IX. Видавнича діяльність

У 2012 році опубліковано 8 статей, 24 тез, подано до друку 3 статті.

Статті:

1. Сибирный А.А. Молекулярные механизмы биогенеза пероксисом у дрожжей // Молекулярная биология. – 2012. – Т. 46, № 1. – С. 14-30.

2. Яцишин В.Ю., Клюз М., Федорович Д.В., Сибірний А.А. Створення продуцентів та розробка технології отримання препаратів флавінмононуклеотиду на основі дріжджів Сandida famata // Наука та інновації. – 2012. – Т. 8, № 5. – С. 72-78.

3. Dmytruk K.V., Sibirny A.A. Candida famata (Candida flareri) // Yeast. – 2012. – V. 29, No. 11. – P. 453-458.

4. Klionsky D.J., Abdalla F.C., Abeliovich H., et al. Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy // Autophagy. – 2012. – V. 8, No. 4. – P. 445-544.

5. Polupanov A.S., Nazarko V.Y., Sibirny A.A.Gss1 protein of the methylotrophic yeast Pichia pastoris is involved in glucose sensing, pexophagy and catabolite repression // Int. J. Biochem. Cell. Biol. – 2012. – V. 44, No. 11. – P. 1906-1918.

6. Prokopiv T.M., Fedorovych D.V., Boretsky Y.R., Sibirny A.A.Oversynthesis of riboflavin in the yeast Pichia guilliermondii is accompanied by reduced catalase and superoxide dismutases activities // Curr. Microbiol. – 2012. – DOI 10.1007/s00284-012-0242-0.

7. Sibirny A.A. Genetic control of riboflavin overproduction and construction of robust producers of riboflavin and flavin nucleotides in yeast // Proceedings of XIII Conference DIAGMOL 2012 “Molecular biology in diagnostics of infectious diseases and biotechnology” 24 november 2012 WULS-SGGW in Warshaw, Poland. – P. 83-88.

8. Sibirny A.A. Mechanisms of autophagy and pexophagy in yeasts // Biochemistry (Mosc). – 2011. – V. 76, No. 12. – P. 1279-1290.

Тези доповідей:

1. Борецька Н.І., Федорович Д.В., Гураль С.В. Особливості антиоксидантного захисту каротино-синтезуючих дріжджів Phaffia rhodozyma // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 46.

2. Berezka K., Paciorek B., Grabek-Lejko D., Sibirny A. Insertional tagging of the Pichia stipitis genes involved in xylose alcoholic fermentation // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 62.

3. Boretsky Y., Fedorovych D., Bobak Ya., Prokopiv T., Sibirny A. Yeast Pichia guilliermondii possesses two high affinity iron transport systems // 13^th International congress on yeast, August 26-30, 2012, Madison, Wisconsin, USA, Abstract book. – 2012. – P. 360.

4. Boretsky Y., Pynyaha Y., Fedorovych D.V., Boretsky V., Fayura L., Kapustyak K., Sybirny A. Development of Pichia guilliermondii as a model organism to study regulation of riboflavin biosynthesis, iron acquisition and oxidative stress response // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 31.

5. Chorna D.S., Sybirna K.A., Levkiv A.I., Bottin H., Sibirny A.A., Boretsky Y.R. Development of the effective system for heterologous gene expression in the chemolitotrophic bacterium Shewanella oneidensis // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 67.

6. Dmytruk K., Boretsky Y., Fedorovych D., Yatsyshyn V., Pynyaha Y., Lyzak O., Sibirny A. Genetic control of riboflavin synthesis in flavinogenic yeasts and construction of the robust of riboflavin and flavin nucleotides in these organisms // 13^th International congress on yeast, August 26-30, 2012, Madison, Wisconsin, USA, Abstract book. – 2012. – P. 157.

7. Dmytruk K., Sibirny A. Construction of improved Candida famata industrial riboflavin producers // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 58.

8. Dmytruk O., Sibirny A. Catabolite degradation of fructose-1,6-bisphosphatase in metylotrophic yeasts Pichia pastoris and Hansenula polymorpha // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 63.

9. Fayura L., Boretsky Y., Pynyaha Y., Boretsky V., Sibirny A. Efficient production of arginine deiminase of Mycoplasma hominis // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 75.

10. Fedorovych D.V., Prokopiv T. M., Boretsky Y. R., Sibirny A. A. Iron and oxidative stress are involved in the regulation of riboflavin oversynthesis in Pichia guilliermondii yeast // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 30.

11. Hryniv O., Dmytruk K., Sibirny A. Application of ethanol-induced promoters for positive selection of the Saccharomyces cerevisiae mutants overproducing ethanol // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 70.

12. Kluz M., Sibirny V., Dmytruk K., Sibirny A. Optimization of the fermentation conditions for maximizing riboflavin production by the recombinant strain of the yeast Candida famata // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 66.

13. Krasovska O., Vovk O., Stasyk O. Overexpression of human arginase I in methylotrophic yeast Hansenula polymorpha as anticancer enzyme // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 73.

14. Kurylenko O., Hryniv O., Krasovska O., Ruchala J., Grabek-Lejko D., Stasyk O., Dmytruk K., Sibirny A. Peroxisomes are important for yeast xylose alcoholic fermentation // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 55.

15. Kurylenko O., Ruchala J., Dmytruk K., Sibirny A. Engineering of Hansenula polymorpha recombinant strains with improved xylose alcoholic fermentation // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 65.

16. Kurylenko O., Ruchala J., Hryniv O., Dmytruk K., Sibirny A. Metabolic engineering as a tool for improvement of xylose alcoholic fermentation in non-conventional yeast Hansenula polymorpha // 13^th International congress on yeast, August 26-30, 2012, Madison, Wisconsin, USA, Abstract book. – 2012. – P. 362.

17. Kutsiaba V., Gonchar M., Sibirny A. Genetic construction of the thermotolerant Saccharomyces cerevisiae strains for alcohol fermentation of the industrial wheat wort starch // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 124.

18. Murashchenko L., Pynyaha Y., Dmytruk K., Sibirny A. Construction of Saccharomyces cerevisiae strains producing isobutanol as the main product of alcoholic fermentation // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 74.

19. Nazarko V., Nazarko O., Sibirny A. Mutations in HXK2 gene affect peroxisome biogenesis and degradation in Saccharomyces cerevisiae // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 86.

20. Polupanov A., Nazarko V., Sibirny A. Involvement of GSS1 sensor-like protein in autophagic pathways and catabolite repression in the methylotrophic yeast Pichia pastoris // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 91.

21. Pynyaha Y.V., Boretsky Y.R., Fedorovych D.V., Sybirny A.A. Targeting of the genes, which participate in the riboflavin transport of Pichia guilliermondii // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 102.

22. Semkiv M., Dmytruk K., Sibirny A. Development of the optimal approach for the intracellular ATP depletion in the yeast Saccharomyces cerevisiae // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 72.

23. Uzhenkov O., Dmytruk K., Sibirny A. Development of the system for selection of the modified glucose/xylose transporter with increased affinity to xylose // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 69.

24. Yatsyshyn V. Y., Fedorovych D.V., Sibirny A.A. Strains and medium engineering to obtaining of flavin mononucleotide by the yeast Candida famata // International Symposium on Cell Biology jointly with 3^rd Ukrainian Congress for Cell Biology, May 16-20, 2012, Yalta, Ukraine, Abstract book. – 2012. – P. 57.

Праці, подані до друку:

1. Наумова Е.С., Дмитрук К.В., Кшановская Б.В., Сибирный А.А., Наумов Г.И. Молекулярная идентификация индустриально-важного штамма Ogatae parapolymorpha // Микробиология (Прийнята до друку).

2. Grabek-Lejko D., Sibirny V., Sibirny A. Regulacja ekspresji genow u drozdzy metylotroficznych // Postepy biochemii (Прийнята до друку).

3. Дмитрук К.В., Сибирный А.А. «Метаболическая инженерия дрожжей Hansenula polymorpha для создания эффективных продуцентов этанола» // Цитология и генетика

4. Біоресурси у новітніх біотехнологіях отримання альтернативних палив: Монографія / Я.Б.Блюм, Г.Г.Гелетуха, І.П.Григорюк, К.В.Дмитрук, В.О.Дубровін, А.І.Ємець, Г.М.Забарний, Г.М.Калетнік, М.Д.Мельничук, В.Г.Мироненко, Д.Б.Рахметов, А.А.Сибірний, С.П.Циганков – Київ: «Аграр Медіа Груп», 2010. – 408 с. c.155-213

Участь в редакційних колегіях:

Проф. Сибірний є членом редакційних колегій журналів:

Cell. Biol. Intern.,Yeast, FEMS Yeast Res., Autophagy, Український біохім. журн, Мікробіол. журн., Цитологія і генетика, Мікробіол. і біотехнол., Вісник УТГіС, Журнал агробіології та екології та ін.

Х. Міжнародне наукове та науково-технічне співробітництво.

Відділ протягом 2012 року співпрацював із рядом міжнародних і вітчизняних наукових центрів.

1. Продовжилася співпраця по спільному україно-польсько-шведському проекті VISBI: „Non-conventional yeasts for ethanol, chemical and food production: Next generation techniques for manipulation and analysis”.

2. Разом з центром Атомних Досліджень в Саклє (Франція) проводились роботи по створенню ефективних систем гетерологічної експресії на основі бактерій Shewanella oneidensis та дослідження можливості їх використання для конструювання ефективних продуцентів водню.

3. Індивідуальний грант FEMS Research Fellowship FRF 2012-2 “ Development of the multicopy integration system of genes inducing futile cycles to increase the efficacy of alcoholic fermentation in Saccharomyces cerevisiae” у співпраці з Жешівським університетом (Польща).

4. Продовжилась співпраця з Державним науково-дослідний інститутом генетики та селекції промислових мікроорганізмів (Росія) по Українсько-Російському Проекту № Ф40.4/006 “Молекулярно-генетичне дослідження адаптації дріжджів Saccharomyces до підвищених температур”.

5. Продовжились роботи по проекту НАН України та УНТЦ №5505 «Метаболічна інженерія метилотрофних дріжджів Hansenula polymorpha для підвищення виходу етанолу при високотемпературної ферментації ксилози»

6. Проект НАН України та УНТЦ №5729 «Метаболічна інженерія дріжджів Candida famata для конструювання ефективних продуцентів рибофлавіну».

7. Разом з центром Атомних Досліджень в Саклє (Франція) проводились роботи по створенню ефективних систем гетерологічної експресії на основі бактерій Shewanella oneidensis та дослідження можливості їх використання для конструювання ефективних продуцентів водню

Постійно підтримувались наукові контакти з наступними вченими:

1. Prof. T. Jeffries (Institute of Microbial and Biochemical USDA, США).

2. Prof. J. Thevelein (Інститут ботаніки і мікробіології, Лювен, Бельгія).

3. Dr. H. Kang, (Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Taejon, Korea).

4. Prof. Penninckx M (Faculte de Sciences Section Interfacultaire Unite de Physioilogie et Ecologie Microbienne, Брюссель, Бельгія).

5. Prof. Y. Piskur (Університет м.Лунд. Відділ біології, Швеція).

6. Prof. Bartosz G. (Відділ біотехнології і мікробіології Жешівського університету, Польща).

7. Prof. Koloczek H. (Аграрний університет, кафедра біохімії, Краків, Польща)

8. Prof. Bolotin M. (Université Paris-Sud, Orsay, France)

9. Prof. Passoth V. (University of Uppsala, Sweden)

10. Hervé Bottin (Laboratoire Photocatalyse et Biohydrogéne, Centre d'Etudes Atomiques de Saclay, France).