Модифицируются не только аминокислотные остатки в границах N(C)-концевых доменов, но и аминокислотные остатки в составе глобулы Особый интерес представляют модификации аминокислотных остатков, контактирующих с ДНК
вариантные гистоны
Вариантные гистоны кодируются отдельными генами и включаются в нуклеосомы по независящему от репликации пути
Н1
Н2А
H2B
Н3
Н5 в эритроцитах птиц варианты Н11-Н18 в мышиных клетках
macro H2A - 64% гомологии с H2A (в неактивной копии Х хромосомы)
H2A-Bbd – 42% гомологии с H2A |
(в активном хроматине) |
|
H2A.Z |
|
(в активном и неактивном хроматине) |
H2A.X |
|
( после фосфорилирования |
|
|
маркирует мишени для репарации) |
есть вариантные формы, специфичные для семенников
|
СENP-A |
(центромерный белок) у человека |
|
|
Cse4 |
(chromosome segregation protein 4 in Saccharomyces cerevisiae |
|
|
CID |
(centromere identifier in Drosophila melanogaster) |
|
|
|
|
|
|
Н.3.3 |
|
(активный хроматин) |
|
|
|
|
H4 нет вариантных форм
A - аланин; S – серин; V – валин; M – метионин; I - изолейцин; G - глицин
«Основные» и «вариантные» формы гистонов кодируются разными генами
H2A |
L1 |
acidic |
|
patch |
docking domain |
|
взаимодействие с N-концевым доменом
Н4 соседней нуклеосомы, контроль упаковки в компактные структуры
Докинг домен взаимодействует с N-концевым доменом H3 модулирует его связывание с ДНК на входе и выходе из нуклеосомы
взаимодействие между L1 петлями двух H2A способствует удержанию димеров в составе нуклеосомы
Bönisch C , and Hake S B Nucl. Acids Res. 2012;40:10719- 10741
Amino acid sequences of human H2A variants.
Bönisch C , and Hake S B Nucl. Acids Res. 2012;40:10719- 10741
© The Author(s) 2012. Published by Oxford University Press.
Нуклеосомы, построенные
при участии Н2A.Bdd защищают от нуклеазной атаки 125 п.н. ДНК, а не 145 п.н., как обычные нуклеосомы
Промоторы, инсуляторы, энхансеры и другие регуляторные последовательности ДНК обычно располагаются в участках гиперчувствительности к ДНКазе I.
Раньше считали, что в этих участках вообще нет нуклеосом.
В последнее время появились основания считать, что там расположены особые нестабильные нуклеосомы, в состав которых одновременно входят вариантные гистоны H2A.Z и H3.3