- •1. Макромолекулярная структура днк, ее гетерогенность.
- •2. Репликация днк у бактерий. Белки участники.
- •3. Регуляция процесса репликации.
- •4. Репликация эукариот.
- •5. Репликативное метилирование днк.
- •6. Повреждения днк
- •7. Прямая репарация тиминовых димеров
- •8. Гликозилазы, эксцизионная репарация, ферменты.
- •9. Механизм репарации неспаренных нуклеотидов. Роль метилирования.
- •11. Транскрипция у прокариот. Особенности структуры рнк полимеразы.
- •12. Промоторы у прокариот.
- •13. Роль сигма-фактора
- •14. Негативная и позитивная регуляция транскрипции.
- •15. Структура Lac - оперона. Lac- репрессор.
- •16. Факторы транскрипции эукариот.
- •17. Белковые домены, узнающие специфические последовательности днк. Гомеодомены.
- •18. "Лейциновые молнии", "цинковые пальцы", взаимодействие с днк.
- •19. Рецепторы гормонов, типы, особенности узнавания днк.
- •Ответ на внеклеточные сигналы
- •20. Внешние сигналы, активирующие транскрипцию генов.
- •21. Структурная организация нуклеосом. Модификации гистонов, динамическая структура хроматина.
- •22. Роль нуклеосомных структур в активации экспрессии генов.
- •23. Процессинг рнк. Интроны. Сплайсинг.
- •24. Редактирование рнк. Молекулярные механизмы, типы редактирования.
- •25. Общая схема биосинтеза белка.
- •26. Основные свойства генетического кода.
- •27. Транспортные рнк, их строение и функции.
- •28. Аминоацил-тРнк-синтетазы. Структура, механизм действия.
- •29. Рибосомы, рРнк, рибосомные белки.
- •30. Цикл работы рибосомы. Каталитические и функциональные центры.
- •31. Элонгация трансляции. Участие белковых факторов.
- •32. Антибиотики ингибиторы первого этапа элонгации трансляции.
- •33. Второй этап элонгации - транспептидация. Химия и энергетический баланс реакции.
- •34. Регуляция трансляции у прокариот.
- •35. Регуляция трансляции у эукариот.
- •36. Ковалентные модификации белков. Гликопротеины, роль в межклеточном узнавании.
26. Основные свойства генетического кода.
Код триплетен. РНК из четырех нуклеотидов A,G,U,C, что означает, что триплетного обозначения для кодирования аминокислот хватает с избытком.
Код вырожден. Каждая а.к. кодируется более, чем одним триплетом (от 2 до 6 кодонов на одну а.к., кроме метионина и триптофана)
Код однозначен. Каждый код шифрует одну а.к.
Между генами есть знаки препинания: триплеты УАА, УАГ, УГА. Каждый из них означает прекращение синтеза одной полипептидной цепи.
Непрерывность. Между триплетами нет промежутков, информация считывается непрерывно.
Неперекрываемость. Один и тот же нуклеотид не может входить в разные триплеты.
Универсальность. Работает одинаково в организмах разных таксонов и уровня организации. Одинаков для всех от вирусов до человека. (есть ряд исключений)
Помехоустойчивость. Мутации замены нуклеотидов, не приводящие к смене класса а.к. - консервативные. Со сменой класса - радикальные.
27. Транспортные рнк, их строение и функции.
Каждая тРНК обладает участком - антикодоном, комплиментарным кодону мРНК, которая определяет включение в растущую полипептидную цепь аминокислотного остатка.
Все тРНК про- и эукариот имеют сходную структуру. Состоят примерно из 80 оснований, и различаются по их составу. Модификация оснований тРНК происходит после её синтеза.
Вторичная структура напоминает клеверный лист с возможностью образовывать водородные связи между основаниями.
У каждой а.к. есть своя тРНК. Аминокислота ковалентно присоединяется к 3` концу ферментом аминоацил-тРНК-синтазой.
28. Аминоацил-тРнк-синтетазы. Структура, механизм действия.
Фермент, катализирующий образование аминоацил-тРНК в реакции этерификации определенной аминокислоты с соответствующей ей тРНК.
Синтез идет в две стадии:
а.к.+АТФ = аминоацил-АМФ +РРi (пирофосфат)
аминоацил-АМФ + тРНК = аминоацил-тРНК + АМФ
В итоге к аденину на 3` конце тРНК ковалентно прикрепляется остаток а.к.
Каждая из 20 синтетаз должна прикрепить к тРНК только свою а.к., но ошибки возникают раз на 10’000-100’000 тРНК
Редактирование - процесс распознавания и гидролиза ошибочно синтезироавнных аминоацил-тРНК.
Два типа синтетаз:
В основе структуры - параллельный β-лист
В основе - антипараллельный β-лист
Строение: состоит из двух основных доменов - аминоацилирующего, в котором расположен активный центр и происходят реакции, и антикодон-связывающего, узнающего последовательность антикодона тРНК, а так же редактирующий домен - выполняет гидролиз ошибочных аминоацил-тРНК.
29. Рибосомы, рРнк, рибосомные белки.
Рибосома - состоит из белков и РНК. диаметр рибосом прокариот 15-20 нм. эукариот - 25-30 нм.
Константа седиментации прокариот: 70S (50S + 30S), эукариот: 80S (60S + 40S)
У эукариот рибосомы в основном связаны с мембраной ЭПР, но могут располагаться свободно в цитоплазме. Часто с одной мРНК ассоциируется несоклько рибосом (полирибосома). Синтез рибосомальной РНК происходит в ядрышке (большое количество копий генов рРНК).
рРНК составляет около 70% всей РНК в клетке. У рибосом эукариот есть 4 молекулы рРНК, 3 из которых (18S, 5.8S, 28S) синтезируется в ядрышке РНК-полимеразой I в виде единого предшественника 45S а одна (5S) синтезируется РНК-полимеразой III. Первичный транскрипт 45S расщепляется ферментом рибонуклеазой III.
Основная функция рРНК - осуществление трансляции: считывание с мРНК через тРНК и катализ (ПТФ-центр) образования пептидных связей между а.к.
У прокариот в 30S субъединице рибосомы находится 16S рРНК, в 50S - 23S и 5S рРНК.
Рибосомальные белки:
Их очень много, и они очень разнородные. Каждый рибосомальный белок имеет свою посадочную площадку на рРНК, и свою последовательность, с которой он ассоциирован.
На 23S рРНК находится 32 белка, а на 16S - 21 белок.
Белки смещены к периферии рибосомы, рРНК находится в ядре рибосомы. Белки могут обеспечивать функциональность рибосомы своими активными центрами и модифицировать/стабилизировать рРНК (поддерживающая функция). Они так же стабилизируют пептидную связь в синтезирующихся а.к. цепях.
