Задания для самостоятельной работы студентов:

Разделы и темы для самостоятельного изучения	Виды и содержание самостоятельной работы
Роль протеомики в оценке патологических состояний.	– для овладения знаниями: 1. Составить таблицу «Методы фракционирования и очистки белков»
Сложные белки, классификация	– для овладения знаниями: 1. Составить таблицу «Классификация сложных белков»
Уровни структурной организации белков: первичная, вторичная, надвторичная, третичная и четвертичная структуры, домены, субдомены, надмолекулярные структуры. Связи, поддерживающие структуры белка: дисульфидные, ионные, водородные, гидрофобные. Взаимосвязь структуры и функции. Денатурация и ренатурация.	– для овладения знаниями: 1. Конспектирование первоисточников и другой учебной литературы; проработка учебного материала (по конспектам лекций, учебной и научной литературе). – для закрепления и систематизации знаний: 2. Работа с тестами для самопроверки. 3.Создание глоссария по теме.
Функции белков: структурная, каталитическая, транспортная, рецепторная, регуляторная, защитная, сократительная. войства простых белков. Гистоны, альбумины. Структурные белки: тубулины, кератины, коллаген, эластин. Миоглобин и гемоглобин. Конформационные изменения и кооперативные взаимодействия субъединиц гемоглобина. Эффект Бора. Роль 2,3 – бисфосфоглицерата.	– для овладения знаниями: 1.Конспектирование первоисточников и другой учебной литературы; проработка учебного материала (по конспектам лекций, учебной и научной литературе). – для закрепления и систематизации знаний: 2. Работа с тестами для самопроверки. 3. Создание глоссария по теме.
Роль протеомики в оценке патологических состояний.	– для формирования умений: написание рефератов (эссе).

Заполнить таблицы (использовать материалы учебника, лекции)

«Методы фракционирования и очистки белков»

Метод	Принцип действия	Применение в медицине
Диализ
Высаливание
Электрофорез
Хроматография

«Классификация сложных белков»

Класс сложных белков	Простетическая группа	Биологическая функция

Задания для самоконтроля подготовки к практическому занятию (тесты):

1. Установите соответствие

а. Первичная структура

б. Вторичная структура

в. Третичная структура

1) стабилизируется водородными связями между атомами пептидного остова

2) в ее формировании принимают участие гидрофобные взаимодействия радикалов

3) фиксируется ковалентными связями между аминокислотами

2. Выберите правильный ответ. В изоэлектрической точке белок:

а) имеет наименьшую растворимость б) обладает наибольшей степенью ионизации

в) является катионом г) является анионом

д) денатурирован

3. Выберите правильный ответ. Пептид, плохо растворимый в воде:

а) Глу-Цис-Лиз б) Гли-Асп-Фен в) Арг-Сер-Про г) Мет-Ала-Лей

4. Выберите правильный ответ. Пептид, лучше других растворимый в воде (рН 7,0):

а) Асп-Тре-Лиз б) Асп-Мет-Фен в) Про-Сер-Ала г) Цис-Гли-Три

5. Выберите правильный ответ. Незаменимыми аминокислотами являются:

а) лиз, три, фен б) сер, гли, гис

в) асп, ала, тре г) про, оксипро, арг

6. Выберите правильный ответ. Препятствует образованию α-спирали аминокислота

а) аланин б) серин

в) валин г) пролин

7. Выберите один неправильный ответ. Гидрофобные радикалы аминокислот чаще всего располагаются:

а) внутри глобулярных цитозольных белков

б) в местах контактов протомеров олигомерных белков

в) на поверхности цитозольных белков

г) на поверхности интегральных мембранных белков

8. Выберите правильный ответ. Вторичная структура природных белков представлена:

а) только α – спиралью б) только ß - структурой

в) аморфными участками, α-спиралями, ß-структурами г) α-спираль и ß-структура

9. Установите соответствие:

А. Первичная структура

Б. Вторичная структура

В. Третичная структура

Г. Супервторичная структур

Д. Четвертичная структура

1) порядок чередования аминокислот, соединенных пептидной связью

2) пространственная структура, образованная водородными связями, возникающими между атомами пептидного остова 3) специфический порядок чередования вторичных структур

10. Выберите одно наиболее полное утверждение. Простетическая группа - это:

а) неорганическая часть белка

б) органическая часть белка

в) присоединенное к белку лекарственное вещество

г) лиганд, присоединяемый к белку при функционировании

д) небелковая часть, прочно связанная с активным центром белка

11. Выберите правильный ответ. В процессе функционирования белковые молекулы:

а) сохраняют жестко фиксированную пространственную конформацию

б) происходит существенное изменение пространственной структуры

в) претерпевают небольшие конформационные изменения

12. Выберите правильный ответ. При денатурации белка не происходит:

а) нарушения четвертичной структуры

б) нарушения третичной структуры

в) нарушения вторичной структуры

г) гидролиза пептидных связей

д) диссоциации протомеров

13. Выберите правильный ответ. Коллаген – единственный белок, в состав которого входит

а) орнитин б) аргинин в) изолейцин г) 5-окситриптофан д) оксипролин

14. Установите соответствие:

1) мономерный белок А. Миоглобин

2) гемопротеин Б. Гемоглобин

3) олигомерный белок В. Оба

4) альбумин Г. Ни один

15. Выберите один неправильный ответ. В HbS (серповидно-клеточная анемия):

а) на поверхности находится гидрофобная аминокислота

б) нарушения затрагивают α-цепи гемоглобина

в) образуется участок, склонный к агрегации г) содержится 4 гема

16. Выберите правильный ответ. Наибольшие изменения в структуре и свойствах гемоглобина произойдут при мутации, связанной со следующей заменой аминокислот:

а) глутаминовая кислота – аспарагин

б) глутаминовая кислота – лизин

в) глутаминовая кислота – аргинин

г) глутаминовая кислота – валин

17. Выберите правильный ответ. Следствием нарушения первичной структуры гемоглобина является:

а) железодефицитная анемия б) метгемоглобинемия

в) гипопротеинемия г) серповидно-клеточная анемия

18. Выберите правильный ответ. Первичные протеинопатии возникают в следствии

а) гемодиализа

б) дефицита незаменимых аминокислот

в) действия денатурирующих факторов

г) мутаций в ДНК

19. Выберите правильные ответы. Белки шапероны:

а) защищают синтезированные белки от агрегации

б) принимают участие в ренативации белка

в) катализируют процесс образования дисульфидных связей

г) участвуют в образовании пептидных связей

д) вызывают диссоциацию субъединиц

20. Выберите правильный ответ. Протеинурия – это

а) появление аномальных белков в организме

б) изменение конформации белковой молекулы

в) повышение белка в плазме крови

г) наличие белка в моче

Литература:

а) обязательная

1. Биологическая химия: Учебник/Е.С, Северин, Т.Л. Алейникова и др.- М.: ООО

« Медицинское информационное агентство», 2008. - 368 с.

2. Биохимия: Учебник / Под ред. Е.С. Северина. - М.: «ГЭОТАР-МЕД», 2003 – 784 с.

3. Биохимия: Учебник / Под ред. Е.С. Северина, А.Я. Николаева, 3 изд. - М.: «ГЭОТАР», 2005 – 441 с.

4. Биохимия с упражнениями и задачами: Учебник/Под ред. Е.С.Северина.- М.: «ГЭОТАР», 2008 – 384 с.

5. Биохимия с упражнениями и задачами: Учебник/Под ред. Е.С.Северина.- М.: «ГЭОТАР», 2011 – 624 с.

6. Николаев А.Я. Биологическая химия. – М.:«Медицинское информационное агентство». – 2004. -566 с.

7. Щербак И.Г. Биологическая химия: Учебник. – СПб.: «Издательство СПбГМУ», 2005. – 480 с.

б) дополнительная

1. Хасина М.А. Словарь-справочник по клинической биохимии – Владивосток: «Медицина ДВ», 2008.

2 . Хасина М.А., Артюкова О.А., Хасина М. Ю. Витамины и минеральные вещества в жизни человека – Владивосток: «Медицина ДВ», 2008. – 102 с.

3. Интернет-ресурсы (http://www.biblioclub.ru/. http://www.studmedlib.ru/ и др.).

Практическое занятие № 3

Тема: «Строение и функции ферментов. Механизм ферментативного катализа. Классификация и номенклатура ферментов»

Мотивация: знания химической природы ферментов, механизма их действия необходимо для понимания природы биокатализа и изучения свойств ферментов.

Общая цель:научиться применять знания о строении, свойствах, функциях ферментов и ферментном составе органов и плазмы крови при последующем изучении особенностей метаболизма органов и систем, а также для решения вопросов диагностики, профилактики и лечения болезней, связанных с нару­ше­нием функционирования ферментов. Полученные по данной теме знания формируют профессиональные компетенции (ПК-9, ПК-15), необходимые в последующем для изучения вопросов клинической направленности.

Конкретные цели и задачи. В результате изучения темы студенты должны:

- знать особенности строения ферментов и особенности ферментативного катализа; виды специфичности ферментов; основы классификации ферментов; классы ферментов (примеры катализируемых реакций); строение кофакторов и коферментов, их роль в катализе; основы ферментативной кинетики; единицы активности ферментов.

- уметьобъяснять свойства ферментов и особенности ферментативного катализа; определять принадлежность ферментов к определенному классу (подклассу) в соответствии с номенклатурой; рассчитывать активность ферментов и оценивать сродство ферментов к субстрату.

- владеть медико-функциональным понятийным аппаратом (терминами): ферменты (энзимы), кофактор, кофермент, ингибитор, органо­­специфические ферменты, изоферменты.

Контрольные вопросы:

1. Строение и функции ферментов. Общие представления о катализе. Механизм ферментативного катализа.

2. Зависимость активности ферментов от температуры и рН среды, количества фермента и субстрата. Единицы активности ферментов. Специфичность действия ферментов.

3. Кинетика ферментативных реакций. Уравнение и график Михаэлиса-Ментен. Преобразование Лайнуивера-Бэрка.

4. Металлоферменты и ферменты, активируемые металлами. Кофакторы и коферменты.

5. Классификация и номенклатура ферментов. Изоферменты.

Задания для самостоятельной работы студентов:

Разделы и темы для самостоятельного изучения	Виды и содержание самостоятельной работы
Строение и функции ферментов. Общие представления о катализе. Механизм ферментативного катализа. Кинетика ферментативных реакций. Уравнение и график Михаэлиса-Ментен.	– для овладения знаниями: 1. Конспектирование первоисточников и другой учебной литературы; проработка учебного материала (по конспектам лекций, учебной и научной литературе). – для закрепления и систематизации знаний: 2. Работа с тестами для самопроверки. 3.Создание глоссария по теме. – для формирования умений: 4. Решение задач.
Классификация и номенклатура ферментов. Изоферменты.	– для закрепления и систематизации знаний: заполнить таблицу «Классификация ферментов»
Металлоферменты и ферменты, активируемые металлами. Кофакторы и коферменты.	– для закрепления и систематизации знаний: переписать таблицу в рабочую тетрадь.

Заполнить таблицу (использовать материалы учебника)