- •Термодинаміка біологічних процесів
- •Термодинаміка рівноважних станів
- •Перший закон термодинаміки
- •1.2. Ентальпія. Закон Гесса
- •1.3. Калориметрія
- •Циліндра калориметра, відповідно
- •І енергетичні еквіваленти Qo поживних речовин
- •1.4. Другий закон термодинаміки
- •При досягненні термодинамічної рівноваги (t – час)
- •1.5. Термодинамічні потенціали
- •1.6. Зміна стандартної вільної енергії
- •1.7. Хімічний потенціал
- •1.8. Електрохімічний потенціал
- •Термодинаміка необоротних процесів
- •2.1. Зміна ентропії у відкритих термодинамічних системах
- •2.2. Швидкість продукції ентропії й дисипативна функція
- •2.3. Основні положення лінійної нерівноважної термодинаміки
- •2.4. Співвідношення взаємності Онзагера
- •2.5. Теорема Пригожина
- •2.6. Стійкість системи в рівновазі й у стаціонарному стані
- •2.7. Нелінійна термодинаміка необоротних процесів
- •2.8. Найпростіші коливальні реакції
1.6. Зміна стандартної вільної енергії
Зміна вільної енергії ΔG залежить від умов перебігу хімічних реакцій (температури, тиску, концентрації реагуючих речовин), що ускладнює порівняння хімічних перетворень для різних речовин. Труднощі зникають, коли використовується стандартна вільна енергія G0, яка визначається за стандартних умов: концентрація розчину с = 1 моль/л, тиск р= 105 Па (1 атм), рН = 7,0, Т = 298 К.
Зміна вільної енергії для 1 моль/л ідеального газу за Т = const з урахуванням рівняння стану рV = RT і виразу (1.32) буде такою:
Інтегруючи (1.33), отримуємо:
де G0 − стандартна вільна енергія, яка вимірюється за фіксованих параметрів, як зазначалось вище. З певним наближенням (для розведених розчинів) у рівнянні (1.34) тиск р замінюють на концентрацію с, і тоді:
Розглянемо просту хімічну реакцію А ↔ В. Відповідно до (1.35) зміна вільної енергії ΔG для цієї реакції становитиме:
де [А] і [В] − концентрації реагуючих речовин; ΔG0 − зміна стандартної вільної енергії. За умови, що із часом хімічна реакція досягає рівноваги і ΔG = 0, з (1.36) знаходимо зміну стандартної вільної енергії:
де Kр = [В]р/[А]р − константа рівноваги. З рівнянь (1.37) та (1.28) знаходимо:
Це формула Вант-Гоффа. З температурної залежності lnКр = f(1/T) легко знайти стандартні значення ΔH 0 і ΔS 0.
Визначення ΔG0 для білків і нуклеїнових кислот часто проводиться за допомогою спектрофотометрії. Теплова денатурація білка реєструється на диференційному спектрофотометрі (рис. 1.4).
Якщо процес денатурації оборотний і здійснюється в одну стадію, припускається, що може відбуватися перехід між двома станами білка − нативним (нижче 293 К) і денатурованим (вище 323 К). Концентрації білка в цих двох станах позначимо, як [N] і [D]. Тоді в температурному інтервалі, де відбувається різка зміна диференційної молярної екстинкції Δε, спостерігатиметься рівновага двох форм білка з константою рівноваги Кр = [D] / [N]. Різниця ΔεT − ΔεN буде пропорційною [D], а ΔεD − ΔεN − концентрації нативного білка [N], ΔεT − диференційна молярна екстинкція білка за температури Т. Тоді
Рис. 1.4. Залежність диференційної екстинкції хімотрипсину від температури: Δε – коефіцієнт диференційної молярної екстинкції,
виміряної за λ=293 нм
За рН = 1,7 і температури 316 К для хімотрипсину:
ΔG0 = − 4,18 кДж ∙ моль−1.
Для багатьох біохімічних реакцій встановлено зміни стандартних термодинамічних величин. Величину ΔG0 визначають за формулою (1.38), вимірюючи Кр різними методами, а ΔH0 − калориметричним методом. Нижче наведено приклади ΔG0 деяких біохімічних реакцій, які вимірювались за стандартних умов (c = 1 моль/л, Т = 298 К, рН = 7):
окиснення глюкози:
C6H12O6 + 6О2 → 6СО2 + 6Н2О
ΔH0 = − 2810 кДж • моль−1 (− 673 ккал ∙ моль−1);
ΔG0 = − 2870 кДж • моль−1 (− 687 ккал ∙ моль−1);
реакції гідролізу етерів фосфорної кислоти:
АТФ + Н2О → AДФ + Ф
ΔH0 = − 19,71 кДж ∙ моль−1 (− 4,7 ккал ∙ моль−1);
ΔG0 = − 34,54 кДж ∙ моль−1 (− 8,2 ккал ∙ моль−1).
Сполуки, при гідролізі яких виділяється значна кількість енергії, називають макроергічними. Від'ємне значення ΔG0 вказує на довільність цього процесу. У клітинах, крім АТФ, є інші подібні сполуки з великою енергією гідролізу фосфоетерного зв'язку. При гідролізі креатинфосфату ΔG0 = – 43,1 кДж ∙ моль−1. Деякі реакції гідролізу фосфатних сполук проходять зі значно меншою величиною ΔG0 (наприклад, для глюкозо-1-фосфату ΔG0 = − 20,9 кДж ∙ моль−1), ніж це відбувається при гідролізі АТФ. Саме велике значення ΔG0 = − 34,54 кДж ∙ моль−1 визначає АТФ як універсальне джерело енергії для багатьох біохімічних реакцій, що відбуваються з поглинанням енергії.
