- •ТРАНСЛЯЦИЯ БЕЛКОВ
- •ТРАНСЛЯЦИЯ БЕЛКОВ
- •ТРАНСЛЯЦИЯ БЕЛКОВ
- •ТРАНСЛЯЦИЯ БЕЛКОВ
- •ПОСТТРАНСЛЯЦИОННАЯ МОДИФИКАЦИЯ ФУНКЦИОНАЛЬНЫХ ГРУПП БЕЛКОВ
- •правильность положения дисульфидных мостиков контролируется протеиндисульфид-изомеразой
- •ДВЕ ГРУППЫ ПРОЦЕССОВ ПОСТРАНСЛЯЦИОННОЙ МОДИФИКАЦИИ
- •ЧЕТЫРЕ ОСНОВНЫЕ ГРУППЫ ФУНКЦИЙ БЕЛКОВ, ТРЕБУЮЩИХ ПОСТТРАНСЛЯЦИОННОЙ МОДИФИКАЦИИ БОКОВЫХ РАДИКАЛОВ
- •ЧЕТЫРЕ ОСНОВНЫЕ ГРУППЫ ФУНКЦИЙ БЕЛКОВ, ТРЕБУЮЩИХ ПОСТТРАНСЛЯЦИОННОЙ МОДИФИКАЦИИ БОКОВЫХ РАДИКАЛОВ
- •МОДИФИКАЦИЯ БЕЛКОВ ПУТЕМ ПРИСОЕДИНЕНИЯ ПРОСТЕТИЧЕСКИХ ГРУПП
- •КАРБОКСИЛАЗЫ – перенос одноуглеродного фрагмента в виде СО2 на ацетилСоА, пропионилСоА
- •При прохождении белков по секреторным путям эукариотической клетки происходит уменьшение уровня глутатиона и
- •ДВЕ ГРУППЫ ПРОЦЕССОВ ПОСТРАНСЛЯЦИОННОЙ МОДИФИКАЦИИ
- •ДВЕ ГРУППЫ ПРОЦЕССОВ ПОСТРАНСЛЯЦИОННОЙ МОДИФИКАЦИИ
- •АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ – перенос углеродных фрагментов на СоА через восстановительное ацилирование липоамида в процессах
- •АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ – перенос ацильного фрагмента от одного фермента мультиферментного комплекса к другому
- •Тиоэфиры - серные аналоги сложных эфиров - находят весьма ограниченное применение в классической
- •ЦИТОХРОМ С ОКСИДАЗА – Перенос электронов в мембране митохондрий при окислительном фосфорилировании
- •АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – трансаминирование аминокислот
- •АСПАРТАТ АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – катализирует реакцию переаминирования между оксалоацетатом
- •АСПАРТАТ АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – катализирует реакцию переаминирования между оксалоацетатом
- •ГИСТОНОВЫЙ КОД
- •Модификаций много, а память и время ограничены
- •Реакции нуклеофильного замещения
- •Факторы, влияющие на скорости реакций замещения
- •Факторы, влияющие на скорости реакций замещения
- •Факторы, влияющие на скорости реакций замещения
- •ФОСФОРИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •Главную роль в осуществлении реакций, отвечающих за перестройку всех процессов внутри клетки, приводящих,
- •ФОСФОРИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •ФОСФОРИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- ••Основные этапы передачи сигналов с помощью фосфорилирования
- •Сигнальная
- •Схема передачи сигнала через мембранные рецепторы, ассоциированные с JAK
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ-ОТЩЕПЛЕНИЯ
- •Тетраэдрический механизм нуклеофильного замещения
- •Тетраэдрический механизм нуклеофильного замещения
- •Тиоэфиры - серные аналоги сложных эфиров - находят весьма ограниченное применение в классической
- •Ацилирование белков (ацетилирование белков)
- ••По ацилирующей способности все ацилкоферменты А и в том числе ацетилкофермент А, будучи
- •АЦИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- ••Кроме ацетилирования в природе довольно широко распространено посттрансляционное ацилирование
- •АЦЕТИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- •N-Homocysteinylation of proteins
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ-ОТЩЕПЛЕНИЯ
- •Антибиотики пенициллинового ряда
- •МОДИФИКАЦИЯ БОКОВОГО РАДИКАЛА ЛИЗИНА
- •Убиквитинилирование белков
- •Шапероны – кофакторы убиквитинилированных белков
- •ПОЛИУБИКВИТИНИЛИРОВАНИЕ БЕЛКОВ
- ••При полиубиквитилировании субстрата фрагмент убиквитин, непосредственно связанный с белком-мишенью, ацилируется по остаткам Lys-29,
- •Схема введения остатка (остатков) убиквитина в белок-субстрат. Е1-SH - убиквитин- активирующий фермент, Е2-SH
- ••В зависимости от природы используемого реагента модификация остатков лизина может быть как обратимой,
- •ОБРАТИМОЕ АЦЕТИЛИРОВАНИЕ
- •В зависимости от рН при взаимодействии соединений, содержащих карбонильную группу, реакция может остановиться
- •Сериновые протеазы. Механизм ковалентного катализа.
- •РЕАКЦИИ НУКЛЕОФИЛЬНОГО ПРИСОЕДИНЕНИЯ-ОТЩЕПЛЕНИЯ
- •ХИМИЧЕСКАЯ И ПОСТТРАНСЛЯЦИОННАЯ МОДИФИКАЦИЯ -АМИНОГРУППЫ ЛИЗИНА
- •Что необходимо знать после лекции
- •Что необходимо знать после лекции
АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ – перенос углеродных фрагментов на СоА через восстановительное ацилирование липоамида в процессах окислительного декарбоксилирования -кетокислот
O

(CH2)4
NH
(CH2)4






NH CH CO






S S
АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ – перенос ацильного фрагмента от одного фермента мультиферментного комплекса к другому
-O






NH
O NH |
NH |
|
SH |
|
O |
OH |
|
O
P
O
O
CH2
CH CO






Тиоэфиры - серные аналоги сложных эфиров - находят весьма ограниченное применение в классической органической химии, но играют важную роль в организме.
При всей сложности строения молекулы ацетилкофермента А с позиций химического подхода можно определить, что этот кофермент функционирует как тиоэфир.
ЦИТОХРОМ С ОКСИДАЗА – Перенос электронов в мембране митохондрий при окислительном фосфорилировании
O C |
|
|
|
|
|
|
CH |
CH2 |
|
|
|
|
NH |
S |
CH3 |
CH3 |
|
|
|
|
CH |
||
|
H3C |
|
|
|
|
O C |
|
|
N |
N |
|
CH |
CH2 |
|
Fe |
|
|
|
|
N |
|
||
NH |
S |
|
N |
|
|
|
|
|
|
||
|
CH |
|
|
|
|
|
H3C |
|
|
|
|
|
|
|
CH3 |
CH |
3 |
|
|
|
|
|
|
O
C
O-
C O-
O
ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ – окисление группы –СН2-СН2- до транс-СН=СН-
|
|
|
аденозин |
|
|
O |
O |
|
|
- O P O P O |
|
|
|
O |
O |
|
|
рибитил |
|
N |
N CH2 |
N |
N O |
H2C |
H3C |
N |
NH |
|
|||
NH CH |
CO |
|
O |
|
|
||
АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – трансаминирование аминокислот
P
HC
N
N
HO
(CH2)4






NH CH CO






|
Lys258 |
Arg386 |
|
|
|
|
|
|
|
||
|
NH CO |
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
Arg + |
|
|||
|
NH |
CO |
|
CH |
|
|
|
H |
|
||
|
CH |
|
(CH2)3 |
|
|
H Arg + |
R C COO- |
|
|||
|
(CH2)4 |
|
NH |
(Lys) |
NH2 |
|
(Lys) |
|
|||
|
|
|
+ |
C NH2 |
|
R C COO- |
|
|
|
|
|
O |
H C N |
O- |
H2N |
H C N |
O- |
NH3+ |
|
H C N+ H |
|
||
O P O CH2 |
|
|
|
P |
|
P |
|
O |
- |
||
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
N+ |
CH3 |
|
|
N+ |
CH |
|
|
|
N+ CH3 |
|
|
H |
|
|
|
|
3 |
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
H |
|
|
|
|
H |
|
|
O C O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
O C O |
|
|
O |
C |
O |
|
||
|
CH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
(Asp) |
|
|
(Asp) |
|
|||
|
CH |
|
|
|
|
|
|
||||
NH |
|
|
|
|
|
|
|
||||
CO |
(1) |
|
|
(2) |
|
|
|
(3) |
|
||
Asp222 |
|
|
|
|
|
|
|||||
|
(Lys) |
|
|
|
(Lys) |
|
Arg + |
|
|
|
Arg + |
|
|
H2N: H |
|
Arg |
+ |
|
(Lys) |
H |
R |
||||
|
|
|
NH + |
R C COO- |
|
O: C COO- |
||||||
|
R C COO- |
|
3 |
|
|
H2N: H |
|
|
||||
H |
C |
N |
|
|
|
H |
- |
N+ H |
|
H |
C |
N+ H |
|
+ H |
- |
|
|
P |
C |
O- |
P |
H |
O- |
||
P |
|
O |
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
N |
CH3 |
|
|
|
N |
CH3 |
|
|
N+ |
CH3 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|||
O C O H |
|
|
|
|
O C O H |
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
O C O |
|
||||||
(Asp) |
|
|
|
|
|
(Asp) |
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
(Asp) |
|
||||
|
|
(4) |
|
|
|
|
|
(5) |
(6) |
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
R Arg + |
|
(Lys) |
C COO- |
|
NH3+ |
O |
|
|
||
H2C |
NH2 |
|
O- |
||
P |
N+
CH3
H
O
C O
(Asp)
(7)
АСПАРТАТ АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – катализирует реакцию переаминирования между оксалоацетатом
иглутаматом
•Кофермент в трансаминазе присутствует не в виде свободного альдегида, а в виде внутреннего альдимина с боковой аминогруппой лизина (Lys258). Связанный с ферментом имин обеспечивает более быстрый путь протекания реакции, чем свободный пиридоксальфосфат. Именно структура определяет более высокую активность иминов по сравнению с соответствующими альдегидами. Более основный азот иминов протонируется гораздо сильнее, чем кислород карбонильной группы.
