбинация (межвидовая) |
Донор F+ E.coli селективные признаки Lac+, Str 5. Реципиент F- S. flexneri признаки Lac-, Str7 |
Генетические рекомбинанты Lac+, Str2 |
Приложение №5
СХЕМА ПОЛУЧЕНИЯ ПОЛОВЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕКОМБИНАНТ
-
дизентерийные бактерии F- - реципиент с главными селективными признаками: Lac-, Str(r);
-
кишечные палочки F+ -донор с главными селективными признаками Lac+, Str(s);
-
минимальная среда (голодная, солевая);
-
стрептомицин в порошке;
-
1% раствор лактозы;
-
эозин - метиленовый индикатор.
Этапы проведения эксперимента:
- стандартизация скрещиваемых культур по Пехову А. и Абидову А. Реципиент F- - I млрд. мт/1 мл.
Донор - 250 млн. мт/мл,
-
скрещивание культур путем приготовления бактериального кросса F+ : F- в соотношении 4:1,
-
инкубация в термостате для конъюгации, 1 час при +37С0,
-
готовят минимальную среду с селективными добавками и индикатором: расплавить, остудить до +45С0, добавить 150 ЕД/мл стрептомицина, 1% лактозы и индикатор эозин 0,4 мг/мл +метиленовая синь 0,065 мг/мл,
-
высевают на среду бактериальную смесь кросса и отдельно - исходные культуры на селективные среды,
-
инкубировать в термостате при +37С0 1-5 суток,
-
учет-обнаружение и изучение половых гибридов. На селективной среде они вырастают только в виде цветных колоний, поскольку рекомбинанты унаследовали от донора признак Lact +, а от реципиента – Str(r).
СРАВНИТЕЛЬНЫЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ УЧАСТНИКОВ ЭКСПЕРИМЕНТА
Свойства селективные |
Дизентерийные бактерии (реципиент) |
Кишечная палочка (донор) |
Половой рекомбинант |
Отношение к лактозе |
Lac - не разлагают |
Lac+ |
Lac+ |
Отношение к стрептомицину |
Str(r) резистентны |
Str(s) чувствительны |
Str(r) резистентны |
Наличие фактора фертильности |
F- - отсутствует |
F+ - имеется |
F+ или F- вариабельно |
Реципиент на селективной среде не растет по причине признака Lac-, неспособности утилизировать единственного источника питания на голодной среде, а донор - из-за присутствия стрептомицина и Str(s).
Приложение 6