Общая схема репликации ДНК
5’ SSB-белки
Фрагменты оказаки |
|
||
|
1 |
|
|
Полимераза |
2 |
Геликаза |
|
|
3 |
|
|
Отстающая цепь |
+ |
|
|
|
|
Инициаторные белки |
|
|
|
|
3’ |
|
праймаза |
|
Пары оснований |
Полимераза III |
5’ |
||
|
|||
|
’ |
|
3 |
|
|
’ |
|
5 |
|
РНК-праймер
3’
РНК-праймеры замещаются ДНК-полимеразой I, разрывы
соединяются ДНК-лигазой
Лидирующая цепь
СРАВНЕНИЕ СВОЙСТВ ДНК-ПОЛИМЕРАЗ E.coli
ДНК-полимеразы IV и V (1999) вовлечены в необычные формы репарации ДНК
ОСНОВНЫЕ КОМПОНЕНТЫ РЕПЛИСОМЫ E.coli
БЕЛОК |
ФУНКЦИЯ |
МОЛ.ВЕС |
|
|
kDa |
Инициация репликации |
|
|
Dna A |
Инициаторный белок |
52 |
Геликаза (Dna B) |
Расплетание двойной цепи |
300 |
Dna C |
«Загрузчик» геликазы |
29 |
HU |
Гистон-подобный белок |
19 |
SSB |
Связывает одноцепочечную ДНК |
75,6 |
Праймаза (Dna G) |
Синтез РНК-праймера |
60 |
ДНК-топоизомераза II |
Снятие торсионного стресса при |
400 |
|
расплетании |
|
Dam-метилаза |
метилирование GATC в oriC |
32 |
Инициация репликации (E.coli)
OriC:
Связывание инициаторного белка dnaA c ДНК
Присоединение геликазы и праймазы
БЕЛОК |
ФУНКЦИЯ |
МОЛ.ВЕС |
|
|
kDa |
Элонгация репликации |
|
|
Геликаза (Dna B) |
Расплетание двойной цепи |
300 |
SSB |
Связывает одноцепочечную ДНК |
75,6 |
ДНК-полимераза III |
Элонгация вновь образующейся цепи |
|
α |
полимеразная активность |
130 |
ε |
корректирующая 3’-5’- экзонуклеазная |
27 |
β |
скользящий зажим |
40 |
δ |
загрузчик зажима (clamp loader) |
32 |
γ |
|
52 |
τ |
димеризация кора |
71 |
χ |
Взаимодействие с SSB-белками |
16,6 |
ψ |
Взаимодействие с γ и χ субъединицами |
15,2 |
θ |
? |
10 |
ДНК-полимераза I |
удаление РНК-праймеров |
103 |
ДНК-лигаза |
соединение разрывов в отстающей цепи |
74 |
ДНК-топоизомераза II |
Снятие торсионного стресса при |
400 |
|
расплетании |
|
CУБЪЕДИНИЧНЫЙ СОСТАВ ХОЛОФЕРМЕНТА ДНК- ПОЛИМЕРАЗЫ III E.coli
СТРУКТУРА РЕПЛИСОМЫ В ХОДЕ ЭЛОНГАЦИИ
Ф |
Ф |
Пространственная модель комплекса димера β-субъединицы, связанного с ДНК
СХЕМАТИЧЕСКОЕ ИЗОБРАЖЕНИЕ КОРА ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ III
большая бороздка ДНК
«большой палец» (“thumb”)
Поступающие
дезоксирибонуклеозид
трифосфаты
связывание
ДНК
“palm”
матрица
матрица
праймер
праймер
«ладонь»
(“palm”)
«пальцы» (“fingers”)