
- •1. Будова нуклеїнових кислот. Пуринові і пиримідинові азотисті основи, нуклеотиди, мононуклеотиди.
- •2. Окислювальне перетворення глюкозо-6-фосфата (пентозофосфатний шунт), його значення.
- •3. Основні шляхи перетворення амінокислот в організмі: трансамінування, дезамінування, декарбоксилювання.
- •4. Метаболізм нейтральних ліпідів. Біосинтез триацилгліцеролів в печінці та кишечнику.
- •5. Заг. Уява про процес аеробного окислення – дихання. Етл мітохондрій тварин, його зв’язок з процесами субстратного ф-ня.
- •6. Рівняння Міхаеліса-Ментен. Константа Міхаеліса та макс. Швидкість ферм. Реакції. Конкурентне та неконкурентне інгібування.
- •7. Структура та властивості ферментів. Ізоферменти. Механізм дії ферментів.
- •8. Дихальний шлях. Енергетика переносу електронів. Спряженість окисного фосфорилювання з процесом перенесення електронів.
- •9. Мембранозв'язані етл. С-ми синтезу стероїдів в мх. Мікросомальні етл. Дихальна с-ма мітохондрій.
- •10. Простагландини, тромбоксани і лейкотрієни. Характеристика. Біологічна роль. Молек. Механізм дії.
- •11. Характеристика гістонових та негістонових білків. Ковалентні модифікації. Біохімічні механізми конденсації та деконденсації хроматину.
- •12. Ліпіди. Властивості, розповсюдження, класифікація, значення.
- •13. Коферменти, класифікація і роль, зв'язок з вітамінами.
- •14. Перетворення білків у кишково-шлунковому тракті. Протеолітичні ферменти та їх специфічність.
- •15. Процесінг первинних транскриптів. Механізми сплайсингу рнк. Особливості процесінгу тРнк, мРнк, рРнк у про- та еукаріотів. Регуляція експресії генів шляхом альтернативного сплайсингу.
- •16. Енергетика ферментативних процесів. Енергія активації. Рівняння Арреніуса та Вант-Гоффа; Лейдлера-Скетчарда та Бренстеда-б'єрума.
- •17. Біохімічні основи регуляції клітинного циклу. Роль білка mpf, білків сімейства циклінів, ростових факторів та циклін-залежних кіназ.
- •18. Регуляція метаболізму ліпідів, жирова тканина і печінка в регуляції метаболізму ліпідів, регуляція обміну холестеролу.
- •19. Катаболізм вуглеводів, шляхи розпаду вуглеводів у тканинах, анаеробне перетворення вуглеводів.
- •20. Шляхи регуляції вуглеводного обміну, роль адреналіну та інсуліну.
- •21. Характеристика складних ліпідів, фізіологічне значення.
- •23. Молекулярні механізми проведення регуляторних сигналів. Система вторинних посередників.
- •24. Регуляція вуглеводного обміну. Роль гормонів у вуглеводному обміні. Порушення. Цукровий діабет.
- •25. Перекисне окиснення ліпідів. Регуляція пол. Біологічна активність продуктів пол
- •26. Роль білків в процесі реплікації. Поcтреплікативні модифікації днк. Роль рестриктаз у збереженні „чистоти” ген. Інформації.
- •27. Вітамін в12 – кобаломін. Будова вітаміну. Особливості всмоктування вітаміну в тонкому кишечнику. Транскобаломіни. Біологічна роль, будова в12-коферментів.
- •28. Рівні структурної організації хроматину. Хромосома, теломера та теломеразна активність.
- •29. Загальні шляхи обміну амінокислот: трансамінування, процеси дезамінування та декарбоксилювання.
- •30. Молек механізми проведення і підсилення рецепторного сигналу. Основні теорії рецепції. Вторинні месенджери. Механізми проведення та підсилення рецепторного сигналу.
- •31. Кальмодулін – регуляторний тригерний білок, його участь у роботі месенджерних каскадів.
- •32. Катаболізм триацилгліцеролів та фосфоліпідів
- •33. Класифікація кофакторів та їх характеристика.
- •34. Шляхи катаболізму пуринових та піримідинових основ, кінцеві продукти.
- •35. Кінетика та енергетика мембранного транспорту
- •36. Структура та властивості рнк-полімерази.
- •37. Пасивний та активний транспорт через мембрану.
- •38. Кінетика ферментативного каталізу. Швидкість ферментативних реакцій. Енергія активації.
- •39. Система циклічних нуклеотидів:структура, утворення, роль.
- •40. Гормони підшлункової залози, структура, механізм дії.
- •41. Біологічні мембрани та їх функції. Сучасне уявлення про структуру та функції мітохондрій.
- •42. Утворення моносахаридів. Біосинтез оліго- та полісахаридів.
- •43. Гормони щитовидної залози: структура, біологічна роль.
- •44. Характеристика вітамінів а, е, к. Структура, біологічна роль.
- •45. Транспортна рнк, особливості будови, роль в біосинтезі білка.
- •46. Трансамінування амінокислот, його механізм.
- •47. Транскрипція, ферменти транскрипції і її регуляція. Реорганізація хроматину при транскрипції.
- •48. Рівні організації днк, реплікація днк.
- •50. Роль металів у каталітичній активності ферментів.
- •51. Перетворення енергії в живих системах. Шляхи синтезу атф у клітині.
- •52. Молекулярні механізми проведення регуляторних сигналів
- •53. Гормони. Хімічна будова, фізіологічна роль найважливіших гормонів.Молекулярний механізм дії.
- •54. Цикл ди та трикарбонових кислот (цикл Кребса)
- •55. (№7) Ферменти. Структура ферментів, ізоферменти, механізми дії ферментів.
- •56. Структура та роль нуклеотидтрифосфатів.
- •57. Структура і біологічна роль днк.
- •58. Принцип класифікації і номенклатура ферментів.
- •59. Глюконеогенез - синтез глюкози
- •60. Структура, властивості та класифікації амінокислот.
- •61. Мембрани й міжклітинні взаємодії
- •62. Гідроліз білків в шкт. Внутрішньоклітинне перетворення білків.
- •63. Кінетика гальмування (інгібування) ферментативних реакцій
- •64. Шляхи перетворення ліпідів у клітині
- •65. Вуглеводи, будова, властивості, класифікація і роль у живій природі.
- •66. Основні етапи біосинтезу білка на рибосомах
- •67. Анаеробне перетворення вуглеводів. Спиртове бродіння.
- •68. Характеристика хромопротеїдів. Представники. Гемоглобін і транспорт кисню.
- •69. Білки, структура і біологічна функція. Рівні організації білкових структур.
- •70. Шляхи біосинтезу пуринових та піримідинових основ.
- •71. Характеристика активних центрів ферментів.
- •72. Чоловічі статеві гормони.
- •73. Поняття про кінетику ферментативного каталізу.
- •74. Регуляція біосинтезу білка в клітинах.
- •75. Метаболічний розпад пуринів та піримідинів.
- •76. Метаболізм простагландинів.
- •77. Вітаміни а та d: структуру, значення.
- •78. Структура і біологічна роль рнк. Види рнк.
- •79. Порушення обміну вуглеводів. Цукровий діабет.
- •80. Біосинтез сечовини.
- •81. Регуляція метаболізму ліпідів
- •82. Біосинтез фосфоліпідів.
- •83. Регуляція ферментного апарату клітин.
- •84. Розпад та біосинтез полісахаридів.
- •85. Біосинтез жирних кислот (жк)
- •86. Декарбоксилювання амінокислот, роль амінів
- •87. Біогенні аміни та їх значення.
- •88. Дихальний ланцюг (ланцюг переносу електронів).
- •89. Анаеробне перетворення вуглеводів, глікогеноліз.
- •90. Ейкозаноїди - похідні арахідонової кислоти, класифікація, значення.
8. Дихальний шлях. Енергетика переносу електронів. Спряженість окисного фосфорилювання з процесом перенесення електронів.
Ланцюг переносу електронів від NADH та FADH2 на кисень. Перенесення електронів від NADH до О2 включає ряд переносників, які локалізовані у внутрішній мембрані мітохондрій. За винятком убіхінону і цитохрому С, це складні білкові комплекси. NADH-дегідрогеназа (NADH-Q-редуктаза, комплекс I) складається з декількох поліпептидних ланцюгів. Роль простетичної групи виконує FMN. Єдиний субстрат ферменту – NADH, з якого 2 електрони і протон переносяться на FMN з утворенням FMNH2. Другий протон поглинається з матриксу. Реакція протікає за рівнянням: NADH + Н+ + Е (FMN) NAD+ + E (FMNH2). З FMNH2 електрони переносяться потім на ряд залізо-сірчаних білків (Fe), що виконують роль другої простетичної групи в молекулі NADH-дегідрогенази. Атоми заліза в цих білках (негемове залізо) зібрані в кілька груп, так званих залізо-сірчаних центрів. FeS-центри входять до складу багатьох білків (флавопротеїнів, цитохромів), які беруть участь в окисно-відновних реакціях. Відомі 3 типи FeS-центрів (Fe, Fe2S2, Fe4S4), в яких атом заліза зв'язаний з атомом сірки залишків цистеїну або неорганічної сірки.
NADH-дегідрогеназа містить кілька центрів типу Fe2S2 і Fe4S4. Атоми заліза в таких центрах можуть приймати і віддавати електрони по черзі, переходячи у ферро- (Fe2+) і ферри- (Fe3+) стани. Від залізо-сірчаних центрів електрони переносяться на кофермент Q (убіхінон). Убіхінон виконує колекторну функцію, приєднуючи електрони від NADH-дегідрогенази та інших флавінзалежних дегідрогеназ, зокрема, від сукцинатдегідрогенази. Убіхінон бере участь у реакціях типу: E (FMNH2) + Q Е (FMN) + QH2. Цитохроми або гемопротеїни присутні в усіх типах організмів. У клітинах еукаріотів вони локалізовані в мітохондріальних мембранах і в ЕР. Відомо близько 30 різних цитохромів. Усі цитохроми в якості простетичної групи містять гем. У залежності від здатності поглинати світло у визначеній частині спектра всі цитохроми поділяють на групи а, b, с. Усередині кожної групи окремі види з унікальними спектральними властивостями позначають цифровими індексами (b, b1, b2 і т.д.). QH2-дегідрогеназа (коензим Q-цитохром с-редуктаза, комплекс III) складається з 2 типів цитохромів (b1 і b2) і цитохрому с1. QH2-дегідрогеназа переносить електрони від убіхінолу на цитохром с. Усередині комплексу III електрони передаються від цитохромів b на FeS-центри, далі на цитохром с1, а потім на цитохром с. Групи гема, подібно FeS-центрам, переносять тільки по одному електрону. Таким чином, від молекули QH2 2 електрони переносяться на 2 молекули цитохрому b. Як проміжний продукт у цих реакціях переносу електронів можливе утворення вільного радикала семіхінону. У цитохромах типу b гем не зв'язаний ковалентно з білком, а в цитохромах с1 і с він приєднується до білка за допомогою тіоефірних зв'язків. Ці зв'язки утворюються шляхом приєднання 2 цистеїнових залишків до вінільних груп гема.
Організація дихального ланцюга в мітохондріях. Основні переносники електронів вбудовані у внутрішню мембрану мітохондрій і організовані в 4 комплекси, що є розташованими у визначеній послідовності (векторно). У цій послідовності їх стандартні окисно-відновні потенціали стають більш позитивними в міру наближення до кисню. Кожна ланка цього ланцюга специфічна у відношенні донора й акцептора електронів. На першому етапі дегідрогенази каталізують відщіплення водню від різних субстратів. Якщо субстратами служать -гідроксикислоти малат, ізоцитрат, 3-гідроксібутират, водень переноситься на NAD+. NADH, що утворився, у дихальному ланцюзі, у свою чергу, киснюється NADH-дегідрогеназою (комплекс I). Якщо субстратами служать такі сполуки, як сукцинат або гліцерол-3-фосфат, акцепторами водню є FAD-залежні дегідрогенази. Від NADH і FADH2 електрони і протони передаються на убіхінон і далі через ланцюг цитохромів до молекулярного кисню. Дотепер точно невідомо, яким чином розташовані всі переносники електронів дихального ланцюга. Однак установлено, що в розташуванні дихальних комплексів існує визначена асиметрія: деякі з білків-переносників знаходяться ближче до тієї сторони внутрішньої мембрани, що звернена до матриксу, а інші – до протилежного; деякі білки пронизують мембрану наскрізь.
Інгібітори дихального ланцюга. Вивченню послідовності переносу електронів сприяло дослідження дії специфічних інгібіторів, що блокують визначені етапи цього процесу (рис. 8). Переносники електронів, які знаходяться в ланцюзі безпосередньо перед блокованим етапом, стають більш відновними, а ті що знаходяться після цього етапу – більш окисними. Довести це твердження можна за допомогою спектрофотометра, тому що в окисних і відновних форм переносників різні спектри поглинання.
Механізм спряження окиснення та фосфорилювання. Найбільш обґрунтовану відповідь на це питання дає хеміосмотична теорія Мітчелла, запропонована ним у 1961 р. Основні положення були підтверджені й розроблені детально спільними зусиллями багатьох дослідників у наступні роки. Переносення електронів по дихальному ланцюгу від NADH до кисню супроводжується викачуванням протонів з матриксу мітохондрій через внутрішню мембрану в міжмембранний простір. На цю роботу затрачається частина енергії електронів, які переносяться по ЛПЕ. Протони, що переносяться з матриксу в міжмембранний простір, не можуть повернутися назад у матрикс, тому що внутрішня мембрана непроникна для протонів. Таким чином, створюється протонний градієнт, при якому концентрація протонів у міжмембранному просторі більше, а рН менше ніж у матриксі. Крім того, кожен протон несе позитивний заряд, і внаслідок цього з'являється різниця потенціалів по обидві сторони мембрани: негативний заряд на внутрішній стороні та позитивний – на зовнішній. У сукупності електричний і концентраційний градієнти складають електрохімічний потенціал Н+ – джерело енергії для синтезу АТФ. Найбільш активний транспорт протонів у міжмембранному просторі, який є необхідним для утворення Н+, відбувається на ділянках ЛПЕ, що відповідають розміщенню комплексів I, III і IV. Ці ділянки називають пунктами спряження дихання та фосфорилювання (рис.А). Механізм транспорту протонів через мембрану мітохондрій в пунктах спряження недостатньо ясний. Однак встановлено, що важливу роль у цьому процесі відіграє КоQ. Більше детально механізм переносу протонів за участі KoQ вивчений на рівні комплексу III (рис. Б).
KoQ переносить електрони від комплексу I до комплексу III і протони з матриксу в міжмембранний простір, тобто відбуваються своєрідні циклічні перетворення, названі Q-циклами. Донором електронів для комплексу III є відновлений убіхінон (QH2), а акцептором – цитохром с. Цитохром с знаходиться зі зовнішньої сторони внутрішньої мембрани мітохондрій; там же розташовується активний центр цитохрому с1, з якого електрони переносяться на цитохром с.
У мембрані існує стаціонарний загальний фонд Q/QH2, з якого кожна молекула QH2 в одному циклі забезпечує перенесення протонів із матриксу в міжмембранний простір і електронів, що в остаточному підсумку надходять на кисень. На роботу, спричинену при викачуванні протонів, витрачається частина вільної енергії, що звільняється при перенесенні електронів по градієнту редокс-потенціала. Енергія електрохімічного потенціалу (Н+) використовується для синтезу АТФ, якщо протони повертаються в матрикс через іонні канали АТФ-синтази.
Рис. А. Спряження дихання та синтезу АТФ у мітохондріях: І – НАДН-дегідрогеназа; ІІ – сукцинат дегідрогеназа; ІІІ – QН2-дегідрогеназа; ІV – цитохрооксидаза; V – АТФ-синтаза. Енергія протонного потенціалу (електрохімічного потенціалу Н+) використовується для синтезу АТФ, якщо протони повертаються до матриксу крізь іонні канали АТФ-синтази. |
|
Рис. Б. Сполучення перенесення електронів крізь дихальний комплекс ІІІ із транспортом Н+ крізь мембрану Відновлений убіхінон (QН2) взаємодіє з Fе3+ гему b1, і відновлюючи його, вивільняє протон водну фазу, та перетворюється в семихінон (НQ). Електрон від гему b1 переноситься на Fе3+ гему b2. НQ віддає другий електрон на FеS-центр, який знаходиться ближче до зовнішньої поверхні мембрани; при цьому другий протон опиняється в міжмембранному просторі; електрон надходить до цитохрому с1, а далі до цитохрому с. Окиснений Q дифундує до внутрішньої поверхня мембрани, де отримує електрон від гему b2 і протон із матриксу, перетворюючись у НQ. НQ отримує електрон від комплексу І та протон із матриксу; у мембрані утворюється QН2, і весь процес повторюється з початку. |