
- •1. Будова нуклеїнових кислот. Пуринові і пиримідинові азотисті основи, нуклеотиди, мононуклеотиди.
- •2. Окислювальне перетворення глюкозо-6-фосфата (пентозофосфатний шунт), його значення.
- •3. Основні шляхи перетворення амінокислот в організмі: трансамінування, дезамінування, декарбоксилювання.
- •4. Метаболізм нейтральних ліпідів. Біосинтез триацилгліцеролів в печінці та кишечнику.
- •5. Заг. Уява про процес аеробного окислення – дихання. Етл мітохондрій тварин, його зв’язок з процесами субстратного ф-ня.
- •6. Рівняння Міхаеліса-Ментен. Константа Міхаеліса та макс. Швидкість ферм. Реакції. Конкурентне та неконкурентне інгібування.
- •7. Структура та властивості ферментів. Ізоферменти. Механізм дії ферментів.
- •8. Дихальний шлях. Енергетика переносу електронів. Спряженість окисного фосфорилювання з процесом перенесення електронів.
- •9. Мембранозв'язані етл. С-ми синтезу стероїдів в мх. Мікросомальні етл. Дихальна с-ма мітохондрій.
- •10. Простагландини, тромбоксани і лейкотрієни. Характеристика. Біологічна роль. Молек. Механізм дії.
- •11. Характеристика гістонових та негістонових білків. Ковалентні модифікації. Біохімічні механізми конденсації та деконденсації хроматину.
- •12. Ліпіди. Властивості, розповсюдження, класифікація, значення.
- •13. Коферменти, класифікація і роль, зв'язок з вітамінами.
- •14. Перетворення білків у кишково-шлунковому тракті. Протеолітичні ферменти та їх специфічність.
- •15. Процесінг первинних транскриптів. Механізми сплайсингу рнк. Особливості процесінгу тРнк, мРнк, рРнк у про- та еукаріотів. Регуляція експресії генів шляхом альтернативного сплайсингу.
- •16. Енергетика ферментативних процесів. Енергія активації. Рівняння Арреніуса та Вант-Гоффа; Лейдлера-Скетчарда та Бренстеда-б'єрума.
- •17. Біохімічні основи регуляції клітинного циклу. Роль білка mpf, білків сімейства циклінів, ростових факторів та циклін-залежних кіназ.
- •18. Регуляція метаболізму ліпідів, жирова тканина і печінка в регуляції метаболізму ліпідів, регуляція обміну холестеролу.
- •19. Катаболізм вуглеводів, шляхи розпаду вуглеводів у тканинах, анаеробне перетворення вуглеводів.
- •20. Шляхи регуляції вуглеводного обміну, роль адреналіну та інсуліну.
- •21. Характеристика складних ліпідів, фізіологічне значення.
- •23. Молекулярні механізми проведення регуляторних сигналів. Система вторинних посередників.
- •24. Регуляція вуглеводного обміну. Роль гормонів у вуглеводному обміні. Порушення. Цукровий діабет.
- •25. Перекисне окиснення ліпідів. Регуляція пол. Біологічна активність продуктів пол
- •26. Роль білків в процесі реплікації. Поcтреплікативні модифікації днк. Роль рестриктаз у збереженні „чистоти” ген. Інформації.
- •27. Вітамін в12 – кобаломін. Будова вітаміну. Особливості всмоктування вітаміну в тонкому кишечнику. Транскобаломіни. Біологічна роль, будова в12-коферментів.
- •28. Рівні структурної організації хроматину. Хромосома, теломера та теломеразна активність.
- •29. Загальні шляхи обміну амінокислот: трансамінування, процеси дезамінування та декарбоксилювання.
- •30. Молек механізми проведення і підсилення рецепторного сигналу. Основні теорії рецепції. Вторинні месенджери. Механізми проведення та підсилення рецепторного сигналу.
- •31. Кальмодулін – регуляторний тригерний білок, його участь у роботі месенджерних каскадів.
- •32. Катаболізм триацилгліцеролів та фосфоліпідів
- •33. Класифікація кофакторів та їх характеристика.
- •34. Шляхи катаболізму пуринових та піримідинових основ, кінцеві продукти.
- •35. Кінетика та енергетика мембранного транспорту
- •36. Структура та властивості рнк-полімерази.
- •37. Пасивний та активний транспорт через мембрану.
- •38. Кінетика ферментативного каталізу. Швидкість ферментативних реакцій. Енергія активації.
- •39. Система циклічних нуклеотидів:структура, утворення, роль.
- •40. Гормони підшлункової залози, структура, механізм дії.
- •41. Біологічні мембрани та їх функції. Сучасне уявлення про структуру та функції мітохондрій.
- •42. Утворення моносахаридів. Біосинтез оліго- та полісахаридів.
- •43. Гормони щитовидної залози: структура, біологічна роль.
- •44. Характеристика вітамінів а, е, к. Структура, біологічна роль.
- •45. Транспортна рнк, особливості будови, роль в біосинтезі білка.
- •46. Трансамінування амінокислот, його механізм.
- •47. Транскрипція, ферменти транскрипції і її регуляція. Реорганізація хроматину при транскрипції.
- •48. Рівні організації днк, реплікація днк.
- •50. Роль металів у каталітичній активності ферментів.
- •51. Перетворення енергії в живих системах. Шляхи синтезу атф у клітині.
- •52. Молекулярні механізми проведення регуляторних сигналів
- •53. Гормони. Хімічна будова, фізіологічна роль найважливіших гормонів.Молекулярний механізм дії.
- •54. Цикл ди та трикарбонових кислот (цикл Кребса)
- •55. (№7) Ферменти. Структура ферментів, ізоферменти, механізми дії ферментів.
- •56. Структура та роль нуклеотидтрифосфатів.
- •57. Структура і біологічна роль днк.
- •58. Принцип класифікації і номенклатура ферментів.
- •59. Глюконеогенез - синтез глюкози
- •60. Структура, властивості та класифікації амінокислот.
- •61. Мембрани й міжклітинні взаємодії
- •62. Гідроліз білків в шкт. Внутрішньоклітинне перетворення білків.
- •63. Кінетика гальмування (інгібування) ферментативних реакцій
- •64. Шляхи перетворення ліпідів у клітині
- •65. Вуглеводи, будова, властивості, класифікація і роль у живій природі.
- •66. Основні етапи біосинтезу білка на рибосомах
- •67. Анаеробне перетворення вуглеводів. Спиртове бродіння.
- •68. Характеристика хромопротеїдів. Представники. Гемоглобін і транспорт кисню.
- •69. Білки, структура і біологічна функція. Рівні організації білкових структур.
- •70. Шляхи біосинтезу пуринових та піримідинових основ.
- •71. Характеристика активних центрів ферментів.
- •72. Чоловічі статеві гормони.
- •73. Поняття про кінетику ферментативного каталізу.
- •74. Регуляція біосинтезу білка в клітинах.
- •75. Метаболічний розпад пуринів та піримідинів.
- •76. Метаболізм простагландинів.
- •77. Вітаміни а та d: структуру, значення.
- •78. Структура і біологічна роль рнк. Види рнк.
- •79. Порушення обміну вуглеводів. Цукровий діабет.
- •80. Біосинтез сечовини.
- •81. Регуляція метаболізму ліпідів
- •82. Біосинтез фосфоліпідів.
- •83. Регуляція ферментного апарату клітин.
- •84. Розпад та біосинтез полісахаридів.
- •85. Біосинтез жирних кислот (жк)
- •86. Декарбоксилювання амінокислот, роль амінів
- •87. Біогенні аміни та їх значення.
- •88. Дихальний ланцюг (ланцюг переносу електронів).
- •89. Анаеробне перетворення вуглеводів, глікогеноліз.
- •90. Ейкозаноїди - похідні арахідонової кислоти, класифікація, значення.
51. Перетворення енергії в живих системах. Шляхи синтезу атф у клітині.
1 етап - підготовчий: складні органічні речовини під дією травних ферментів розпадаються на прості, при цьому виділяється тільки теплова енергія. Білки -> амінокислоти. Жири-> гліцерин і жирні кислоти. Крохмаль -> глюкоза II етап-гліколіз (безкисневий): здійснюється в гіалоплазмі, з мембранами не пов'язаний, в ньому беруть участь ферменти; розщепленню піддається глюкоза. У дріжджових грибів молекула глюкози без участі кисню перетворюється в етиловий спирт і діоксид вуглецю (спиртове бродіння): В інших мікроорганізмів Г. може завершуватися утворенням ацетону, оцтової кислоти і т, д. У всіх випадках розпад однієї молекули глюкози супроводжується утворенням двох молекул АТФ. У ході безкисневого розщеплення глюкози у вигляді хімічного зв'язку в молекулі АТФ зберігається 40% анергії, а решта розсіюється у вигляді теплоти. III етап-гідроліз (кисневий): здійснюється в мітохондріях, пов'язаний з матриксом мітохондрій і внутрішньою мембраною, в ньому беруть участь ферменти, розщепленню піддається молочна кислота: СзН6Оз + ЗН20 -> 3СО2 + 12Н. С02 виділяється з мітохондрій у навколишнє середовище. Атом водню включається в ланцюг реакцій, кінцевий результат яких - синтез АТФ.
Ці реакції йдуть в такій послідовності: 1. Атом водню Н з допомогою ферментів-переносників надходить у внутрішню мембрану мітохондрій, що утворить крісти, де він окислюється: Н-е -> H +
2. Протон водню H + (катіон) виноситься переносниками на зовнішню поверхню мембрани крист. Для протонів ця мемрана непроникна, тому вони накопичуються в міжмембранну просторі, утворюючи протонний резервуар. 3. Електрони водню переносяться на внутрішню поверхню мембрани крист і тут же приєднуються до кисню за допомогою ферменту оксидази, утворюючи негативно заряджений активний кисень (аніон): O2 + е -> O2- 4. Катіони й аніони по обидві сторони мембрани створюють різнойменно заряджене електричне поле, і коли різниця потенціалів досягне 200 мВ, починає діяти протонний канал. Він виникає в молекулах ферментів АТФ-синтетаз, які вбудовані у внутрішню мембрану, що утворить Крісті. 5. Через протонний канал протони водню H + спрямовуються всередину мітохондрій, створюючи високий рівень енергії, велика частина якої йде на синтез АТФ з АДФ і Ф (АДФ + Ф -> АТФ), а протони H + взаємодіють з активним киснем, утворюючи воду та молекулярний 02 : (4Н + +202- -> 2Н20 +02) Таким чином, О2, що надходить у мітохондрії в процесі дихання організму, необхідний для приєднання протонів водню Н. При його відсутності весь процес в мітохондріях припиняється, так як електронно-транспортна ланцюг перестає функціонувати. Загальна реакція III етапи: (2СзНбОз + 6Oз + 36АДФ + 36Ф ---> 6С02 + 36АТФ + +42 Н20) У результаті розщеплення однієї молекули глюкози утворюються 38 молекул АТФ: на II етапі - 2 АТФ і на III етапі - 36 АТФ. Утворилися молекули АТФ виходять за межі мітохондрії і беруть участь у всіх процесах клітини, де необхідна енергія. Розщеплюючись, АТФ віддає енергію (одна фосфатна зв'язок укладає 40 кДж) і у вигляді АДФ і Ф (фосфату) повертається в мітохондрії. Синтез АТФ: При гліколізі: Глюкоза + 2НАД + + 2АДФ + 2Фн = 2НАД • Н + 2ПВК + 2АТФ + 2H2O + 2Н +. На етапах перетворення фосфоенолпіруват в піруват (піруваткіназа) Цикл Кребса: При перетворенні сукцініл-CoA + GDP + Pi = сукцинат + CoA-SH + GTP (сукциніт кофермент А синтазою) = 1 АТФ Ізоцітрат + NAD = Оксалосукцінат + NADH + H + (ізоцитратдегідрогеназа) = 2,5 АТФ α-кетоглутарат + NAD + + CoA-SH = сукцініл-CoA + NADH + H + + CO (альфакетоглутаратдегидрогеназ) = 2,5 АТФ Сукцинат + убіхінон (Q) = фумарат + убіхінол (QH2) (сукцинатдегідрогеназа) = використовується FAD як простетична група (FAD-> FADH2 на першій стадії реакції) у ферменті, утворюється еквівалент 1.5 ATP L-малат + NAD = оксалоацетата + NADH + H + (малатдегідрогеназа) утворюється NADH (еквівалетно 2.5 ATP) Аденозінтріфосфатсінтамза (АТФ-сінтамза) - клас ферментів, що синтезують АТФ з АДФ і неорганічних фосфатів з витратами енергії. Цю енергію АТФ-синтетаза часто отримує від протонів, які проходять поелектрохімічному градієнту, наприклад з просвіту хлоропласта в його строму, або ж з міжмембранну простору в матрикс мітохондрії.
Реакція синтезу така: АДФ + Фн → АТФ + H2O Антибіотик олігоміцін пригнічує активність FO-компонента АТФ-синтази. АТФ-синтазних комплекс FOF1 за формою нагадує плодове тіло гриба, у якого компонент F1 - це капелюшок, ніжка - це γ-субодиниця компонента F1, а «коріння» гриба - компонент FO, заякорені в мембрані. Синтез АТФ пов'язаний зі змінами конфігурації АТФ-синтази, що викликаються обертанням γ-субодиниці, так званий механізм зміни ділянки зв'язування (англ. flip-flop).
Механізм дії АТФ-синтази. Кристал F1 складається з перемежованих α-і β-субодиниць (по 3 кожного виду), розташованих як часточки апельсина навколо асиметричної γ-субодиниці. Відповідно до прийнятої моделі синтезу АТФ, градієнт електричного поля, спрямований поперек внутрішньої мітохондріальної мембрани і зумовлений ЕТЛ, змушує протони проходити крізь мембрану через АТФ-синтазних компонент FO. Частина компонента FO (кільце з c-субодиниць) обертається, коли протони проходять через мембрану. Це c-кільце жорстко пов'язано з асиметричною центральної ніжкою (що складається в основному з γ-субодиниці), яка в свою чергу обертається усередині α3β3-ділянки компонента F1. Це призводить до того, що три ділянки каталізу, що зв'язуються з нуклеотидами, зазнають змін у конфігурації, що призводять до синтезу АТФ.
Основні субодиниці (α3β3) компонента F1 з'єднані додатковою бічною ніжкою з нерухомою ділянкою FO, що запобігає їх обертання разом з γ-субодиницею. Структура непошкодженоъ АТФ-синтази з низькою точністю виявлена за ЕКМ. Показано, що бічна ніжка - це гнучка перемичка, схожа на канат, намотуються на комплекс під час його роботи. У певних умовах каталітична реакція може протікати у зворотному напрямку, при цьому гідроліз АТФ викликає прокачування протонів через мембрану. У механізмі зміни ділянки зв'язування задіяний активна ділянка β-субодиниці, послідовно проходить через три стани. У «відкритому» стані АДФ і фосфат підходять до активної ділянки. Потім білок охоплює ці молекули і вільно зв'язується з ними («вільний» стан). Наступна зміна форми білка притискає молекули один до одного («тісна» стан), що призводить до формування АТФ. Нарешті, активну ділянку знов переходить в «відкрите» стан, звільняє АТФ і пов'язує таку молекулу АДФ і фосфату, після чого цикл виробництва АТФ повторюється
Фізіологічне значення: Великі концентрації АТФ змушують її розщеплювати АТФ і створювати трансмембранний протонний градієнт. Таке використання АТФ-синтази відмічено у анаеробних бактерій, які не мають електронної транспортного ланцюжка. Ці бактерії застосовують гідроліз АТФ для створення протонного градієнта, який задіяний в русі джгутиків і клітинному харчуванні. У аеробних бактерій у нормальних умовах АТФ-синтетаза, як правило, працює в зворотному напрямку, виробляючи АТФ за рахунок енергії електрохімічного потенціалу, створюваного електронної транспортної ланцюжком. У цілому даний процес називается окислювальним фосфорилюванням. Він протікає і в мітохондріях еукаріотів, на внутрішній мембрані яких розташовані молекули АТФ-синтази, причому компонент F1 знаходиться в матриксі, де і протікає процес синтезу АТФ з АДФ і фосфату.