- •Предисловие
 - •Глава 1. Аминокислоты и белки
 - •1.1 Общая характеристика
 - •1.2 Классификация аминокислот
 - •1.3 Модификация аминокислот
 - •1.4 Ионизация аминокислот
 - •1.5 Пептидная связь
 - •1.6 Пептиды и белки
 - •1.7 Функции белков
 - •1.8 Уровни структурной организации белков
 - •А Первичная структура белка
 - •Б Вторичная структура белка
 - •В Третичная структура белка
 - •Д Четвертичная структура белка
 - •1.9 Глобулярные и фибриллярные белки
 - •А Кератин
 - •1.10 Простые и сложные белки
 - •1.11 Денатурация и ренатурация белков
 - •1.12 Методы работы с белками
 - •А Очистка и выделение белка
 - •Б Высаливание
 - •В Диализ
 - •Д Аналитические методы работы с белками
 - •Термины
 - •Вопросы к семинарскому занятию (1-я часть)
 - •Вопросы к семинарскому занятию (2-я часть)
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - • Аминокислоты
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 2. Ферменты
 - •2.1 Общая характеристика
 - •2.2 Номенклатура ферментов
 - •2.3 Свойства ферментов
 - •2.4 Строение фермента
 - •2.5 Специфичность ферментов
 - •А Модель «ключ-замок»
 - •Б Модель индуцированного соответствия
 - •2.7 Термодинамика ферментативных реакций
 - •2.8 Кинетика ферментативных реакций
 - •А Вывод уравнения Михаэлиса-Ментен (по Бергу)
 - •В Уравнение Лайнуивера-Берка
 - •2.9 Механизмы ферментативного катализа
 - •2.10 Влияние факторов среды на скорость протекания ферментативной реакции
 - •А Концентрация субстрата
 - •2.12 Мультисубстратные реакции
 - •А Последовательный механизм
 - •2.13 Ингибирование ферментов
 - •Б Бесконкурентные ингибиторы
 - •В Неконкурентные ингибиторы
 - •2.14 Кооперативные взаимодействия внутри молекул ферментов
 - •А Параллельная модель
 - •2.15 Аллостерическая регуляция активности ферментов
 - •2.16 Регуляция активности ферментов с помощью ковалентной модификации
 - •2.17 Анти-, мульти- и изоферменты
 - •2.18 Ферменты в медицине
 - •А Энзимодиагностика
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию (1-я часть)
 - •Вопросы к занятию (2-я часть)
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 3. Нуклеиновые кислоты
 - •3.1 Общая характеристика
 - •3.2 Строение нуклеотида
 - •3.3 Первичная структура ДНК
 - •3.4 Вторичная структура ДНК
 - •3.5 Денатурация и ренатурация ДНК
 - •3.6 Третичная структура ДНК
 - •3.7 Четвертичная структура ДНК
 - •3.8 Виды РНК и их функции
 - •3.9 Первичная структура РНК
 - •3.10 Вторичная структура РНК
 - •3.11 Третичная структура РНК
 - •3.12 Четвертичная структура РНК
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 4. Репликация
 - •4.1 Общая характеристика
 - •4.2 Инициация репликации у прокариот
 - •4.3 Элонгация репликации у прокариот
 - •Б Механизм ферментативной реакции
 - •4.4 Терминация репликации у прокариот
 - •4.5 Репликация у эукариот
 - •4.6 Проблемы репликации
 - •Б Проблема высокой точности процесса
 - •4.7 Плазмиды
 - •В Типы плазмид
 - •Д Механизмы репликации кольцевых плазмид
 - •4.8 Репликация вирусов
 - •Б Репликация генома РНК-вирусов
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 5. Транскрипция
 - •5.1 Организация генетической информации
 - •5.2 Общая характеристика транскрипции
 - •5.3 Гипотеза Жакоба и Моно
 - •5.4 Строение РНК-полимераз
 - •5.5 Инициация транскрипции у прокариот
 - •5.6 Элонгация транскрипции у прокариот
 - •5.7 Терминация транскрипции у прокариот
 - •5.8 Инициация транскрипции у эукариот
 - •5.9 Элонгация транскрипции у эукариот
 - •5.10 Терминация транскрипции у эукариот
 - •А Кэпирование
 - •Б Полиаденилирование
 - •В Сплайсинг
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 6. Трансляция
 - •6.1 Общая характеристика
 - •6.2 Свойства генетического кода
 - •6.3 Основные этапы биосинтеза белка
 - •А Этап 1. Активация аминокислот
 - •Д Этап 5. Фолдинг и посттрансляционная модификация
 - •6.4 Рибосомы
 - •6.5 Инициация у прокариот
 - •6.6 Инициация у эукариот
 - •6.7 Элонгация у прокариот
 - •6.8 Элонгация у эукариот
 - •6.9 Терминация у прокариот
 - •6.10 Терминация у эукариот
 - •6.11 Гипотеза «качания»
 - •6.12 Фолдинг и посттрансляционная модификация белков
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 7. Регуляция биосинтеза белка
 - •7.1 Регуляция экспрессии генов у прокариот
 - •В Катаболическая репрессия. Лактозный оперон
 - •Д Аттенуация. Триптофановый оперон
 - •Е «Сильные» и «слабые» промоторы
 - •Ж σ-Субъединица РНК-полимеразы
 - •7.2 Регуляция экспрессии генов у эукариот
 - •Хроматин-перестраивающие комплексы
 - •Архитектурные белки высокомобильной группы
 - •Ковалентная модификация гистонов
 - •Метилирование ДНК
 - •В Регуляция с помощью факторов транскрипции
 - •7.3 Регуляция на уровне трансляции у про- и эукариот
 - •А Дискриминация мРНК
 - •Б Трансляционная репрессия
 - •7.4 Другие механизмы регуляции у эукариот
 - •Б РНК-интерференция
 - •Интерференция с помощью малых интерферирующих РНК
 - •Интерференция с помощью микроРНК
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - • Регуляция на уровне транскрипции (прокариоты)
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 8. Мутации и репарация
 - •8.1 Мутации
 - •8.2 Классификация мутаций по вызвавшим их причинам
 - •8.3 Классификация мутаций по степени изменений генома
 - •8.4 Классическая классификация
 - •8.5 Репарация
 - •А Прямая репарация
 - •8.6 Эксцизионная репарация оснований (BER)
 - •8.7 Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER)
 - •8.8 Мисметч репарация
 - •8.9 Репарация двунитевых разрывов
 - •8.10 Негомологичное соединение цепей ДНК при двунитевых разрывах
 - •8.11 SOS-репарация (SOS-ответ)
 - •8.12 Рекомбинационная репарация
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 9. Иммунитет и антитела
 - •9.1 Иммунитет: его виды и элементы
 - •9.2 Врожденный (неспецифический) иммунитет
 - •В Химические медиаторы врожденного иимунитета
 - •Е Классический путь активации комплемента
 - •Ж Альтернативный путь активации комплемента
 - •З Активация терминальных компонентов комплемента
 - •И Как фагоциты отличают чужеродные клетки от «своих»?
 - •9.3 Приобретенный (специфический) иммунитет
 - •А T-лимфоциты
 - •В Антитела
 - •Е Вторичный иммунный ответ
 - •Ж Активация гуморального иммунитета
 - •9.4 Группы крови
 - •9.5 Трансфузионные реакции
 - •9.6 Правила переливания
 - •9.7 Резус-фактор (Rh)
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 10. Биологические мембраны
 - •10.1 Строение биомембран
 - •В Липиды биомембран
 - •10.2 Функции мембран
 - •10.3 Мембранный транспорт
 - •10.4 Эндо- и экзоцитоз
 - •10.5 Трансмембранная передача сигнала
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 11. Энергетический обмен
 - •11.1 Энергия в клетке
 - •11.2 Дыхательная цепь митохондрий
 - •11.3 Сопряжение дыхания и окислительного фосфорилирования
 - •11.4 Разобщение дыхания и окислительного фосфорилирования
 - •Термины
 - •Вопросы к занятию
 - •Дополнительные вопросы и ключевые слова
 - •Вопросы для самопроверки
 - •Глава 12. Введение в метаболизм
 - •12.1 Общая характеристика
 - •А Метаболические пути
 - •Б Метаболиты
 - •В Гомеостаз
 - •12.2 Функции метаболических путей
 - •А Образование энергии
 - •Б Катаболизм органических соединений
 - •Переваривание
 - •Гликолиз
 - •Окисление жирных кислот
 - •Катаболизм аминокислот
 - •В Синтез органических соединений и предшественников макромолекул
 - •Глюконеогенез: синтез глюкозы
 - •Синтез жирных кислот
 - •Синтез гема
 - •Креатинфосфат
 - •Гликоген
 - •Жиры или триацилглицеролы
 - •Д Выведение потенциально опасных соединений
 - •Цикл мочевины
 - •Синтез желчных кислот
 - •Катаболизм гема
 - •Е Образование регуляторных молекул
 - •12.3 Ключевые положения всех метаболических путей
 - •А АТФ — донор энергии для синтеза
 - •В Эссенциальные органические соединения
 - •Д Взаимосвязи метаболических путей
 - •Е Нелинейность метаболических путей
 - •Ж Локализация метаболических путей в клетке
 - •З Тканеспецифичность метаболических путей
 - •И Метаболизм при голодании
 - •12.4 Интеграция метаболизма
 - •А Основные физиологические состояния организма и роль различных органов в интеграции метаболизма
 - •Состояние насыщения
 - •Состояние голодания
 - •Б Интеграция метаболизма в различных физиологических состояниях
 - •Состояние голодания
 - •Продолжительное голодание
 - •Состояние насыщения
 - •Физические нагрузки
 - •В Регуляция метаболизма
 - •Инсулин
 - •Глюкагон
 - •Адреналин
 - •Гидрокортизон
 - •Адипоцитокины
 - •Рекомендуемая литература
 - •Приложение 1. Аминокислоты и белки
 - •Классификация аминокислот
 - •Приложение 2. Ферменты
 - •Строение химотрипсина
 - •Приложение 3. Нуклеиновые кислоты
 - •Приложение 4. Репликация
 - •Приложение 5. Транскрипция
 - •Приложение 6. Трансляция
 - •Приложение 7. Регуляция биосинтеза белка
 - •Приложение 8. Мутации и репарация
 - •Приложение 9. Иммунитет и антитела
 - •Приложение 10. Биологические мембраны
 - •Приложение 11. Энергетический обмен
 - •Оглавление
 
52  | 
	Глава 2  | 
	Ферменты  | 
График, соответствующий этому уравнению, имеет вид прямой, а потому удобнее для определения Vmax (пересечение с осью ординат) и Km (пересечение с осью абс-
цисс) (см. Рис. 35 ):
Рис. 35. График Лайнуивера-Берка
С помощью графика находим значения константы Михаэлиса и максимальной скорости реакции:
x  | 
	1  | 
	y  | 
	1  | 
|
  | 
||||
K  | 
	
  | 
	V  | 
||
  | 
	m  | 
	
  | 
||
  | 
	
  | 
	
  | 
	max  | 
|
K  | 
	
  | 
	
  | 
	1  | 
	V  | 
	
  | 
	1  | 
  | 
	
  | 
|||||
m  | 
	
  | 
	
  | 
||||
  | 
	
  | 
	x  | 
	max  | 
	
  | 
	y  | 
|
  | 
	
  | 
	
  | 
	
  | 
	
  | 
2.9 Механизмы ферментативного катализа
Каталитические механизмы ферментов и химических катализаторов схожи.
Воснове лежат:
—Общий кислотно-основный катализ: ускорение реакции достигается путём переноса протона; этот тип катализа происходит при значениях pH близких к нейтральным. Аминокислоты, входящие в состав активного центра: аспартат, глутамат, гистидин, цистеин, тирозин, лизин.
—Ковалентный катализ: между субстратом и ферментом образуются ковалентные связи при достижении переходного состояния. Обычно ковалентная связь образуется между нуклеофильной группой фермента (донор электронов) и электрофильной группой субстрата.
—Ионный катализ: примерно 1/3 всех ферментов нуждается в ионах металлов для ускорения реакций: Fe2+, Fe3+, Cu2+, Mn2+, Co2+. Ионы металлов
участвуют в катализе тремя путями:
