8. Классификация и номенклатура ферментов: систематические и рабочие названия, коферменты (по классами специфичности – типу реакции)

Классификация ферментов:

1. Оксидоредуктазы.

Катализируют окислительно-восстановительные реакции. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются, одно окисляется, другое восстанавливается: Sвост + S’окисл ↔ S’вост + Sокисл

1. дегидрогеназы (отщепляют Н от субстратов)

2. оксидазы (переносят Н с субстрата на кислород),

3. оксигеназы (включают кислород в молекулу субстрата)

4. гидроксипероксидазы (разрушают перекиси водорода и органические перекиси).

Систематическое название: донор: акцептор – оксидоредуктаза

Тривиальное название: донордегидрогеназа.

Шифр: КФ 1.1.1.1

Пример: Пируват + НАДН₂ ↔ лактат + НАД⁺

Систематическое название: Лактат: НАД⁺ оксидоредуктаза

Тривиальное название: ЛДГ. Шифр: КФ 1.1.1.1

2. Трансферазы

Принимают участие в переносе атомных групп, молекулярных остатков от одного соединения к другому. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются: S-G + S’ ↔ S + S’-G.

1. фосфотрансферазы (киназы)

2. аминотрансферазы

3. гликозилтрансферазы

4. метилтрансферазы

5. ацилтрансферазы.

Систематическое название: откуда: куда - в какое положение–что–трансфераза или донор: акцептор–транспортируемая группа– трансфераза

Тривиальное название: кудакиназа

Шифр: 2.1.1.1

Пример: АТФ + D-гексоза ↔ АДФ + D- гексоза-6ф

Систематическое название: АТФ: D-гексоза-6-фосфотрансфераза

Тривиальное название: гексокиназа

3. Гидролазы.

Расщепляют ковалентную связь с присоединением молекулы воды. В реакцию вступают 2 вещества и 2 образуются: S-G + Н₂О ↔ S-ОН + G-Н.

1. гликозидазы – гидролиз гликозидов (лактоза – лактаза, мальтоза – мальтаза, сахароза – сахараза)

2. пептидазы – гидролиз пептидных связей

3. эстеразы – разрыв связи в сложных эфирах.

Систематическое название субстрат–что отщепляется–гидролаза или субстрат–гидролаза

Тривиальное название: субстрат-что отщепляетсяаза

Шифр: 3.1.1.1

Пример: Глюкозо-6ф + Н₂О → глюкоза + Н₃РО₄

Систематическое название: Глюкозо-6ф-фосфогидролаза

Тривиальное название: Глюкозо-6ф-фосфотаза

4. Лиазы

Отщепление групп от субстратов по негидролитическому механизму с образованием двойных связей (или наоборот, присоединение по двойной связи). Реакции обратимы, за исключением отщепления СО₂. В реакцию вступает 1 вещество и 2 образуются (или наоборот): -SХ-SY- ↔ XY + -S=S-

Систематическое название: субстрат: что отщепляется–лиаза

Тривиальное название: продуктаза

Шифр: 4.1.1.1

Пример: L-малат ↔ фумарат + Н₂О

Систематическое название: L-малат: гидро–лиаза

Тривиальное название: фумараза

5. Изомеразы

Взаимопревращения оптических, геометрических, позиционных изомеров. В реакцию вступает 1 вещество и 1 образуется.

1. Рацемазы

2. Эпимеразы

3. Таутамеразы

4. цис,- трансизомеразы

5. мутазы (при внутримолекулярном переносе группы)

6. цикло-, оксоизомеразы.

Систематическое название субстрат–вид изомеризации–изомераза или субстрат–продукт–изомераза

Шифр: 5.1.1.1

Пример: гл-6ф ↔ фр-6ф

Систематическое название: гл-6ф–фр-6ф–изомераза

6. Лигазы (синтетазы)

Соединение 2 молекул с использованием энергии макроэргических соединений (АТФ и др). В реакцию вступают 3 вещества, образуется 3 вещества.

Систематическое название: субстрат: субстрат–лигаза (источник энергии)

Тривиальное название: субстратсубстратлаза

Шифр: 6.1.1.1

Пример: АТФ + ПВК + СО₂ → АДФ + Фн + ЩУК

Систематическое название: ПВК: СО₂–лигаза (АТФ → АДФ + Фн)

Тривиальное название: пируваткарбокилаза

Коферменты:

Выступает в роли акцептора и донора химических группировок.

Локализуется в каталитическом участке активного центра.

• Простестическая группа – кофермент связан с белковой частью молекулы ковалентными связями. Связь прочная. Есть некоторые коферменты, связанные нековалентными связями, но являющиеся очень прочными.

• Связь нековалентная - временное взаимодействие на время химической реакции, может рассматриваться в качестве второго субстрата.

К коферментам относятся:

• гемы,

• нуклеотиды,

• коэнзим Q,

• ФАФС,

• SAM,

• Глутатион

• производные водорастворимых витаминов:

Витамины	Коферменты
РР (никотиновая кислота)	НАД+, НАДФ+
В2 (рибофлавин)	ФАД, ФМН
В6 (пиридоксаль)	Пиридоксальфосфат
В1 (тиамин)	Тиаминпирофосфат
В12	Кобаламины