- •Селеноцистеин nh2-ch(ch2-SeH)-cooh
- •Первичная структура - определяется последовательностью аминокислот в пептидной цепочке, стабилизируется ковалентными пептидными связями (инсулин, пепсин, химотрипсин).
- •Вторичная структура - пространственная структура белка. Это либо -спираль, либо -складчатость. Создаются водородные связи.
- •1.Простые(протеины)-Ак. Нет небелковых добавок
- •2Й эт. Дифференциальное центрифугирование (субфракционирование)
- •Vmax – активные центры всех молекул
- •Накапл. [s]
- •Конц. Продуктов ph мала (нет ингибиторов)
- •Прямой конкурентный формат ифа использует иммобилизованые на твердой фазе специфические антитела, а меченый ферментом и немеченый антиген конкурируют за связь с иммобилизованным антителом.
- •В непрямом конкурентном формате ифа используются меченные ферментом антитела (специфические или вторичные) и иммобилизованный на твердой фазе конъюгат антиген-белок-носитель.
- •Биосинтез и катаболизм пуриновых нуклеотидов. Регуляция биосинтеза.
- •Катаболизм пуриновых нуклеотидов. Причины формирования гиперурикемии. Пути лечебного воздействия при подагре.
- •Биосинтез и катаболизм пиримидиновых оснований. Регуляция биосинтеза.
- •Синтез пиримидинов de novo. Причины формирования оротацидурии. Пути лечебного воздействия при оротацидурии.
- •Строение и физико-химические свойства днк.
- •Методы исследования структуры днк. Гибридизация, секвенирование, пцр.
- •Строение и функции рнк.
- •Репликация днк у прокариот. Свойства днк-полимераз прокариот. Ингибиторы репликации.
- •Репликация днк у эукариот. Свойства днк-полимераз эукариот. Ингибиторы репликации.
- •Инициация, элонгация и терминация транскрипции у прокариот. Днк- зависимая рнк-полимераза прокариот.
- •Инициация, элонгация и терминация транскрипции у эукариот. Днк- зависимые рнк-полимеразы эукариот.
- •Процессинг рнк у прокариот и эукариот.
- •Активирование аминокислот. Инициация трансляции у прокариот и эукариот.
- •Процесс трансляции у прокариот. Ингибиторы трансляции.
- •Процесс трансляции у эукариот. Ингибиторы трансляции.
- •Регуляция экспрессии генов.
- •Факторы мутагенеза. Виды мутаций. Антимутагенная защита.
- •Молекулярные механизмы канцерогенеза. Пути активации протоонкогенов.
- •Источники и пути расходования аминокислот в организме. Азотистый баланс. Реакции образования и детоксикации аммиака в организме.
- •Детоксикация аммиака в организме. Цикл синтеза мочевины.
- •Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов цикла синтеза мочевины. Методы определения концентрации мочевины в крови и моче. Причины формирования и диагностическое значение азотемии.
- •Общие реакции обмена аминокислот. Кетогенные и глюкогенные аминокислоты.
- •Реакция декарбоксилирования аминокислот. Синтез биогенных аминов: гистамина, серотонина, катехоламинов. Общий путь распада биогенных аминов.
- •Обмен фенилаланина и тирозина. Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов обмена этих аминокислот.
- •Биологически активные производные тирозина. Локализация синтеза и их роль в организме.
- •Биосинтез креатина, креатинфосфата в организме. Диагностическое значение креатина и креатинина. Карнитин, карнозин, ансерин. Их роль в организме.
- •Синтез и катаболизм гема. Значение конъюгирования продуктов метаболизма гема в печени.
- •Причины гипербилирубинемии, виды желтух. Диагностическое значение общего, прямого и непрямого билирубина. Метод определения билирубина в крови.
- •6. Энергетический обмен
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата. Пируватдегидрогеназный ферментный комплекс.
- •Цикл лимонной кислоты. Локализация, регуляция, функции.
- •Строение митохондрий и организация электрон-транспортной цепи. Ингибиторы дыхательной цепи.
- •Общие и специфические пути катаболизма белков, жиров и углеводов (по Кребсу). Виды биологического окисления.
- •Окислительное декарбоксилирование пирувата. Пируватдегидрогеназный ферментный комплекс.
- •Цикл лимонной кислоты. Локализация, регуляция, функции.
- •Строение митохондрий и организация электрон-транспортной цепи. Ингибиторы дыхательной цепи.
- •1 Комплекс. Надн-коq-оксидоредуктаза
- •3 Комплекс. КоQ-цитохром с-оксидоредуктаза
- •Строение атф-синтетазы митохондрий. Механизм сопряжения окисления и фосфорилирования. Разобщение процессов.
- •Дыхательная цепь и теплопродукция. Коэффициент р/о. Потоки важнейших метаболитов, поступающих в митохондрии и выходящих из них.
- •Системы микросомального окисления. Строение, изоформы цитохрома р450. Участие в эндогенном обмене и детоксикации.
- •Образование активных форм кислорода. Роль афк в организме, их токсичность. Антиоксидантная система.
- •70. Строение и функции углеводов в организме.
- •71. Строение и функции протеогликанов в организме. Причины мукополисахаридозов.
- •72. Глюкоза как важнейший метаболит углеводного обмена. Источники и пути использования глюкозы в организме.
- •73. Катаболизм глюкозы в присутствии кислорода (аэробный гликолиз).
- •74. Катаболизм глюкозы в анаэробных условиях (анаэробный гликолиз).
- •75. Пути образования и использования пировиноградной кислоты в клетках (напишите все ферментативные реакции).
- •76. Челночные механизмы переноса восстановленных эквивалентов через митохондриальную мембрану (глицерофосфатный и малатаспартатный).
- •77. Окисление углеводов в аэробных условиях до со2 и н2о. Энергетический выход окисления глюкозы. Метаболическая регуляция, влияние ингибиторов.
- •78. Глюконеогенез: локализация, функции, регуляция. Особенности регуляции гликолиза и глюконеогенеза в гепатоцитах.
- •86. Окисление жирных кислот. Реакции β-окисления насыщенных жирных кислот. Локализация, энергетический выход, регуляция процесса.
- •87. Окисление жирных кислот. Реакции α-окисления, ω-окисления жирных кислот. Окисление полиненасыщенных жирных кислот, жирных кислот с нечетным количеством атомов углерода.
- •88. Синтез и использование кетоновых тел. Причины и механизмы развития кетоацидоза.
- •89. Образование триацилглицеринов из углеводов. Метаболизм триацилглицеринов. Энергетическое использование глицерина. Депонирование и мобилизация жиров.
- •91. Происхождение, строение и функции желчных кислот. Энтерогепатическая циркуляция. Образование «холестериновых» камней при желчнокаменной болезни.
- •92. Строение, классификация, метаболизм и функции липопротеинов. Дислипопротеинемии.
- •93. Методы определения общего холестерина в крови. Информативность данного показателя для диагностики атеросклероза, индекс атерогенности. Механизм развития атеросклероза.
- •103. Эйкозаноиды и их роль в процессах регуляции.
- •104. Калликреин-кининовая и ренин-ангиотензиновая системы организма.
- •105. Интеграция и регуляция метаболизма. Направление потоков ключевых метаболитов между различными метаболическими путями.
Детоксикация аммиака в организме. Цикл синтеза мочевины.
Сумм. ур-ие: СО2 + NH3 + Asp + 3ATP + 2H2O → Мочевина + Фумарат + 2(ADP+Pi) + (AMP+PPi)
карбамоилфосфат H2N-C(O)-OPO3H2
орнитин NH2-(CH2)3-CH(NH2)-COOH
цитруллин (кето) NH2-C(O)-NH-(CH2)3-CH(NH2)-COOH
цитруллин (енол) NH=C(OH)-NH-(CH2)3-CH(NH2)-COOH
Asp NH2-CH(CH2-COOH)-COOH
аргининосукцинат COOH-CH(NH2)-(CH2)3-NH-C(=NH)-NH-CH(COOH)-CH2-COOH
фумарат COOH-CH=CH-COOH
Arg NH2-CH[(CH2)3-NH-C(=NH)-NH2]-COOH
мочевина NH2-C(O)-NH2
(1 ключ!) КарбамоилФосфатСинтетаза I
NH3 + CO2 + 2ATP + H2O → карбамоилфосфат + 2ADP + Pi
лок. в мтх гптц; N-ацетилглутамат – аллостерич. эффектор (без него акт-ть ферм. низкая), ↑сод. Glu в пище → стим. цикла синт. мочевины.
(2) ОрнитинКарбамоилТрансфераза
орнитин + карбамоилфосфат → цитруллин (кето) + Pi
цитруллин (кето) → в ц/пл → цитруллин (енол)
(3) АргининоСукцинатСинтетаза
цитруллин (енол) + Asp + ATP → аргининосукцинат + AMP + PPi
(4) АргининоСукцинатЛиаза
аргининосукцинат → Arg + фумарат
(5) Аргиназа
Arg + H2O → мочевина + орнитин
В мол. мочевины атомы N: из мол. NH3, из Asp, – С – из СО2.
NH3 обр. при окисл. дезаминир. Glu → NAD (затем→ 3АТР). Т.о., процесс синт. мочевины энергоНЕзатратный.
! Окисл. дезамин. – осн. для чел-ка и жив. (исключительно с Glu с пом. глутамат ДГ):
Glu + H2O ←(NAD(P)+ → NAD(P)H+H+)→ α-КГ + NH3.
Подробнее: Glu (–2H) –(ГлДГ)→ HOOC-CH2-CH2-C(=NH)-COOH –(+H2O)→ HOOC-CH2-CH2-C(=O)-COOH + NH3
Регуляция: (+) ADP, GDP; (–) ATP, GTP. Обратно – восстановит. аминирование.
Фумарат → (в ЦТК) оксалоацетат → 1) дальше в ЦТК, 2) переаминир. в Asp (возм. вновь в синт. мочевины), 3) в Glc-неогенез.
Болезни, вызванные генетическими дефектами ферментов цикла синтеза мочевины. Методы определения концентрации мочевины в крови и моче. Причины формирования и диагностическое значение азотемии.
Дефекты цикла: при полн. отстуств. одного из ферм. – гибель в утробе матери.
(1) КарбамоилФосфатСинтетаза I → тип I гипераммониемии
NH3 + CO2 + 2ATP + H2O → карбамоилфосфат + 2ADP + Pi
(2) ОрнитинКарбамоилТрансфераза → тип II гипераммониемии
орнитин + карбамоилфосфат → цитруллин (кето) + Pi
цитруллин (кето) → в ц/пл → цитруллин (енол)
(3) АргининоСукцинатСинтетаза → цитруллинурия
цитруллин (енол) + Asp + ATP → аргининосукцинат + AMP + PPi
(4) АргининоСукцинатЛиаза → аргининосукцинатная ацидемия
аргининосукцинат → Arg + фумарат
(5) Аргиназа → гипераргининемия
Arg + H2O → мочевина + орнитин
Цитруллин и аргининосукцинат в N отсутствуют в крови!
№1 и №2 – наиб. тяжелые.
Причины токсичности аммиака – ?. Возм., нед. α-КГ. Либо угнет. р-ии переаминир. Сниж. ско. ЦТК. В крови – алкалоз → ↑сродство HHb к О2 → гипоксия. Либо пов. осмотич. давл. за счет высок. синт. Gln. → судороги, тремор, кома, смерть.
Если б-нь распозн. быстро, то лечение простое: низкопротеиновая диета с доб. цитруллина и Arg.
В кач-ве ЛС исп. бензоат Na (обр. компл. с Glu и Gly → NH3 пойдет на синтез).
Предельно допустимый ур-нь аммиака в крови 60 мкмоль/л.
Методы определения мочевины:
(1) Ксантгидроловые: гетероцикл. спирт ксантгидрол → в р-ию с мочевиной → нераств. диксантилмочевина (опр. грави-, нефело-, колори- или титрометрически). Точно, но трудоемко.
(2) Гипохлоритные – метод Б.А.Рашкована, появл. окраски при вз/д мочевины с гипохлоритом Na и фенолом, практич. не примен.
(3) Диацетилмонооксимные: р-ия Фирона – вз/д мочевины и диацетилмонооксима с обр. окраш. прод., хорошая воспроизводимость, высокая чув-ть, большая специфичность. 2 этапа: 1. Гидролиз диацетилмонооксима с обр. диацетила и гидроксиламина. 2. Гидроксиламин вз/д с мочевиной с обр. окраш. диазинового пр.
(4) Полуколичественные: с исп. индикаторной бумаги.
(5) С исп. ионоселективных электродов.
(6) Ферментативные: осн. на гидролизе мочевины уреазой (оптимум pH 6,0‑8,0) → аммиак опр. с пом. разл. р-ий (фенолгипохлоритная, с пом. глутаматДГ, салицилатно‑гипохлоритная).
(7) Газометрические (гипобромитные) осн. на окисл. и разлож. мочевины гипобромитом Na в щел. среде: NH2-C(O)-NH2 + 3NaBrO → N2 + CO2 + 3NaBr + H2O. Выд. CO2 поглощает р-р, свободн. остается N2, объем которого измеряют. Метод неспецифичен (гипобромит реаг. с в-вами, сод. аминогруппы), неточен, плохо воспроизводим, трудоемок.
Унифицир. методы: фенолгипохлоритный, диацетилмонооксимный и уреазный методы, экспресс‑метод с использованием индикаторной бумаги "Уреатест".
N величины:
Сыворотка (по р-ии с диац.моноокс.; с реакт. Несслера): взр. 2,5–8,3 ммоль/л, (по р-ии с фенолгипохлоритом) 3,3–8,3 ммоль/л.
Моча (по р-ии с диац.моноок.) 330–580 ммоль/сут
Моча (по р-ии с реакт. Несслера) 430–710 ммоль/сут
Слюна ок. 1,83 ммоль
Для сопоставл. концентр. остат. азота с сод. азота мочевины концентр. последней разделить на 2,14.
Сыворотка. Ур-нь мочевины зав. от ск. ее синт. в печени и выд. через почки, а также от величины б. катаб. ↑уровня: при нар. ф-ии почек, истощ. запасов воды, повыш. катаб. б. (о. инф. миок., стресс, ожоги, желт. атроф. печени, ЖК кр/теч), при диете с выс. сод. б. ↓уровня: при диете с низк. сод. б., при тяж. заб. печени, сопр. нар. синт. мочевины (паренхим. желтуха, цирроз).
Моча. ↑кол-ва: гипертиреоз, злокач. анемия, лихорадка, при отрав. фосфором, при диете с выс. сод. б., в послеоперац. п-оде. ↓кол-ва: нефрит и др. заб. почек, паренхим. желтуха, цирроз или дистроф. печени, у здоровых растущих детей и при низкобелк. диете.
