Как работает топоизомераза I
Фермент связывается с ДНК |
5’-фосфат разрезанной цепи |
|
ковалентно прикрепляется к |
|
тирозиновому остатку фермента |
Топоизомеразы типа II
•Временно разрезают обе цепи дуплекса
•Вводят/удаляют сверхспирализацию: превращают один положительный сверхвиток (св) в отрицательный, или наоборот
•В результате L изменяется на два (±2) за один шаг:
∆L = ±2; ∆T = 0; ∆W = ±2
•Разделяют катенаны, предотвращают спутывание хромосом
•Энергия: гидролиз 1 молекулы АТФ до АДФ
•К топоизомеразам типа II относятся эукариотическая топо II и бактериальные ферменты гираза (топо II) и топо IV.
Топоизомераза типа II: ДНК-гираза
Е.coli (ТопоII)
Гетеротетрамер А2В2;
Мr 400 kDa.
В присутствии АТФ обладает высокой процессивностью – вводит ~100 отрицательных
сверхвитков/мин
∆L=-2; ∆T=0; ∆W=-2
Без АТФ обеспечивает
релаксацию 10 св/мин
∆L=+2; ∆T=0; ∆W=+2
Процессивность – число каталитических актов, которое фермент проводит без диссоциации с полимерным лигандом
Строение ДНК-гиразы Е.coli - гетеродимера А2В2
связывание АТФ контролирует шарнирное раскрытие полости
2 субъединицы В
2 субъединицы А
полость для связывания ДНК
Модель работы топоизомеразы II
∆L=±2