- •Глава 1. Растительная клетка (Носов а.М.)
- •1.1. Все живые клетки имеют как общие, так и специфичные черты.
- •1.1.1. Принципиальное отличие любой эукаритической клетки от прокариотической – наличие множества отсеков, именуемых органеллами.
- •1.1.2. В клетке существует два пути транспорта белков.
- •1.2. Растительная клетка – результат двойного симбиоза.
- •1.3. Плазматическая мембрана растительной клетки (плазмалемма).
- •1.3.1. Структура плазмалеммы.
- •1.3.2. Функции плазмалеммы.
- •1.4. Ядро растительной клетки.
- •1.4.1. Строение ядра растительной клетки не отличается от ядра других эукариот.
- •1.4.2. Комплекс ядерных пор выполняет функции фильтров и активных переносчиков макромолекул.
- •1.5. Пластиды.
- •1.5.1. Пластиды - семейство органелл, свойственных только растительным клеткам.
- •1.5.2. Все типы пластид развиваются из пропластид.
- •1.5.3. Внешняя и внутренняя мембраны оболочки пластид отличается по составу, структуре и транспортным функциям.
- •1.5.4. Размножение пластид осуществляется путем деления уже существующих пластид.
- •1.5.5. Пластиды наследуются у большинства растений по материнской линии.
- •1.5.6. Пластиды частично сохранили свою автономию: они имеют собственную днк прокариотического типа и белок-синтезирующую систему
- •1.5.6.1. Работу «домашнего хозяйства» пластид обеспечивают две негомологичные рнк-полимеразы.
- •1.5.6.2. Транскрипция пластидной рнк - хорошо спланированный сценарий, регулируемый светом.
- •1.5.7. Созревание пластидной рнк – многоступенчатый процесс, основа регулирования работы пластидных генов.
- •1.5.8.Трансляция белков в пластидах: слуга двух господ.
- •1.5.9. Для транспорта в хлоропласт цитозольные белки имеют один или два лидерных пептида.
- •1.5.10. Функции пластид достаточно разнообразны.
- •1.6. Растительные митохондрии
- •1.6.1. Растительные митохондрии по строению и функциям мало отличаются от митохондрий других эукариот.
- •1.6.2. Геном митохондрий высших растений значительно отличается как от генома пластид, так и от митохондриальных геномов других эукариот.
- •1.6.3. Транспорт цитозольных белков в митохондрии и в пластиды имет много общих черт.
- •1.7. Пероксисомы – возможно, потомки древних органелл, выполнявших функции детоксикации кислорода.
- •1.8. Цитоскелет
- •1.8.1. Актин.
- •1.8.2. Тубулин.
- •1.8.3. Белки промежуточных волокон 1.
- •1.9. Эндомембранные структуры растительной клетки.
- •1.9.1. Растительный эр: динамическая органелла, составленная из многих дискретных функциональных областей.
- •1.9.2. Аппарат Гольджи (аг).
- •1.9.2.1. Растительный аппарат Гольджи состоит из рассеянных по цитозолю комплексов диктиосом с тгс, которые передвигаются с током цитоплазмы.
- •1.9.2.3. Аппарат Гольджи растительных клеток является фабрикой углеводов и гликозилированных белков.
- •1.9.3. Вакуоли.
- •1.9.3.1. Растения используют вакуоли, чтобы увеличить размеры клетки без больших затрат.
- •1.9.3.2. Вакуоли – многоцелевые органеллы растительной клетки, которые являются внутриклеточным конечным пунктом секреторного пути транспорта веществ.
- •1.9.3.3. Новые вакуоли возникают преимущественно за счет расширения специализированных областей гладкого эр.
- •1.9.3.4. Автофагия – особый случай формирования вакуолей
- •1.9.3.5. Большинство растительных клеток содержат два типа вакуолей.
- •1.10. Клеточная стенка.
- •1.10.1. Клеточная стенка - динамичная структура с поразительно разнообразными функциями.
- •1.10.2. Клеточная стенка представляет собой три независимые сети полимеров со специфичными функциями.
- •1.10.2.1. Сахара - основные строительные материалы клеточной стенки.
- •1.10.2.2. Первая сеть клеточной стенки образована волокнами целлюлозы, соединенные специальными гликанами. Сопромат отдыхает.
- •1.10.3. Вторая сеть клеточных стенок образована пекитновыми соединениями - полимерами, обогащенными галактуроновой кислотой.
- •1.10.4. Третья сеть клеточной стенки построена из структурных белков или из фенилпропаноидов.
- •1.10.5. Клеточные стенки покрытосеменных растений имеют два различных типа строения.
- •1.10.6. Биосинтез клеточной стенки.
- •1.10.6.1. Клеточная стенка возникает из развивающейся стрединной пластинки (фрагмопласта).
- •1.10.6.2. Все “нецеллюлозные” полимеры клеточной стенки синтезируются в аппарате Гольджи.
- •1.10.6.3. Микрофибриллы целлюлозы собираются на поверхности плазматической мембраны.
- •1.11. Онтогенез растительной клетки.
- •1.11.1. Система cdk-циклин - ключевой момент регуляции клеточного цикла.
- •1.11.2. Рост клетки
- •1.11.2.1. Рост клетки во многом определяется перестройками в клеточной стенке.
- •1.11.2.2. Ориентация синтезирующихся микрофибрилл целлюлозы определяется расположением кортикальных микротрубочек.
- •1.11.2.3. Гипотеза “кислого роста” постулирует, что ауксин-зависимое подкисление клеточной стенки активирует растяжимость клеточной стенки и рост клетки.
- •1.11.2.4. После прекращения роста форма клетки должна быть зафиксирована компонентами клеточной стенки.
- •1.11.3. Дифференциация клетки.
- •1.11.3.1. Одним из основных признаков дифференцированной клетки является прекращение роста и формирование вторичной клеточной стенки.
- •1.11.3.2. Вторичное осаждение суберина и кутина делает клеточную стенку непроницаемой для воды.
- •1.11.3.3. Лигнин - главный компонент некоторых вторичных клеочных стенок.
- •1.11.4. Смерть растительной клетки
- •1.12. Особенности функционирования растительной клетки.
- •1.12.1. Функционирование клетки – координированная работа многих органелл.
- •1.12.2. В работе растительной клетки участвуют как «прокариотческие», так и «эукариотические» метаболические системы.
- •Глава 2. Основы биоэнергетики (Полесская о.Г.)
- •2.1. Живые организмы могут использовать две формы энергии – световую и химическую.
- •2.2. Упорядоченность биологических систем и обмен энергией с окружающей средой.
- •2.3. Направление химической реакции определяется величиной изменения свободной энергии.
- •2.4. Энергозависимые реакции сопряжены с реакцией гидролиза атф.
- •2.6. Трансмембранный электрохимический протонный градиент и его составляющие.
- •2.9. Циркуляция ионов через мембраны – фундаментальный процесс клеточной биологии. Другие атФазы.
- •2.10. Электрон-транспортные цепи. Направление переноса электронов в этц определяется редокс -потенциалом переносчиков.
- •2.11. Организация этц в мембране.
- •2.12. Некоторые переносчики электронов являются общими для этц всех типов.
- •2.13. Заключение.
- •Глава 3. Фотосинтез (Гавриленко в.Ф., Жигалова т.В.)
- •3.1. Фотосинтез как основа биоэнергетики.
- •3.1.1. Космическая роль зеленого растения в трансформации вещества и энергии
- •3.1.2. Природа основных реакций и физико-химическая сущность фотосинтеза
- •3.2. Структурная и биохимическая организация фотосинтетического аппарата.
- •3.2.1. Лист – специализированный орган фотосинтеза в растении
- •3.2.2. Хлоропласты - центры фотосинтеза клеток растений
- •3.2.2.1. Основные принципы структурной организации хлоропластов.
- •3.2.2.2. Химический состав и физические свойства тилакоидных мембран хлоропластов.
- •3.2.3. Основные этапы биогенеза хлоропластов
- •3.3. Пигментные системы фотосинтезирующих организмов.
- •3.3.1. Пигментные системы как первичные фоторецепторы
- •3.3.2. Хлорофиллы
- •3.3.2.1. Основные элементы структуры и их значение в поглощении и преобразовании энергии.
- •3.3.2.2. Метаболизм магний-порфиринов.
- •3.3.3. Фикобилины
- •3.3.4. Каротиноиды
- •3.3.4.1. Общая характеристика класса каротиноидов.
- •3.3.4.2. Антенная функция каротиноидов.
- •3.3.4.3. Защитная функция каротиноидов.
- •3.3.4.4. Фотопротекторная функция каротиноидов.
- •3.3.4.5. Биосинтез каротиноидов.
- •3.4. Функциональная организация пигментов в хлоропластах.
- •3.4.1. Образование пигмент-белковых комплексов
- •3.4.2. Основные типы пигмент-белковых комплексов
- •3.4.3. Энергетическое взаимодействие пигментов в антенных комплексах и реакционных центрах
- •3.5. Первичные процессы фотосинтеза. Реакционные центры
- •3.5.1. Структурная и функциональная организация реакционных центров.
- •3.5.2. Механизм преобразования энергии в реакционных центрах.
- •3.5.3. Сравнительный анализ энергетической эффективности работы реакционных центров бактерий и высших растений.
- •3.6. Электрон-транспортная цепь хлоропластов
- •3.6.1. Структурно-функциональная организация электрон-транспортной цепи хлоропластов.
- •3.6.1.1. Компоненты этц хлоропластов, их природа и физико-химические свойства.
- •3.6.2. Функциональные комплексы этц хлоропластов.
- •3.6.2.1. Комплекс фотосистемы II. Механизмы фотоокисления воды и выделения молекулярного кислорода.
- •3.6.2.2. Комплекс фотосистемы I.
- •3.6.2.3. Цитохромный b6f-комплекс хлоропластов.
- •3.6.3. Пластохиноны - подвижные переносчики электронов этц фотосинтеза.
- •3.6.4. Кинетические закономерности работы этц. Механизмы регуляции электронного транспорта.
- •3.6.4.1. Взаимодействие двух фотосистем в хлоропластах, механизмы координации их работы. Кратковременная и долговременная адаптация хлоропластов к условиям освещения.
- •3.6.4.2. Кинетические закономерности работы этц хлоропластов. Согласованная работа комплексов в мембране хлоропластов определяется кинетическими характеристиками реакций переноса электронов в этц.
- •3.6.4.3. Механизмы регуляции электронного транспорта.
- •3.6.4.4. Фотоингибирование. Механизмы защиты растений от фотодеструкции в условиях высоких интенсивностей света.
- •3.7. Фотоэнергетические реакции хлоропластов
- •3.7.1. Фотосинтетическое фосфорилирование. Основные типы, их физиологическое значение.
- •3.7.2. Механизм сопряжения электронного транспорта с формированием трансмембранного градиента электрохимического потенциала.
- •3.7.3. Структурно-функциональная организация и механизм работы атф-синтазного комплекса.
- •3.8. Метаболизм углерода при фотосинтезе.
- •3.8.3. Метаболизм углерода по типу толстянковых (сам-фотосинтез)
- •3.8.4. Фотодыхание.
- •3.9. Экология фотосинтеза
- •3.9.1. Влияние интенсивности и спектрального состава света на фотосинтез.
- •3.9.2. Влияние концентрации углекислого газа на фотосинтез.
- •3.9.3. Влияние температуры на фотосинтез.
- •3.9.4. Влияние водного режима на фотосинтез.
- •3.10. Фотосинтез как основа продуктивности растений
- •3.10.1. Хлоропласты – источник ассимилятов и атф.
- •3.10.2. Донорно-акцепторные взаимодействия как фактор эндогенной регуляции фотосинтеза в системе целого растения.
- •3.10.3. Теория фотосинтетической продуктивности.
- •Глава 4. Дыхание растений (Полесская о.Г.)
- •4.1. Введение
- •4.2. Биохимические пути окисления глюкозы.
- •4 2.1. Наружная и внутренняя мембраны делят митохондрии на два функциональных компартмента.
- •4.2.2. Основным субстратом дыхания у растений является глюкоза.
- •4.2.3. Гликолиз – первый этап дыхания, в ходе которого глюкоза окисляется до пирувата.
- •4.2.4. Реакции гликолиза могут идти в обратном направлении. Синтез сахаров при обращении гликолиза называется глюконеогенезом.
- •4.2.5. В цикле трикарбоновых кислот образуются восстановительные эквиваленты, атф и со2.
- •4.2.6. Особенностью растительных митохондрий является присутствие малик-энзима.
- •4.2.7. Распад глюкозы регулируется ключевыми метаболитами и подчинен комплексной системе контроля.
- •4.2.8. Между митохондриями и цитозолем существует обмен восстановительными эквивалентами и метаболитами цтк. В митохондриях пересекается обмен углеводов, белков и жиров.
- •4.2.9. Глиоксилатный цикл позволяет растениям превращать жиры в углеводы.
- •4.2.10. Глюкоза может быть окислена через окислительный пентозофосфатный цикл.
- •4.3. Электронный транспорт и синтез атф в митохондриях растений.
- •4.3.3. Комплекс II – сукцинат-убихинон-оксидоредуктаза восстанавливает убихинон при окислении сукцината до фумарата.
- •4.3.9. Растительные митохондрии содержат четыре над(ф)н-дегидрогеназы - над(ф)н-убихинон-оксидоредутазы. Они окисляют надн и надфн по обе стороны внутренней мембраны и восстанавливают убихинон.
- •4.3.10. Митохондрии растений содержат альтернативную оксидазу –убихинол-кислород оксидоредуктазу. Альтернативная оксидаза окисляет qh2 и восстанавливает о2 до воды.
- •4.4 Клетка и активные формы кислорода.
- •4.4.1. Активные формы кислорода образуются в процессе нормальной жизнедеятельности растительной клетки.
- •4.4.2. Антиоксидантные системы защищают клетку от афк. Роль аскорбата и глутатиона в нейтрализации перекиси водорода.
- •4.4.3. Афк участвуют в реакции сверхчувствительности и защищают растение при внедрении патогена.
- •4.4.4. Супероксидрадикал и перекись в низких концентрациях действуют как сигнальные молекулы.
- •4.5. Дыхание в фотосинтезирующей клетке.
- •4.6. Дыхание целого растения.
- •4.7. Заключение
- •Глава 5. Вода в жизни растений (Мейчик н.Р., Балнокин ю.В.)
- •5.1. Введение.
- •5.2. Относительное содержание воды в клетках – важный параметр водного обмена.
- •5.3. Классификация растений по их способности регулировать водный обмен.
- •5.4. Общие закономерности транспорта воды через мембраны растительных клеток.
- •5.4.1. Химический потенциал воды.
- •5.4.2. Осмотическое давление.
- •5.4.3 Осмотическое давление как функция концентраций растворенных веществ.
- •5.5.4. Водный потенциал.
- •5.4.5 Матричное давление.
- •5.5. Соотношение между осмотическим давлением и гидростатическим давлением в клетке.
- •5.6. Водные каналы мембран: аквапорины.
- •5.7. Поток воды в клетку.
- •5.8. Движение воды в целом растении.
- •5.8.1. Теория когезии и натяжения.
- •5.8.2. Движение воды в листьях и транспирация.
- •5.8.3. Движение воды по ксилеме и клеточным стенкам.
- •5.8.4. Движение воды в корне.
- •5.8.5. Движение воды из почвы в корень.
- •5.8.6. Регуляция транспорта воды в целом растении.
- •Глава 6. Минеральное питание (Алехина н.Д.)
- •6.1. Введение: Значение растений в циркуляции минеральных элементов в биосфере; особенности минерального питания растений.
- •6.2. Поглощение элементов минерального питания.
- •6.2.1. Корень - орган поглощения минеральных веществ.
- •6.2.1.1. Рост корня, как основа добывания веществ из почвы.
- •6.2.1.2. Структурно-функциональные особенности корня и поглощение веществ.
- •6.2.2. Поступление ионов из среды в клетку и корень.
- •6.2.2.1. Поступление ионов в апопласт.
- •6.2.2.2. Механизмы транспорта через мембрану.
- •6.2.3. Радиальный и дальний транспорт ионов по растению.
- •6.2.3.1. Пути радиального транспорта.
- •6.2.3.2. Движущие силы радиального транспорта ионов и загрузка ксилемы.
- •6.2.3.3. Дальний транспорт ионов.
- •6.2.4. Поглощение ионов интактным растением стационарного состояния.
- •6.2.4.1. Кинетика поглощения ионов интактным растением.
- •6.2.4.2. Модель корня и регуляция поступления ионов в интактном растении .
- •6.3. Включение в обмен веществ и функции элементов минерального питания.
- •6.3.1. Фосфор (Харитонашвили е.В.).
- •6.3.1.1. Характерные особенности фосфорного питания.
- •6.3.1.2. Основные типы фосфорсодержащих соединений.
- •6.3.1.3. Транспорт фосфата через мембраны.
- •6.3.1.4. Метаболизм фосфата.
- •6.3.1.5. Ответные реакции растительного организма на дефицит р.
- •6.3.2. Азот (Харитонашвили е.В.).
- •6.3.2.1. Формы азота, используемые растением.
- •6.3.2.2. Поглощение и усвоение нитрата.
- •6.3.2.3. Поглощение и ассимиляция аммония.
- •6.3.2.4. Интеграция азотного метаболизма на уровне целого растения.
- •6.3.3. Сера (Харитонашвили е.В.).
- •6.3.3.1. Серусодержащие органические соединения.
- •6.3.3.2. Поглощение и транспорт сульфата.
- •6.3.3.3. Ассимиляторное восстановление сульфата.
- •6.3.3.4. Глутатион и его производные.
- •6.3.4. Кальций.
- •6.3.4.2. Системы транспорта кальция.
- •6.3.5. Калий.
- •6.3.5.2. Регуляция мембранного потенциала.
- •6.3.5.3. Регуляция активности ферментов и синтез белка.
- •6.3.5.4. Осморегуляция и катионно-анионный баланс.
- •6.3.6. Движения устьиц: транспорт ионов и регуляция.
- •6.3.6.1. Откравыние устьиц.
- •6.3.6.2. Закрывание устьиц.
- •6.3.7. Хлор.
- •6.3.8. Магний.
- •6.3.9. Железо.
- •6.3.10. Медь.
- •6.3.11. Марганец.
- •6.3.12. Молибден.
- •6.3.13. Цинк.
- •Глава 7. Рост и развитие растений (Чуб в.В.)
- •7.1. Общее представление о росте и развитии.
- •7.1.1. Параметры роста.
- •7.1.2. Кривая роста.
- •7.1.3. Дифференцировка.
- •7.1.4. Тотипотентность. Терминальная дифференцировка.
- •7.1.5. Периодизация индивидуального развития.
- •7.2. Гормональная система растений.
- •7.2.1. Введение.
- •7.2.1.1. Регуляторные молекулы растений.
- •7.2.1.2. Рецепция и усиление сигнала.
- •7.2.1.3. Фосфатидил-инозитольная система вторичных мессенджеров.
- •7.2.1.4. Взаимодействие сигналов.
- •7.2.2. Ауксины – гормоны апекса побега.
- •7.2.2.1. История открытия ауксинов.
- •7.2.2.2. Биосинтез и деградация ауксинов.
- •7.2.2.3. Транспорт ауксинов.
- •7.2.2.4. Физиологические эффекты ауксинов.
- •7.2.2.5. Ауксины и неоднородность внешней среды.
- •7.2.2.6. Ауксин и плоды.
- •7.2.2.7. Ауксин как гербицид.
- •7.2.2.8. Гравитропизм.
- •7.2.3. Цитокинины –гормоны корневого апекса.
- •7.2.3.1. История открытия.
- •7.2.3.2. Биосинтез и инактивация цитокининов.
- •7.2.3.3. Эффекты цитокининов от апекса корня до апекса побега.
- •7.2.4. Взаимодействие ауксинов и цитокининов.
- •7.2.4.1. Физиологическое действие ауксинов и цитокининов в культуре in vitro.
- •7.2.4.2. Баланс между ауксинами и цитокининами в интактном растении.
- •7.2.4.3. Цитокинины и паразиты растений.
- •7.2.5. Гиббереллины – гормоны листа.
- •7.2.5.1. История открытия.
- •7.2.5.2. Биосинтез гиббереллинов.
- •7.2.5.3. Основные физиологические эффекты гиббереллинов.
- •7.2.5.4. Гиббереллины и прорастание зерна.
- •7.2.5.5. Гиббереллин и проявление пола у растений.
- •7.2.5.6. Гиббереллин и цветение растений.
- •7.2.6. Абсцизовая кислота – сигнал водного стресса.
- •7.2.6.1. Окрытие абсцизовой кислоты.
- •7.2.6.2. Биосинтез абсцизовой кислоты.
- •7.2.6.3. Передача абк-сигнала.
- •7.2.6.5. Регуляция покоя семян абк.
- •7.2.6.6. Синдром дефицита абк.
- •7.2.6.7. Абк и форма листьев.
- •7.2.7. Этилен – сигнал механического стресса.
- •7.2.7.1. Открытие физиологической роли этилена.
- •7.2.7.2. Биосинтез этилена.
- •7.2.7.3. Рецепция и передача сигнала.
- •7.2.7.4.Этилен как гормон механического стресса.
- •7.2.7.5. Этилен и прикосновение.
- •7.2.7.6. Этилен и заживление ран.
- •7.2.7.7. Регуляция листопада в умеренных широтах.
- •7.2.7.8. Формирование и созревание плодов.
- •7.2.7.9. Биотический стресс.
- •7.2.7.10. Этилен и цветение ананасов.
- •7.2.8. Другие гормональные вещества растений.
- •7.2.8.1. Брассиностероиды.
- •7.2.8.2. Жасминовая кислота.
- •7.2.8.3. Салициловая кислота.
- •7.2.8.4. Олигосахарины.
- •7.2.8.5. Короткие пептиды.
- •7.3. Рецепция световых сигналов.
- •7.3.1. Введение.
- •7.3.1.1. Принципы фоторецепции.
- •7.3.1.2. Физиологически важные области спектра. Фитохром и криптохром.
- •7.3.2. Фоторецепция в красной области спектра: фитохромная система.
- •7.3.2.1. История открытия фитохрома.
- •7.3.2.2. Фотоконверсия фитохрома. Фитохром а и фитохром в.
- •7.3.2.3. Этиоляция и деэтиоляция.
- •7.3.2.4. Избегание тени.
- •7.3.2.5. Регуляция прорастания семян.
- •7.3.2.6. Внутренние часы и фитохромная система.
- •7.3.3. Фоторецепция в синей области спектра: криптохром и фототропин.
- •7.3.3.1. История изучения фоторецепции в синей области спектра.
- •7.3.3.2. Криптохром – рецептор синего света, локализованный в ядре и цитоплазме.
- •7.3.3.3. Фототропин – мембранный рецептор синего света .
- •7.3.3.4. Суперхром – «кентавр» с головой фитохрома и туловищем фототропина.
- •7.4. Регуляция роста и развития растений.
- •7.4.1. Эндогенные факторы развития растений.
- •7.4.1.1. Образование листьев.
- •7.4.1.2. Переход к цветению.
- •7.4.1.3.Образование цветка.
- •7.4.1.4. Заключение.
- •7.4.2. Влияние внешних факторов на рост и развитие.
- •7.4.2.1. Пищевые ресурсы экотопа. Регуляция цветения элементами минерального питания.
- •7.4.2.2. Фотопериодизм и климатические факторы.
- •7.4.3. Фотопериодизм.
- •7.4.3.1. История открытия фотопериодизма.
- •7.4.3.2. Опыты м.Х.Чайлахяна.
- •7.4.3.3. Гормональная теория цветения м.Х.Чайлахяна.
- •7.4.4. Термопериодизм. Стресс-периодизм.
- •7.4.4.1. Сезонная специализация растений.
- •7.4.4.2. Термопериодизм: стратификация и яровизация.
- •7.4.4.3. Опыты м.Х.Чайлахяна.
- •7.4.4.4. Стресс-периодизм.
- •7.5. Заключение.
- •Глава 8. Растения в условиях стресса (Балнокин ю.В.)
- •8.1. Введение.
- •8.2. Водный дефицит.
- •8.2.1. Понижение водного потенциала растительных клеток как стратегия избежания обезвоживания.
- •8.2.2. Осмолиты.
- •8.2.2.1. Свойства осмолитов.
- •8.2.2.2.Функции осмолитов
- •8.2.2.3. Метаболические пути биосинтеза некоторых наиболее распространенных осмолитов.
- •8.3.2.3.1. Пролин
- •8.2.2.3.2. Глицин-бетаин
- •8.2.2.3.3. Маннитол
- •8.2.2.3.4. Пинитол
- •8.2.2.3.5. Полиамины спермидин и спермин
- •8.2.3. Белки, образующиеся в растениях в ответ на осмотический стресс
- •8.2.3.1. Lea белки
- •8.2.3.2. Шапероны и ингибиторы протеаз
- •8.2.3.3. Протеазы и убиквитины
- •8.2.3.4. Аквапорины
- •8.2.4. Белки, индуцируемые водным дефицитом, выполняют защитные и регуляторные функции.
- •8.2.5. Регуляция экспрессии генов, индуцируемых водным дефицитом.
- •8.2.5.1. Рецепция сигнала.
- •8.5.2.3. Вторичные мессенджеры
- •8.3. Солевой стресс.
- •8.3.1. Повреждающее действие солей
- •8.3.1.1. Эффекты, проявляющиеся на клеточном уровне.
- •8.3.1.2. Эффекты, проявляющиеся на уровне целого растения.
- •8.3.2. Адаптации, противодействующие осмотическому эффекту солей.
- •8.3.3. Ионное гомеостатирование цитоплазмы растительной клетки как стратегия избежания токсического действия солей
- •8.3.3.3.4. Системы экспорта Cl-, локализованные в плазматической мембране и тонопласте
- •8.3.4. Интеграция клеточных механизмов устойчивости к водному дефициту и высоким концентрациям солей в защитную систему целого растения
- •8.3.5. Регуляция генов устойчивости к NaCl
- •8.3.6. Различия между гликофитами и галофитами
- •8.4. Изменения температурных условий
- •8.4.1. Поддержание метаболической активности и структурной целостности биополимеров при изменении температурных условий
- •8.4.1.1. Компенсация температурных эффектов путем изменения свойств ферментов.
- •8.4.1.2. Компенсация температурных эффектов путем изменения внутриклеточного содержания ферментов.
- •8.4.1.3. Термофильные бактерии – модель для изучения механизмов термостабильности
- •8.4.1.4. В акклимацию растений к высоким температурам вовлечены белки теплового шока
- •8.4.1.5. Температурозависимые модификации липидного бислоя мембран.
- •8.4.1.5.1 Десатуразы жирных кислот
- •8.4.1.5.2 Ферменты, контролирующие длину углеводородных цепей жирных кислот.
- •8.4.1.6. Энергия активации ферментативных реакций, протекающих в мембранах.
- •8.4.2. Устойчивость растений к замораживанию
- •8.4.2.1. Дегидратация клеток при замораживании
- •8.4.2.1.1. Дегидратация клеток как механизм, предотвращающий внутриклеточное образование льда.
- •8.4.2.1.2. Последствия обезвоживания клеток.
- •8.4.2.2. Механизм переохлаждения
- •8.4.2.2.1. Биологические антифризы.
- •8.4.2.2.2. Анатомические барьеры.
- •8.4.2.3. В акклимацию растений к замораживанию вовлечены белки холодового шока.
- •8.4.3. Механизмы терморегуляции у растений.
- •8.4.3.1. Теплопродукция при дыхании.
- •8.4.3.2. Теплопродукция при замораживании.
- •8.5. Кислородный дефицит.
- •8.5.1. Морфологические и анатомические структуры растений, позволяющие им поддерживать аэробный обмен в условиях о2-дефицита.
- •8.5.2. Активирование анаэробного метаболизма в условиях о2-дефицита.
- •8.5.3. Акклимация растений к аноксии.
- •8.5.4. Изменения в экспрессии генов при переходе от аэробного метаболизма к гликолизу.
- •8.5.5. В процесс образования аэренхимы при o2-дефиците вовлечен растительный гормон этилен.
- •8.6. Окислительный стресс.
- •8.6.1. Повреждения биомолекул активными формами кислорода.
- •8.6.1.1. Повреждения липидов.
- •8.6.1.2. Повреждения нуклеиновых кислот.
- •8.6.1.3. Повреждения белков.
- •8.6.2. Детоксикация продуктов окислительной модификации биомолекул.
- •8.6.3. Атмосферный озон вызывает окислительный стресс в растениях.
- •Глава 9. Вторичный метаболизм (Носов а.М.)
- •9.1. Вторичные метаболиты – это низкомолекулярные соединения, обычно обладающие биологической активностью, присутствие которых в растительной клетке совсем не обязательно.
- •9.2 Структурно вторичные метаболиты часто бывают очень похожи на первичные.
- •9.3. Вторичны метаболиты могут быть классифицированы исходя из разных принципов.
- •9.4. Вторичные метаболиты представлены многими группами соединений.
- •9.5. Некоторые закономерности строения вторичных метаболитов. Модификации вторичных метаболитов.
- •9.6. Основные группы вторичных метаболитов.
- •9.6.1.Алкалоиды – азотсодержащие вторичный метаболиты.
- •9.6.2.Изопреноиды (терпеноиды).
- •9.6.3. Фенольные соединения (растительные фенолы).
- •9.6.4. Минорные группы вторичных метаболитов.
- •9.7. Биосинтез вторичных метаболитов.
- •9.8. Физиология вторичного метаболизма.
- •9.8.1. Локализация вторичных метаболитов в растении.
- •9.8.2. Изменение вторичного метаболизма в онтогенезе растений.
- •9.8.3. Функции вторичных метаболитов.
- •Глава 1. Растительная клетка (Носов а.М.) 1
- •Глава 2. Основы биоэнергетики (Полесская о.Г.) 70
- •Глава 3. Фотосинтез (Гавриленко в.Ф., Жигалова т.В.) 91
- •Глава 4. Дыхание растений (Полесская о.Г.) 187
- •Глава 5. Вода в жизни растений (Мейчик н.Р., Балнокин ю.В.) 240
- •Глава 6. Минеральное питание (Алехина н.Д.) 275
- •Глава 7. Рост и развитие растений (Чуб в.В.) 376
- •Глава 8. Растения в условиях стресса (Балнокин ю.В.) 464
- •Глава 9. Вторичный метаболизм (Носов а.М.) 541
6.3.4.2. Системы транспорта кальция.
Содержание кальция в отдельных структурах клетки регулируется с участием Са2+-помп и Са2+-каналов (рис. 6.61). Градиент электрохимического потенциала для Са2+ на плазмалемме (ПМ), тонопласте (ТП) и мембране ЭР таков, что поступление Са2+ в цитозоль происходит по каналам пассивно, а удаление с участием помп – с затратой энергии.
Низкая концентрация кальция в цитозоле – необходимое условие для функционирования Са2+ в качестве универсального посредника при передаче информации. Реализация функций мессенжера связана с очень малыми его потоками через мембраны. Разнообразные стимулы (гормоны, свет, механические воздействия, гипоосмотики и окислители, засуха, низкая и высокая температура, Nod-фактор, сигналы межклеточных взаимодействий, гравиотропизм и др.) через быстрое изменение потенциала клеточной мембраны приводят к открыванию Са2+-каналов и возрастанию его концентрации в цитозоле. Возвращение концентрации Са2+ к стационарному уровню покоя обеспечивается работой Са2+-АТФаз. Такое изменение концентрации Са2+ в цитозоле названо нестационарным или переходным (transient) состоянием. Локальное и часто кратковременное увеличение концентрации Са2+ в цитозоле действует как сигнал, передающий информацию от поверхности клетки внутрь. Кальциевый сигнал может усиливаться за счет дополнительного выхода Са2+ в цитозоль из вакуоли или ЭР.
Са2+- помпы. Выкачивание Са2+ из цитозоля осуществляют Са2+-АТФазы, которые принадлежат к большому семейству АТФаз Р-типа, и Са2+/Н-антипортеры.
Са2+-АТФазы растений и животных делят на: ПМ (или IIВ) типа, стимулируемые кальмодулином (КаМ), и ЭР (или IIА) типа, которые непосредственно КаМ не стимулируются. У растений, в отличие от животных, Са2+-АТФазы ПМ типа локализованы не только на плазмалемме (Са2+-АТФаза ПМ1), но и на эндомембранах (Са2+-АТФаза ПМ2 и ПМ3) (рис. 6.54). Са2+-АТФазы ЭР типа также присутствуют как на мембране ЭР, так и на тонопласте.
ПМСа2+-АТФазы имеют высокое сродство к Са2+ (Кm от 0,4 до 12 мкМ). На тонопласте, помимо Са2+-помпы, функционирует Са2+/Н+ антипорт. Выкачивание Са2+ из цитозоля с участием антипорта сопряжено с работой вакуолярной Н+-АТФазы, для которой гомеостатирование кальция считается конститутивной функцией. Более того, вакуолярная Н+-АТФаза, пирофосфатаза (Н+-ПФаза) и Са2+/Н+ антипортер совместно участвуют в поддержании рН и ионного гомеостаза в цитозольном и вакуолярном компартментах. Некоторые Са2+-АТФазы и Са2+/Н+ антипортеры идентифицированы на генном уровне.
Итак, Са2+-помпы выполняют несколько важных функций. Наряду с центральной – поддержание низкой концентрации кальция и создание фона для возникновения кальциевого сигнала, они обеспечивают создание пулов Са2+ в апопласте, вакуоли, ЭР, откуда он может контролируемо возвращаться в цитозоль. Функционирование Са2+-АТФаз, связанное с восстановлением [Са2+]цит до уровня покоя, одновременно обеспечивает завершение переходного состояния и, таким образом, формирование Са2+ сигнала (см. раздел 3.4.3).
Са2+-каналы. Са2+ каналы делятся на две группы: потенциал-зависимые (VD-voltage-dependent) и рецептор-управляемые или лигандо-зависимые. К настоящему времени изучены электрические и биохимические свойства, регуляция и физиологическая роль ряда кальциевых каналов из разных мембран растений, но пока не осуществлена их идентификация на генетическом уровне.
В плазмалемме клеток, главным образом, корней и замыкающих клеток устьица, обнаружено несколько VD Са2+-каналов, которые могут быть подразделены на каналы, активируемые при деполяризации, и при гиперполяризации плазмалеммы. К первому классу относится так называемый «макси-катионный канал» (рис. 6.54), который имеет высокую проводимость единичного канала, но мало селективен. Он пропускает K+, Na+, Ba+, Mg2+, Mn+ и некоторые другие ионы, хотя вход Са2+ через этот канал при физиологических концентрациях ионов, видимо, доминирует. Другой Са2+-канал, также активируемый при деполяризации (VD Са2+-канал) более селективен для Са2+, но имеет меньшую проводимость. Неселективные каналы, очевидно, основной путь поступления кальция в клетку из внешней среды, например, в корнях, или из апопласта в устьичные клетки листа. В класс VD Са2+-каналов плазмалеммы, активируемых при гиперполяризации, входят механочувствительные (stretch-activated) каналы разных типов, в том числе и Са2+-канал замыкающих клеток устьица, который регулируется АБК (рис. 6.54 – VD-мех Са2+-канал). У других клеток подобные каналы также могут иметь большое значение в восприятии тургора, например, при удлинении корневого волоска и пыльцевой трубки.
На тонопласте функционируют потенциал-зависимые каналы, активирующиеся при гиперполяризации – ВVD Са2+-канал и при деполяризации - медленный (slowly) SVD Са2+-канал (рис. 6.54). Оба эти типа VD-каналов не являются строго специфичными для Са2+ и проницаемы также для Mg2+, K+, а SVD Са2+-канал – еще и для Na+, Rb+, Cs+. Выход Са2+ через SVD Са2+-канал активируется, помимо потенциала, при увеличении [Са2+]цит и регулируется другими факторами (рН, концентрацией других ионов, соотношением [Са2+]цит/[Са2+]вак, КаМ, 14-3-3 белками и, возможно, состоянием фосфорилирования-дефосфорилирования). Функции SVD Са2+-канала связывают с осморегуляцией и поддержанием гомеостаза. Кроме того, через этот канал происходит Са2+ индуцируемое высвобождение Са2+ из вакуоли (CICR- Са2+ induced Са2+ release), что приводит к увеличению его концентрации в цитозоле и вносит вклад в специфичность сигнала (см. раздел 3.6.3).
Из вакуоли Са2+ выходит также через рецептор-управляемые каналы, которые открываются при рецепции вторичных мессенжеров: инозитол-1,4,5-фосфата (IP3 инозитолтрифосфат) или циклической АДФ-рибозы (цАДФриб) (рис. 6.54). С активацией этих вакуолярных каналов связаны ответные реакции на гиперосмотический (BIP3 Са2+кан) и холодовой (цАДФриб Са2+-кан) шок. В ответ на действие АБК при закрывании устьиц активируются оба эти канала.
В мембране ЭР также присутствуют потенциал- и лигандо-зависимые Са2+ каналы. Одним из первых каналов ЭР мембраны растений был охарактеризован потенциал-зависимый механочувствительный канал (ЭРVD Са2+-кан) (рис. 6.54) из усиков Brionia dioica (назван ВСС1 Brionia calcium channal). Предполагают, что ВСС1 регулируется через изменение концентрации кальция в люмене ЭР, хотя рН цитозоля также влияет на его активность. С IP3 Са2+-каналом ЭР мембраны связывают увеличение [Са2+]цит и передачу информации в растущей пыльцевой трубке.
Итак, в растительной клетке в ответ на действие разных стимулов увеличивается концентрация кальция в цитозоле, что является Са2+ сигналом для передачи информации. Первичными источниками изменений концентрации являются Са2+-каналы с разными пропускными характеристиками, с разными способами регуляции и расположенные на плазмалемме и эндомембранах. Разнообразие путей входа Са2+ в цитозоль вместе с разнообразием путей выхода (Са2+ помпы) создают большую гибкость в контроле за его потоками как в пространстве клетки, так и во времени и обеспечивают возникновение специфического Са2+ сигнала, локализованного в связи с участием каналов разных типов в определенных участках клетки.
6.3.4.3. Са2+ и системы внутриклеточной сигнализации.
Изменение программ роста и развития, контроль метаболизма и формирование ответных реакций на действие условий среды происходит вследствие передачи сигналов на белки-мишени или в геном по сложной сети информационных (сигнальных) путей. В клетке информация передается цитозольным структурам и компартментам через изменения концентрации множества вторичных мессенжеров (посредников), которые действуют в той или иной сигнальной системе вместе с кальцием или самостоятельно. Однако, Са2+ в комплексной сети передачи информации (transduction) служит универсальным посредником, поскольку ни один вторичный мессенжер не реагирует на столь большое число стимулов, как свободный Са2+ цитозоля. Включение Са2+ в широкую сеть сигнальных путей, которые передают послания от разных стимулов (внешних и внутренних) и заканчиваются соответствующими ответными реакциями, поднимает вопрос о том, каким образом в растительной клетке с участием одного и того же мессенжера достигается специфичность сопряжения стимула и ответа.
Специфичность Са2+ сигнала. Исходно в основе специфичности кальциевой сигнализации лежит компетентность клетки, ее функциональное предназначение. Способность реагировать на определенные стимулы и формировать соответствующий ответ зависит от экспрессии генов, кодирующих компоненты каскадного пути передачи конкретного сигнала в соответствующих клетках. Комплекс характерных свойств клетки, определяющий особенность ее сигнальной системы, получил название «физиологического адреса», который различается у разных клеток (например, у замыкающих клеток устьиц и трихобластов корня). Информация от стимулов, включая силу их воздействия, первоначально кодируется в кальциевом сигнале, отражающем характер возрастания концентрации Са2+ в цитозоле ([Са2+]). Это переходное (транзитное) состояние может иметь вид всплесков, волны, пульсаций или осцилляций, плато, градиента, или быть сочетанием этих проявлений (рис. 6.55). Основные варьирующие параметры Са2+ сигнала, которые могут быть оценены количественно, это: уровень увеличения [Са2+]цит; продолжительность лаг-периода от момента воздействия до начала подъема [Са2+]; продолжительность подъема нахождения на высоком уровне и возвращения к уровню покоя. Сигнальная информация может быть закодирована в амплитуде и частоте осцилляций (пульсаций), их регулярности. Даже самое общее сравнение характера Са2+-сигналов при действии разных стимулов (рис. 6.55) свидетельствует об их разнообразии: кратковременное (холодовой шок) или очень продолжительное (красный свет) увеличение [Са2+]цит; появление двухфазной кинетики переходного состояния (гипоосмотический шок) или образование градиента концентрации Са2+ (растущий корневой волосок). Кинетика изменения концентрации Са2+ может меняться в зависимости от силы и продолжительности действия стимула. Однако, только в редких случаях величина изменения [Са2+]цит и конечная ответная реакция на стимул коррелируют со степенью его воздействия. Это обусловлено множеством причин, в частности, тем, что стимул (фактор) в своем действующем начале имеет две составляющие: само воздействие (физическое, химическое или комплексное) и параметры времени. При холодовом шоке, например, увеличение уровня [Са2+]цит (которое начинается сразу) (рис. 6.55 п.1) зависит не от абсолютного значения низкой температуры, а от скорости ее снижения. При действии многих стимулов увеличение [Са2+] в цитоплазме связано с осцилляциями (пульсациями), которые имеют определенную амплитуду и частоту и могут повторяться через менее или более регулярные интервалы (рис. 6.55 п.4 и 6).
Разнообразие свойств и способов регуляции Са2+-каналов является основой, обеспечивающей взаимодействие путей передачи сигналов с участием разных посредников. Идентифицирован ряд вторичных мессенжеров, которые связаны с возникновением и спецификой Са2+ сигнала (IP3, цАДФриб, Н+ и др.). Инозитол-1,4,5,-фосфат – конечный продукт превращения минорного компонента плазмалеммы фосфатидилинозитола (РI), но непосредственным предшественником IP3 является PIP2 (РI-4,5бисфосфат) (рис. 6.64). При рецепции определенных стимулов активируются регуляторные G-белки плазмалеммы, в результате чего диссоциирует их -субъединица, активирующая фосфолипазу С (ФЛ «С»)*. Активированная ФЛ «С» гидролизует PIP2 с образованием двух вторичных мессенжеров: 1,2-диацетилглицерола (ДАГ) – активатора протеинкиназы С и IP3 – регулятора активности Са2+-каналов эндомембран и, как считают, основного участника формирования Са2+ волны**. Другой распространенный вторичный мессенжер животных и растительных клеток – цАДФриб также действует как сигнальная молекула, активирующая выход Са2+ из эндогенных депо.
Поступление кальция в цитозоль через рецептор управляемые Са2+-каналы вносит дополнительный (к притоку Са2+ извне) вклад в увеличение [Са2+]цит и приводит к возникновению и поддержанию осцилляций (например, в базальной части пыльцевой трубки, при осмотическом стрессе, при действии АБК в замыкающих клетках устьица) (рис. 6.55 п.4). Таким способом сигнальная информация не только кодируется в амплитуде и частоте всплесков, но с помощью осцилляции сигнал усиливается и меняется по продолжительности, что обеспечивает регуляцию его передачи во времени.
Специфичность Са2+ сигнала обусловлена также его локализацией в клетке и, если это касается такой формы сигнала как градиент или волна, вектором их распространения. Разный характер увеличения и снижения концентрации Са2+ в цитозоле может быть результатом его поступления из разных депо (апопласт, вакуоль, ЭР) через разнообразные Са2+-каналы, снижение при возвращении [Са2+]цит к уровню покоя (новый уровень может не совпадать с исходным) за счет работы Са2+-АТФаз разных мембран (рис. 6.54). В клетках, растущих кончиком (трихобласт, пыльцевая трубка и др.), сигналом ориентированного роста служит градиент с высокой Са2+ концентрацией в растущем кончике (рис. 6.55 п.5). Основой поддержания этого градиента является пространственное разделение входа Са2+ в цитозоль по Са2+ каналам плазмалеммы в зоне активного роста кончика и выкачивания Са2+ АТФазами плазмалеммы и эндомембран в базальной части клетки корневого волоска. При воздействии Nod-фактора, вызывающего образование азот-фиксирующих клубеньков у бобовых, кальций также поступает извне через Са2+каналы кончика корневого волоска (рис. 6.55 п.6). Но Са2+ сигнал проявляется как быстро нарастающее увеличение [Са2+]цит и всплески в области ядра, что приводит к скручиванию корневого волоска и смены программ дифференциации и функционирования.
Образование всплесков, осцилляций, волн, градиентов концентрации Са2+ цитозоля, их разнообразных субпроизводных и сочетаний, а также различия в кинетике и локализации изменений [Са2+]цит отражают комплексность системы формирования Са2+ сигнала в каждой отдельной клетке. Возникающий в ответ на определенный стимул Са2+-сигнал является настолько специфичным с точки зрения кодирования информации, что получил название Са2+ подписи (Са2+ signature). Подобный специфичный Са2+-сигнал – первый этап возникновения специфичной ответной реакции.
Пути передачи Са2+ сигналаю. Зашифрованная информация, чтобы достигнуть нужных белков-мишеней, определяющих ответ на стимул, передается по сигнальным путям с помощью образования комплексов кальция со специальными белками. К группе регуляторных белков растений, связывающих Са2+ относятся: кальмодулин – КаМ (CaM - calmodulin); Са2+-зависимые протеин-киназы – Са2+-завПК (CDPKs – calcium dependent protein kinases) и Са2+/КаМ зависимые протеин-киназы - Са2+/КаМ ПК (CCaMKs - calcium and calmodulin dependent protein kinases) (рис. 6.56). Эти белки имеют специальные места связывания Са2+, называемые EF руками. Термин возник из обозначения двух спиралей, E и F, являющихся частью Са2+-связывающего центра. Часто белки, имеющие подобные домены связывания кальция, именуют как группу регуляторных белков «EF рука».
Са2+-завПКзы принадлежат к одной из групп суперсемейства протеинкиназ (ПК) эукариотических клеток. ПКазы катализируют обратимый перенос фосфата с АТФ на боковые участки аминокислот белковой цепи. Функции ПК могут быть обращены действием протеиновых фосфатаз (ПФФ). Реакции фосфорилирования-дефосфорилирования оказывают значительное воздействие на активность белков и их взаимодействие с другими белками. Са2+-завПКазы имеют три функциональных домена – каталитический, автоингибиторный и С-терминальный кальмодулин-подобный регуляторный домен с четырьмя EF руками, связывающими Са2+. Это позволяет считать Са2+-завПКазы (как и КаМ) первичными сенсорами путей передачи Са2+ сигнала (рис. 6.56 4а, 4б). Впервые Са2+завПКзы были обнаружены у растений и простейших и пока не найдены в клетках дрожжей и животных. Считают, что у растений большая часть киназной активности, которая стимулируется кальцием, связана именно с Са2+-завПКазами (меньшая с Са2+/КаМПКазами и КаМ). Обнаружено множество изоформ Са2+завПКаз (у Arabidopsis идентифицировано более 40 изоформ). Это ставит вопрос о функциях этих изоформ. Есть основание полагать, что разные изоформы могут «специализироваться» на узнавании Са2+-сигналов. Постоянно пополняемый список белков-мишеней для Са2+завПК включает транспортные белки мембран (Н+АТФазу ПМ, калиевые и анионные каналы замыкающих клеток устьиц, аквапорины и др.), ферменты (сахарофосфатсинтазу (СФС), фосфоэнолпируваткарбоксилазу (ФЭПк), нитратредуктазу (НР), фосфатидилинозитолкиназу и др.), факторы транскрипции, элонгации, белки цитоскелета и другие мишени (рис. 6.56, 5). Таким образом, Са2+-завПК включены в передачу Са2+-сигнала, связанную с поддержанием мембранного потенциала, регуляцией углеводного и азотного обмена, устьичными движениями, ответами на стрессовые воздействия, формированием архитектуры клетки и т.д..
Однако, видимо, полная активация фермента при фосфорилировании с участием Са2+-завПКаз возможна, если одновременно к регуляторному участку присоединяется 14-3-3-белок. Вместе с Са2+-завПК, 14-3-3-белки включены в передачу сигнала, функционируя как адапторы, шапероны, активаторы и репрессоры. Они участвуют в регуляции активности СФС, НР, ФЭПк, что обеспечивает согласованное функционирование этих ферментов в условиях дня и ночи. 14-3-3-белкам приписывается также роль обеспечения взаимосвязи между различными путями передачи сигналов, которые вызываются разными, действующими одновременно стимулами (экзогенными и эндогенными).
Кальмодулин (КаМ) относится к семейству белков «EF рука» и является наиболее распространенным Са2+-связывающим белком, который играет центральную роль у всех организмов. Растительные КаМ – высококислые белки с массой 14 кДа, локализованные в цитозоле (обнаружены в ядре и, возможно, прикреплены к плазмалемме). КаМ эукариотных организмов проявляют большую консервативность: аминокислотные последовательности белка растений идентичны КаМ позвоночных и дрожжей на 90 и 60%, соответственно. Но у растений, в отличие от животных, обнаружены мультигенные семейства КаМ-родственных генов, экспрессия которых индуцируется физическими (касание, тепловой и холодовой шок, темнота-свет) и химическими (ауксин, NaCl) стимулами. Индуцированная экспрессия некоторых из этих КаМ-генов опосредована увеличением [Са2+]цит (рис. 6.56, 4в). Предполагается, что характер их экспрессии, заканчивающийся появлением изоформ КаМ (рис. 6.56, 6), и/или конечные мишени сигнального пути (рис. 6.56, 5, 5а, 5в) различаются в зависимости от стимула. Таким образом, наличие изоформ КаМ значительно расширяет возможности адресной доставки сигнала. КаМ и комплекс Са2+КаМ не обладают свойствами фермента и включаются в передачу сигнала и регуляцию клеточных процессов, присоединяясь к белкам-мишеням. Са2+ связывающий центр КаМ имеет структуру спираль-петля-спираль. Петля, где связывается Са2+, состоит из 12 аминокислот и ограничена с С- и N- концов спиральными участками, состоящими также из 12-14 аминокислот и обозначенными буквами E и F. Разные Са-связывающие белки могут иметь разное число центров для связывания Са2+. КаМ растений имеют четыре функциональные «EF-руки» с Са-связывающими доменами. Связывание Са2+ при увеличении его концентрации в цитоплазме вызывает пространственную переориентацию аминокислот в петле и спиралях и переупаковку этих центров, связывающих Са2+, в структуре всего КаМ-белка. Передача сигнала становится возможной, если эти конформационные перестройки узнаются белками-мишенями, которые, в конечном итоге, преобразуют изменения концентрации Са2+ в цитозоле в ответ на специфический сигнал (рис. 6.56, 5).
Концентрация КаМ в цитозоле может составлять 5-20 мкМ и варьирует в разных типах клеток. Это предполагает вероятность конкуренции за КаМ между КаМ-связывающими белками, что может играть роль в детерминировании клеточного ответа на увеличение [Са2+]цит. Взаимодействие между Са2+КаМ и КаМ-регулируемыми белками, главным образом, гидрофобное, и даже незначительные модификации последовательностей на гидрофобном прикрепляющем участке КаМ могут лишить его возможности активировать белки-мишени.
Важное отличительное свойство Са2+-КаМ комплекса – способность связываться с большим числом разнообразных белков-мишеней. Са2+-КаМ комплекс активирует непосредственно или через модификацию реакций фосфорилирования-дефосфорилирования много больше 100 белков. У животных идентифицировано более 30 ферментов и других белков, которые регулируются Са-КаМ. В растительной клетке таких белков идентифицировано и охарактеризовано значительно меньше. Са2+-КаМ зависимыми являются: Са2+-АТФазы II В-типа; SV вакуолярный катионный канал; НАД-киназа, глутаматдекарбоксилаза, супероксиддисмутаза; миозин V, киназин; ПКазы и ПФФаза 2В, белки кончика корня и некоторые другие (рис. 6.56, 5, 5а).
Мишенями, на которые передаются Са2+-сигналы, часто являются транспортные системы, в том числе Са2+-помпы. Са2+-АТФазы II В-типа обеспечивают регуляцию [Са2+]цит, необходимую для возникновения Са2+ сигнала, определяют характер переходного состояния, связанный с завершающей стадией, и в то же время сама их активность регулируется с участием Са2+-КаМ. Са2+-АТФазы II В-типа являются компонентами не только плазмалеммы, но и эндомембран (рис. 6.54) и, возможно, локализованы в оболочке ядра. КаМ регулирует активность Са2+-помпы, связываясь на автоингибиторном домене С-конца и меняя пространственное расположение этого участка, он снимает его блокирующее действие. Но у растительных Са2+-АТФаз (по крайней мере, у некоторых - АСА2 - Arabidopsis Ca2+-ATPasa, локализованной на мембране ЭР, SCA1 - soybean Ca2+-ATPasa, на ПМ) КаМ-связывающий домен находится не на С-конце, а на N-терминале. У растений, как и у животных, КаМ-зависимые Са2+-АТФазы эндоплазматического ретикулума могут быть ведущими в регуляции и поддержании осцилляций и волны [Са2+]цит.
Са2+-КаМ комплекс может включаться в каскадную передачу Са2+-сигнала, взаимодействуя с киназами, относящимися к группе кальций/кальмодулин зависимых протеин-киназ (Са2+-КаМ ПК) (рис. 6.56, 5а). Эти ПК имеют не четыре, как Са2+-завПК и КаМ, а три «EF руки» на регуляторном домене. Са2+-КаМ связывается на сайте автоингибиторного домена, вследствие чего, как предполагают, происходит активирование Са2+/КаМ протеин-киназы. Са2+/КаМ ПК могут выполнять специальные функции в каскадной передаче сигнала, что обусловлено их субстратной специфичностью, субклеточной локализацией и чувствительностью к кальцию, которые не совпадают с подобными характеристиками у Са2+-завПК. Кроме того, параллельно с митоген-активиуемыми протеин-киназами (МАПК), Са2+/КаМ ПК регулируют экспрессию гена, фосфорилируя фактор транскрипции при получении Са2+ сигнала (рис. 6.56, 5в).
Действие ПКаз может быть нейтрализовано или обращено ПФФазами. По существу, именно баланс фосфорилирования-дефосфорилирования белков регулирует многочисленные реакции и процессы в клетке и включен в систему передачи сигналов. ПФФазы (как и ПКазы) делятся на две большие группы по субстратной специфичности аминокислот (серин/треонин либо тирозин) в сайте, где связывается и отщепляется фосфатная группа. В группу сер/тре ПФФ входит четыре семейства, среди которых ПФФазы 2 В являются Са2+-КаМ зависимыми. Сведений о ПФФазах значительно меньше, чем о ПКазах. Установлено, что они не только контрагенты киназ, но выполняют ведущую роль во многих сигнальных каскадах: при передаче сигнала от АБК на ионные каналы в замыкающих клетках устьиц, при стрессовых ответах на патогены, при регуляции роста корневого волоска, при свето- и гравиотропизмах и т.д..
Наиболее изученной Са2+-КаМ ПФФазой животных является кальцийнейрин. В клетках Arabidopsis taliana также обнаружена ПФФаза, подобная кальцийнейрину (КН), которая взаимодействует с Са2+-КаМ и активируется при возникновении Са2+-сигнала. КН – гетеродимер, состоящий из консервативной каталитической субъединицы А типа (объединена с одной из класса вариабельных субъединиц) и регуляторной субъединицы В типа (КНВ, где В – буква латинского алфавита). В корнях и стебле арабидопсис присутствует 6 изоформ КНВ и синтез одной из них активировался при действии засухи, холода, ветра. Наличие изоформ у КНВ и КаМ значительно увеличивает число возможных комбинаций их совместного регулирования активности кальцийнейрина (КН), расширяя спектр специфичности ответов.
Функция КНВ может быть связана с прикреплением фермента к цитоскелету или мембране, что, определит место в пространстве, где будет проявляться дефосфорилирующая активность. КН, как предполагают, может стать одним из компонентов трансдукона – большого комплекса разнообразных белков плазмалеммы, включенных в каскад стимул-ответ. Например, трансдуксон может быть системой поддержания и регуляции тургора и объединять: рецепторы, вторичные мессенжеры, К+- и Са2+- и анионные каналы, Са2+-ПКазу и КН, Са2+-АТФазу и КаМ, если помпа активирована. Подобный трансдукон может быть включен в разнообразные двигательные реакции растений (устьичные движения, тропизмы, настии и т.д.). Возможно, КН является составной частью механизма контроля ионных потоков из среды в корни.
С реакцией дефосфорилирования может быть связана еще одна важная функция - декодирования информации, зашифрованной в виде пиков и осцилляций кальциевого сигнала. Модель дешифровки этой информации предполагает совместное функционирование ПКаз и ПФФаз, имеющих разную кинетику Са2+-зависимой активации.
Итак, передача Са2+-сигнала на белки-мишени может происходить разными путями с участием первичных сенсоров (Са2+ ПКазы, КаМ) либо по более длинным каскадным путям (рис. 6.56). При этом через КаМ, ПК и ПФФ, имеющих множество изоформ, осуществляется специфическое кодирование Са2+-сигнала и передача информации к нужному белку-эффектору (мишени). Часто белками-мишенями становятся Са2+-каналы, Са2+-АТФазы и другие ионные каналы и помпы. Мишенями для сигналов, передаваемых по различным Са2+-зависимым сигнальным путям, могут быть отдельные ферментные системы, цитоскелетные белки, белки факторов транскрипции и др. (рис. 6.56).
Ответные реакции, связанные с Са2+ сигнализацией, делили на быстрые, происходящие на пост-трансляционном уровне, и медленные, связанные с экспрессией генома. В настоящее время быстрый и медленный ответы рассматриваются как разные стадии одного общего процесса адаптивной модификации метаболизма. Са2+ сигнализация, связанная с экспрессией генома, часто сочетается с гормональной регуляцией процессов, что добавляет еще больше сложности в расшифровку сети путей передачи сигнала по сетиразных сигнальных путей в клетке.
