- •Глава ι классификация и номенклатура
- •Источники углерода
- •Белковые реакции
- •Глава 2 основные принципы и ( этапы бактериологического исследования
- •Материал для исследования отбор материала и транспортировка проб
- •Выделение и первичная идентификация
- •Дифференциация родов
- •Глава 3 характеристика родов. Внутриродовая дифференциация
- •II биовар — ксилоза —, арабиноза —
- •Определение фаговаров s. Paratyphi a
- •Глава 4 ускоренные и упрощенные методы бактериологического исследования
- •Метод флуоресцирующих антител
- •Реакция коагглютинации (коа)
- •Глава 5 питательные среды и реактивы
- •1. Консерванты
- •Среды обогащения
- •3. Плотные среды для выделения чистых культур
- •4. Среды для первичной дифференциации
- •5. Среды для дальнейшей дифференциации
- •I 2) Калий гидро-
- •2. Среду с лактозой готовят иногда с большим содержанием
- •3. К средам может быть добавлен агар (0,2—0,4%).
- •6. Среды и реагенты
- •8. Индикаторы
- •9. Некоторые дополнительные сведения
- •Тесты для контроля стерилизации
- •2. Приложение к главе 3
Тесты для контроля стерилизации
Работу стерилизующей аппаратуры рекомендуется постоянно контролировать, закладывая вместе с подвергаемым обработке материалом запаянные ампулы, содержащие небольшое количество соответствующего температурному режиму вещества. Для большей наглядности к нему добавляют крупицу красителя
(фуксин или др.).
1. Суховоздушная стерилизация. Тест-реактив — сахароза,
которая плавится при 170 "С.
2. Стерилизация под давлением. Тест-реактивы: бензонаф тол, который плавится при 110°С, антипирин — при 113СС, ре- зорпин и сера —при 119 °С, бензойная кислота — при 120 °С.
ПРИЛОЖЕНИЯ 1. ПРИЛОЖЕНИЕ К ГЛАВЕ 1
Классификация семейства Enterobacteriaceae no Sergey's Manual of Systematic Bacteriology (1984)*
Данное руководство находилось в печати, когда вышло 9-е переработанное и дополненное издание Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (1984). В связи с тем что в этом издании классификация семейства Enterobacteriaceae значительно' изменена, целесообразно поместить ее в настоящем приложении. D. J. Brenner (председатель Подкомитета по таксономии Enterobacteriaceae Международного комитета систематической бактериологии) описал основные свойства семейства Enterobacte-viaccac, относящегося к факультативно анаэробным грамотри-нательным бактериям (Секция 5), н привел подробные сведения о морфологических, биохимических и генетических характеристиках его представителей. Автор сопоставил новую классификацию энтеробактерий с данными 8-го издания, и указал на существенные, но труднорешаемые проблемы таксономии. D. J. Brenner подчеркнул важность решения Юридической комиссии Международного комитета систематической бактериологии, которое узаконило сохранение прежнего наименования семейства Enterobacteriaceae с типовым родом Eschenchia.
Вероятно, полезно ознакомит^ читателей с определением основных свойств, характеризующих семейство, поскольку оно немного отличается от приведенного в издании 1974 г.
Семейство Enterobacteriaceae — грамотрицателыше тонкие палочки, 0,3—1,0-1,0—6,0 цм; подвижные перитрихи, кроме Tatumclla, или неподвижные. Они не образуют эндоспоры или микроцисты, не кислотоустойчивы. Растут в присутствии кислорода или без него. Хорошо развиваются в пептонных и мясных средах и обычно на среде Мак Конки. Некоторые используют D-гл'юкозу как единственный источник углерода, другие требуют в качестве добавок витамины и (или) аминокислоты. Питание осуществляют за счет органических соединений; механизм метаболизма дыхательный и ферментативный. Не галофилы. Кислоту и часто видимые объемы, газа продуцируют при ферментации D-глюкозы, других углеводов и многоатомных спиртов. Каталазоположительны, за исключением Shigella dysenteriae
* Bergey's Manual o( Systematic Bacteriology. — 9lh ed./Eds J. G. Holt, N. R. Krieg, —Baltimora — London: Williams a Wilkins, 1984, vol. 1. p. 408— 516. 'О-гругшы 1 и Xenorhabdus nematophilus; оксидазонегативпы. Нитраты редуцируют в нитриты, за исключением некоторых штаммов Erwinia и Yersinia. Содержание Г+Ц в ДИК 38— 60 моль%. ДНК видов, принадлежащих к большинству родов, родственны между собой не больше чем на 20%, также и к Escherichia coli, типовому виду всего семейства. Составляют исключение некоторые виды Yersinia, Proteus, Providencia, Hafnia и Ed wards I el la, ДИК которых имеют 10—20% родства с ДИК видов, принадлежащих к другим родам.
Все изученные виды содержат энтеробактериальпый общий антиген (СА) [Kunin et al., 1962; Whang, Neter, 1962; Kunin 1963; Vosti et al., 1964; Le Minor et al., 1972], кроме Erwinia chrysanthemi [Le Minor et al., 1972].
Типовой род — Escherichia Castellan! и Chalmers 1919 — .определен Юридической комиссией Международного комитета •систематической бактериологии в 1958 г.
В прежних изданиях семейство Enterobactcriaceae было разделено на трибы (группы) на основании биохимических характеристик, а в 8-м частично учитывался и генетический анализ. Известно, что комбинации соединения родов в трибы и их число заметно отличались от издания к изданию, В настоящее время отвергнута диагностическая значимость триб, а их таксономическое значение вызывает сомнение. В связи с этим семейство Enterobacteriaceae разделено непосредственно на роды, а понятие «триба» опущено. Дальнейшему пересмотру с этих позиций подлежит «Одобренные списки названий бактерий», где еще указаны трибы, не соответствующие приведенным в 8-м издании.
Описания отдельных родов составлены различными ведущими исследователями, работающими в соответствующих областях бактериологии (F. 0rskov, В. Rowe, R. Gross, L. Le Minor, R. Sa-kazaki, I. Orskov, C. Richard, I. R. Lelliott, R. Dickey, P. Gri-mont, F. Grimont, J. J. Farmer III, A. McWhorter, J. Penner, -H. Bercovier и Н. Mollaret), однако все сведения были представлены по общей схеме. Для каждого рода даны основные определения, внутривидовая классификация, культуральные, биохимические и генетические характеристики, антигенная структура, отношение к бактериофагам и колицинам, оттенены главные дифференцирующие признаки внутри рода и по отношению .к другим сходным бактериям.
По новой классификации рассматриваемое семейство состоит из общеизвестных 14 родов (в ранг рода внесены Provideii-•cia и Morganella). Кроме того, в 9-м издании J. J. Farmer III представил дополнительные сведения о малоизученных или недавно описанных энтсробактсриях. Одни из них не привлекали •внимания из-за их ограниченного распространения (например, Obesumbacterium), другие были мало известны исследователям (например, Kluyvera) или недавно описаны (например, Ccdc-сеа). В настоящее время они составили группу из 6 так называемых «других родов».
Новая классификация приведена ниже.
Классификация семейства Enterobacteriaceae (по Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 1984)
Сеиейство I. Enterobacteriaceae Rahn 1937; Norn. fam. cons Opin 15 Jud. Comm. 1958; Ewing, Farmer, Brenner, 1980; Judical! Commission 1981
Типоиойрод: Escherichia Castellani, Chalmers 1919
Род |
1. |
Вид |
1. |
|
2. |
Род |
II. |
Вид |
1. |
|
2. |
|
3. |
|
"А |
Род |
III. |
Ппдрод |
I. |
|
II- |
|
III. |
|
IV. |
|
V. |
Escherichia Castellani, Chalmers 1919 Escherichia coli Escherichia blattae
Shigella Castellani, Chalmers 1!W Shigella dysenteriae Shigella flexneri Shigella boydii Shigella sonnei
Salmonella Ligniers 1900 SI ч ." • SI1, atypical S (II) SIII («S. arizonae») SIV («S. houtenae») SV («S. bongor»)
/•' i
Род
IV. 1. 2. 3.
V. 1.
Citrobacter Workman, Gillen 1932 Citrobacter freundii Citrobacter diversus Citrobacter amalonaticus
Род
Вид
•2. 3. 4.
VI.
1.
2.
3.
4.
5.
Klebsiella Trevisan'l885 Klebsiella pneumouiac Klebsiella pneumoniae подвид pncumoniae Klebsiella pncumoniae подвид ozaenae Klebsiella pneumoniae подвид rhinosclerpmatis, Klebsiella oxytoca Klebsiella terrigena Klebsiella planticola
Род Вид
Enterobacter Hormaeche, Edwards I960 Enterobacter cloacae Enterobacter sakasakii Enterobacter agglomerans ET]lerobacter.aerogenes~i Enterobacter gergoviae'
Другие микроорганизмы, принадлежащие к роду Enterobacter
a. Enterobacter intermedium
b. Entcrobacter amnigenus
c. Erwinia dissolvens
d. Erwinia nimipressuralis
Род
Вид
VII. Erwinia WInslow, Rogers, Smith 1920
Erwinia amylovora
Erwinia tracheiphila
|
3. |
Erwinia mallotivora |
|
4. |
Hrwinia rubrifaciens |
|
5. |
Erwinia quercina |
|
"6. |
Erwinia salicis |
|
7. |
Erwinia herbicola |
|
8. |
Erwinia ananas |
|
9. |
Erwinia rhaponlici |
|
10. |
Erwinia carotovora |
|
Ша. |
Erwinia carulovora подвид carotovora |
|
10Ь. |
Erwinia carotovora подвид atroseplica |
|
|
«Erwinia carotovora подвид beta va sen lorum> |
|
11. |
Erwinia cbrysanlhcmi |
|
12. |
Erwinia cypripedii |
|
13. |
Erwinia nigrifluens |
|
14. |
Erwinia stewartii |
|
15. |
Erwinia uredovora |
|
|
Species Inccrtae Sedis (виды с неопределенной таксономи- |
|
|
ческой позицией) |
|
а. |
Erwinia cancerogena |
|
Ь. |
Erwinia carnegieana |
|
с. |
Erwinia dissolvens |
|
d. |
Erwinia mmipressuralis |
"Рол |
VIII. |
Serratia Bizio 1823 |
Вид |
1. |
Serratia marcescens |
|
2. |
Serratia liquefaciens |
|
3. |
Serratia plymuthica |
|
4. |
Serratia rubidaea |
|
5. |
Serralia о dor if era |
|
6. |
Serratia ficaria |
•Роя |
IX. |
Hafnia Meller 1954 |
Вид |
1. |
Hafnia alvei |
'Род |
X. |
Edwaradsiella Ewing, McWhorter 1965 . i " |
Вид |
1. |
Edwardsiella tarda |
|
2. |
Edwardsiella hoshinae |
|
3. |
Edwardsiella ictaluri |
•Род |
XI. |
Proteus Hanser 1885 |
Вид |
1. |
Proteus vulgaris |
|
2. |
Proteus mirabilis |
|
3. |
Proteus myxofaciens, |
'Род |
XII. |
Providencia Ewing 1962 |
Вид |
1. |
Providencia alcalifaciens |
|
2. |
Providencia stuartii |
|
3. |
Providencia rettgeri |
'Род |
XIII. |
Morganella Fulton 1943 |
Вид |
1. |
Morganella morganii |
'Род |
XIV. |
Yersinia Van Loghem 1944 |
Вид |
1. |
Yersinia pestis |
|
2. |
Yersinia pseudotuberculosis |
|
3. |
Yersinia enterocolitica |
|
4. |
Yersinia intermedia |
|
5. |
Yersinia frederiksenif |
|
6. |
Ters'inia Itristensenii |
|
7. |
Tersinia ruckeri |
Другие роды ceMefictBa\Enterobacteriaceae
Род Obesumbacterium Sjilrawcll 1963
Вид 1. ObesunibVjterium proteus BiogroupX Biogroup 2\
Род Xenorhabdus"Thomas, Poinar 1979
В«д 1. Xenorhabdu^ rtematophirus :
2. Xenorhabdus lunu'nescens Род Kluyvera Farmer^ Fanning, Huntley-Carter, Holms, Nickman,
Richard, Brenner 1981 Вид 1. Kluyvera ascorbata\
2. Kluyvera cryocrescerip Род Rahnella Izard, Gavirti, Trinel, Leclerc 1981
Вид 1. Rahjiella aqualilis
Род Cedecea Grimont, Grimorit, Farmer, Asbury 1981
Вид 1. Cedecea davisac 2. . Cedecea lapagei
Непоименованные виды
«Вид 3> «Вид 4» «Вид 5> Род Вид 1.
Tatumella Hollis, Hickman, Fanning 1982 Tatumella ptyseos
Классификация и номенклатура многих даже хорошо изученных родов еще не окончательно установлена (например, рода Salmonella) и подлежит дальнейшему совершенствованию на основе новейших научных данных.
Клиническое значение большинства дополнительно введенных в семейство Enterobacteriaceae родов и видов еще не изучено.
