- •Ход работы. К 5 каплям раствора белка добавить 5 капель 0,1%-ного раствора нингидрина, кипятить 1-2 мин - появляется розово-фиолетовое или сине-фиолетовое окрашивание.
- •ЗАНЯТИЕ 2 («Хроматографическое разделение аминокислот. Высаливание белков. Количественное определение белков»)
- •График зависимости оптической плотности растворов белка в пробах с сульфосалициловой кислотой от концентрации белка
- •1. Как узнать, осажден ли полностью белок из биологической жидкости после 50% насыщения её сульфатом аммония?
- •Дополнительные сведения: жидкость после 50% насыщения сульфатом аммония и фильтрования прозрачна.
- •Аудиторная работа
- •Лабораторная работа (Определение компонентов фосфо-
- •ЗАНЯТИЕ 4 (итоговое)
- •Занятие 5 (Влияние температуры и реакции среды на каталитическую активность ферментов. Специфичность ферментов)
- •Аудиторная работа.
- •1. Выявление ускоряющего и замедляющего влияния на ферменты.
Аудиторная работа.
Лабораторная работа (активаторы и ингибиторы ферментативных реакций)
1. Выявление ускоряющего и замедляющего влияния на ферменты.
Хлорид натрия - активатор амилазы слюны, ингибиторы амилазы ионы серебра, соли меди, свинца.
Ход работы. В три пробирки внести по 3 мл слюны, разведенной 1:3 водой. В первую пробирку добавить 2 капли 1%-ного раствора хлорида натрия, во вторую - 1 каплю 1%-ного раствора сернокислой меди, в третью - каплю воды (контроль). Затем во все пробирки внести по 5 капель 1%-го раствора крахмала и оставить при 370С на 3 мин, после чего внести во все пробирки по одной капле раствора Люголя и сравнить интенсивность появляющегося синего окрашивания, характерного для крахмала. Выявить (по интенсивности окраски), в какой из пробирок произошел наиболее полный распад крахмала. Напомним, что интенсивность окра-
ски пропорциональна концентрации крахмала.
2. Количественное определение активности амилазы мочи (диа-
стазы). Нормальная активность диастазы в моче здоровых людей невелика - от 4 до 64 ед. (за единицу принимают то её количество, которое за 30 мин при 380С полностью расщепляет 1 мл 0,1%-ного раствора крахмала).
При некротических процессах или воспалительных заболеваниях поджелудочной железы, при воспалении околоушной железы увеличивается активность диастазы в крови, и, как следствие, в моче. Это наблюдение является вспомогательным диагностическим признаком.
Ход работы. В десять пронумерованных пробирок внести по 1 мл 0,14 н раствора хлорида натрия. В одну из пробирок внести 1 мл исследуемой мочи, смешать и затем перенести 1 мл смеси во вторую пробирку, смешать, перенести в третью и т. д. Из последней (десятой) пробирки 1 мл смеси вылить. Во все пробирки внести по 2 мл 0,1%-ного раствора крахмала и по 1 мл 0,14 н раствора хлорида натрия, смешать, поместить на водяную баню (450С) на 15 мин.
Одновременно и быстро охладить все пробирки, поместив их в холодную воду и добавить в каждую по одной капле раствора Люголя. Жидкость окрашивается в желтоватый цвет йодом, в различные оттенки розового (декстрины) и фиолетового (декстрины с большим размером молекул), а также в синий цвет (крахмал).
Учет результата. Рассчитать количество мочи в последней (слева направо) пробирке, сохранившей желтоватую окраску (полное расщепление крахмала).
Допустим, это пробирка № 4, моча в которой разведена в 16 раз по сравнению с пробиркой 1, где было 0,5 мл мочи. Следовательно, в пробирке 4-й мочи содержится 0,03125 мл (0,5/16). Это количество мочи вызвало расщепление 2 мл 0,1%-го раствора крахмала, а 1 мл мочи способен
22
расщепить х мл, т.е. 0,03125 мл мочи расщепило 2 мл 0,1%-ного раствора
крахмала, а 1,0 мочи может расщепить хмл крахмала. Составляем уравнение и рассчитаем значение величины Х:
Х = |
2х1 |
= 64 мл 0,1 %-ного раствора крахмала, |
|
0,03125 |
|||
|
|
следовательно, в моче содержится 64 ед. амилазы на 1 мл мочи
3адание: каждый студент получает результаты анализа двух проб мочи и определяет содержание диастазы в одном мл мочи, выражая в единицах. Результат сопоставить с нормальными значениями.
Выполнить следующее:
1.При определении активности фермента получены данные, представленные в таблице:
рН |
1,0 |
1,2 |
1,5 |
2,0 |
3,0 |
4,0 |
5,0 |
6,0 |
7,0 |
8,0 |
Актив- |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
ность, ед. |
12 |
18 |
25 |
38 |
31 |
27 |
21 |
17 |
11 |
2,0 |
Построить график зависимости активности энзима от рН, высказать предположение о том, какой фермент находится в растворе, определить принадлежность фермента к классу и группе соответственно высказанному предположению.
2.Оптимум рН исследуемого фермента 6,9 - 7,0, субстрат фермента - высокомолекулярный природный полимер, обнаруживаемый по характерному окрашиванию в присутствии йода; продукты взаимодействия фермента с субстратом окрашиваются при нагревании в присутствии сернокислой меди в красно-кирпичный цвет.
Назовите фермент, субстрат, реагент, используемый для обнаружения субстрата, продукты гидролиза субстрата и определите принадлежность фермента к классу, группе.
3.Субстрат исследуемого фермента образует белый осадок при нагревании, дает положительную биуретовую реакцию. После длительной инкубации с ферментом при разных значениях рН интенсивность биуретовой реакции снизилась, увеличилось число свободных аминогрупп, усилилась положительная реакция с нингидрином. Особенно заметными эти изменения были при рН 8,0 - 9,0.
Назовите субстрат, фермент, определите принадлежность фермента к классу и группе. Почему увеличилось число свободных аминогрупп и нингидриновая реакция: стала интенсивнее?
4.За единицу активности амилазы слюны принимают то ее количество, которое расщепляет за 30 мин при 380С 1 мл 0,1%-ного раствора крахмала. При инкубации разведенной слюны обнаружилось, что в восьмой
23
пробирке реактив Люголя окрашивает жидкость в желтый цвет, а в девятой появился розовый оттенок. Разведение слюны готовили в геометрической прогрессии со знаменателем, равным двум (в пробирке 1 был 1 мл слюны). Количество раствора крахмала везде было одинаковым - 1 мл. Сколько единиц активности амилазы содержит 1 мл исследуемой слюны?
5.Исследуемый фермент расщепляет внутримолекулярные связи (исключая связи С-С) согласно реакции А + Б +Н2О> АН+БОН.
К какому классу относится фермент?
6.Фермент расщепляет С - С связи негидролитическим путем. Назовите класс, к которому относится фермент.
8.К какому классу относится фермент, катализирующий превращение молекулы глюкозы в молекулу фруктозы?
9.Назовите класс, к которому относится фермент, катализирующий реакции типа СН3 - СО - СООН + CО2 → HООC - СН2 – СО - СООН.
ЗАНЯТИЕ 7 (Введение в обмен веществ и энергии. Биологическое окисление).
Цель: 1. Познакомиться с определением понятия «Обмен веществ», убедиться в том, что обмен веществ – совокупность всех химических превращений в организме; познакомиться с терминологией, используемой при изучении настоящего раздела, уяснить суть понятий «анаболизм» и «катаболизм» и их отличия от терминов синтез и распад. 2. Познакомиться с историей развития представлений о биологическом окислении и современным понятием «биологическое окисление», с представлением о формах биологического окисления, роли свободных радикалов кислорода, значении свободнорадикального окисления.
Студент должен знать:
1.Что включает понятие «Обмен веществ».
2.Как сочетаются в обменных процессах (анаболических и катаболических) реакции синтеза и распада.
3.Что значит «метаболический путь», виды метаболических путей.
4.Чем отличается биологическое окисление от окисления в неживой природе.
5.В чем заключается биологический смысл окисления в организмах.
6.Структуру макроэргических соединений.
7.Что представляет собой свободнорадикальное окисление.
24
.Студент должен уметь:
1. Отличать понятия катаболизм и анаболизм от понятий синтез и де-
струкция (расщепление).
2.Охарактеризовать основные этапы метаболизма
3.Составить схему круговорота энергии и веществ в живой природе с учетом аутотрофных и гетеротрофных организмов.
4.Изобразить структурные формулы важнейших макроэргических соединений живой природы.
5.Составить схему экспериментального выявления окислительно-вос- становительных свойств у исследуемого вещества (на примере тирозина)
Студент должен получить представление:
1)об общих чертах метаболических процессов,
2)о важнейших источниках энергии в животном организме,
3)о значении свободнорадикального окисления как физиологического процесса,
4)о патологических состояниях, связанных с гипероксидацией,
5)о значении антиоксидантов в комплексе терапевтических мероприятий.
Сведения из базовых дисциплин, необходимые для изучения темы:
1)основные положения термодинамики,
2)понятия о фазовых реакциях,
3)сведения о катализе,
5)сведения о процессах фотосинтеза в клетке,
6)современная номенклатура химических соединений.
Аудиторная работа.
Лабораторная работа (Оксидоредуктазы)
Обнаружение тирозиназы в картофеле. Фермент тирозиназа (или со-
гласно классификации моноамин: О2-оксидоредуктаза дезаминирующая)
содержится в тканях растений и животных, относится к числу медьсодержащих белков, катализирует, как следует из рационального названия, окислительное дезаминирование моноаминов согласно реакции:
25
О2+Моноамин + Н2О→Альдегид +Аммиак + Н2О2.
Ворганизме тирозиназа катализирует превращение адреналина в адренохром - бурый пигмент.
Ход работы. Примерно 1 г картофеля измельчить скальпелем и растереть
вступке с 3 мл дистиллированной воды. Гомогенат фильтровать через двойной слой марли - в фильтрате содержится тирозиназа.
Вдве пробирки внести по 1 мл фильтрата. Содержимое одной пробирки нагреть до кипения и поддерживать кипение 2 мин (инактивация
фермента). В обе пробирки внести по 5 капель 0,1%-ного раствора адреналина, смешать и инкубировать при 400С, периодически встряхивая и наблюдая за изменением окраски.
Жидкость в пробирке с активным (не подвергшимся нагреванию) фильтратом розовеет, затем принимает бурую и темную окраску. Это связано с окислительным дезаминированием, приводящим к образованию пигментов. В пробирке, где фермент инактивирован кипячением, изменение окраски не наблюдается, т. е. адреналин не подвергается превращениям.
Аргументировано и кратко ответить на следующее:
1.Может ли осуществиться окисление СНЗ - СН2 - СН2 - ОН в СН3 - СН2-СН=О в бескислородной среде? Какие условия для этого необходимы? Написать схему реакции.
2.Может ли и при каком условии в бескислородной среде произойти
окисление по типу СН3 - СН2 - СН=О → СН3 - СН2 - СООН? Укажите необходимые компоненты, составьте схему реакции.
3.Является ли кислород исключительным (единственным) конечным акцептором водорода в цепи тканевого дыхания и вообще в биологическом окислении? Почему эволюция «избрала» кислород в качестве конечного акцептора водорода?
4.Реакция СН3 - СН =О → СН3 - СООН осуществлена в бескислородной среде. Как объяснить появление двух атомов кислорода в продукте реакции, в то время как исходный продукт содержит только один атом кислорода?
5.Какие компоненты, необходимые для осуществления изображенной ниже реакции, отсутствуют в схеме?
СООН - СН2-- СН2 – СООН + 1/2О2 → СООН - СН = СН - СООН+Н2О.
5. Почему окисление в живой природе отождествляли с горением ?
26
6.Описать внешние признаки сходства между горением и процессом окисления в организме.
7.Где в организме осуществляется потребление кислорода ?
8.Назвать предпосылки, обусловившие появление теории активации водорода.
9.Сформулировать понятие «дегидрирование», определить роль кислорода и воды в биологическом окислении, протекающем как процесс дегидрирования.
10.Функция кислорода в дегидрировании (определить с помощью трёх слов).
11.Сформулировать современное положение о биологическом окислении, назвать его виды.
12.Свободнорадикальное окисление в клетке, активные формы кислорода, как ограничивается интенсивность процесса.
ЗАНЯТИЕ 8 («Тканевое дыхание, локализация и участники процесса»)
Цель: ознакомиться с важнейшим механизмом биологического окисления – тканевым дыханием, структурой и локализацией ферментов этого процесса, с механизмами транспорта протонов и электронов по дыхательной цепи, фактором, определяющим направление переноса.
Студент должен знать:
1.В какой роли выступает в процессе тканевого дыхания окисляемый субстрат.
2.Что представляют собой акцепторы-донаторы протонов и электронов в дыхательной цепи, их структуру, последовательность взаимодействия,
3.Чем определяется направление транспорта протонов-электронов; компоненты структуры простетических групп дегидрогеназ, определяющие их способность транспортировать электроны и протоны.
4.Водородтранспортный и электронтранспортный участки дыхательной цепи, множественность форм электронтранспортных компонентов, чем отличаются неаутооксидабельные и аутооксидабельные компоненты.
5.Локализацию энзимов тканевого дыхания, последовательность их расположения во внутренней мембране митохондрии.
27
6.О свойстве внутренней мембраны относительно Н-ионов, структуру и роль протонного канала.
7.Значение некоторых витаминов в транспорте протонов и электронов.
8.Отличия в механизмах дегидрирования насыщенных, ненасыщенных соединений, спиртов, альдегидов, кетонов и аминокислот.
.Студент должен уметь:
1.о ведущей роли биологического окисления в поддержании энергетического обмена,
2.Опознать по структуре кофермента дегидрогеназ их место в дыхательной цепи.
3.Составить схему локализации и функционирования дыхательной цепи.
4.Изобразить схему того структурного компонента митохондрий, в котором располагаются энзимы дыхательной цепи, указать на схеме элементы протонного канала
5.Уметь изображать структурные формулы важнейших макроэргических соединений живой природы.
6.Показать на фрагментах структурных формул насыщенных и ненасыщенных соединений, спиртов, альдегидов и кетонов ход их дегидрирования.
Студент должен получить представление:
1) о значении нарушений биологического окисления в развитии некоторых патологических состояний,
3) о патологических состояниях, ведущих к нарушению энергетического обмена..
Сведения из базовых дисциплин, необходимые для изучения темы:
1)основные положения термодинамики,
2)представления об окислительно-восстановительном потенциале,
3)о принципах определения окислительно-восстановительного потенциа-
ла in vitro.
Аудиторная работа.
28
Лабораторная работа (сопоставление окислительно-восстанови- тельного потенциала рибофлавина и метиленовой сини).
Ход работы. В пробирку внести 4 - 5 капель воды, одну каплю взвеси рибофлавина и по каплям добавлять раствор красителя «метиленовый синий» до появления синего или зеленовато-синего окрашивания раствора. Затем внести в пробирку гранулу цинка и 2 капли концентрированной соляной кислоты. Начинается выделение пузырьков водорода. По мере насыщения раствора водородом окислительно-восстановительный потенциал смеси постепенно снижается, и происходит восстановление рибофлавина и метиленового синего. Восстановление всего имеющегося метиленового синего (Е - 0,11) происходит раньше, чем восстановление значительной части рибофлавина (Е - 0,20), поэтому окраска жидкости переходит последовательно в зеленый, желто-зеленый, желтый и, наконец, блед- но-желтый или розовый цвет.
Бледно-желтую жидкость слить в другую пробирку и наблюдать изменение окраски. Водород в жидкость больше не поступает, а ранее растворенный в ней водород частично уходит в атмосферный воздух, отчасти переносится через рибофлавин и метиленовый синий на кислород воздуха. В связи с этим окислительно-восстановительный потенциал, постепенно повышается. После расходования водорода в растворе начинается окисление восстановленного рибофлавина, он передает водород через метиленовый синий на кислород и приобретает желтую окраску (раствор желтеет). Затем начинается окисление восстановленного (т.е. бесцветного) метиленового синего - раствор становится вначале зеленым, а затем синим.
В протоколе работы записать схему переноса водорода в изучаемой системе.
Дать (приводя ход решения) ответы на следующие задачи или выполнить указанные действия:
1. Соединения А, В, С, Х и Y имеют редокс-потенциалы, равные - 0,39, + 0,22, - 0,37, - 0,35, + 0,28 В соответственно.
В какой последовательности будет происходить перенос электронов в системе, включающей эти соединения (от водородного электрода)?
2. Написать реакции дегидрирования соединений:
а) R-СН2-СН2-R; б) R-СН=О; в) R-СНОН-R; г) R-СН=СН-R.
3.Какие из перечисленных соединений являются субстратом флавиновых
ферментов: глюкоза, сахароза, янтарная кислота, глицериновый альдегид, НАД Н+, НАДФ Н+, глутаминовая кислота?
4.Какие из перечисленных соединений могут служить акцепторами водо-
рода от флавиновых ферментов: О2, НАД, НАДФ, цитохромы, пирови-
ноградная кислота, глутатион, фумаровая кислота?
29
5.Как изменится коэффициент полезного действия (КПД) тканевого дыхания, сопряженного с окислительным фосфорилированием, если в переносе протонов и электронов не участвуют НАД-дегидрогеназы (КПД в условия нормы принять равным 0,4)?
6.Как изменится теплопродукция органа; если при постоянной интенсивности тканевого дыхания в связи с появлением разобщающего фактора коэффициент Р/О снизился с 3 до 1?
7.Какой элемент отсутствует в уравнении:
СOOH-СН2-СН2-COOH + ? →сукцинатдегидрогеназа→ СООН-CH=CH-СООН + ?
8. Какие элементы отсутствуют в уравнениях:
а) Н2СО + ? → ? + НСООН;
б) ? + 1/2О2 ксантиноксидаза> НСООН + ?
9.Напишите химическое уравнение реакции анаэробного дегидрирования первичного спирта с учетом всех необходимых компонентов.
10.Три названных ниже продукта могут составить окислительно-восста-
новительную цепь: 02, глутаминовая кислота, протеин-ФМН.
Построить цепь в последовательности: донатор - промежуточный акцептор протонов и электронов - конечный акцептор.
11.Как изменится теплопродукция органа, если блокирована НАД-деги- дрогеназа, но сохранена функция, других компонентов дыхательной цепи? В качестве субстрата используется глутаминовая кислота (до повреждения орган продуцировал 50 кал/мин).
12.Коэффициент Р/О исследуемой ткани снизился с 3 до 2 (с 3 до 1). Какой процесс, на каких этапах нарушен в первом и втором случаях?
13.В пробирке создана система, содержащая неповрежденные митохондрии, обеспечивается доступ кислорода, присутствуют достаточные количества АДФ и неорганического фосфата.
Подберите из перечисленных ниже субстратов такие, окисление кото-
рых может обеспечить коэффициент Р/О, равный.2 или 3: глюкоза, гли-
цериновый альдегид, глутаминовая кислота, НАД Н+, НАДФ Н+, янтарная кислота.
30
14. Как изменится концентрация неорганического фосфата и АДФ в системе, содержащей неповрежденные митохондрии и обильно снабжаемой способным к окислению субстратом: 1) в присутствии 2,4-динитрофенола, 2) в отсутствие 2,4-динитрофенола.
Аргументировать ответ
Занятие 9 (итоговое).
При подготовке к занятию в порядке самоконтроля определить с помощью следующих вопросов, усвоены ли Вами разделы «Ферменты» и «Биологическое окисление» (использовать материалы лекций, учебники).
1.Природа и свойства ферментов.
2.Номенклатура и классификация ферментов.
3.Принципы определения и выражения активности ферментов.
4.Кинетика ферментативных процессов; эффекторы ферментативных реакций (ингибиторы и активаторы);
8.Современные представления о биологическом окислении (тканевое дыхание и окислительное фосфорилирование).
9.Ферменты тканевого дыхания – локализация, последовательность размещения, понятия «донатор-акцептор» протонов и электронов, водород- и эелектронтранспортные участки, конечный акцептор электронов и протонов
10.Типы дегидрирования.
11.Механизмы сопряжения и разобщения (фактор сопряжения, разобщающие факторы, коэффициент Р/О).
31