- •Селеноцистеин nh2-ch(ch2-SeH)-cooh
- •Первичная структура - определяется последовательностью аминокислот в пептидной цепочке, стабилизируется ковалентными пептидными связями (инсулин, пепсин, химотрипсин).
- •Вторичная структура - пространственная структура белка. Это либо -спираль, либо -складчатость. Создаются водородные связи.
- •1.Простые(протеины)-Ак. Нет небелковых добавок
- •2Й эт. Дифференциальное центрифугирование (субфракционирование)
- •Vmax – активные центры всех молекул
- •Накапл. [s]
- •Конц. Продуктов ph мала (нет ингибиторов)
- •Прямой конкурентный формат ифа использует иммобилизованые на твердой фазе специфические антитела, а меченый ферментом и немеченый антиген конкурируют за связь с иммобилизованным антителом.
- •В непрямом конкурентном формате ифа используются меченные ферментом антитела (специфические или вторичные) и иммобилизованный на твердой фазе конъюгат антиген-белок-носитель.
- •Биосинтез и катаболизм пуриновых нуклеотидов. Регуляция биосинтеза.
- •Катаболизм пуриновых нуклеотидов. Причины формирования гиперурикемии. Пути лечебного воздействия при подагре.
- •Биосинтез и катаболизм пиримидиновых оснований. Регуляция биосинтеза.
- •Синтез пиримидинов de novo. Причины формирования оротацидурии. Пути лечебного воздействия при оротацидурии.
- •Строение и физико-химические свойства днк.
- •Методы исследования структуры днк. Гибридизация, секвенирование, пцр.
- •Строение и функции рнк.
- •Репликация днк у прокариот. Свойства днк-полимераз прокариот. Ингибиторы репликации.
- •Репликация днк у эукариот. Свойства днк-полимераз эукариот. Ингибиторы репликации.
- •Инициация, элонгация и терминация транскрипции у прокариот. Днк- зависимая рнк-полимераза прокариот.
- •Инициация, элонгация и терминация транскрипции у эукариот. Днк- зависимые рнк-полимеразы эукариот.
- •Процессинг рнк у прокариот и эукариот.
- •Активирование аминокислот. Инициация трансляции у прокариот и эукариот.
- •Процесс трансляции у прокариот. Ингибиторы трансляции.
- •Процесс трансляции у эукариот. Ингибиторы трансляции.
- •Регуляция экспрессии генов.
- •Факторы мутагенеза. Виды мутаций. Антимутагенная защита.
- •Молекулярные механизмы канцерогенеза. Пути активации протоонкогенов.
- •Источники и пути расходования аминокислот в организме. Азотистый баланс. Реакции образования и детоксикации аммиака в организме.
- •Детоксикация аммиака в организме. Цикл синтеза мочевины.
- •Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов цикла синтеза мочевины. Методы определения концентрации мочевины в крови и моче. Причины формирования и диагностическое значение азотемии.
- •Общие реакции обмена аминокислот. Кетогенные и глюкогенные аминокислоты.
- •Реакция декарбоксилирования аминокислот. Синтез биогенных аминов: гистамина, серотонина, катехоламинов. Общий путь распада биогенных аминов.
- •Обмен фенилаланина и тирозина. Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов обмена этих аминокислот.
- •Биологически активные производные тирозина. Локализация синтеза и их роль в организме.
- •Биосинтез креатина, креатинфосфата в организме. Диагностическое значение креатина и креатинина. Карнитин, карнозин, ансерин. Их роль в организме.
- •Синтез и катаболизм гема. Значение конъюгирования продуктов метаболизма гема в печени.
- •Причины гипербилирубинемии, виды желтух. Диагностическое значение общего, прямого и непрямого билирубина. Метод определения билирубина в крови.
- •6. Энергетический обмен
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата. Пируватдегидрогеназный ферментный комплекс.
- •Цикл лимонной кислоты. Локализация, регуляция, функции.
- •Строение митохондрий и организация электрон-транспортной цепи. Ингибиторы дыхательной цепи.
- •Общие и специфические пути катаболизма белков, жиров и углеводов (по Кребсу). Виды биологического окисления.
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата. Пируватдегидрогеназный ферментный комплекс.
- •Цикл лимонной кислоты. Локализация, регуляция, функции.
- •Строение митохондрий и организация электрон-транспортной цепи. Ингибиторы дыхательной цепи.
- •1 Комплекс. Надн-коq-оксидоредуктаза
- •3 Комплекс. КоQ-цитохром с-оксидоредуктаза
- •Строение атф-синтетазы митохондрий. Механизм сопряжения окисления и фосфорилирования. Разобщение процессов.
- •Дыхательная цепь и теплопродукция. Коэффициент р/о. Потоки важнейших метаболитов, поступающих в митохондрии и выходящих из них.
- •Системы микросомального окисления. Строение, изоформы цитохрома р450. Участие в эндогенном обмене и детоксикации.
- •Образование активных форм кислорода. Роль афк в организме, их токсичность. Антиоксидантная система.
- •70. Строение и функции углеводов в организме.
- •71. Строение и функции протеогликанов в организме. Причины мукополисахаридозов.
- •72. Глюкоза как важнейший метаболит углеводного обмена. Источники и пути использования глюкозы в организме.
- •73. Катаболизм глюкозы в присутствии кислорода (аэробный гликолиз).
- •74. Катаболизм глюкозы в анаэробных условиях (анаэробный гликолиз).
- •75. Пути образования и использования пировиноградной кислоты в клетках (напишите все ферментативные реакции).
- •76. Челночные механизмы переноса восстановленных эквивалентов через митохондриальную мембрану (глицерофосфатный и малатаспартатный).
- •77. Окисление углеводов в аэробных условиях до со2 и н2о. Энергетический выход окисления глюкозы. Метаболическая регуляция, влияние ингибиторов.
- •78. Глюконеогенез: локализация, функции, регуляция. Особенности регуляции гликолиза и глюконеогенеза в гепатоцитах.
- •86. Окисление жирных кислот. Реакции β-окисления насыщенных жирных кислот. Локализация, энергетический выход, регуляция процесса.
- •87. Окисление жирных кислот. Реакции α-окисления, ω-окисления жирных кислот. Окисление полиненасыщенных жирных кислот, жирных кислот с нечетным количеством атомов углерода.
- •88. Синтез и использование кетоновых тел. Причины и механизмы развития кетоацидоза.
- •89. Образование триацилглицеринов из углеводов. Метаболизм триацилглицеринов. Энергетическое использование глицерина. Депонирование и мобилизация жиров.
- •91. Происхождение, строение и функции желчных кислот. Энтерогепатическая циркуляция. Образование «холестериновых» камней при желчнокаменной болезни.
- •92. Строение, классификация, метаболизм и функции липопротеинов. Дислипопротеинемии.
- •93. Методы определения общего холестерина в крови. Информативность данного показателя для диагностики атеросклероза, индекс атерогенности. Механизм развития атеросклероза.
- •103. Эйкозаноиды и их роль в процессах регуляции.
- •104. Калликреин-кининовая и ренин-ангиотензиновая системы организма.
- •105. Интеграция и регуляция метаболизма. Направление потоков ключевых метаболитов между различными метаболическими путями.
Репликация днк у эукариот. Свойства днк-полимераз эукариот. Ингибиторы репликации.
См. 41, НО:
В синт. Эу- DNA уч. 5 DNA-pol: α, β, γ, δ, ε. α,δ – на лид. цепи, α,δ/ε,β – на отстающей. α (I) иниц. репелик. (синт. праймера: 8-10 Rib-нклтд)+ ок. 50 dRib-нклтд, β (III) устраняет бреши между фрагм. Оказ., γ – мтх DNA, δ (II) и ε: RNA-праймер на ост. цепи удлин. до встречи с др. праймером.
Инициация, элонгация и терминация транскрипции у прокариот. Днк- зависимая рнк-полимераза прокариот.
Трнскр – счит. инф. с 1sDNA на мол. mRNA. У про- сопр. с трансляцией, обр. готов. mRNA; rRNA и tRNA обр. в виде предшеств.
Факторы трнскр: DNA-d RNA-pol (только полимеразная акт-ть 5’→3’), DNA-матрица, NTP, Mg2+ (катализ).
DNA-d RNA-pol у про-: 5 с/ед (2α – 40 кДа, форм. каркас RNA-pol, спос. вз/д с промотером;
β – 155 кДа, RNA-pol акт-ть;
β’ – 160 кДа, св. ферм. с DNA, есть шип;
ω – 60 кДа, то же, что α).
+ σ (85 кДа) – иниц. транскр. (м.б. много).
У компл. бол. (–) зар. (наиб. – у σ) – нар.; внутр. – (+) зар. → хор. св. с фосф. гр. DNA. В акт. ц – Mg2+ (для присоед. нклтд). NTP св. с Mg2+ → необх. 2 иона. В β’ – шип (разделяет DNA-RNA гибрид).
Ед. трнскр = оперон. p–o–A–B–C–t.
p → узнав., инициация. o → оператор (св. индукт. или репресс., вкл./выкл. p+o = 5’-UTR. t=terminator=3’-UTR (UnTranslated Region). A, B, C – структурные гены. Интронов нет.
→ ПОЛИЦИСТРОННАЯ mRNA (код. неск. б., у эу- – в мтх).
Ингибиторы транскрипции: рифампицины (ингиб. бакт. DNA-d RNA-pol, препятств. инициации транскрипции), интеркаляторы (актиномицин D, антималярийные преп.), гепарин (преп. св. с промотером), амантин (яд блед. пог., блок. акт-ть RNA-pol III).
Этапы.
(1) Инициация. Праймер не треб., т.к. есть промотор, кот. нацелив. DNA-d RNA-pol. Присоед. DNA-d RNA-pol → start point (где присоед. 1 нклтд, далее → 3’=upstream=(–), →5’=downstream=(+) ). TATAAT = Pribnow box, часть промотора (энхансер), прибл. на 10 пар нклтд выше точки начала трнскр.
Ведущая с/ед у про- в иниц. – σ (присоед. к ТАТААТ). В обл. upstream (→3’) – промотор (узнав. по 2 точкам). Энхансеры – акт., сайленсеры – торм.
(2) Элонгация. Рег. мол. действ. на факт. транскр. (TBP-б. → рег. генов, отв. за p53, NFκβ, эстрогенов. Rs). Синт. pre-RNA. У про- и эу- одинаково. RNA-pol 5’→3’: узнав. промтороа, плавление промотора, движ. фермента, синтез, до ter.
(3) Терминация. 1) при участии ρ-фактора (гексамер): св. с растущей цепью RNA, движ. → догоняет RNA-pol и св. с ней; на DNA – ter уч-ок (мн. C, G), б. св. с ферм., ведет к расплет.; ρ св. с RNA-pol. 2) без ρ-белка. В обл. ter – палиндромы (мн. C, G), далее – мн. А («шпилька»).
Инициация, элонгация и терминация транскрипции у эукариот. Днк- зависимые рнк-полимеразы эукариот.
DNA-d RNA-pol у эу-: 3 ядерных, 1 мтх. Гетеромультимерн. компл. Сходство с про- в β-с/ед (символика другая).
RNA-pol I – 14 с/ед – ядрышки – 45S rRNA
RNA-pol II – 12 с/ед – нукл/пл – hnRNA, snRNA
RNA-pol III – 17 с/ед – нукл/пл – tRNA, 5S rRNA, scRNA, snRNA
Ед. трнскр = транскриптон. Зоны: информативная (стр. гены: интроны и экзоны, терминатор) и неинформативная (промтор, гены оператора).
→ МОНОЦИСТРОННАЯ mRNA
Ингибиторы транскрипции: рифампицины (ингиб. бакт. DNA-d RNA-pol, препятств. инициации транскрипции), интеркаляторы (актиномицин D, антималярийные преп.), гепарин (преп. св. с промотером), амантин (яд блед. пог., блок. акт-ть RNA-pol III).
Этапы.
(1) Инициация. Праймер не треб., т.к. есть промотор, кот. нацелив. DNA-d RNA-pol. Присоед. DNA-d RNA-pol → start point (где присоед. 1 нклтд, далее → 3’=upstream=(–), →5’=downstream=(+) ). У эу- в промоторе – ТАТА-box = бокс Голдберга-Хогнесса.
RNA-pol I – промотор аналогичен прокариотическому; ТАТА.
RNA-pol II – синт. hnRNA; 3 тчк узнав.: TATA box, CAAT box, GC box.
RNA-pol III – счит. инф. для 5S, для них промотор в обл. downstream.
Энхзанс. – акт., сайленс. – торм. Ок. 10% генома – кодировка факт. транскр. (ок. 2 600 б.) Б.-факт. транскр. сод. DNA-binding домен или комплем. др. факт. транскр.
(2) Элонгация. Рег. мол. действ. на факт. транскр. (TBP-б. → рег. генов, отв. за p53, NFκβ, эстрогенов. Rs). Синт. pre-RNA. У про- и эу- одинаково. RNA-pol 5’→3’: узнав. промтороа, плавление промотора, движ. фермента, синтез, до ter.
(3) Терминация. У эу- есть факт. терминации. ter сод. мн. А. RNA-pol дефосфорилир. → неакт.