Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Структура рибосомы и биосинтез белка - А.С.Спирин.pdf
Скачиваний:
106
Добавлен:
24.05.2014
Размер:
4.8 Mб
Скачать

тон соответственно;

их участие в связывании мРНК с рибосомной

40S субчастицей более

необходимо.

Важным белком является eIF4E, чаще называемый кэпсвязывающим

белком (CBP-I), с молекулярной массой 24000 дальтон. Специфически связываясь с модифицированным (кэппированным) 5'-концом мРНК, он стимулирует ассоциацию рибосомных частиц с матрицей и инициацию трансляции. Имеются указания, однако, что этот белок существует и функционирует в норме в составе большого кэпсвязывающего мультибелкового 8—10S комплекса, обозначаемого как СВР-П или eIF-4F; комплекс включает в себя также eIF4A и субъединицу (один полипептид) с молекулярной массой 220000 дальтон. Комплекс СВР-П (eIF4F) функционирует совместно со свободными eIF4A и eIF-4B.

В отличие от прокариотических систем стадия связывания мРНК в процессе инициации у эукариот включает распад АТФ до АДФ и ортофосфата. Гидролиз АТФ сопряжен с участием СВР-П (eIF4F), eIF4A и eIF4B в связывании мРНК. Возможно, что кэпсвязывающие белки осуществляют АТФ-зависимое расплетание или дестабилизацию вторичной структуры 5'-концевого участка эукариотической мРНК, тем самым способствуя ассоциации этого участка с рибосомными частицами.

Крупный белок eIF-2B, построенный из 5 различных субъединиц, имеет вспомогательное значение. Он образует комплекс с eIF-2, в котором сродство eIF-2 к ГДФ уменьшено, а к ГТФ увеличено, в результате чего обеспечивается эффективный обмен связанного ГДФ на свободный ГТФ. (Иначе, при физиологических концентрациях ГДФ и ГТФ более 90% молекул eIF-2 было бы связано с ГДФ, существуя, таким образом, в неактивном состоянии.) Образующийся комплекс eIF-2B • eIF-2 • GTP непосредственно связывает инициаторную метионилтРНК, и затем комплекс Met-tRNAF -eIF-2-GTP переносится от eIF-2B на инициирующую 40S рибосомную частицу. Таким образом, eIF-2B

катализирует повторное

использование eIF-2 после его освобождения

(в форме eIF-2 • GDP)

из рибосом, заканчивающих инициацию (см.

рис. 124).

 

В целом картина с белковыми факторами, участвующими в инициации трансляции у эукариот, получается сложной.

3. СОСТОЯНИЕ РИБОСОМЫ ПЕРЕД ИНИЦИАЦИЕЙ

Как и в случае прокариот, терминировавшие (нетранслирующие) рибосомы перед инициацией трансляции должны перейти в диссоциированное состояние. Однако эукариотические 80S рибосомы довольно стабильны, и надо полагать, что их окончательная диссоциация на субчастицы после терминации трансляции достигается только в результате действия белковых факторов. Во всяком случае, в цитоплазматических экстрактах эукариотических клеток существуют так называемые «нативные» 40S и 60S субчастицы, отличающиеся от «производных» 40S и 60S субчастиц, получаемых из 80S рибосом путем диссоциации понижением концентрации Mg2+. «Нативные» субчастицы не способны ассоциировать в 80S рибосомы при умеренных концентрациях Mg2 + ; в противоположность «производным» субчастицам. «Нативные» субчастицы, и

249

особенно 40S субчастицы, имеют существенно большее содержание белка, чем «производные» субчастицы; соответственно, если плавучая плотность в CsCl у «производной» 40S субчастицы равна около 1,52—1,55 г/см3, то у «нативной» 40S субчастицы она составляет около 1,49 г/см3 и может приближаться даже к 1,40 г/см3. В составе «нативных» 40S субчастиц находят ряд факторов инициации в связанном виде в варьирующих количествах (именно «нативные» субчастицы и являются источником для получения факторов инициации при их препаративном получении). Все «нативные» 40S частицы обязательно содержат eIF-З в эквимолярном количестве. «Нативные» 60S субчастицы могут иметь, по-видимому, связанные факторы элонгации.

Итак, в цитоплазме эукариотических клеток и в их экстрактах всегда имеется больший или меньший фонд свободных неассоциируемых («нативных») 40S и 60S субчастиц, связанных с факторами инициации и, возможно, также с рядом других белков. Именно «нативные» 40S субчастицы, несущие на себе eIF-З и некоторые другие факторы инициации, начинают процесс инициации трансляции.

4. ОБРАЗОВАНИЕ КОМПЛЕКСА РИБОСОМНОЙ 40S СУБЧАСТИЦЫ С ИНИЦИАТОРНОЙ тРНК

В присутствии ГТФ eIF-2 специфически узнает инициаторную метио- нил-тРНК и образует с ней тройственный комплекс:

eIF-2 + GTP + Met-tRNA . Met-tRNA • eIF-2 • GTP

Тройственный комплекс имеет сильное сродство к «нативной» 40S

субчастице. В результате образуется

инициаторный 43S комплекс:

40S + Met-tRNA • eIF-2 • GTP «

' 40S • Met-tRNA • elF-2 • GTP

Уже указывалось, что eIF-2B, взаимодействуя

с eIF-2, стимулирует обра-

зование тройственного комплекса Met-tRNA F

• eIF-2 • GTP и его вступле-

ние в инициаторный 43S комплекс (см. рис. 124).

Присутствие других факторов инициации на 40S субчастице, и особенно eIF-З, а также eIF-4C и, возможно, eIF-1, стабилизирует инициаторный 43S комплекс. Для образования комплекса ГТФ может быть заменен на его нерасщепляемый аналог.

Таким образом, в эукариотических системах связывание малой рибосомной субчастицы с инициаторной тРНК, по-видимому, предшествует ассоциации с мРНК, являясь первым этапом инициации трансляции.

5. АССОЦИАЦИЯ РИБОСОМНОЙ 40S

СУБЧАСТИЦЫ С мРНК

Комплекс нативной 40S субчастицы с инициаторной метионил-тРНК (включающий некоторые факторы инициации и ГТФ) вступает в ассоциацию с мРНК. На этом этапе абсолютно необходимым оказывается eIF-З. Механизм его действия не ясен. Предполагается, что он, будучи связанным с «нативной» 40S субчастицей, участвует в формировании центра, узнающего мРНК. Ему приписывают также функции белка, способствующего расплетанию вторичной структуры матричного полинуклеотида в

250

e l F - 4 A '
e l F 4 B

процессе инициации. Имеются указания на роль eIF-З в дискриминации различных мРНК. Наличие eIF-2 на 40S субчастице также сильно способствует связыванию и, возможно, дискриминации мРНК, тем более что этот белок обладает сильной РНК-связывающей способностью. В ассоциации 40S субчастицы с мРНК принимают участие также eIF-1, eIF4A, eIF-4B, eIF-4C и кэпсвязывающие белки (eIF-4E, eIF-4F), и происходит гидролиз АТФ до АДФ и ортофосфата. В результате образуется так называемый инициаторный 48S комплекс:

40S • eIF-3 • elF^tC • Met-tRNA • eIF-2 • GTP +

+ eIF-1 + mRNA • СВР + ATP + H2O

• 40S • mRNA • Met-tRNA • eIF-2 • GTP • eIF-3 • eIF4C • eIF-1 +

+СВР + ADP + P,

Вбольшинстве случаев важным условием для начальной ассоциации с мРНК является наличие кэп-структуры на 5'-конце (см. рис. 5) и комплексированного с ним кэпсвязывающего белка или белков (СВР). Действительно, все клеточные эукариотические мРНК имеют кэп, и удаление его резко понижает эффективность трансляции мРНК. Показано, что кэпструктура вместе с кэпсвязывающими белками увеличивают сродство мРНК к рибосомным частицам. Добавление химических аналогов кэпструктуры, таких, как m7 GMP, m7 GDP или m7GpppNm (где N —любой нуклеотид), ингибирует связывание рибосом с кэппирдванными мРНК и, соответственно, их трансляцию в бесклеточных системах. Антитела против кэпсвязывающего белка точно так же ингибируют связывание рибосом и инициацию трансляции кэппированных мРНК. Интересно, что прокариотические (некэппированные) мРНК могут в ряде случаев транслироваться эукариотическими рибосомами, но со сравнительно низкой эффективностью; присоединение кэп-структуры к их 5'-концу делает их высокоэффективными матрицами в эукариотических бесклеточных системах.-

Следует указать, однако, что РНК некоторых животных и растительных вирусов не имеют кэп-структуры на 5'-конце, но тем не менее являются эффективными матрицами в эукариотических системах. Это относится, например, к РНК пикорнавирусов, такого, как вирус энцефаломиокардита, к РНК сателлитного вируса некроза табака и т. п. Кэпсвязывающие белки не участвуют в их ассоциации с рибосомами. Предполагается, что в этих исключительных случаях 5'-конец мРНК имеет особую (может быть, развернутую) структуру, обеспечивающую ему высокое сродство к 40S субчастице с факторами инициации в отсутствие кэпструктуры и кэпсвязывающих белков.

Как уже отмечалось, одной из функций, приписываемых кэп-струк- туре, является связывание кэпсвязывающих белков, обеспечивающих необходимую дестабилизацию или перестройку собственной 5'-концевой вторичной и/или третичной структуры мРНК. Предполагается, что расплетающий эффект кэпсвязывающего белкового комплекса зависит от АТФ, и что гидролиз АТФ требуется для такого расплетания. Возможно, что лишь специально подготовленная (например, «расплавленная») пространственная структура 5'-концевого участка мРНК может достаточно эффективно участвовать в ассоциации с эукариотической рибо-

251

сомной частицей. Действительно, ряд наблюдений указывает на то, что чем менее структурирован 5'-концевой участок мРНК, тем меньше его ассоциация с рибосомами зависит от наличия кэпа.

На моноцистронный характер большинства эукариотических мРНК и неспособность эукариотических рибосом осуществлять «внутреннюю инициацию» было указано еще М. Джекобсоном и Д. Балтимором в 1968 г. Позднее необходимость 5'-конца мРНК для инициации трансляции в эукариотических системах была продемонстрирована в очень изящных опытах М. Козак (США): если матричный полинуклеотид, способный транслироваться как эукариотическими, так и прокариотическими рибосомами, был замкнут в кольцо (путем соединения 5'-конца с З'-концом РНК-лигазой), то тогда только прокариотические рибосомы могли транслировать его, в то время как эукариотические рибосомы полностью теряли способность инициировать трансляцию на такой циркулярной матрице. Разрыв кольца перед инициирующим кодоном AUG восстанавливал способность эукариотических рибосом транслировать этот полинуклеотид. Точно так же в экспериментах М. Розенберга и Б. Патерсона (США) было показано, что если прокариотическая полицистронная мРНК снабжена 5'-концевой кэп-структурой, чтобы разрешить ее эффективную трансляцию эукариотическими рибосомами, то трансляция ограничена лишь 5'-проксимальным цистроном. Эукариотические рибосомы действительно оказываются, как правило, не способными инициировать на внутренних участках матричного полинуклеотида (в противоположность прокариотическим рибосомам).

Анализ первичных структур рибосомных РНК и мРНК эукариот показал, что здесь отсутствует столь хорошо просматриваемая у прокариот комплементарность 3'-конца РНК малой рибосомной субчастицы с прединициирующей полипуриновой последовательностью прокариотических мРНК и их отдельных цистронов. Поразительно, что 3 -конце- вые 50-нуклеотидные последовательности рибосомных РНК малых субчастиц (16S РНК прокариот и 18S РНК эукариот) консервативны в эволюции и очень гомологичны, давая похожую шпильку вторичной структуры, но именно полипиримидиновый блок CCUCC прокариотической 16S РНК отсутствует в эукариотической 18S РНК (рис. 122). Этот факт наводит на мысль, что по каким-то важным причинам эукариоты вынуждены были отказаться от использования первичного комплементарного узнавания между рибосомной РНК и мРНК в ассоциации рибосом с матрицей и выработать другой путь для узнавания инициирующей последовательности. Этот путь состоит, по-видимому, в первичном узнавании 5'-конца. (Конечно, можно думать и наоборот: узнавание 5'-конца является более ранним, и эволюция прокариотических организмов, особенно развитие оперонов и полицистронных матриц, привели к специальному механизму узнавания внутренних инициирующих районов; таким механизмом служит спаривание полипуриновой последовательности Шайна —Даль- гарно с эволюционно приобретенной вставкой CCUCC у самого 3'-конца рибосомной РНК.) В то же время в процессе инициации какое-то комплементарное взаимодействие между последовательностями у 5'-конца кэппированной мРНК и 3'-конца 18S РНК, видимо, имеет место; однако это спаривание строго зависит от присутствия факторов инициации.

252

Соседние файлы в предмете Химия