- •Селеноцистеин nh2-ch(ch2-SeH)-cooh
- •Первичная структура - определяется последовательностью аминокислот в пептидной цепочке, стабилизируется ковалентными пептидными связями (инсулин, пепсин, химотрипсин).
- •Вторичная структура - пространственная структура белка. Это либо -спираль, либо -складчатость. Создаются водородные связи.
- •1.Простые(протеины)-Ак. Нет небелковых добавок
- •2Й эт. Дифференциальное центрифугирование (субфракционирование)
- •Vmax – активные центры всех молекул
- •Накапл. [s]
- •Конц. Продуктов ph мала (нет ингибиторов)
- •Прямой конкурентный формат ифа использует иммобилизованые на твердой фазе специфические антитела, а меченый ферментом и немеченый антиген конкурируют за связь с иммобилизованным антителом.
- •В непрямом конкурентном формате ифа используются меченные ферментом антитела (специфические или вторичные) и иммобилизованный на твердой фазе конъюгат антиген-белок-носитель.
- •Биосинтез и катаболизм пуриновых нуклеотидов. Регуляция биосинтеза.
- •Катаболизм пуриновых нуклеотидов. Причины формирования гиперурикемии. Пути лечебного воздействия при подагре.
- •Биосинтез и катаболизм пиримидиновых оснований. Регуляция биосинтеза.
- •Синтез пиримидинов de novo. Причины формирования оротацидурии. Пути лечебного воздействия при оротацидурии.
- •Строение и физико-химические свойства днк.
- •Методы исследования структуры днк. Гибридизация, секвенирование, пцр.
- •Строение и функции рнк.
- •Репликация днк у прокариот. Свойства днк-полимераз прокариот. Ингибиторы репликации.
- •Репликация днк у эукариот. Свойства днк-полимераз эукариот. Ингибиторы репликации.
- •Инициация, элонгация и терминация транскрипции у прокариот. Днк- зависимая рнк-полимераза прокариот.
- •Инициация, элонгация и терминация транскрипции у эукариот. Днк- зависимые рнк-полимеразы эукариот.
- •Процессинг рнк у прокариот и эукариот.
- •Активирование аминокислот. Инициация трансляции у прокариот и эукариот.
- •Процесс трансляции у прокариот. Ингибиторы трансляции.
- •Процесс трансляции у эукариот. Ингибиторы трансляции.
- •Регуляция экспрессии генов.
- •Факторы мутагенеза. Виды мутаций. Антимутагенная защита.
- •Молекулярные механизмы канцерогенеза. Пути активации протоонкогенов.
- •Источники и пути расходования аминокислот в организме. Азотистый баланс. Реакции образования и детоксикации аммиака в организме.
- •Детоксикация аммиака в организме. Цикл синтеза мочевины.
- •Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов цикла синтеза мочевины. Методы определения концентрации мочевины в крови и моче. Причины формирования и диагностическое значение азотемии.
- •Общие реакции обмена аминокислот. Кетогенные и глюкогенные аминокислоты.
- •Реакция декарбоксилирования аминокислот. Синтез биогенных аминов: гистамина, серотонина, катехоламинов. Общий путь распада биогенных аминов.
- •Обмен фенилаланина и тирозина. Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов обмена этих аминокислот.
- •Биологически активные производные тирозина. Локализация синтеза и их роль в организме.
- •Биосинтез креатина, креатинфосфата в организме. Диагностическое значение креатина и креатинина. Карнитин, карнозин, ансерин. Их роль в организме.
- •Синтез и катаболизм гема. Значение конъюгирования продуктов метаболизма гема в печени.
- •Причины гипербилирубинемии, виды желтух. Диагностическое значение общего, прямого и непрямого билирубина. Метод определения билирубина в крови.
- •6. Энергетический обмен
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата. Пируватдегидрогеназный ферментный комплекс.
- •Цикл лимонной кислоты. Локализация, регуляция, функции.
- •Строение митохондрий и организация электрон-транспортной цепи. Ингибиторы дыхательной цепи.
- •Общие и специфические пути катаболизма белков, жиров и углеводов (по Кребсу). Виды биологического окисления.
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата. Пируватдегидрогеназный ферментный комплекс.
- •Цикл лимонной кислоты. Локализация, регуляция, функции.
- •Строение митохондрий и организация электрон-транспортной цепи. Ингибиторы дыхательной цепи.
- •1 Комплекс. Надн-коq-оксидоредуктаза
- •3 Комплекс. КоQ-цитохром с-оксидоредуктаза
- •Строение атф-синтетазы митохондрий. Механизм сопряжения окисления и фосфорилирования. Разобщение процессов.
- •Дыхательная цепь и теплопродукция. Коэффициент р/о. Потоки важнейших метаболитов, поступающих в митохондрии и выходящих из них.
- •Системы микросомального окисления. Строение, изоформы цитохрома р450. Участие в эндогенном обмене и детоксикации.
- •Образование активных форм кислорода. Роль афк в организме, их токсичность. Антиоксидантная система.
- •70. Строение и функции углеводов в организме.
- •71. Строение и функции протеогликанов в организме. Причины мукополисахаридозов.
- •72. Глюкоза как важнейший метаболит углеводного обмена. Источники и пути использования глюкозы в организме.
- •73. Катаболизм глюкозы в присутствии кислорода (аэробный гликолиз).
- •74. Катаболизм глюкозы в анаэробных условиях (анаэробный гликолиз).
- •75. Пути образования и использования пировиноградной кислоты в клетках (напишите все ферментативные реакции).
- •76. Челночные механизмы переноса восстановленных эквивалентов через митохондриальную мембрану (глицерофосфатный и малатаспартатный).
- •77. Окисление углеводов в аэробных условиях до со2 и н2о. Энергетический выход окисления глюкозы. Метаболическая регуляция, влияние ингибиторов.
- •78. Глюконеогенез: локализация, функции, регуляция. Особенности регуляции гликолиза и глюконеогенеза в гепатоцитах.
- •86. Окисление жирных кислот. Реакции β-окисления насыщенных жирных кислот. Локализация, энергетический выход, регуляция процесса.
- •87. Окисление жирных кислот. Реакции α-окисления, ω-окисления жирных кислот. Окисление полиненасыщенных жирных кислот, жирных кислот с нечетным количеством атомов углерода.
- •88. Синтез и использование кетоновых тел. Причины и механизмы развития кетоацидоза.
- •89. Образование триацилглицеринов из углеводов. Метаболизм триацилглицеринов. Энергетическое использование глицерина. Депонирование и мобилизация жиров.
- •91. Происхождение, строение и функции желчных кислот. Энтерогепатическая циркуляция. Образование «холестериновых» камней при желчнокаменной болезни.
- •92. Строение, классификация, метаболизм и функции липопротеинов. Дислипопротеинемии.
- •93. Методы определения общего холестерина в крови. Информативность данного показателя для диагностики атеросклероза, индекс атерогенности. Механизм развития атеросклероза.
- •103. Эйкозаноиды и их роль в процессах регуляции.
- •104. Калликреин-кининовая и ренин-ангиотензиновая системы организма.
- •105. Интеграция и регуляция метаболизма. Направление потоков ключевых метаболитов между различными метаболическими путями.
Дыхательная цепь и теплопродукция. Коэффициент р/о. Потоки важнейших метаболитов, поступающих в митохондрии и выходящих из них.
Строение подробно – см. 65.
Принцип работы дыхательной цепи
Образ. в р-иях катаб. NADH и FADH2 передают атомы водорода (т.е. H+ и e) на ферм. дых.цепи.
e движ. по ферментам дых.цепи и теряют энергию.
Эта энергия используется на выкач. Н+ из матрикса в межмембр. пр-во.
В конце дых.цепи e попадают на O2 и восст. его до H2O.
Н+ стремятся обратно в матрикс и проходят через АТФ-синтазу.
При этом они теряют энергию, которая исп. для синтеза ATP.
Т.о., восст. формы NADH+H+ и FADH2 окисляются → присоединение фосфата к ADP, т.е. фосфорилирование. Поэтому все вместе = окислительное фосфорилирование.
СТРОЕНИЕ МТХ: внеш. мембр. проницаема для в-в с М 5-10 кДа (связ. с бол. кол-вом порина, форм. отв. d2-3нм; белок:липид=1:1), внутр. мембр. низкопроницаема, обр. кристы. Легко диффундируют только газы и мол. с М до 150 кДа. До 70% - белки, среди липидов – кардиолипин. Оч. гидрофобна, непрониц. для ионов. Для переноса разл. в-в организованы транслоказы, кот. переносят ADP, ПВК в матрикс, АТР, цитрат, Ас – из матрикса.
Системы микросомального окисления. Строение, изоформы цитохрома р450. Участие в эндогенном обмене и детоксикации.
Микрос. Ох лок. в мембр. sER. Катализ. Ох больш-ва эндогенных субстр. и ксенобиотиков. Исп. мол. О2 и NADPH+H.
Гидроксилирующая сис-ма сост. из 2 комп.: (1) цит.Р450-редуктаза (сод. FAD, FMN). забир. е и Н+ с NADPH+H+, передает на субстрат. (2) цит.Р450 связ. одновр. О2 и субстрат, осущ. гидроксилир. Гемопротеин. 450 – max поглощения в комплексе с СО. Одноврем. связ. и субстрат, и О2.
Цит.Р450 найден ао всех ядросод. кл., оч. много в микросомах печени, в над/поч.
Ф-ии микрос. Ох: (1) участие в биосинтезе, осущ. гидроксилир. при синт. стероидн. горм., желчн. к-т, Ох вит.Д и т.д. (2) участ. в проц. детоксикации: печень и погран. тк.
Ген cyp (код. цитохромы): ок. 50 аллелей, опр. субстртн. специф. цитохрома. Полиморфизм цит → подбор дозы лек. ср-в осущ. индивидуально (напр., варфарина).
13 сем-в цитохромов (цифра), п/сем-во (буква), пор. №. Разные субстранты: CYP1A2 – ацетаминофен, CYP2D6 – бета-адреноблокаторы, CYP2E1 – этанол.
Образование активных форм кислорода. Роль афк в организме, их токсичность. Антиоксидантная система.
АФК – это оч реакц/спос мол., сод. делокализованные одиночные неспаренные электроны. Кроме полного четырехэлектронного восстановления молекулы О2 до воды, в дыхательной цепи митохондрий в аэробных клетках всегда происходит и неполное 1-, 2- и 3-электронное восстановление с образованием АФК по реакции:
O2 (+ ē) → •O2¯ (+ ē, 2H+) → H2O2 (+ ē) → HO• (+ ē, 2H+) → 2H2O
Образование АФК происходит либо ферментативным путем, либо неферментативным, когда донорами электрона служат ионы металлов (Fe2+, Сu2+) или убихиноны, а также сами АФК.
К числу АФК относят супероксид-радикал(•O2), супероксиданион-радикал (•O2¯), гидроперекисный радикал (НО2•), гидроксил-радикал (НО•), перекись водорода (Н2О2), гипохлорит (ClO¯), синглетный кислород (1О2), NO и пероксинитрит (ONOO¯).
АФК генерируются во всех частях клетки. Наибольший вклад вносит дыхательная цепь митохондрий, особенно при низкой концентрации АДФ. Важна роль системы цитохрома Р-450, локализованной в ЭПР. Участвуют ядерная мембрана и другие части клетки, при этом АФК часто возникают не только спонтанно, но и ферментативно (НАДФН-оксидаза дыхательного взрыва в плазматической мембране и ксантиноксидаза в цитоплазме).
АФК вызывают образование органических гидропероксидов ДНК, белков, липидов, а также малых молекул. Гидропероксиды химически тоже активны, при последующем метаболизме они переходят в спирты, альдегиды, эпоксиды и другие окисленные соединения. Образование гидропероксидов называют перекисным окислением.
Наиболее подвержены действию АФК жирные кислоты, содержащие двойные связи, расположенные через СН2-группу. Именно от этой СН2-группы свободный радикал (инициатор окисления) легко отнимает электрон, превращая липид, содержащий эту кислоту, в свободный радикал. ПОЛ – это цепные реакции, в результате которых образуется большое количество частиц, имеющих неспаренный электрон, которые инициируют дальнейшее распространение перекисного окисления.
Состояние, при котором клетка испытывает повышенное воздействие свободных радикалов на фоне недостаточности антиоксидантного потенциала, называется окислительным стрессом.
К прооксидантам в живой клетке относятся высокие концентрации кислорода (возникающие, например, при длительной гипербарической оксигенации), ферментные системы, генерирующие супероксидные радикалы (например, ксантиноксидаза, ферменты плазматической мембраны фагоцитов), ионы двухвалентного железа.
В состав антиоксидантной системы (далее – АОС) входят как низкомолекулярные АО, так и антиоксидантные ферменты.
АОС включает:
1.Ферментативное звено:
1)энзиматические перехватчики, такие как супероксиддисмутаза (СОД), дисмутирующая •О2 до Н2О2, каталаза и глутатионпероксидаза (ГПО), конвертирующие Н2О2 до воды. ГПО вместе с глутатион-S-трансферазой (GSТ) участвует в детоксикации гидропероксидов жирных кислот;
2)ферменты, осуществляющие восст. окисленных низкомол. биоАО (глутатионредуктаза) или участвующие в подд. в функц. активном сост. белковых тиолов (тиоредоксинредуктаза);
3)ферменты, участвующие в подд. внутрикл. стационарного уровня восст. эквивалентов (глюкозо-6-фосфатд ДГ, катализирующая образование НАДФН в пентозофосфатном пути окисления глюкозы);
2.Неферментативное звено:
1)гидрофильные скэвенджеры радикалов: восстановленный глутатион (GSН), аскорбат, урат, тиолы (цистеин, эрготионеин);
2)липофильные перехватчики радикалов: токоферолы, флавоноиды, каротиноиды, убихиноны, билирубин;
3)Антиоксидантные белки, по отдельности относящиеся к ферментативному или неферментативному звену АОС): церулоплазмин, альбумин, ферритин, трансферрин, лактоферрин и др., – участвующие в хранении, транспорте или обезвреживании ионов металлов переменной валентности.
7. ОБМЕН И ФУНКЦИИ УГЛЕВОДОВ
