Molekulyarnaya_biotekhnologia_Glik_B__Pasternak_Dzh

тельных процессов, активации фагоцитоза и литиче- ском действии на клеточные мембраны. Активизируется взаимодействием с иммунным комплексом.

Комплементарная ДНК, кДНК (Complementary DNA) Молекула ДНК, синтезированная на РНК-матрице с участием РНК-зависимой ДНК-полимеразы (обратной транскриптазы).

Комплементарные нуклеотидные последовательности

(Complementary base sequences) Полинуклеотидные по-

следовательности, которые взаимодействуют между собой в соответствии с правилами спаривания оснований: аденин (А) образует пару с тимином (Т) [или ура- цилом (U) в РНК], гуанин (G) - с цитозином (С).

Комплементарный гомополи черный «хвост» (Homoporymeric tall) Гомополимер из дезоксирибонуклеозидмонофос- фатов, присоединяемый к З'-ОН-концам обеих цепей фрагмента ДНК с тупыми концами. Создание комплементарных «хвостов» [например, poly(A) во встраиваемом фрагменте ДНК и poly(T) в векторе] позволяет клонировать фрагмент в составе рекомбина нтной плазмиды.

Комплементация (Complementation) Восстановление фенотипа дикого типа (или близкого к нему фенотипа) при объединении в одной клетке двух ДНК с двумя рецессивными мутациями, находящимися в транс-кон- фигурации,

Конкатемерные молекулы (Concatemeric molecules)

Длинные молекулы ДНК, состоящие из нескольких тандемно повторяющихся единиц. В такой форме находится геном некоторых фагов во время репликации.

Константа Мнхаэдиоц Ам (Michaelis constant, Ам ) Кинетический параметр ферментативной реакции, численно равный концентрации субстрата, при которой скорость реакции составляет половину максимальной. Характеризует сродство фермента к субстрату. Чем ниже Км> тем прочнее связывание между субстратом и ферментом.

Константный домен (Constant domain) Неизменная для данного класса иммуноглобулинов часть пол и пептидной цепи (легкой или тяжелой).

Конститутивный синтез (Constitutive synthesis) Постоянно происходящий в клетке или целом организме синтез РНК или какого-либо белка.

Контнг (Contig) Непрерывный набор клонов, охватывающих данную область хромосомы или всю хромосому.

Контрапсфекция (Contransfection) Введение в одну эу- кариотическую клетку двух разных молекул ДНК, В случае системы экспрессии на основе бакуловирусов — процедура одновременного введения бакуловируса и вектора в клетки насекомых в культуре.

Конфирмационный полиморфизм олпоцспочечной ДНК,

SSCP (Single-strand conformâtional polymorphism) Раз-

личие в конформации одноцепочечных ДНК, отличающихся одна от другой всего одним нуклеотидом. Анализируемые ДНК подвергают денатурации. Денатурированные цепи принимают разную конформа- иию и при гель-электрофорезе мигрируют с разной скоростью.

Копью гати иные плязмидм (Conjugative plasmids) Плазмиды, способные передаваться от одной клетки другой во время конъюгации.

Конъюгация (Conjugation) Форма полового процесса. У бактерий — однонаправленный перенос ДНК из одной контактирующей клетки в другую.

Корспрсссор (Corepressor) Небольшая молекула, связываю ищяс и с неактивным репрессором (апорепрессо- ром) с образованием комплекса, присоединяющегося к оператору и блокирующего транскрипцию.

Корончатый галл (Oown gall) Опухоль растений, обра- зование которой вызывают бактерии рода Agrohacterium,

Короткий концевом повтор, STR (Short tandem repeat) Концевая нуклеотидная последовательность, состоящая из ди-, триили тетрануклеотидных повторяющихся элементов,

Косегрегацня (Côsegregation) Феномен, состоящий в том, что два признака наследуются совместно, т.е. их гены при крссинговере не разделяются,

Космида (Cosmid) Вектор, объединяющий скойства плазмидного нектора и вектора на основе фага λ. Имеет cos-сайты.

Косупрессия (Cosupression) Подавление экспрессии специфического растительного гена при трансформации растения дополнительной копией этого гена, включенной в «смысловой» ориентации.

Кофактор (Cofactor) Низкомолекулярное вещество, необходимое для протекания определенной ферментативной реакции.

Кофермснтяция (Cofermentation) Одновременный рост двух микроорганизмов в одном биореакторе.

Кроссинговер (Crossing-over) Взаимный обмен участками гомологичных хромосом, основанный на разры- ве-соединении хроматид и приводящий к новой комбинации аллелей. Называется также рекомбинацией.

Ксенобиотик (Xenoblotic) Соединение, полученное искусственным путем, а не синтезированное живым организмом.

Ксилема (Xylose) Пятиуглеродный сахар, основной компонент гемииеллюлозы.

Культура (Culture) Популяция клеток или микроорганизмов, выращиваемых в контролируемых условиях in vitro.

Культуралышя среда (Culture medium) Твердая или жидкая среда, использующаяся для выращивания мик- роорги-нюмов in vitro.

«Кэп» (Сар) Метилированный гуанозин на 5'-конце многих мРНК эукариот.

ft,,,, Константа скорости ферментативной реакции. Чем выше эта величина, тем быстрее субстрат превращается в продукт.

ЛЫ|/АМ Каталитическая эффективность фермента- ru ьшой реакции. Чем она выше, тем быстрее и эффективнее субстрат превращается в продукт,

«Левый» элемент оперена (Upstream) Условное название участка оперона, расположенного перед сайтом инициации транскрипции, в направлении 5' от него. Обычно первое транскрибируемое основание оперона обозначается +1, а все «левые» элементы — цифрами со знаком «—»,

Лигирование (Liga t ion) Соединение двух молекул ДНК с помощью фосфод и Мирных связей. In vitro катализируется ферментом ДНК-лигазой фага Т4.

Лигироиание олигонуклеотидных зондов, ЛОЗ

(Oligonucleotideligatioii assay) Метод выявления однону-

клеотидных замен в гене-мишени с помощью коротких олигонуклеотидов, комплементарных противополож- ным цепям тестируемого отрезка ДНК. Если замена отсутствует, то оба олигонуклеотида полностью гибриди- зуются с ДНК, и после добавления в реакционную смесь ДНК-лигазы происходит их сшивание (лигирование). В противном случае сшивание оказывается невозможным,

Л m моце.илоло.ча (Lignocellulose) Комплекс лигнина, ιемице.шюлозы и целлюлозы, составляющий струк- турный каркас клеточной стенки растений.

Лндерная последовательность (Leader sequence) Heтранслируемая последовательность мРНК, расположенная между 5'-концом и инициирующим колоном

AUG.

Лизис (Lysis) Разрушение клеточных стенок под действием ферментов, содержащихся в лизосомах, или других агентов,

Лизогення (Lysogeny) Интеграция генома бактериофага в геном клетки-хозяина. В результате индукции вирусная ДНК может выщепляться с образованием зрелых фаговых частиц.

Линкер (Linker) Синтетический олигонуклеотид, содержащий сайт рестрикции. Используется для соединения векторной и клонируемой ДНК, к концам которой по методу сшивания тупых концов присоединены линкеры.

Липаза (Llpase) Фермент, расщепляющий липиды,

Липкие юнцы (Cohesive ends) Взаимно комплементарные одноцепочные участки ДНК, выступающие по концам двухцепочечной молекулы; образуются в результате ступенчатых разрезов двухцепочечных ДНК.

Липополисахарид (Lipopolysaccharide) Соединение, содержащее ли π ид, связанный с полисахаридом. Один из компонентов клеточной стенки бактерий.

Лнпосома (Liposome) Пузырек, образуемый одноили двухслойной мембраной, состоящей излипидных молекул. Гидрофобная часть этих молекул обращена внутрь пузырька, гидрофильная - наружу. Внутри пузырька могут находиться нуклеиновые кислоты, лекарственные вещества и т.д., адресно доставляемые липосомой.

Литическин цикл (Lytic cycle) Размножение вируса в клетке-хозяине, оканчивающееся лизисом клетки.

Локус (Locus) Место на хромосоме, где находится специфический ген.

Макромолекула ( Macrom olecule) Полимер с мол. массой от нескольких тысяч до сотен млн. дальтон (белки, нуклеиновые кислоты, полисахариды и т.д.).

Макрофаг (Macrophage) Крупный лейкоцит, обладающий способностью к фагоцитозу.

Маркерные экспрессируемые последовательности, EST

(Expressed sequence tag) Короткие маркерные после-

довательности, характерные для каждого экспресси- руемого гена человека. Позволяют изучать размеры, разнообразие и транскрипционную активность экс- прессирующихся генов человека.

Маркерный ген (Marker gene) Ген с известной хромосомной локализацией, имеющий четкое фенотипиче- ское проявление (устойчивость к антибиотику, фер- ментативная активность и т.д.).

Маркерный пептид (Marker peptid) Участок гибридной белковой молекулы, облегчающий идентификацию или очистку белка.

Матричная РНК, мРНК (Messenger RNA) Молекула РНК, в которой заключена информация об аминокислотной последовательности определенной белковой молекулы.

Матричная цепь (Template strand) Цепь ДНК или другой полинуклеотид, использующийся ДНК-полимера- зой в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи,

Меэофильиые микроорганизмы (Mesophile) Организмы, способные расти при температурах от 20 до 50 °С; оптимальная температура роста 37 "С.

Меристема (Meristematic tissue) Ткань растений, обладающая способностью к активному делению, У молодых растений обычно находится у кончиков корней и побегов,

Метаболизм (Metabolism) Совокупность физических и химических процессов, протекающих в организме и обеспечивающих его существование. Продукты метаболизма называются метаболитами.

Метаболическая перегрузка (Metatotic load) Нарушение метаболизма организма-хозяина в результате введения в его геном и экспрессии чужеродной ДНК,

Метилирование (Methylatîon) Присоединение к макромолекуле метильной группы. Например, при метилировании ДНК происходит присоединение такой группы к специфическим остаткам цитозина, а иногда аденит.

Метка ([.abel) Радиоактивный изотоп или идентифицируемр.ш биохимическими либо иммунологическими методами лиганд (например, флуорофор), связывающийся с макромолекулой. Позволяет обнаружить меченое вещество в образце.

Метод отпечатков (реплик) (Replica plating) Перенос колоний микроорганизмов с одной чашки Петри на другую с помощью бархатной «печатки» с полным сохранением взаимного расположения колоний.

Метод случайных лраймеров (Random primer method) Способ получения меченых ДНК-зондов, основанный

на применении синтетических олигонуклеотидов, содержащих все возможные комбинации из шести нуклеоткдов, и на их гибридизации с денатурированной ДНК-мишенью, Олигонуклеоткды, комплементарные последней, спариваются с ней, В реакционную смесь добавляют все четыре дезоксирибонуклеотида (причем один из них меченый) и фермент, катализирующий синтез фрагментов ДНК с использованием цепей ДНК-мишени в качестве матрицы, а гибридизировавшихся фрагментов — в качестве затравки,

Мнкроинъекцин (MkToinjection) Введение в изолированную эу к ар йоги ч с ι; кую клетку ДНК или других молекул с помощью тонкой иглы.

Мнни-сателлитная ДНК человека (Human minisatellite

DNA) Некодирующая ДНК человека, обычно ОС-бо- гатая, содержащая тандемные повторы коротких (длиной 9—40 п.п.) сегментов.

Миссенс-мутация (Missense mutation) Мутация, в результате которой кодон, кодирующий какую-либо аминокислоту, изменяется с образованием кодона, кодирующего другую аминокислоту,

Мицелий (Mycelium) Вегетативное тело гриба, состоящее из тонких ветвящихся нитей.

Мишень (Target) В самом широком смысле — биологический объект (ткань, молекула, клетка, микроорганизм), которая интересует исследователя.

Мобилизация (Mobilization) Передача от одной бактериальной клетки другой хромосомных генов либо неконъюгативных плазмид с участием конъюгативных плазмид.

Мобильный генетический элемент (Transposable element)

Участок ДНК, способный изменить свое положение в геноме. Среди таких элементов различают IS-элемен- ты и транспозоны.

M олекуляр! ia я диагноста к a (Molecular diagnostic) В ы и -

вление молекулярно-биологическими методами патогенного микроорганизма, специфического вещества или измененной нуклеотидной последовательности, ответственных за то или иное заболевание.

Моиоклональные антитела (Monoclonal antibodies) Однотипные антитела, строго специфичные в отношении одного эпитопа (антигенной детерминанты). Синтезируются гибридомами — клеточными гибридами, полученными при слиянии нормальных антителообразующих клеток с миеломной опухолевой клеткой, способной к неограниченному росту. Некоторые мие-

ломные клетки синтезируют моноклональные тела са- мосгояте л ьно.

Мульч и.ткуснан генетическая карта, карта t цен лен им

(Multipoint map, multilocus linkage тар) Схема изаимно-

го расположения локусов на хромосомах данного организма.

Мутагенез (Mutagenesis) Искусственное введение мутаций с помощью физических или химических агентов.

Мутант (Mutant) Организм, измененный в результате мутации; как правило, отличается от исходной формы (дикого типа).

Мутация (Mutation) Спонтанное или индуцированное изменение структуры гена.

Мутация со сдвигом рамки (Fnuneshift mutation) Мута- ция, связанная с появлением лишнего или с потерей одного или нескольких (в числе, не кратном трем) ну- клеотидов. Приводит к нарушению триплетного кода и синтезу совершенно другого белка (если только синтез вообще не блокируется).

Нарушение комплемента риости (Mismatch, mis pa ring) Наличие в двухцепочечной молекуле ДНК одной или нескольких пар некомплементарных оснований.

Негативная регуляция (Negative control) Тип регуляции, при котором транскрипция гена подавляется ре- гуляторным белком (репрессором); соответственно при инактивации белка-регулятора структурные гены остаются в активном состоянии.

Независимое распределение генов (Independent assortment) Распределение генов, локализованных на разных хромосомах, по гаплоидным гаметам с образованием всех возможных комбинаций генов. Лежит в основе закона Менделя о независимом распределении признаков.

Неметаболизирующиеся индукторы (Gratuitous înducers) Вещества, индуцирующие синтез индуцибельных ферментов, но не являющиеся для них субстратами, а потому остающиеся в исходном виде.

Неомицинфосфотрансфераза (TSeuiiiycinphnsphntransfcrase)

Фермент, инактииирующий антибиотики неомипип и канамицин. Часто используется как селективный мар- кер для трансгенных растений.

Неполная пенетрантность (Incomplete penetranee) Частичное проявление конкретного аллеля в группе родственных организмов. Характерна для большинства мутантных аллелей.

Непрерывная ферментация (Continuous fermentation)

Культивирование микроорганизмов при непрерывном добавлении в биореактор среды и выведении такого же объема суспензии.

Нозерн-блоттинг (Nothern Hotting) Перенос молекул РНК, подвергнутых элктроферезу, с геля на твердую подложку {нитроцеллюлозный или найлоновый фильтр) с последующей ДНК—P H К-гибридизацией,

«Нокаут» (Knockout) Направленное разрушение гена с помощью гомологичной рекомбинации.

Нуклеаза SI (SI nudease) Фермент, специфически деградирующий одноцепочечную ДНК,

Нуклеознд (Nucteoside) Пуриновое или пиримидино- вое азотистое основание, ковалентно связанное с пя- тиутлеродным сахаром (пентозой). Если сахаром является рибоза, то мы имеем дело с рибонуклеозидом, а если дезоксирибоза, то с дезоксирибонуклеозидом.

Нуклеотид (Nudeotide) Нуклеозид, к которому присоединена одна или более фосфатных групп; присоединение происходит по 5'-углеродному атому сахарного кольца. Нуклеозиды, связанные с рибозой, называются рибонуклеозидмонофосфатами (rNMP), рибонуклеозиддифо с фитами (rNDP) или рибонуклеозидтрифосфатами (rNTlJ). Для нуклеозидов, связанных с дезоксирибозой, соответствующие названия таковы: дезоксирибонуклеозидмоно-, ди- и три фосфаты

(dNMP,d NDP ,d NT P) .

N-конец (N terminus) Первая аминокислота (или несколько аминокислот) в белковой молекуле.

Обратная транскриптаза (Reverse transcriptase) РНКзависимая ДНК-полимераза, использующая молекулу РНК в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи ДНК.

Обратная транскрипция—ι юл и неравная ценная реакция

(Reverse Ira г se ri ptin n—pol y me rase chain reaction) Способ получения в большом количестве кДНК, состояший из двух этапов. Вначале in vitro синтезируют кДНК, используя обратную транскриптазу, мРНК в качестве матрицы и oligo(dT) в качестве праймера. Затем кДНК амплифииируют с помощью полимеразной иепной реакции (ПЦР), используя два праймера: один комплементарен участку первой цепи кДНК, а второй — другой цепи, комплементарной первой,

Одноцепочечный разрыв (Nick) Разрыв фосфод и эфирной связи между соседними нуклеотидами в одной це- пи ДНК.

Окрашивание по Грану (Gram stain) Метод окрашивания микробиологических препаратов, позволяющий идентифицировать две группы бактерий: грамположительные и грамотрицательные. Основан на различии биохимического состава мембран бактериальных клеток.

Олигонуклеотид, олигомер (Oligonuclcotide) Короткий (6—10 нуклеотидов) сегмент одноцепочечной ДНК. Обычно получают химическим путем.

Онкоген (Oncogene) Ген, экспрессия которого приводит к неконтролируемой пролиферации (трансформации) клеток.

Оператор (Operator) Участок ДНК, непосредственно примыкающий к структурному гену и регулирующий его транскрипцию при участии репрессора или активатора,

Оперон (Оретоп) Участок ДНК, содержащий несколько структурных генов, транскрибируемых с образованием одной полицистронной м РНК.

Опнн (Opine) Продукт конденсации аминокислоты с кетокислстой и сахаром.

Оптимизация кодонов (Codon optimization) Модификация кшонов данного гена без изменения аминокислотной последовательности кодируемого им белка, направленная на то чтобы кодоны эффективно считывались хозяйским организмом,

Отжиг (Annealing) Процесс образования двухцепочеч- ных молекул (ДНК—ДНК или ДНК—РНК) из одиночных полинуклеотидных комплементарных цепей.

Открытая рамка считывания (Open reading frame) Последовательность нуклеотидов, не содержащая терминирующих кодонов; кодирует полипептид или белок.

«Отпечаток пальцев» (ΠΝΛ fingerprint) Набор рссгрик- циопных фрагмента u ДНК, характерный для данного индивидуума. Для получения «отпечатка» используют либо гель-электрофорез как таковой, либо в сочетании с ПЦР-амплификацией.

Отталкивание (Repulsion) Конфигурация, при которой два мутантных неаллельных гена находятся на разных хромосомах. Аналогично транс-конфигурации. См. также Сопряжение.

Пакующая клеточная линия (Packaging eel line) Клеточная линия, созданная для продуцирования вирусных частиц, не содержащих инфекционной нуклеиновой кислоты.

Палиндром (Palindrome) Участок двух цепочечной молекулы ДНК, обе цепи которого обладают одинаковой нуклеотидной последовательностью при прочитывании от 5'- к 3'- концу. Такие участки часто распознаются рестрицирующими эндонуклеазами типа 11,

Параспоральиый кристалл (Parasporal crystal) Плотно упакованные молекулы токсина, синтезируемые

Bacillus thurittgiettsis при образовании спор.

11ассивиый иммунитет (Passive immunity) Форма иммунитета, возникающая при введении в организм сыворотки, содержащей антитела, выработанные другим организмом в результате активной иммунизации. Наблюдается также у новорожденных,

Патогенез-зависимый промотор (Pathogènes! s-related promotnr) Промотор растительных генов, активизируемый при инфицировании растения патогенами.

Пенетрантностъ (Penetrance) Частота проявления данного аллеля в группе родственных организмов. При полной пенетрантности наблюдается проявление аллеля у всех членов выборки.

Пептид (Peptidc) Короткая цепочка аминокислот, соединенных пептидными связями,

Пептидил-тЖ К (Peptirtyl-tKlNA) Молекула тРНК с присоединенной к ней растущей полипептидной цепью.

Пепгвдиая вакцина (Peptide vaccine) Короткая цепочка из аминокислот, индуцирующая образование антител к специфическому инфекционному агенту,

Пептидная связь (Peptide bond) Ковалентная связь между свободной карбоксильной группой при α-углерод- ном атоме одной аминокислоты и свободной карбоксильной группой при таком же атоме соседней аминокислоты в полипептидной цепи.

Первичная культура (Primary culture) Культура клеток или тканей, взятых непосредственно от организма.

Первичный гранскрнпт (Primary transcript) Молекула РНК, трапскрибиронанная с нукаритическош структурного гена и не подвергшаяся процессингу (т.е. содержащая все экзоны и интроны).

Первое антитело (Primary antibody) Антитело, связывающееся с молекулой-мишенью при проведении иммунологического анализа (например, с помощью метода

ELISA).

Периодическая ферментация (Batch fermentation) Культивирование микроорганизмов в течение ограничен-

ного интервала времени. Свежую среду ино кулируют посевным материалом и проводят культивирование в непрерывном режиме, не добавляя новых порций среды и не удаляя продуктов, пока процесс не завершится сам собой.

Периодическая фермеитация с добавлением субстрата

(Fed-Batch fermentation) Культинириианис микроорга-

низмов в течение ограниченного интервала времени с периодическим добавленим субстрата и сбором продукта только по завершении процесса,

Пернплазматическое пространство (Periplasmatic space) Пространство между плазматической мембраной бактериальной клетки и наружной мембраной или клеточной стенкой,

Пиримидины (PyrimidiiLc) Один из двухтипов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот, к пиримидинам относятся тимин, цитгаин и урацил. Второй тип оснований — пурины; к ним относятся аде- нин и гуанин.

Пироген <Pyrogen) Вещество, продуцируемое бактериями и вызывающее повышение температуры у че - ло иска.

Плазмида (Plasmid) Внехромосомный генетический элемент, способный к длительному автономному су - ществованию и репликации. Обычно этодвухцепочечная кольцевая ДНК длиной 1—200 т.п.н.

Плазмнда-помшцник (Helper plasmiri) Плазмида, восполняющая функции другой шнимидм в той же клетке. Некоторые плазмиды-помощники способствуют переносу неконъюгативных плазмид из донорной клетки в реципиентную.

2 мкм-плазмида (2 μιη plasmid) Существующая в природных условиях двухцепочечная кольцевая плазмида длиной 6318 п.н., обнаруженная в ядре Saccharomyces cerevisiae. На ее основе получены многие плазмидные векторы для дрожжевых клеток.

Плазмидная несовместимость (Plasmid incompatibility) Механизм регуляции числа копий плазмид одного типа в бактериальной клетке. Обеспечивает невозможность внутриклеточного сосуществования плазмид, принадлежащих к одной группе совместимости.

Плазмовирус (Plasnrovirus) Генетическая конструкция, которая содержит ретровирусные гены, находящиеся под контролем 5'-LTR-npoMoropa, a также «терапевтический* ген и ген env, управляемые цитомегаловирус- ным промотором.

Пластида (Hastid) Органелла растительных клеток (например, хлоропласт). Многие пластиды имеют собственный геном.

Подвид (Subspescles) Группа в пределах вида, облага- ющая признаками, не характерными для остальной части членов популяции данного вида.

Позитивная регуляция (Positive control) Тип регуляции, при котором регулируемый ген транскрибируе тся только в присутствии белка-активатора.

Позитивно-негативный mfiop (Positive-negative selection)

Методика, при которой одновременно происходит отбор клеток, несущих вставку в специфическом хромосомном сайте (позитивный отбор), и «отбраковка» клеток, несущих вставку в другом, неспецифическом сайте.

Позитивный отбор (Positive selection) Отбор клеток по наличию в них маркерного гена, благоприятствующего росту на селективной среде (например, среде с анти - биотиком).

Позиционное картирован ие (Positional gene cloning) Одна из стратегий идентификации гена заболевания в отсутствие данных о продукте этого гена и каких-ли- бо генов-кандидатов. В подобных случаях сначала определяют хромосомную локализацию (позицию) гена. Затем получают геномные клоны, охватывающие кар - тированный сайт {используя соответствующие маркеры), идентифицируют и анализируют присутствующие в них экзоны. Используя целый ряд методов {идентификация GC-островков, улавливание экз о- нов, секвенирование, компьютерный анализ и тл.), определяют, какой именно ген ответствен за данное заболевание.

Позиционно-кавдидатное картирование (Positional-can- didate gene cloning) Одна из стратегий идентификации гена заболевания, когда данные о продукте этого гена отсутствуют, но ген картирован в том же хромосомном районе, что и уже идентифицированные гены и EST. Сначала анализируют современные генетические и транскрипционные карты, с тем чтобы выявить кодирующие последовательности (гены, вн утригенные EST), находящиеся в этом районе, затем с помощью мутационного анализа или какими -либо другими методами выявляют экзоны, связанные с данным заболеванием.

Полиадеиилирование (l'olyadcnylation) Ферментативное присоединении остатков аденина к З'-концу молекулы эукариотической мРНК. Этот богатый аденином З'-конец называется ро1у(А)-хвостом.

Поливалентная вакцина (Multivalent vaccine) Вакцина, дающая иммунный ответ на несколько инфекционных агентов или на разные эпитопы одной молекулы.

Поликетидсинтаза (Polyketide synthase) Фермент, участвующий в биосинтезе поликетидных антибиотиков.

Поликетидные антибиотики (Polyketidc antibiotics) Класс антибиотиков, которые образуются в результате последовательной ферментативной конденсации кар- боновых кислот (ацетата, пропионата и т.д.).

Полилинкер <Polylinker) Короткий участок ДНК, содержащий несколько уникальных сайтов узнавания для эндонуклеаз; в эти сайты встраивают чужеродную ДНК (осуществляют клонирование).

Молимеразнан цепная реакция, ПЦГ (Polymcrase chain reaction) Мстил нмплификнции специфического ее г мента ДНК с помощью термостабильной ДНК-поли- меразы с использованием олигонуклеотидных ДНКзондов, комплементарных последовательностям противоположных цепей ДНК, фланкирующим амп- лифицируемый сегмент. Процесс состоит из серии циклически повторяющихся реакций: денатурации ДНК, отжига зондов, синтеза ДНК,

Полиморфизм длины рестр HI (ионных фрагментов,

ПДРФ (Restriction fragment length polymorphism; KFLP)

Вариабельность длины фрагментов ДНК, образующихся при ее расщеплении рестриктазами. Обусловлена мутационным изменением сайтов рестрикции или появлением новых сайтов. Обнаруживается при разделении фрагментов с помошью гель-электрофо- реза.

Полиморфизм коротких таидемных повторов, STRP (Short tandem repeat polymorphism) Вариабельность блоков из тандемных ди-, триили тетрануклеотид- ных повторяющихся элементов по числу этих элементов при частоте встречаемости блоков в большой популяции не менее \%. STRP-локусы выявляют с помощью гель-электрофореза после проведения ПЦР с использованием праймеров, комплементарных уникальным последовательностям, фланкирующим данный локус.

Полиморфный сайт (Polymorphic site) Участок хромосомы, представленный в популяции более чем одним вариантом и встречающийся с частотой не менее 1%.

Полинуклеотцд (Polynudeotide) Линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. Полинуклеотида- ми являются, например, молекулы ДНК и РНК.

Полипептид (Polypeptide) Линейный полимер, состоящий из аминокислот, соединенных друг с другом пептидными связями. Полипептидом является, например, белковая молекула.

Полицистронная мРНК (Multigene RNA, polysistronic message) Молекула мРНК, кодирующая более одного белка. Образуется при транскрипции двух или более соседних генов, входящих в состав одного оперона.

Полиэдрин (Folybedrin) Белок капсида бакуловирусов; накапливается в больших количествах в ядрах пораженных клеток насекомых.

Полное сцепление (Complete linkage) Сонместнос наследование двух или более соседних генных шжусин и хромосоме. Проявляется отсутствием рекомбинаций между ними и стабильным попаданием в одну гамету при митозе.

Посттрансляционные модификации (Posttranslational modifications) Изменение структуры белковых молекул после завершения их синтеза рибосомами. К таким модификациям относятся: фосфорилирование, глико- зилирование, окисление цистеина, отщепление сигнальных последовательностей и тл.

«Правый» элемент оперона (Downstream) Условное название участка, расположенного после сайта инициации транскрипции, в направлении 3' от него.

Праймер (Primer) Короткий олигонуклеотид, который гибридизуется с матрицей и служит затравкой при ее копировании.

Прсдранний ген (Immediate-early gene) Фаговый ген, транскрибируемый сразу же после заражения клеток. Его продукт необходим для транскрипции других генов бактериофага — так называемых задержанноран- них и поздних,

«Прогулка по хромосоме» (Chromosome walking) Метод идентификации нуклеотидных последовательностей, фланкирующих известные гены, для которых имеются опигонуклеотидные зонды. Фланкирующие последовательности используются затем в качестве зондов для идентификации прилегающих к ним последовательностей, и т.д.

Проект «Геном человека» (Human Genome Project) Международная программа, целью которой является построение генетической и физической карт генома человека и определение полной нуклеотидной последовательности ДНК.

Прокариоты (Procaryotes) Организмы, у которых нет ограниченных мембранами ядра и органелл. К прокариотам относятся все бактерии.

Промотор (Promoter) Участок молекулы ДНК, с которым связывается РНК-полимераза, что сопровождается инициацией транскрипции соответствующих генов. Обычно находится перед 5'-концом регулируемого гена.

Протеиназы, протеолитические ферменты (Protease) Ферменты, расщепляющие пептидные связи в белковых молекулах.

Протеолиз (Proteolysis) Ферментативное расщепление белков.

Протопласт (Protoplast) Бактериальная, дрожжевая или растительная клетка, стенка которой разрушена ферментативным или химическим путем.

Профаг (Prophage) ДНКбактериофага, интегрированная в геном бактериальной клетки-хозяина и реплицирующаяся вместе с ней.

Процессинг (Processing) Совокупность процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке, Включает ряд последовательных расщеплений моле- кулы-предшественника эндонуклеазой или протеи- назами.

Прочитывание терминатора, сквозное лрочитывание (Readthrough) «Проскакивание» транскрипции через специфический терминатор. Аналогичный термин используется и в отношении трансляции.

«Прыжки по хромосоме» (Chromosome jumping) Один из вариантов метода «прогулки по хромосоме», характеризующийся тем, что в результате мутации маркерный ген, использующийся для скрининга, перемещается (прыгает), что позволяет выявить новые сцепленные с ним гены.

Нсихрифилы (Psychrophile) Микроорганизмы, способные расти при температуре 0—5 °С.

Пурины (Purine) Один из двух т и пои а:ютистых оси и па- ни и, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пуринам относятся вденин и гуанин. Второй тип оснований — пиримидины; к ним относятся тимин, урацил и цитозин,

Psaidommas широко распространенная грамотрица- тельная бактерия. Многие ее виды, обитающие в почве, продуцируют пигмент, флуоресцирующий в УФ- свете.

Рамка считывания (Reading frame) Один из трех возможных способов считывания нуклеотидной последо-

вательности в виде триплетов. Открытая рамка считывания не содержит терминирующих колонов и может транслироваться в белок.

Расстояние на генетической карте (Map distance) Patстояние между двумя генами, определяемое по частоте рекомбинаций на анализируемом участке. За единицу картирования принимают расстояние между генами, вероятность рекомбинации между которыми равна \% (одной сантиморганиде).

Реактор с механическим перемешиванием (Stirred tank fermenter) Биореактор, в котором для равномерного распределения газа по всему объему используются мешалки.

Регуляторный белок (Regulatory protein) Белок, «включающий» или «выключающий» транскрипцию.

Реком&шантнаяДНК(КесотЫпап1В1ЧА) Молекула ДНК, полученная объединением in vitro разнородных, вместе нигде в приропр не существующих, фрагментов ДНК.

Рекомбннантная плазмида (Recombinant plasmid) Плаз- мида, измененная методами генной инженерии. Состоит из участков разных плазмид либо содержит сегменты ДНК других организмов.

РекомбинантиыЙ белок (Recombinant protein) Белок, кодируемый клонированной ре комби нантной ДНК,

Pc пату рация (Rcnaturation) Воссоединение цепей л ну хне π очечной ДНК, разошедшихся при денатурации.

Репликативная форма, РФ (Replfcative form) Промежу- точная форма двухцепочечной вирусной нуклеиновой кислоты, служащая матрицей для синтеза ДНК и РНК. Представляет собой релаксированное (открытое) кольцо.

Репликация (Replication, reduplication) Процесс само-

воспроизведения (синтеза) ДНК.

Репликация по типу катящегося кольца (Rolling circle model) Процесс репликации кольцевых молекул ДНК с образованием конкатемерной дуплексной ДНК (ДНК, состоящей из нескольких тандемно повторяющихся единиц генома).

Репрессия (Repression) Один из двух альтернативных (наряду с индукцией) механизмов регуляции генов. Состоит в подавлении транскрипции или трансляции путем связывания белка-репрессора с оператором.

Релрессор (Represser) Белок, связывающийся с оператором или промотором данного гена и блокирующий связывание с этими элементами РНК-полимеразы.

Рестрнктаза, рестрицирующая эндонуклеаза (Restriction cndonuclcasc) Бактериальный фермент, расщепляющий двухцепочечную молекулу ДНК в специфических сайтах.

Рссгрикционная карга (Restriction map) Диаграмма расположения на молекуле ДНК сайтов узнавания ре- стриктазами.

Ретровирусы (Retrovinises) Группа РНК-содержащих вирусов, содержащих обратную транскритггазу; синтезированная на РНК-матрице двухцепочечная ДНК может встраиваться в хромосому инфицированной этим вирусом клетки.

Рецессивный аллель (ген) [Recessive alete (gene)] Аллель, кодирующий признак, который проявляется только у особей, несущих этот аллель в гомозиготном состоянии.

Рибоза (ffibose) Пятиуглеродный моносахарид. Входит в состав РНК.

Рибознм (Ribozyme) Молекула РНК, обладающая ферментативной активностью.

Рибонуклеиновая кислота, РНК (Ribonucleic acid, RNA) Нуклеиновая кислота, состоящая из рибонуклеотидов, у которых сахаром является рибоза, а одним из пири- мидинов — урацил (вместо тимина),

Рибосома (RlMttome) Клеточная органелла, рибонук- леопротеидная частица, при участии которой осуществляется синтез белка (трансляция). Состоит из двух субчастиц, большой и малой.

Рибосомная РНК, рРНК (Ribosomal RNA, rRNA) РНК, входящая в состав рибосом.

Гибулозо 1,5 йисфосфат-карбоксилаза (Rjbulozo bisphosphate carboxylasc) Наиболее распространенный фермент, присутствующий в тканях всех зеленых растений и ответственный за связывание диоксида углерода на начальном этапе фотосинтеза.

Ризосфера (Rhizosphere) Слой почвы, непосредственно примыкающий к корням растений и характеризующийся повышенным содержанием микроорганизмов.

РНК-полимераза (RNA polymerase, RNA synthetase)

Фермент, осуществляющий синтез РНК из рибонукле- озидтрифосфатов. Матрицей может служить ДНК или РНК, соответствующие РНК-полимеразы называют ДНКили РНК-зависимыми.

Rec А Бактериальный белок, участвующий в рекомбинации и репарации ДНК,

Rhlzobium Вездесущие бактерии, обитающие в корнях растений или в примыкающем к ним слое почвы.

Сайг встраивания (клонирования) (Cloning site) Специфический участок векторной молекулы, к который встраивают фрагмент чужеродной ДНК. Очень часто это уникальный сайт рестрикции.

Сайт рестрикции (Restriction site) Нуклеотидная последовательность в молекуле ДНК, узнаваемая рестри- ктазой. Обычно представляет собой короткий палиндром.

Сайт-специфический мутагенез (Site-specific itiutagene- sis) Внесение in vitro мутации в конкретный сайт клонированной последовательности. Позволяет идентифицировать функциональные участки в молекулах белков и получать белки с заранее заданными свойствами. Иногда называется олигонуклеотид-направлен- ным мутагенезом.

Самореплицирующийся элемент (Sdf-replicating element) В нехромосомная молекула нуклеиновой кислоты, способная к независимой от хромосомной ДНК (автономной) репликации. Примером такою элемента служит плазмида,

Сантиморганида, сМ (Centimorgan) Единица измере- ния расстоянии на генетической карте. 1 сМ соответствует расстоянию между генами, рекомбинация между которыми происходит с частотой \%. Для хромосом человека 1 сМ равна примерно 106 п.н. Эта единица была введена Т.Мограном, когда он проводил эксперименты по изучению генетического сцепления у

Drosophila.

Саузери-блоттинг (Southern blotting) Обнаружение специфических нуклеотидных последовательностей путем переноса денатурированных молекул ДНК, подвергнутых электрофорезу, с агарозного геля на нитроцеллю- лозный или наилоновый фильтр за счет капиллярного эффекта и гибридизации с меченым зондом, комплементарным искомой последовательности.

Секвенирующий гель (Sequencing gel) Длинная пластина полиакриламидного геля, позволяющая проводить электрофоретическое разделение олиго- и полинук- леотидов, различающихся подлине всего на 1 нуклео- тид.

Секреция (Secretion) Выведение веществ из клетки во внешнюю среду.

Селекция (Selection) i, Наука о методах создания новых сортов культурных растений и пород животных.

2. Отбор нужных организмов (клеток) в смешанной популяции.

СЕРН {Centre d'Etude de Polymorphisme Humain)

(сложного белкового комплекса сыворотки крови) и ферментативных реакций, запускаемая в ответ на образование комплекса антиген—антитело.

Центр по изучению поли морфиамн у человека, находящийся в Париже. Располагает базой данных по генетической и молекулярно-генетической изменчивости популяций человека из большинства регионов земного шара.

Серстип (Serotype) Антигенная характеристика клетки (бактерии, клетки крови и т.д.), установленная на основе ее взаимодействия с антителами.

Сибсы (Sibses) Прямые потомки одних и тех же роди- телей (братья и/или сестры).

Сигма-фактор (Sigma factor) Бактериальный белок, об УС печи паю щи и узнавание ДНК-полимеразой ее участка связывания в молекуле ДНК и инициацию транскрипции.

Сигнал полиадетитрования (Polyadenylation sygnal) Нуклеогидная последователи ι петь, ответственная за окончание транскрипции и детерминирующая ферментативное присоединение остатков адеиина к З'-концу молекулы мРНК.

Сигнальная последовательность (Signal region, initiator element) Нуклеогидная последовательность в гене, служащая местом связывания белка (фактора транскрипции), который регулирует транскрипцию.

Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лн- дериый пептид (Signal peptirie) N-концевой участок белковой молекулы длиной 15—30 аминокислот, обес- печивающий секрецию белка (перенос через мембрану). После секреции этот участок отшепляется от белковой молекулы.

Скдерофор (Siderophore) Низкомолекулярное вещество, эффективно связывающее железо. Синтезируется многими почвенными микроорганизмами, обеспечивая их железом, которое затем поставляется растениям, находящимся с этими микроорганизмами в симби- отических отношениях.

Симбиоз (Symbiosis) Сосу шествование разных организмов, при котором каждое из них выполняет свои функции, В некоторых случаях взаимовыгодно.

Синдром (Syndrome) Совокупность ряда симптомов (признаков), характерных для данного заболевания.

Система комплемента (Complement cascade) Серия последовательных процессов активации комплемента

Скрещивание (Gross, crossing, mating) Однократное скрещивание генетически различающихся организмов.

Скрининг (Screening) Метод (или комплекс методов) идентификации единичного объекта (особи в популяции, клетки с искомыми свойствами, участка нуклео- тидной последовательности и т.д.) путем перебора большого числа объектов.

Соматическая клетка (Somatic cell) Любая неполовая клетка многоклеточного организма.

Сопряжение (Coupling) Конфигурация, при которой две доминантные или две рецессивные формы двух разных генов находятся на одной хромосоме. Аналогично цис-конфигурации. Си. также Отталкивание.

Сплайсинг (Splicing) Вырезание из предшественника мРНК интронов и кова-'ienTHoe соединение экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.

Стационарное состояние (Steady state) Состояние непрерывного процесса ферментации, при котором число клеток, удаляемых из ферментера и поступающих в него, одинаково,

Стволовые клетки (Stem cells) Митотически активные стволовые клетки, в результате деления которых происходит замещение погибших клеток в многоклеточном организме.

Структурный ген (Structural gene) Ген, кодирующий какой либо белок.

Ступенчатый разрыв (Staggered cut) Разрезание двуше- почечной ДНК, при котором разрывы в комплементарных цепях располагаются не строго один напротив другого, а немного смешены.

Субклонирование (Subcloning) Перенос части уже клонированной молекулы ДНК в другой клонирующий вектор.

Субстрат (Substrate) Вещество, превращение которого катализируется специфическим ферментом.

Суотплизин (Subtilisin) Протеолетический фермент, синтезируемый клетками Bacillus substilis.

Субьединичная вакцина (Subunit vaccine) Вакцина, содержащая лишь отдельные компоненты патогенного ми кроорганизма.