- •1. Предмет и задачи биофизики
- •2. Развитие и становление биофизики как науки
- •8. Колебательные процессы в биологии. Значение их теоретического исследования. Предельные циклы и тд.
- •9. Кинетика ферментативных реакций. Особенности механизма ферментативных процессов.
- •10. Стационарная кинетика ферментативных реакций.. Уравнение михаэлиса-ментен. Влияние различных факторов.
- •11. Множественность стационарных состояний биологических систем. Модели триггерного типа.
- •12. Влияние температуры на скорость реакций в био системах. Теория абсолютных скоростей реакций и активириванного комплекса.
- •19. Связь энтропии и информации в биологических системах. Понятия количества и ценности информации. Условия запасания, хранения и переработки информации в макромолекулярных системах.
- •20. Общие понятия стабильности конфигурации молекул, энергия связи. Макромолекула как основа организации биоструктур. Своеобразие макромолекул как физического объекта.
- •3.1.3. Электронные конфигурации двухатомных молекул
- •Анализ заселенностей орбиталей по Малликену. Понятие о зарядах и порядках связей.
- •2.3. Объёмное взаимодействие. Переходы глобула - клубок в биополимерах.
- •2.4. Условия существования клубка и глобулы.
- •2.5. Различные типы взаимодействия в макромолекулах.
- •2.7. Ориентационное взаимодействие.
- •2.8. Индукционное взаимодействие.
- •2.9. Дисперсионное взаимодействие.
- •2.10. Водородная связь и электростатические взаимодействия.
- •2.11. Физическая природа водородной связи.
- •2.12. Электростатические взаимодействия.
- •22. Факторы стабилизации макромолекул, надмолекулярных структур и биомембран.
- •23. Взаимодействие макромолекул с растворителем. Состояние воды и гидрофобные взаимодействия в биоструктурах. Переходы спираль-клубок.
- •24. Особенности пространственной организации белков и нуклеиновых кислот. Модели фибриллярных и глобулярных белков.
- •25. Топология кольцевых замкнутых
- •27. Сворачивание полипептида в белковую глобулу
- •28. Методы изучения конформационной подвижности: изотопный обмен, люминесцентные методы, спиновая метка, гамма-резонансная метка ямр высоко разрешения, импульсные методы ямр.
- •32. Современные представления о механизмах действия ферментов.
- •56. Типы фотохимических реакций
- •59. Кинетика фотобиологических процессов и зависимость от интенсивности света. Фотосенсибилизация.
- •61. Кинетика и физические механизмы переноса электрона в электронтранспортных цепях фотосинтеза. Механизмы сопряжения овр с трансмембранным переносом протона. Механизмы фосфорилирования.
- •62. Особенности и механизмы фотоэнергетических реакций бактериродопсина и зрительного пигмента родопсина.
- •64. Использование различных видов излучений в медицине, технике и с/х.
- •65. Первичные и начальные биологические процессы поглощения энергии ионизирующих излучений.
- •66. Единицы активности радионуклеотидов. Единицы доз ионизирующих излучений.
- •69.Действие малых доз и хронического облучения. Отдаленные последствия малых доз радиации на организм.
- •70. Факторы, модифицирующие лучевое поражение: радиопротекторы и радиосенсибилизаторы, их химическая природа и биологическое действие.
61. Кинетика и физические механизмы переноса электрона в электронтранспортных цепях фотосинтеза. Механизмы сопряжения овр с трансмембранным переносом протона. Механизмы фосфорилирования.
Последовательность
отдельных реакций в фотобиологических
процессах включает следующие стадии:
поглощение кванта света хромофорной
группой и образование электронно-возбужденных
состояний -> миграция энергии
электронного возбуждения-> o первичный
фотофизический акт и появление первичных
фотопродуктов —> образование первичных
стабильных химических соединений ->
физиолого-биохимические процессы ->
конечный фотобиологический эффект.
В основе первичных процессов фотосинтеза
лежит сложная совокупность окислительно-
восстановительных реакций переноса
электрона в электрон-траспортной цепи
(ЭТЦ). (Картинка Z-схема)
ФС2 и ФС1 функционируют последовательно: донором электронов для ФС1 служат восстановленные в результате действия ФС2 фотопродукты. Дальний красный свет (лямбда > 680нм) поглощается преимущественно пигментами ФС1 и вызывает окисление цитохрома, который восстанавливается ФС2 при поглощении коротковолнового света (дл.волны < 680нм). Оптимальная интенсивность фотосинтеза наблюдается при определенном соотношении между количеством возбужденных ФС1 и ФС2, которое зависит от спектрального состава света. Поглощение света происходит пигментами светособирающего (СС) пигмент - белкового (ПБ) комплекса (ССПБК), от которого, как из резервуара, энергия возбуждения передается на пигмент - белковые комплексы ФС1 и ФС2 (ПБК1 и ПБК2) и далее непосредственно к реакционным центрам РЦ1 и РЦ2. В зависимости от конформационного состояния фотосинтетических мембран изменяется топография расположения ПБК1 и ПБК2 , их связь с ССПБК, и распределение энергии возбуждения между ФС1 и ФС2. Это определяется присутствием ионов в среде, рН среды, степенью фосфорилирования и поверхностным зарядом белков ССПБК.
Основной
принцип работы РЦ заключается в том,
что при попадании возбуждения от
(ПБК) в фотоактивный пигмент (Р) самого
РЦ происходят отрыв электрона и
восстановление первичного акцептора
(А1),
который затем передает электрон
следующему акцептору (А2)
и так далее по ЭТЦ. (картинка - передача
е)
Восстановление
Р+ происходит затем от доноров электрона
в ЭТЦ. В качестве A1 в РЦ выступают
производные порфириновых молекул
(например, феофитин в РЦ2), а роль
вторичного акцептора выполняют
молекулы хинона (РЦ пурпурных бактерий),
пластохинона (РС2) или железосерные
белки (РЦ1). Эффективность отрыва
электрона от Р+ и переноса его на
А1 достигает
95 - 98% и происходит за времена несколько
пикосекунд (1пс=10-12 с). Если в РЦ исходно
в темноте вторичный акцептор химически
восстановлен, то после появления
электрона на А1 происходят
его рекомбинация с Р+ за 5 - 10 нс и появление
Р+. Это сопровождается замедленным
свечением. (картинка – замедленное
свечение).
В РЦ пурпурных бактерий кинетика переноса электрона между Р (димер бактериохлорофилла), A1(бактериофеофитин БФФ), А2 (первичный хинон QA), Аз (вторичный хинон Qb)
–
Общая схема первичных процессов бактериального типа,
где
внешним источником электронов для
восстановления НАД служит сереводород,
органические молекулы. Цитохром
СН обеспечивает
циклический поток электронов, а
цитохром Cl - связь циклического переноса
с внешними донорами электронов. +
картинка реакции в РЦ пурпурных
бактерий.
Важнейшая особенность функционирования РЦ состоит в том, что отдельные стадии переноса электрона могут протекать эффективно и при низких температурах, вплоть до температур жидкого азота и жидкого гелия.
Первичный хинон, получив в РЦ электрон, изменяет характер своего движения и переходит на другую конформационную координату, соответствующую его восстановленному состоянию. Здесь он, достигнув определенного контактного состояния со вторичным хиноном, отдает ему электрон. При низких температурах подвижность первичного хинона падает, а следовательно, уменьшается и эффективность переноса электрона от него на вторичный хинон. Если, однако, образец медленно охлаждать в условиях постоянного интенсивного освещения, когда в результате действия света и отрыва электрона от Р молекулы первичного хинона в основном находятся в восстановленном состоянии, то картина существенно изменяется.
Картинка
«передача е на пул Пх».
Семихиноныхарактеризуются
поглощением в спектральной области
320-450 нм (первая вспышка). После второй
вспышки света происходит образование
дважды восстановленного хинона Q2-B и
исчезновение полосы поглощения
семихинона. Молекула Q2-B протонируется
из внешнего окружения и обменивается
с одной молекулой хинона из пула Пх,
занимая ее место. Система возвращается
в исходное состояние с той лишь разницей,
что одна молекула пула теперь
протонирована: ПхН2. Третья вспышка
опять приводит к образованию семихинонных
радикалов и соответствующему
увеличению поглощая. Картинка «общая
схема процесса».
Образованный
дважды восстановленный вторичный хинон
QвH2 быстро
окисляется при достаточно высоких
окислительно-восстановительных
потенциалах среды. Семихинонный
вторичный акцептор более стабилен и
медленно окисляется за счет реакции
с окисленной формой медиатора.
Механизм окислительного фосфорилирования
Механизм фосфорилирования АТФ, сопряженный с работой электон-транспортной цепи на мембранах (хлоропластов и митохондрий), был расшифрован в 1961 году английским биохимиком Питером Митчеллом, лауреатом Нобелевской премии (1978).
Процесс образования АТФ, сопряженный с линейным перемещением электронов от ФС II к ФС I называют нециклическим фосфорилированием. В процессе восстановления реакционного центра ФС I за счет электронного транспорта от ФС II между фотосистемами может возникнуть еще один поток электронов: от ферредоксина (Фд) фотосистемы I к комплексу цитохромов (b6/f) фотосистемы II. При этом НАДФ+ не восстанавливается, а освобождающаяся энергия используется для фосфорилирования АДФ и образования макроэргической фосфатной связи АТФ. В итоге создается замкнутый электронный поток, при котором электроны, возбужденные в ФС I, не переходят на НАДФ+, а возвращаются в электрон-транспортную цепь на один из ее участков – «выше по течению». При этом перенос электронов по цепи сопровождается поступлением («перекачкой») протонов через тилакоидную мембрану. Возникающий в связи с этим электрохимический градиент обеспечивает синтез АТФ. Этот процесс называют циклическим фосфорилированием. Синтезированная АТФ переходит в строму хлоропласта.
Таким образом, во время световой фазы фотосинтеза благодаря энергии солнечного света синтезируется АТФ, образуется восстановленный НАДФ·Н и как побочный продукт выделяется кислород. В этом заключается основная функция световой фазы фотосинтеза.
