Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
БИООРГАНИКА / модификация белков_лекция_15_16.ppt
Скачиваний:
53
Добавлен:
06.06.2015
Размер:
5 Мб
Скачать

АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ – перенос углеродных фрагментов на СоА через восстановительное ацилирование липоамида в процессах окислительного декарбоксилирования -кетокислот

O

(CH2)4

NH

(CH2)4

NH CH CO

S S

АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ – перенос ацильного фрагмента от одного фермента мультиферментного комплекса к другому

-O

NH

O NH

NH

 

SH

 

O

OH

 

O

PO

O

CH2

CH CO

Тиоэфиры - серные аналоги сложных эфиров - находят весьма ограниченное применение в классической органической химии, но играют важную роль в организме.

При всей сложности строения молекулы ацетилкофермента А с позиций химического подхода можно определить, что этот кофермент функционирует как тиоэфир.

ЦИТОХРОМ С ОКСИДАЗА – Перенос электронов в мембране митохондрий при окислительном фосфорилировании

O C

 

 

 

 

 

CH

CH2

 

 

 

 

NH

S

CH3

CH3

 

 

 

CH

 

H3C

 

 

 

 

O C

 

 

N

N

 

CH

CH2

 

Fe

 

 

 

 

N

 

NH

S

 

N

 

 

 

 

 

 

CH

 

 

 

 

H3C

 

 

 

 

 

 

 

CH3

CH

3

 

 

 

 

 

O

C

O-

C O-

O

ОКСИДОРЕДУКТАЗЫ – окисление группы –СН2-СН2- до транс-СН=СН-

 

 

 

аденозин

 

 

O

O

 

 

- O P O P O

 

 

O

O

 

 

рибитил

N

N CH2

N

N O

H2C

H3C

N

NH

 

NH CH

CO

 

O

 

 

АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – трансаминирование аминокислот

P

HC N

N

HO

(CH2)4

NH CH CO

 

Lys258

Arg386

 

 

 

 

 

 

 

 

NH CO

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Arg +

 

 

NH

CO

 

CH

 

 

 

H

 

 

CH

 

(CH2)3

 

 

H Arg +

R C COO-

 

 

(CH2)4

 

NH

(Lys)

NH2

 

(Lys)

 

 

 

 

+

C NH2

 

R C COO-

 

 

 

 

O

H C N

O-

H2N

H C N

O-

NH3+

 

H C N+ H

 

O P O CH2

 

 

 

P

 

P

 

O

-

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N+

CH3

 

 

N+

CH

 

 

 

N+ CH3

 

H

 

 

 

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

H

 

O C O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O C O

 

 

O

C

O

 

 

CH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(Asp)

 

 

(Asp)

 

 

CH

 

 

 

 

 

 

NH

 

 

 

 

 

 

 

CO

(1)

 

 

(2)

 

 

 

(3)

 

Asp222

 

 

 

 

 

 

 

(Lys)

 

 

 

(Lys)

 

Arg +

 

 

 

Arg +

 

H2N: H

 

Arg

+

 

(Lys)

H

R

 

 

 

NH +

R C COO-

 

O: C COO-

 

R C COO-

 

3

 

 

H2N: H

 

 

H

C

N

 

 

 

H

-

N+ H

 

H

C

N+ H

 

+ H

-

 

 

P

C

O-

P

H

O-

P

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

N

CH3

 

 

 

N

CH3

 

 

N+

CH3

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

O C O H

 

 

 

 

O C O H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O C O

 

(Asp)

 

 

 

 

 

(Asp)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(Asp)

 

 

 

(4)

 

 

 

 

 

(5)

(6)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R Arg +

(Lys)

C COO-

NH3+

O

 

H2C

NH2

O-

P

N+ CH3

H

OC O

(Asp)

(7)

АСПАРТАТ АМИНОТРАНСФЕРАЗЫ – катализирует реакцию переаминирования между оксалоацетатом

иглутаматом

Кофермент в трансаминазе присутствует не в виде свободного альдегида, а в виде внутреннего альдимина с боковой аминогруппой лизина (Lys258). Связанный с ферментом имин обеспечивает более быстрый путь протекания реакции, чем свободный пиридоксальфосфат. Именно структура определяет более высокую активность иминов по сравнению с соответствующими альдегидами. Более основный азот иминов протонируется гораздо сильнее, чем кислород карбонильной группы.