
- •Предисловие
- •Введение
- •Глава 1. Питание микроорганизмов
- •1.1. Транспорт веществ в клетку бактерий
- •1.2. Автотрофные способы питания микроорганизмов
- •1.3. Ассимиляция со2 хемогетеротрофными микроорганизмами
- •Глава 2. Метаболизм микроорганизмов
- •2.1. Общая характеристика типов метаболизма
- •2.2. Общая характеристика энергетического метаболизма
- •2.2.1. Аэробное дыхание
- •2.2.2. Процессы анаэробного дыхания
- •Нитратное дыхание, или денитрификация
- •Сульфатное дыхание, или диссимиляционная сульфатредукция
- •Серное дыхание
- •Карбонатное дыхание
- •Анаэробное дыхание с использованием в качестве акцепторов электронов других неорганических ионов
- •Фумаратное дыхание и другие типы анаэробного дыхания с использованием органических веществ в качестве акцепторов электронов
- •2.2.3. Процессы брожения
- •Спиртовое брожение
- •Молочнокислое брожение
- •Маслянокислое и ацетонобутиловое брожение
- •Пропионовокислое брожение
- •Брожение смешанного типа, или муравьинокислое брожение
- •2.2.4. Неполное окисление органических веществ микроорганизмами
- •2.2.5. Разложение микроорганизмами природных высокополимерных органических соединений
- •Разложение целлюлозы
- •Разложение гемицеллюлоз
- •Разложение крахмала и других глюканов
- •Разложение лигнина
- •Разложение пектиновых веществ
- •Разложение хитина и хитозана
- •2.2.6. Использование белков микроорганизмами
- •Аэробное расщепление аминокислот
- •Сбраживание аминокислот микроорганизмами
- •2.2.7. Использование микроорганизмами азотистых оснований
- •Анаэробное разложение (сбраживание) азотистых оснований
- •Аэробное окисление азотистых оснований
- •2.2.8. Окисление липидов и фосфолипидов микроорганизмами
- •2.2.9. Разложение углеводородов микроорганизмами
- •Разложение алканов (парафинов) микроорганизмами
- •Разложение ароматических углеводородов (аренов) микроорганизмами
- •2.2.10. Разложение ксенобиотиков микроорганизмами
- •2.2.11. Окисление неорганических соединений бактериями
- •Процесс нитрификации
- •Окисление восстановленных соединений серы
- •Окисление ионов железа
- •Окисление молекулярного водорода
- •Окисление оксида углерода
- •2.2.12. Использование микроорганизмами одноуглеродных соединений
- •2.2.13. Использование микроорганизмами солнечной энергии
- •Фотосинтез у прокариот
- •Глава 3. Конструктивный метаболизм микроорганизмов
- •3.1. Биосинтез аминокислот
- •3.2. Биосинтез нуклеотидов
- •3.3. Биосинтез липидов
- •3.4. Биосинтез углеводов
- •3.5. Биосинтез пептидогликана
- •Глава 4. Фиксация молекулярного азота (азотфиксация, диазотрофия) микроорганизмами
- •4.1. Биохимия азотфиксации
- •Глава 5. Биолюминесценция бактерий
- •Глава 6. Регуляция метаболизма у бактерий
- •6.1. Регуляция активности ферментов
- •6.2. Регуляция на уровне генов, или регуляция синтеза ферментов
- •Литература
- •Оглавление
Разложение ароматических углеводородов (аренов) микроорганизмами
А
CН
1
HC
CН
2
6
HC
CН
3
4
5
CН
При замене атомов водорода в молекуле бензола получаются его производные с одним заместителем, например:
CН3
Толуол
с двумя и более заместителями, например:
CН3
CН3
CН3
CН3
CН3
орто-Ксилол
CН3
мета-Ксилол
CН═СН2
CН2–СН3
пара-Ксилол
Этилбензол
Стирол
Большинство ароматических углеводородов расщепляется бактериями сначала до катехола или прокатеховой кислоты. Как правило, ароматические углеводороды, имеющие заместители по первому и второму С-атомам (например, салициловая кислота) превращаются в катехол:
ОН
ОН
Многие незамещенные ароматические углеводороды (такие как бензол и нафталин) разлагаются через образование 1,2-дифенольных соединений также до катехола. Ароматические углеводороды, несущие заместители в положении 1,3 или 1,4 (например, 3-гидроксибензоат и 4-гидроксибензоат), а также полузамещенные ароматические соединения метаболизируются через образование прокатеховой кислоты:
Реакции расщепления ароматических углеводородов до катехола или прокатеховой кислоты катализируют ферменты оксигеназы. Они сводятся к введению гидроксильных групп в ароматическое кольцо и часто к отщеплению заместителей. Гидроксильными группами могут замещаться атомы хлора, нитрогруппы и сульфогруппы. Оксигеназы представляют собой оксидоредуктазы, включающие в молекулу субстрата атом(-ы) кислорода из О2. Оксигеназы, катализирующие присоединение одного атома кислорода, называются монооксигеназами, катализирующие присоединение двух атомов – диоксигеназами.
Следующим этапом расщепления ароматических углеводородов является расщепление образованных молекул катехола и прокатеховой кислоты под действием диоксигеназ двух типов. Одни диоксигеназы разрывают ароматическое кольцо между двумя гидроксилированными атомами углерода (орто-расщепление):
Далее образовавшиеся при орто-расщеплении катехола и прокатеховой кислоты промежуточные продукты – цис, цис-муконовая кислота и 3-карбокси-цис, цис-муконовая кислота – в ходе дальнейшего катаболизма проходят через этап общего для них обоих продукта – 3-оксоадипиновой кислоты. Последняя активируется КоА-трансферазой и расщепляется с образованием сукцинил-КоА и ацетил-КоА, которые подвергаются дальнейшим превращениям в ходе промежуточного метаболизма.
В более редких случаях диоксигеназы (второго типа) расщепляют ароматическое кольцо не между гидроксилированными атомами углерода (как при орто-расщеплении), а между гидроксилированным и негидроксилированным атомами углерода (мета-расщепление):
Образованные полуальдегиды затем превращаются в пируват, ацетальдегид, оксалоацетат, фумарат, ацетоацетат, сукцинат или иные вещества, вовлекаемые в промежуточный метаболизм.
В настоящее время имеются сведения о том, что разложение ациклических и ароматических углеводородов бактериями контролируется генами, локализованными в плазмидах, которые называются плазмидами биодеградации, или D-плазмидами. Плазмиды данного типа широко распространены у бактерий рода Pseudomonas. В последнее время они обнаружены в клетках других почвенных и водных бактерий, таких как бактерии родов Alcaligenes, Flavobacterium, Rhodococcus и др.
Микроорганизмы, способные окислять углеводороды, широко распространены в почвах и водах. Они приобрели большое практическое значение, в первую очередь, для биологической очистки почв и водоемов от загрязнений нефтью и продуктами ее пeреработки. Нефть представляет собой сложную смесь, состоящую в основном из ациклических и ароматических углеводородов. Утилизировать нефть и продукты ее переработки в качестве источников углерода и энергии способны представители родов Pseudomonas, Mycobacterium, Alcaligenes, Bacillus, Acinetobacter, Arthrobacter, Rhodococcus, Flavobacterium, Caulobacter и др. С участием микроорганизмов осуществляется восстановление исходного статуса (биоремедиация) загрязненных территорий. Кроме того, выращивая на нефтяных отходах дрожжи рода Candida, получают из непищевого сырья дешевый белково-витаминный концентрат для подкормки сельскохозяйственных животных.