Тип Міксоспоридії (Myxozoa)
Це паразити риб чи малощетинковых хробаків. Відомо більш 875 видів Міксоспоридій. Спори Міксоспоридій різноманітні за формою, але завжди представляють багатоклітинні утворення з полярними капсулами. З двох кліток утворяться дві стулки спори, із двох інших — капсули з закрученою полярною ниткою, і ще два ядра містяться в амебоїдному зародку. Спори Міксоспоридій із хворої риби попадають у воду, а потім заковтуються іншою рибою. У кишечнику риби полярні капсули вистрілюють і нитки втикаються в стінку кишки. Потім стулки спори відкриваються й амебоїдний зародок із двома ядрами проникає через епітелій у кров. Зародки по кров'яному руслу попадають під шкіру чи в інші тканини й органи, де спочатку два ядра зливаються і зародок стає диплоїдним, а в результаті розподілу ядер перетвориться в багатоядерний плазмодій з ядерним дуалізмом, у якому незабаром знову утворяться спори.
Ядра плазмодіїв диплоїдні, тільки при утворенні спор відбувається мейоз, і всі ядра багатоклітинної спори гаплоїдні. Після влучення двохядерного амебоидного зародка в тіло хазяїна відбувається злиття його ядер з відновленням диплоїдного стану ядра. Злиття двох гаплоїдних ядер в одній зародковій клітці одержало назву автогамії. Таким чином, на відміну від Споровиків, що велику частину циклу є гаплонтами, крім зиготи, у життєвому циклі миксоспоридий превалює стан диплонта (крім спор з амебоїдним зародком).
Міксоспоридій — тканинні паразити риб і завдають серйозної шкоди рибному господарству. Вони паразитують переважно в шкірі риб, утворюючи жовна і пухлини. У цих пухлинах знаходяться дорослі багатоядерні плазмодії Міксоспоридій, розміром від декількох мікрометрів до двох сантиметрів.
Тип Мікроспоридії (Microspora)
Мікроспоридії — внутрішньоклітинні паразити комах і деяких інших безхребетних, рідше хребетних тварин. Відомо близько 800 видів Мікроспоридій. Спори Мікроспоридій — одноклітинне утворення з 1-2 ядрами і з укрученою полярною ниткою. У них відсутній статевий процес, рідше спостерігається автогамія.
Мікроспоридії — самі дрібні найпростіші (4—6 мкм). Вони не шляхом, утворючи ланцюжок дрібних клітин усередині клітки хазяїна. Зараження тварин відбувається при поїданні ним спор Мікроспоридій. У кишечнику спори розбухають і з них вистрілює полярна нитка, що втикається в стінку кишки хазяїна. Зі спори зародок по каналі нитки попадає усередину кишкової клітини, де розмножується нестатевим шляхом, утворюючи ланцюжка клітин. Надалі з них утворяться одноклітинні спори з полярною ниткою. Після руйнування клітин хазяїна спори попадають у просвіт кишечнику і виносяться назовні. Амебоїдний зародок з одним ядром, що знаходиться у спорі, перетерплює поділ ядра надвоє з наступним їхнім злиттям (автогамія).
Деякі Мікроспоридії завдають господарської шкоди. Так, Nosema apis уражає клітки кишечнику бджіл, а N. bombycis патогенна для гусениць шовковичного шовкопряда і викликає захворювання — пебрину. Інші Мікроспоридії, що паразитують в організмі шкідливих комах, використовуються при біологічному захисті рослин від шкідників.