- •Ядро: експресія генів і чинники транскрипції
- •Організація генетичного матеріалу : загальні принципи Функціональні відділи генома Гени і їх структура
- •Спосіб запису генетичної інформації Функціональна роль ланцюгів днк
- •Основні властивості генетичного коду
- •Генетичний код
- •Оперонная організація генетичного матеріалу у бактерій Регуляторні і конститутивні гени Загальна схема оперону
- •Конститутивні гени і білки
- •Приклади оперонів Лактозний оперон - приклад індуцибельних оперонів
- •Триптофановий оперон – приклад репресибельних оперонів
- •Організація генетичного матеріалу у еукаріот Гени ряду білків і рнк
- •Загальні чинники транскрипції
- •Білок р53 як чинник транскрипції
- •Структура рнк
- •Загальний план будови рнк
- •Особливості будови мРнк
- •Особливості будови тРнк Первинна, вторинна і третинна структури
- •Взаємодії тРнк з лігандами
- •Рибосомальні рРнк і рибосоми
- •Синтез рнк (транскрипція днк) Загальна характеристика транскрипції
- •Механізм транскрипції Ініціація транскрипції
- •Елонгація транскрипції
- •Термінация транскрипції
- •Конвеєрний характер процесу
- •Інгібітори транскрипції
- •Продукти транскрипції
- •Дозрівання (процесинг) рнк
- •Видалення "зайвих" послідовностей Загальний опис
- •Механізм сплайсингу
- •Приєднання і модифікація нуклеотидів
- •Інші системи синтезу рнк
- •Віруси: рнк-синтетазна система Способи реплікації генома рнк-вмісних вірусів
- •Полінуклеотидфосфорилаза
- •Розпад мРнк
- •Руйнування мРнк бактерій з 5´ -конца-ефект положення
- •Руйнування мРнк еукаріот із 3'-кінця Роль пів(а) -фрагмента
- •Роль ау-элементів
- •Вплив продуктів трансляції на розпад мРнк
- •Вплив ліганда білку на розпад мРнк
Механізм сплайсингу
Один з ключових моментів даного механізму (див.мал.) - забезпечення точності розрізання ланцюга про-РНК: помилка навіть на один нуклеотид призведе до "зрушення рамки", що змінить вміст усіх кодонів мРНК або антикодону тРНК.
Точність досягається завдяки двом обставинам. По-перше, на початку і у кінці кожного інтрону є певні послідовності нуклеотидів: так, інтрони завжди починаються з Г-У, а кінчаються дуплетом А-Г. По-друге, для впізнавання цих послідовностей використовуються спеціальні РНК - т. з. малі ядерні РНК (мяРНК). Останні пов'язані з ферментами, що каталізують сплайсинг. Такі рибонуклеопротеїдні комплекси називаються сплайосомами.
Сплайсинг починається з взаємодії двох мяРНК з початком і кінцем інтрону. Це дає "орієнтацію" для ендонуклеази: остання діє на межі двох- і одноланцюгових ділянок.
Перший розрив про- РНК відбувається в області 5' кінця інтрону - на мал. це місце знаходження лівого краю лівої мяРНК. При цьому 5' кінець інтрону зв'язується з одним з нуклеотидів в середній частині того ж інтрону, що призводить до утворення кільцевої (чи, точніше, ласоподобной) структури.
Тому перша (на малюнку - ліва) мяРНК, мабуть, дисоціює, а ферментний комплекс переміщується до іншої (на малюнку - правої) мяРНК, що маркує 3 '- кінець інтрону. Тут відбувається другий розрив про-РНК - по місцю знаходження "правого" кінця "правої" мяРНК. Точніше, зв'язок екзона 2 з інтроном замінюється на зв'язок з екзоном 1.
Отже, обидва розриви здійснюються одним і тим же способом - шляхом заміщення одного межнуклеотидного зв'язку на інший такий же зв'язок.
З порушенням механізму сплайсингу пов'язаний один з видів β-талассемії - генетичного захворювання, при якому порушене утворення β-ланцюгів гемоглобіну. У хворих з т. з. β-талассемією в гені β-глобина заміщена всього одна нуклеотидная пара, причому навіть не в кодуючій частині, а в інтроні. Але в результаті в інтроні β-глобинової про- мРНК з 5 '- кінця виявляється не Г, а А. Тому не відбувається впізнавання цього кінця з боку мяРНК, інтрон не вирізується і зріла мРНК не утворюється.
Приєднання і модифікація нуклеотидів
Отже, в процесі дозрівання про-РНК остання втрачає значну частину нуклеотидів. Але відбувається також і нетраскрипційне приєднання окремих нуклеотидів.
У разі про-мРНК з боку 5'-кінця приєднується (за допомогою нетипового для полінуклеотидів пирофосфатного зв'язку) 7-метилгуаніловий нуклеотид - компонент "ковпачка". А з боку 3 '- кінця понуклеотидно нарощується пів(А) -фрагмент приблизно з 200 нуклеотидів. Для цього використуються спеціальні ферменти; зокрема, для утворення пів(А) -фрагмента - поліаденілатполімераза.
У разі ж про-тРНК з 3 '- кінця по черзі приєднуються три нуклеотиди - Ц, Ц і А, що утворюють акцепторну гілку.
Нарешті, важливий момент дозрівання про-РНК - цтворення в їх складі модифікованих нуклеотидів. Як і у випадку метилування ДНК, мінорні нуклеотиди з’являються в полинуклеотидному ланцюзі не на стадії полімеризації, а після закінчення її - шляхом модифікації звичайних нуклеотидів, що містяться в ланцюзі.
Так, в про-мРНК відбувається метилування рибозних залишків нуклеотидів "ковпачка", а в про-рРНК - теж метилування рибозних залишків, але нуклеотиди, що утворюють їх, розташовані по усій довжині ланцюга - з частотою приблизно 1 %.
Набагато різноманітніші процеси модифікації в випадку про-тРНК. Наприклад, певні залишки уридину піддаються відновленню (з утворенням дигідроуридина), інші - ізомеризації (що дає псевдоуридин), треті, - метилюванню (метилуридин). Деякі залишки аденозина дезамінуються (перетворюючись на інозин), причому частина з продуктів потім ще метилюється (утворюючи метилінозин). І так далі: список модифікацій, що відбуваються, в про-тРНК можна продовжити.
Усі вищеперелічені події і приводять у кінці кінців до утворення в ядрі зрілих молекул РНК:
а) 4 видів рРНК : 28S-, 18S-, 5,8S - і 5S - PHK;
б) декількох десятків видів тРНК - по 1-3 (або навіть більше) для кожної з 20 амінокислот;
в) тисяч різних мРНК - копій генів, функціонучих в цих клітинах.
рРНК і мРНК тут же, в ядрі, зв'язуються з білками. При цьому рРНК формують з рибосомними білками великі і малі субодиниці рибосом, які потім виходять в цитоплазму. А мРНК зв'язуються з іншими білками (які виконують, мабуть, захисну і транспортну функції) і в комуплексі з ними теж переміщуються в цитоплазму.
В процесі усіх цих перетворень істотно змінюються седиментаційні властивості. Для ілюстрації приведемо стадії дозрівання однієї з мРНК.
таблиця. Дозрівання мРНК
Послідовні форми |
40S – про-мPHK
→ |
15S – про-мPHK
→ |
16,5S – пів(А)-мPHK → |
27S – пів(А)-мPHП |
Кількість нуклеотидів в РНК |
≈9200 |
≈1200 |
≈1430 |
≈1430 |
Кількість зв’язаних молекул білка |
----- |
---- |
----- |
3 (з масою по 50000) |
Як видно, в результаті видалення "зайвих" нуклеотидів ланцюг про-мРНК коротшає приблизно на 87 % (тобто залишається лише 13 % від початкової довжини).
Потім приєднуються приблизно 230 аденілових нуклеотидів, тому коефіцієнт седиментації дещо збільшується.
І, нарешті, на останній стаії він зростає набагато сильніше - в результаті зв'язування з мРНК трьох білкових молекул. У результаті утворюється мРНП - м-рибонуклепротеїд, тобто комплекс мРНК з білками.
