
- •Предисловие
- •Введение
- •Глава 1. Питание микроорганизмов
- •1.1. Транспорт веществ в клетку бактерий
- •1.2. Автотрофные способы питания микроорганизмов
- •1.3. Ассимиляция со2 хемогетеротрофными микроорганизмами
- •Глава 2. Метаболизм микроорганизмов
- •2.1. Общая характеристика типов метаболизма
- •2.2. Общая характеристика энергетического метаболизма
- •2.2.1. Аэробное дыхание
- •2.2.2. Процессы анаэробного дыхания
- •Нитратное дыхание, или денитрификация
- •Сульфатное дыхание, или диссимиляционная сульфатредукция
- •Серное дыхание
- •Карбонатное дыхание
- •Анаэробное дыхание с использованием в качестве акцепторов электронов других неорганических ионов
- •Фумаратное дыхание и другие типы анаэробного дыхания с использованием органических веществ в качестве акцепторов электронов
- •2.2.3. Процессы брожения
- •Спиртовое брожение
- •Молочнокислое брожение
- •Маслянокислое и ацетонобутиловое брожение
- •Пропионовокислое брожение
- •Брожение смешанного типа, или муравьинокислое брожение
- •2.2.4. Неполное окисление органических веществ микроорганизмами
- •2.2.5. Разложение микроорганизмами природных высокополимерных органических соединений
- •Разложение целлюлозы
- •Разложение гемицеллюлоз
- •Разложение крахмала и других глюканов
- •Разложение лигнина
- •Разложение пектиновых веществ
- •Разложение хитина и хитозана
- •2.2.6. Использование белков микроорганизмами
- •Аэробное расщепление аминокислот
- •Сбраживание аминокислот микроорганизмами
- •2.2.7. Использование микроорганизмами азотистых оснований
- •Анаэробное разложение (сбраживание) азотистых оснований
- •Аэробное окисление азотистых оснований
- •2.2.8. Окисление липидов и фосфолипидов микроорганизмами
- •2.2.9. Разложение углеводородов микроорганизмами
- •Разложение алканов (парафинов) микроорганизмами
- •Разложение ароматических углеводородов (аренов) микроорганизмами
- •2.2.10. Разложение ксенобиотиков микроорганизмами
- •2.2.11. Окисление неорганических соединений бактериями
- •Процесс нитрификации
- •Окисление восстановленных соединений серы
- •Окисление ионов железа
- •Окисление молекулярного водорода
- •Окисление оксида углерода
- •2.2.12. Использование микроорганизмами одноуглеродных соединений
- •2.2.13. Использование микроорганизмами солнечной энергии
- •Фотосинтез у прокариот
- •Глава 3. Конструктивный метаболизм микроорганизмов
- •3.1. Биосинтез аминокислот
- •3.2. Биосинтез нуклеотидов
- •3.3. Биосинтез липидов
- •3.4. Биосинтез углеводов
- •3.5. Биосинтез пептидогликана
- •Глава 4. Фиксация молекулярного азота (азотфиксация, диазотрофия) микроорганизмами
- •4.1. Биохимия азотфиксации
- •Глава 5. Биолюминесценция бактерий
- •Глава 6. Регуляция метаболизма у бактерий
- •6.1. Регуляция активности ферментов
- •6.2. Регуляция на уровне генов, или регуляция синтеза ферментов
- •Литература
- •Оглавление
Окисление ионов железа
Этот процесс осуществляют железобактерии. Впервые термин «железобактерии» применил русский микробиолог С.Н. Виноградский для прокариот, использующих энергию окисления Fe2+ до Fe3+ для ассимиляции СО2, т. е. способных существовать хемолитоавтотрофно.
Железобактерии с энергетическим метаболизмом хемолитотрофного типа можно разделить на две группы: ацидофильные и микроаэрофильные, растущие при нейтральном рН (нейтрофильные).
Основными представителями ацидофильных железобактерий являются Thiobacillus ferrоoxidans и Leptospirillum ferrоoxidans. Железобактерии вида Thiobacillus ferrоoxidans – грамотрицательные, бесспоровые, палочковидные с полярным жгутикованием бактерии. Они относятся к тионовым бактериям, так как они способны окислять не только Fe2+, но и различные восстановленные соединения серы.
Облигатно ацидофильные бактерии Leptospirillum ferrоoxidans в отличие от Thiobacillus ferrоoxidans способны окислять только Fe2+, восстановленные соединения серы они не окисляют.
Бактерии Leptospirillum ferrоoxidans и большинство изученных штаммов Thiobacillus ferrоoxidans являются облигатными хемолитоавтотрофами. Некоторые штаммы T. ferrоoxidans способны расти на средах с органическими соединениями и являются факультативными хемолитоавтотрофами. Кроме того, среди ацидофильных железобактерий имеются термофильные представители (например, Acidianus brierleyi, Metallosphera sedula, Sulfolobus solfataricus и др.), получающие энергию в результате окисления Fe2+ и нуждающиеся для роста в органических соединениях, т. е. осуществляющие метаболизм хемолитогетеротрофного типа.
Механизм окисления Fe2+ подробно исследован у T. ferrоoxidans. Окисление железа в клетках этих бактерий, приводящее к получению энергии, происходит по уравнению:
2
Fe2+
+ 1/2 O2 + 2H+
Fe3+ + H2O
Установлено, что этот процесс осуществляется в периплазматическом пространстве (в цитоплазму через мембрану Fe2+ не проникает) и сопровождается выделением Fe3+ во внешнюю среду. Электроны, оторванные от Fe2+ с помощью цитохромсодержащей Fe2+-оксидазы, акцептируются особым медьсодержащим растворимым белком рустицианином (РЦ), локализованным в периплазматическом пространстве. Затем с рустицианина они передаются на цитохром с, локализованный на внешней стороне цитоплазматической мембраны, а с него на цитохром а1, расположенный на внутренней стороне мембраны. Перенос электронов с цитохрома а1 на 1/2 O2, сопровождающийся поглощением из цитоплазмы двух протонов, приводит к восстановлению молекулярного кислорода до Н2О:
Внешняя Внутренняя
сторона сторона
2Fe2+
2е–
1/2 O2
+ 2H+
РЦ цит.
c
цит.
а1
2Fe3+ H2O
Периплазма Цитоплазматическая мембрана
Особенностью дыхательной цепи бактерий Thiobacillus ferrоoxidans является отсутствие переноса через мембрану протонов, происходит перенос только электронов. Градиент Н+ по обе стороны цитоплазматической мембраны у Thiobacillus ferroxidans поддерживается как за счет поглощения протонов из цитоплазмы, так и в результате низкого рН внешней среды, в которой обитают эти бактерии. Синтез АТФ происходит за счет движения Н+ из внешней среды в цитоплазму с помощью АТФ-синтазы. Движущей силой служит в основном разность рН снаружи и внутри клетки. Для синтеза одной молекулы АТФ необходимо окислить как минимум две молекулы Fe2+. Образование восстановителя происходит в результате энергозависимого обратного переноса электронов. В целом для фиксации одной молекулы СО2 в цикле Кальвина необходимо окислить более 22 молекул Fe2+.
Ацидофильные железобактерии широко распространены в природе и могут существовать в различных условиях: в подземных водах сульфидных месторождений, кислых водах железистых источников, кислых озерах с высоким содержанием закисного железа и др. Они в большом количестве обнаруживаются в сульфидных минералах, таких как пирит и сульфиды других металлов. При доступе кислорода и воды они сильно подкисляют среду обитания, что часто наблюдается, например, в угольных шахтах. Если кислые шахтные воды попадают в грунтовые воды, имеющие нейтральный рН, происходит выпадение в осадок основных сульфатов Fe3+-ярозитов, которые снижают плодородие почвы и вызывают засорение дренажных труб. Закисление почвы при этом приводит к гибели многих живых организмов.
Ацидофильные железобактерии находят практическое применение – на их использовании основаны методы бактериального выщелачивания меди, марганца, урана, золота и других драгоценных и редких металлов из бедных руд.
Наиболее известными представителями нейтрофильных железобактерий являются бактерии вида Gallionella ferruginea и виды рода Leptotrix. Они участвуют в образовании ржавых осадков (охры) в болотах и заболоченных почвах с нейтральной и слабощелочной реакцией среды. Стебельковые бактерии Gallionella ferruginea имеют клеточную стенку грамотрицательного типа и палочковидную форму. Обитая в железистых водах, они образуют коллоидный гидроксид железа (ферригидрит), из которого формируют стебельки разной длины. На концах стебельков располагаются клетки. Они относятся к типичным хемолитотрофам, так как используют энергию аэробного окисления Fe2+ для фиксации СО2 в цикле Кальвина. Нитчатые, имеющие трубковидный чехол бактерии рода Leptotrix окисляют Fe2+ с образованием вокруг нитей в большом количестве хлопьев и налетов оксидов железа (Fe3+). В массовом количестве нейтрофильные железобактерии находятся в дренажных трубах и железосодержащих ручьях. В системах водоснабжения образуют отложения, служащие причиной загрязнения питьевой воды и засорения коммуникаций.
Кроме охарактеризованных хемолитотрофов, окислять железо и/или марганец способны и другие железобактерии, принадлежащие к разным таксономическим группам. Среди них встречаются как факультативные хемолитотрофы, так и хемоорганотрофы. Установлено, что некоторые представители железобактерий окисляют железо или марганец для детоксикации перекиси водорода, которая может образовываться в их клетках при окислении органических веществ. Окисление железа у таких бактерий протекает в капсулах, чехлах, слизистых выделениях, на поверхности клеточной стенки, где концентрируются все компоненты реакции: восстановленные формы железа или марганца, перекись водорода, каталаза в соответствии с уравнениями:
2 Fe2+ + Н2O2 + 2H+ 2Fe3+ + 2H2O,
M n2+ + 2Н2O2 MnO2 + 2H2O
Магниточувствительные бактерии откладывают сульфид железа в магнитосомах, обеспечивая магнитотаксис.
Однако следует отметить, что ни в одном из приведенных примеров окисление железа и марганца не связано с получением энергии, в отличие от ранее рассмотренных представителей ацидофильных и нейтрофильных хемолитоавтотрофных бактерий.