- •В ведение
- •Глава 1 гели для электрофореза полиакриламидныи гель (пааг) Исходные материалы
- •Процесс полимеризации пааг
- •Выбор концентраций мономеров
- •Агароза
- •Ацетатцеллюлозная пленка, импрегнированная пааг
- •Глава 2 техника приготовления гелей и аппаратура
- •Вертикально расположенные трубки
- •Вертикально расположенные пластины
- •Горизонтально расположенные пластины
- •Глава 3 электрофорез белков
- •Замечания общего характера Миграция белков в геле
- •Напряженность электрического поля (н)
- •Выбор буфера рабочего геля
- •Выделение тепла при электрофорезе
- •Загрузка геля. Ширина белковых зон
- •Введение мочевины и -меркаптоэтанола. Некоторые артефакты
- •Лидирующие красители
- •Разделение белков по размерам и заряду
- •Выбор рабочего буфера
- •Использование мочевины
- •Загрузка геля и подготовка препарата
- •Некоторые примеры
- •Фракционирование гистонов и других щелочных белков.
- •Разделение белков по размеру с использованием ддс-Na Существо метода
- •Выбор пористости геля
- •Присутствие мочевины и неионных детергентов
- •Выбор рабочего буфера геля
- •Подготовка белкового препарата
- •Проведение электрофореза
- •Окрашивание и элюция белков
- •Ступенчатый электрофорез (disc-electrophoresis)
- •Градиент пористости пааг
- •Двумерный электрофорез в пааг
- •Электрофорез с использованием тритона х-100 и цетавлона Тритон х-100
- •Цетавлон
- •Окрашивание белков в пааг
- •Кислые красители
- •Другие красители и методы окрашивания
- •Флюоресцентные красители
- •Локализация ферментов после электрофореза
- •Локализация белковых полос осаждением ддс-Na
- •Элюция белков из геля
- •Определение радиоактивности белков после электрофореза в пааг
- •Счет радиоактивности в элюатах белка
- •Растворение пааг
- •Импрегнирование сцинтиллятора в гель
- •Авторадиография
- •Флюорография
- •Препаративныи электрофорез белков
- •Оглавление
- •Глава 1
- •Глава 2
- •Глава 3
- •Глава 4
- •Глава 1 . Основные понятия теории седиментации ............ 175
- •Глава 2 Ультрацентрифуга ..................... 177
- •Глава 3 Роторы и пробирки .................... 182
- •Глава 4 Раздельное осаждение частиц (дифференциальное центрифугирование) 199
- •Глава 5
Выделение тепла при электрофорезе
Высокая электропроводность буфера нежелательна, посколь- ку ограничивает возможность повышения напряженности элект- рического поля в геле из-за увеличения тока и связанного с этим выделения тепла. Между тем, именно напряженность поля обес- печивает всегда желательное ускорение миграции белков.
Электрическая мощность, рассеиваемая в виде тепла в геле, равна произведению силы тока на падение напряжения по длине геля (IЕ). В главе 1 было отмечено, что разумной продолжи- тельности электрофореза соответствует напряженность поля 10 — 20 В/см. Кстати, как показывает практика, при заметном превышении этих значений качество полос в обычных условиях охлаждения ухудшается. Для геля длиной 20 см такой напря- женности соответствует напряжение 200 — 400 В. При воздуш- ном охлаждении вертикально расположенных пластин эффектив- ный теплоотвод возможен при рассеиваемой мощности не более 20 Вт, что соответствует силе тока 50 — 100 мА на пластину. В приборе GЕ-2/4 фирмы «Рhаrmасiа» (рис. 15) с принудитель- ным жидкостным охлаждением пластин уровень мощности мо- жет быть увеличен до 100 Вт с соответствующим повышением напряженности поля и ускорением фракционирования белков. Приборы для электрофореза в горизонтальных пластинах успеш- но осуществляют теплоотвод при мощности до 40 Вт.
В процессе электрофореза электрическое сопротивление геля может изменяться (чаще всего увеличивается). Причиной этого является замена более подвижных ионов буфера в геле на ме- нее подвижные, например при ступенчатом электрофорезе.
42
Рис. 15. Прибор для электрофореза в вертикальных пластинах с циркуляцией буфера (Тип GЕ-2/4 фирмы «Рharmacia»)
Как уже отмечалось, для сокращения продолжительности разделения и уменьшения диффузии зон электрофорез желатель- но вести при максимальном напряжении. Его начальное значе- ние ограничивается требуемой вначале силой тока и максималь- но допустимой для данного прибора мощностью. По мере роста сопротивления в геле сила тока снижается, и напряжение мож- но увеличивать. Современные источники напряжения делают это автоматически, поддерживая заданный постоянный уровень мощности, рассеиваемой в геле. От опасного (с точки зрения надежности изоляции) повышения напряжения при этом можно застраховаться, ограничив максимально допустимую его вели- чину. Достигнув ее, прибор переключается на режим поддержа- ния постоянного напряжения, поэтому при дальнейшем возра- стании сопротивления сила тока и расходуемая в геле мощность начинают снижаться.
В некоторых случаях сопротивление всей цепи электрофоре- за может и уменьшаться. В частности, это может происходить как из-за нагревания геля (напомним, что подвижность ионов с температурой возрастает), так и за счет накопления ионов в электродных резервуарах. В этих случаях источник тока, отрегу- лированный на постоянную мощность, автоматически снижает напряжение, а максимально допустимая сила тока может быть заранее ограничена. Такого типа источники («Соnstant роwеr suрр1у») выпускаются фирмами «Рharmaciа» (модель ЕСРS 3000/150) и LКВ (модель 2103). В других типах источни-
43
ков (ЕРS 500/400 фирмы «Рharmaciа» и модель 500 фирмы «Вio-Rad») можно заранее установить постоянные значения на- пряжения или тока и задать величину максимально допустимой мощности, по достижении которой соответственно напряжение или ток начинают автоматически уменьшаться.