
- •Биофизика
- •Вместо Предисловия
- •2. Живой организм как физическая система
- •2.1 Термодинамика живого объекта
- •2.1.1. Термодинамические системы:
- •2.2 Формализм химической термодинамики
- •2.3 Элементы линейной неравновесной термодинамики.
- •2.3 Стационарное состояние неравновесной системы
- •2.3.1 Теорема Пригожина.
- •2.3.2 Поведение в окрестности стационарного состояния.
- •3. Основы биоэнергетики.
- •3.1. Природные источники свободной энергии.
- •3.2. Атф и макроэргическая фосфатная связь
- •3.3. Источники энергии для образования атф в клетке.
- •3.4. Окислительно-восстановительный потенциал.
- •3.5. Механизм сопряжения окисления и фосфорилирования.
- •Энергетическая система живой клетки
- •Остальное Осмотический потенциал
- •Активный и пассивный транспорт.
- •Транспортные атф-азы.
- •Первичный активный транспорт.
- •Признаки «бионасоса»:
- •Вторичный (сопряжённый) активный транспорт.
- •Механохимия.
- •Одиночное сокращение
- •Мышечные ткани.
- •Строение мышцы.
- •Одиночное сокращение.
- •Уравнение Хилла.
- •Биофизика сенсорных систем Биофизика рецепций
- •Обоняние.
- •Фоторецепторы.
- •Биофизика отклика.
- •В хлоропластах
- •Бактериородопсиновыйт синтез.
- •Фотосинтез высших растений Биопотенциалы
- •Типы управляемых каналов.
- •К онтакты между клетками.
2.3 Элементы линейной неравновесной термодинамики.
Прежде,
чем продвигаться дальше, сделаем
естественные обобщения. А, введенное
нами как химическое средство реакции
в соотношение де-Донде:
равное по определению – (∂F/∂ξ)T, V =…, может иметь более общее значение, т.к. (2.68) и ∂F/∂ξ характеризует не только химическое превращение. Вытекающая из (2.68) связь знаков А и V характерна для большого круга процессов, когда скорость процесса соразмерна его движущей силе. Так бывает при диффузии, электро- и теплопроводимости, когда соответствуют не только знаки А и ν, но существует и пропорциональность между потоком некой величины и причиной («силой») его возвышающей: закон Ома j~grad φ; закон Фурье j=grad T; закон Фика j = grad c; закон Ньютона j=∆C р.
Поэтому целесообразно ввести понятие «обобщенной силы» или сродства Х и обобщенной скорости процесса («потока») J. Опыт учит, что
J ~ X (2.69)
Е
сли
в системе одновременно протекает r
процессов, то естественно (2.63) и (2.70)
обобщить до линейной комбинации:
С
оотношение
(2.71) – обобщение опыта. Оно не может
быть доказано в рамках термодинамики
и является феноменологическим линейным
соотношением. Но если уж оно справедливо,
то термодинамика позволяет сделать
дополнительные утверждения. Для небольших
отклонений от равновесия Онзагер (1931
г.) установил соотношение взаимности:
т
.е.
матрица Lin
– диагонально симметрична.
В общем случае
Ljj >0, Lik2<LiiLkk (2.74)
Если, например: r=2 ,
то σ = L11X12+(L12+L21)X1X2+L22X22>0
О
тсюда:
знак L12 – любой.
Если после этого обобщения вернуться к химическим реакциям, то, положив Х=А/Т, J=V, получим
J
хим=L·X=LּА/Т· (2.76)
Теперь утверждение о том, что скорость химической реакции пропорциональна химическому сродству, получило феноменологически обобщенное подкрепление.
Возникает законный вопрос – при каких условиях линейные соотношения, справедливы?
Определим эти условия, сравнив два выражения для скорости – (2.76) из линейной термодинамики и точное (2.67) из химической кинетики.
Сопоставляя
скорости реакций из этих выражений,
видим, что они равны лишь при условии
A/RT<<1,
когда (2.67) можно разложить в ряд:
К сожалению условие (2.77) выполняется реже, чем хотелось бы: при комнатной температуре RT ≈ 0,6 кк/м = 3,5 кДж/м = 25 мЭв, а для многих биохимических реакций А ≈ 1-2 кк/м и выше, т.е. А ≥ RT!
Однако,
когда это неравенство не выполняется
и, притом, сильно, то процесс можно
представить себе как идущий через ряд
последовательных стадий, каждую из
которых можно охарактеризовать своим
сродством Аρ и своей
координатой ξρ:
Если
промежуточные вещества нестойки (а
только в этом случае реакция идет
насквозь!), то должно быстро устанавливаться
состояние, при котором:
т
.е.
сохраняется линейность V
и Aρ
(если Aρ<<RT).
Т.е. мы остаемся в рамках применимости линейных соотношений для этого (особого!) стационарного состояния (V1=…Vобщ.) хотя общее A ≥ RT.