Типы трансдукций
Неспецифическая трансдукция. В процессе репродукции фага в момент сборки фаговых частиц в их головку вместе с фаговой ДНК может проникнуть какой-либо фрагмент ДНК бактерии-донора. В клетки реципиентного штамма могут быть перенесены любые гены донора.
Принесенный фагом фрагмент ДНК бактерии-донора способен включаться в гомологическую область ДНК клетки-реципиента путем рекомбинации. Фаги являются только переносчиком генетического материала от одних бактерий к другим. Фаговая ДНК не участвует в образовании рекомбинантов.
Специфическая трансдукция осуществляется фагами, обладающими избирательной локализацией на хромосоме бактерий. Образование трансдуцирующего фага происходит путем выщепления профага из бактериальной хромосомы вместе с генами, расположенными на хромосоме клетки-донора рядом с профагом. При взаимодействии трансдуцирующих фагов с клетками реципиентного штамма происходит включение гена бактерии-донора вместе с ДНК дефектного фага в хромосому бактерии-реципиента.
Абортивная трансдукция. Принесенный трансдуцируемый фагом фрагмент ДНК донора не включается в хромосому клетки-реципиента, а остается в ее цитоплазме и в таком виде способен поддерживаться и проявляться фенотипически.
Во время деления бактериальной клетки трансдуцированный фрагмент ДНК может передаваться только одной из двух дочерних клеток, т.е. наследоваться однолинейно и в конечном итоге утрачиваться в потомстве.
Фаговая (лизогенная) конверсия.
Изменения свойств бактерии-реципиента под влиянием генов умеренного фага.
Механизмы фаговой конверсии
встраивание бактериофага в нуклеоид |
||
ò активация гена бактериофага ò
|
ò внесение гена от бактерии-донора (дефектные фаги при трансдукции) ò
|
встраивание около повреждённого промотора ò замена его фаговым промотором ò экспрессия «молчащих» генов бактерии-реципиента |
появление у бактерии-реципиента нового признака |
Конъюгация - однонаправленная передача генетической информации в результате непосредственного контакта между донорной и реципиентной клетками
Конъюгация E.coli
Необходимым условием для конъюгации является наличие у бактерии-донора F-плазмиды (полового фактоpa), которая контролирует синтез половых ворсинок (sex-pili). Бактерии, имеющие F-плазмиду, называются мужскими (F+) клетками. Женские (F-) клетки не имеют этой плазмиды. Процесс конъюгации между F+ и F- клетками имеет следующие стадии:
установление контакта между донором и реципиентом с помощью половых ворсинок;
прохождение генетического материала через канал половой ворсинки от донора к реципиенту;
рекомбинация между донорской и реципиентной ДНК.
F-плазмида может находиться как в автономном состоянии в цитоплазме, так и в интегрированном с хромосомой клетки. Находясь в автономном состоянии, она контролирует только собственный перенос при конъюгации. В результате F- клетка превращается в F+ клетку, содержащую F-плазмиду. Если F-плазмида интегрирована с хромосомой бактерии, то при конъюгации она контролирует перенос части хромосомной ДНК в клетку-реципиент. С помощью интегрированной F-плазмиды частота переноса хромосомных генов между бактериями существенно возрастает. Поэтому бактерии, у которых F-плазмида интегрирована с хромосомой, обозначают как Hfr (от англ. high frequency recombination), т.е. обеспечивающие высокую частоту рекомбинаций.
ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ УЧЕНИЯ О ГЕНЕТИКЕ МИКРООРГАНИЗМОВ
Генная инженерия в медицинской микробиологии
Продукты, получаемые генно-инженерным способом с помощью рекомбинантных штаммов бактерий
вакцины
гормоны
интерфероны
цитокины
Генетические методы, применяемые в микробиологической диагностике
процентное содержание Г+Ц бактериальном геноме
метод молекулярной гибридизации
полимеразная цепная реакция (ПЦР)
Метод молекулярной гибридизации
Цель
Выявления степени сходства различных ДНК (при идентификации микроорганизмов – сравнение ДНК выделенного штамма с ДНК эталонного штамма)
Принцип осуществления
исследуемая ДНК
нагрев в щелочной среде
расплетение на две отдельные нити
закрепление одной из них на специальном фильтре
помещение этого фильтра в р-р, содержащий радиоактивный зонд (одноцепочечную молекулу ДНК эталонного штамма, меченную радиоактивным изотопом)
понижение температуры
+ - восстановление двойной спирали
– - двойная спираль не восстанавливается
Полимеразная цепная реакция
Цели
обнаружение в патологическом материале конкретного вида микроорганизма без выделения чистой культуры
идентификация микроорганизмов
генотипирование микроорганизмов
Принцип проведения
патологический материал или штамм микроорганизма
выделение ДНК
нагрев
расплетение ДНК на две нити
добавление праймеров (участки ДНК, комплементарные 3’-концам искомого гена)
охлаждение
связывание праймеров с комплементарными участками искомого гена
(слайд 36) добавление ДНК-полимеразы и нуклеотидов
нуклеотиды присоединяются к 3’-концам праймеров
повторение циклов (30-80) – накопление (амплификация) искомого гена
резкое нарастание (двукратное после каждого цикла) количества искомого гена
определение количества ДНК с помощью электрофореза
+ - количество ДНК увеличивается
– - количество ДНК не увеличивается