VI.2. Идентификация микроорганизмов

Группа

Название

Существенные признаки

Представители

Грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку

1

Спирохеты

Клетки спиралевидной формы, гибкие, подвижные. Хемоорганотрофы, микроаэрофилы, факультативные анаэробы или аэробы. Свободножвущие или находящиеся в ассоциациях с животными или человеком. Некоторые патогенны

Borrelia anserine – возбудитель возвратного тифа,

Treponema pallidum – возбудитель сифилиса

2

Аэробные/ микроарофильные, подвижные/виброидные, грамотрицательные бактерии

Клетки спиралевиной или виброидной формы, подвижны.Аэробы или микроарофилы. Некоторые способны к анаэробному дыханию (акцепторы – нитрат или фумарат). Хемоорганоторофы, некоторые – автотрофы (донор электронов – Н₂). Встречаются в почве, пресной или морской воде, корнях растений, репродуктивны орнаах, пищеварительном тракте животных и человека. Некоторые патогенны или являются хищниками по отношению к другим микроорганизмам

Bdellovibrio, Micavibrio, Vampirovibrio – хищники по отношению к другим микроорганизмам.

Azospirillum – азотофиксирующие микроорганизмы

3

Неподвижные или, редко, подвижные, грамотрицательные изогнутые бактерии

Изогнутые, виброиды, или прямые палочки, дугообразные, S – образные. Хемооргнаотрофные гетеротрофы. Сапрофиты

Flectobacillus major – обитатель пресных и морских вод, Ancylobacter aquatilcus – встречается в почве и пресных водах

4

Грамотрицательные, аэробные/ микроарофильные палочки и кокки

Хемоорганотрофные гетеротрофы, некоторые автотрофы (донор электронов – Н₂). Метаболизм дыхательного типа (О₂ – акцептор элеткронов), некоторые способны к анаэробному дыханию с использованием нитрата, фумарата и др. конечных акцепторов электронов. Включает восемь семейств

Agrobacterium tumefaciens – индуцирует образование корончатого галла у растений,

Azotobacter chroococcum – азотофиксаторы,

Pseudomonas aeroginosa – возбудитель гнойно-воспалительных процессов

5

Факультативно анаэробные, грамотрицательные палочки

Хемоорганогетеротрофы, некоторые автотрофы. Не образуют простеки чехлы, газовые вакуоли. Метаболизм дыхательного типа, или брожение. Свободноживущие формы или в ассоциациях с животными, человеком, растениями. Включает три семейства

Escherichia coli – условно патогенные бактерии, обитатели кишечника человека и животных, Salmonella typhi – возбудитель брюшного типа

6

Грамотрицательные, анаэробные, прямые, изогнутые и спиралевидные палочки.

Хемоорганогетеротрофы. Энергию получают за счет анаэробного дыхания или брожения. Основное место обитания – ротовая полость или кишечник животных и человека. Некоторые патогенны

Selenomonas sputigena – встречаются в ротовой полости человека, в рубце жвачных др., Bacteroides fragilis – обитатели пищеварительного тракта, сточных вод, обнаружены в очагах инфекции и нагноения у человека и животных

Группа

Название

Существенные признаки

Представители

7

Бактерии, осуществляющие диссимиляционное восстановление сульфата или серы

Анаэробы. Хемоорганотрофные гетеротрофы. Осуществляют анаэробное дыхание, используя в качестве конечного акцепторов электронов сульфат или другие эндоспоры

Desulfovibrio desulfuricans – обитают в пластовых водах нефтяных месторождений, кишечник е животных, Thermodesulfobacterium commune – выделены из горячих источниках и пластовых водах нефтяных месторождений

8

Анаэробные грамотрицательные кокки

Хемоорганотрофные гетеротрофы. Метаболизм чисто бродильного типа. Главным образом паразиты гомойотермных животных, таких как жвачные, грызуны и свиньи, а также человека

Veillonella parvula – паразиты, встречаются в ротовой полости, кишечнике и дыхательных путях человека и животных

9

Риккетсии и хламидии

Облигатные внутриклеточные паразиты эукариотических хозяев (позвоночных и членистоногих). Клетки палочковидные, кокковидные или плеоморфные. Многие виды патогенны

Chlamydia trachomatic – возбудитель трахомы, урогенитального хламидиоза, Rickettsia prowazekii – возбудитель сыпного тифа

10

Аноксигенные фототрофные бактерии

Бактерии, содержащие бактериохлорофилл и способные использовать свет в качестве источника энергии. Растут на свету в анаэробных условиях и не выделяют О₂ при фотосинтезе. Некоторые способны расти в темноте за счет кислородного дыхания. Не содержат фикобилипротеины

Heliobacillus mobilis – встречаются на рисовых полях и во временно затопляемых почвах, Chlorobium limicola – обитают в сульфатсодержащем иле, пресной воде, азотофиксаторы

11

Оксигенные фототрофные бактерии

Бактерии, содержащие хлорофилл а, используют свет как источник энергии и выделяют О₂ подобно зеленым растениям. Подразделены на два отдела:

1. Цианобактерии. Содержат хлорофилл а и фикобилипротеины. Разнообразная группа, содержит 5 подгрупп.

2. Прохлорофиты. Содержат хлорофилл а и хлорофилл b, но не фикобилипротеины

Synechococcus sp. – пикопланктонная форма, обнаружена в горячих источниках, Prochloron didemni – внеклеточные симбионты в ассоциациях с колониальными асцидиями в субтропических и тропических морских прибрежных водах

12

Анаэробные хемолитотрофные бактерии и близкие организмы

Нефотосинтезирующие бактерии, подразделяются на три подгруппы: 1 – бесцветные сероокисляющие бактерии, 2- железо- и мрганец-окисляющие и/или осаждающие бактерии, 3 – нитрифицирующие бактерии

Thiodendron latens – серобактерии, Gallionella ferruginea – одни из важных железобактерий, образующие в большом кол-ве ферригидрита в водоемах и системах водоснабжения, – Nitrobacter winogradskyi – окисляют нитрит, Nitrosolobus multiformis – окисляют аммиак

13

Почкующиеся и/или обазующие выросты бактерии

Разнообразная и разнородная группа, объединяющая бактерии с необычными формами клеток, выростами и сложными жизненными циклами. Группа подразделена на три подгруппы: 1- бактерии, образующие простеки, 2 – бактерии, не образующие простеки, 3- другие бактерии

Stella humosa – клетки в виде плоских шестилучевых звезд, Planctomyces bekefii – луковицеобразные бактерии, без стебельков, Seliberia stellata – спирально закрученная форма клеток

Группа

Название

Существенные признаки

Представители

14

Бактерии, имеющие чехлы

Не фототрофы, анаэробы. Не способные к скользящему движению. Характерен рост в виде нитей, клетки которых окружены чехлом (трубка или внеклеточное вещество)

Leptothrix ochraceae – палочки, окруженные чехлом, которые пропитаны или покрыты оксидами железа и марганца

15

Нефотосинтезирующие скользящие бактерии, не образующие плодовых тел

Морфологически разнообразная группа, не имеют жгутиков, но способны к скользящему движению по поверхности твердого субстрата

Thiospiirillopsis floridana – бесцветные серные бактерии, имеющие форму спирально извитых нитей, передвигаются за счет вращения нитей

16

Скользящие бактерии, образующие плодовые тела

Бактерии, способные к скользящему движению и образующие плодовые тела и устойчивые к высушиванию микроспоры

Chondromyces crocatus – имеют плодовые тела, состоящие из скоплений ярко-оранжевых спорангиолей, возникающих на длинных, белых, слизистых стебельках

Грамположительные эубактерии, имеющие клеточную стенку

17

Грамположительные кокки

К группе отнесены существенно различающиеся роды, собранные для удобства в одну группу на основании двух общих признаков – сферическая форма и грамположительная реакция при окрашивании по Грамму

Streptococcus pyogenes –паразиты позвоночных, Staphylococcus aureus – ассоциированы с кожными покровами и слизистыми оболочками теплокровных животных

18

Образующие эндоспоры грамположительные палочки и кокки

Образуют устойчивые к нагреванию, сильно преломляющие свет эндоспоры

Bacillus subtilis – обнаруживаются в различных местообитаниях, некоторые патогенны, Closridium botulinum – возбудитель ботулизма

19

Не образующие спор грамположительные палочки правильной формы

Мезофиллы, хемоорганотрофы, растущие на средах сложного состава. Некоторые патогенны для животных

Lactobacillus delbrueckii – обитатель нормальной микрофлоры пищеварительного тракта у птиц и млекопитающих

20

Не образующие спор грамположительные палочки неправильной формы

Облигатно аэробные, факультативно анаэробные и строгие анаэробные. Каталазоположительные и каталазоотрицательные. Некоторые патогенны для животных или растений

Corynebacterium diphtheriae – облигатные паразиты на слизистых оболочках или кожных покровах млекопитающих

21

Микобактерии

Аэробные, неподвижные, не образующие спор, медленно растущие палочковидные бактерии, характеризующиеся кислотоустойчивостью. Свободноживущие или паразиты позвоночных

Mycobacterium tuberculosis – возбудитель туберкулеза

Группа

Название

Существенные признаки

Представители

22-29

Актиномицеты

Образуют разветвленные нити или гифы в виде мицелия, стабильного или распадающегося на палочковидные или кокковидные элементы

Nocardia asteroides – возбудители актиномицетной мицетомы и нокрдиоза

Эубактерии, лишенные клеточной стенки: микоплазмы или молликулы

30

Микоплазмы

Плеоморфные клетки, на агаре образуют колонии характерного вида «яичницы – глазуньи». Устойчивы к пенициллину, чувствительны к спиртам, детергенам и др. Паразиты, комменсалы или сапрофиты, многие патогенны для животных, растений, человека

Mycoplasma hominis и Ureaplasma urealyticum – возбудители урогенитальных инфекций

Архебактерии

31

Метаногены

Строгие анаэробы. Хемоавтотрофы или хемогетеротрофы, всегда образующие метан как продук катаболизма

Methanoculleus bourgense – встречаются в метантенках анаэробных иловых отложениях в озерах

32

Сульфатредуцирующие археи

Анаэробы, способны образовывать H₂S из сульфата в процессе диссимиляционной сульфатредукции. Экстремальные термофилы

Archaeoglobus fulgidus – признаки как для группы, образуют в небольшом кол-ве метан

33

Экстремально галофильные архебактерии (галобактерии)

Нуждаются в высоких концентрациях NaCl (1,5 M и выше). Некоторые алкалофилы (растут при рН > 8,5). Некоторые содержат бактериородопсин и способны использовать свет для синтеза АТФ

Haloarcula vallismortis – встречаются в засоленных местообитаниях с нейтральным рН

34

Архебактерии, лишенные клеточной стенки

Плеоморфные клетки. Облигатные термофилы (температура для роста 33–67⁰С), облигатные ацидофилы (растут при рН 0,5–4,0)

Thermoplasma acidophilum – обитатели саморазогревающихся угольных отвалов и кислых сольфатарных полей

35

Экстремальные термофилы и гипертермофилы, метаболизирующие S⁰

Ацидофилы и нейтрофилы. Автотрофы и гетеротрофы. Температура для рота 45–110⁰С. Большинство видов метаболизирует серу

Sulfolobus acidocaldarius – распространены по всему земному шару, обитатели континентальных сольфатарных полей