- •Биофизика
- •Вместо Предисловия
- •2. Живой организм как физическая система
- •2.1 Термодинамика живого объекта
- •2.1.1. Термодинамические системы:
- •2.2 Формализм химической термодинамики
- •2.3 Элементы линейной неравновесной термодинамики.
- •2.3 Стационарное состояние неравновесной системы
- •2.3.1 Теорема Пригожина.
- •2.3.2 Поведение в окрестности стационарного состояния.
- •3. Основы биоэнергетики.
- •3.1. Природные источники свободной энергии.
- •3.2. Атф и макроэргическая фосфатная связь
- •3.3. Источники энергии для образования атф в клетке.
- •3.4. Окислительно-восстановительный потенциал.
- •3.5. Механизм сопряжения окисления и фосфорилирования.
- •Энергетическая система живой клетки
- •Остальное Осмотический потенциал
- •Активный и пассивный транспорт.
- •Транспортные атф-азы.
- •Первичный активный транспорт.
- •Признаки «бионасоса»:
- •Вторичный (сопряжённый) активный транспорт.
- •Механохимия.
- •Одиночное сокращение
- •Мышечные ткани.
- •Строение мышцы.
- •Одиночное сокращение.
- •Уравнение Хилла.
- •Биофизика сенсорных систем Биофизика рецепций
- •Обоняние.
- •Фоторецепторы.
- •Биофизика отклика.
- •В хлоропластах
- •Бактериородопсиновыйт синтез.
- •Фотосинтез высших растений Биопотенциалы
- •Типы управляемых каналов.
- •К онтакты между клетками.
В хлоропластах
|
Спилловер – переливание возбуждения из ФС-2 в ФС-1 при «перегруженности» РЦ-2 |
Фотосинтез в пурпурных бактериях с циклическим фосфорилированием.
Фотосинтез в зелёных серных бактериях с нециклическим фосфорилированием.
Бактериородопсиновыйт синтез.
Фотосинтез высших растений Биопотенциалы
Если поле внутри считать однородным, то можно получить зависимость тока (веществ) от разности потенциалов на мембране (дебаеаский радиус сравним с толщиной мембраны, т.е. мембрана тонкая). Если же мембрана толстая (rдб << d), то возникает объёмный заряд внутри и поле внутрь почти не проникает.
1
2
Рис.1.
1)
мембрана проницаема только к одному
типу ионов (например к К+).
Если К2+
>> К1+,
то ионы калия выбрасываются наружу,
вследствие чего создаётся разность
потенциалов и каждому следующему иону
всё труднее проникать через мембрану,
следовательно, через некоторое время
установится стационарная разность
потенциалов. Причём в стационарном
состоянии (на пути к стационарному
состоянию?) ток концентрации наружу
пропорционален току проводимости.
,
где Н
–
нернстовский потенциал. Наблюдается
хорошее совпадение теории и эксперимента.
Таблица 1. Концентрации и потенциалы.
параметры |
Аксон кальмара |
Мышца лягушки |
Эритроцит человека |
|
|
|
|
|
78 |
13 |
19 |
|
392 |
138 |
136 |
|
11 |
16 |
6 |
|
0,4 |
30 |
0 |
|
104 |
2 |
78 |
|
|
|
|
|
462 |
108 |
155 |
|
22 |
2,5 |
5 |
|
56 |
1,0 |
1,0 |
|
11 |
2 |
2,5 |
|
286 |
120 |
74 |
равновессный |
|
|
|
|
+45 |
+53 |
+56 |
|
-73 |
-101 |
-86 |
|
-60 |
-92 |
-9 |
Потениал
покоя |
-60 |
-92 |
-6…-10 |
Заметим, что проницаемость мембран для ионов калия существенно больше, чем для любых других ионов, поэтому в первом приближении можно считать, что потенциал покоя клетки нернстовскому потенциалу для К+.
2) Мембрана проницаема сразу для 3 видов ионов. В этом случае равновесие не может быть достигнуто в принципе, т.к. равновесные потенциалы для каждого из этих ионов различны. Но может быть достигнуто стационарное состояние, в котором токи веществ есть, но потенциал на мембране и внутри неё не изменяется во времени.
1
Рк
РNa
PCl
Рис.2.
Уравнение
Нэрнста-Планка-Эйнштейна (см рис.2.):
,
,
.
Где
,
.
–
формула
Гольдмана.
Откуда видно, что стационарный потенциал зависит от проницаемости всех видов ионов. Значение потенциала мембраны живой клетки, вычисленное с помощью этой формулы даёт лучшее согласие с экспериментом.
Iпорог
t
Рис. 4.
Процесс
установления стационарного состояния
можно рассматривать как зарядку ёмкости
мембраны (поле внутри мембраны
const).
Действительно, потенциал клетки есть
разность между потенциалами окружающей
среды и потенциалом внутри мембраны.
Всё вышесказанное справедливо в
предположении однородности внутренней
среды клетки. Насколько это предположение
применимо к реальным биомембранам?
Эксперименты показали, что для мембраны
Ом/см2,
С
1 мкФ/см2,
см2/с,
см2/с
// рисунок
В мембране могут образовываться поры, сквозь которые могут проникать молекулы Н2О. Т.о. проницаемость мембраны для воды >> проницаемости для любых других частиц. Проникать каким бы то ни было молекулам (особенно ионам) внутрь мембраны чрезвычайно не выгодно с энергетической точки зрения: во внешней среде их энергия понижена за счёт гидротированных молекул воды, или «шубы» из молекул растворителя.
Таблица 2.
ион |
Li+ |
Na+ |
K+ |
Rb+ |
Cs+ |
rкрист, нм |
0,06 |
0,035 |
0,133 |
0,148 |
0,169 |
GгидркДж/моль |
-481 |
-377 |
-310 |
-283 |
-255 |
При прохождении сквозь мембрану такая молекула должна потерять всю «шубу», что очень не выгодно, т.к. G в этом случае резко возрастает. Причём, чем меньше размер иона, тем больше энергия гидратации и тем больше «шуба». Существуют специальные каналы из белков, встроенные в мембрану, предназначенные для активного транспорта ионов через мембрану. Все они в явной или неявной форме содержат элемент, который понижает энергию дегидротированного иона, в течение того временя, пока этот ион проходит сквозь мембрану.
Какие ионы лучше будут проходить сквозь мембрану? Критерием может служить энергия гидратации:
С одной стороны, размер самого иона + плюс размер одной молекулы воды должен быть меньше открытой в мембране поры. С другой стороны, если ион маленький, а пора пустая, то энергия иона должна быть скомпенсирована каким-либо механизмом.
Необходимо посчитать, какая энергия нужна, чтобы «содрать» гидратационную оболочку и какую долю энергии можно вернуть за счёт взаимодействия с ионами противоположных знака в стенках ионного канала. На этот счёт существует много теорий, но ближе всех (к эксперименту?) подходит так называемый критерий Эйзенмана: рассмотрим канал в поре диаметра d, и предположим, что где-то в боковой поверхности канала вмонтирован ион противоположного знака.
ra
d
rk
нм,
нм.
Рис. 3.
.
Однако, для больших ra
>>
rk
всё будет
определяться первым членом, тогда можно
построить ряд проницаемости для ионов,
основываясь на данных об энергии
гидратации:
(1
ряд Эйзенмана). Для малых
:
(11 ряд Эйзенмана).
Размер и вход в канал являются дополнительным фильтром (у входа скапливаются молекулы кислорода, понижающие затраты энергии для входа в канал).
Существуют 2 типа искусственных перенсчиков ионов внутрь клетки:
Валиномицин.
Грамицидин (каналообразующие переносчики).
Валиномицин. Состоит из D-валина, L-валина и лактата (L). Служит для облегчённой диффузии ионов калия. Его действие основано на том, что, попадая в такой комплекс, ион калия понижает свою энергию за счёт взаимодействия с атомами кислорода, которые входят в состав валина. Диффузия такого комплекса через мембрану происходит гораздо легче.
Рис. 4.
Антибиотики той же группы: нонактин, А-23187, иономицин (последние два для переноса ионов кальция).
Грамицидин. Состоит из 15 остатков (?). образуется аналог водной среды. В присутствие такого антибиотика клетка погибает, потому что быстро выравнивается концнтрация ионов натрия по обе стороны мембраны. Можно построить ряд проницаемости (P) такого искусственного канала для различных ионов: H+ > Cs+ = Rb+ >NH+ >Tl+ > Na+ > Li+.
Этот канал «дышит», т.е. постоянно то закрывается, то открывается.
Рис. 5.
Использование антибиотиков: 1) В медицине
2) В экспериментах для контроля концентраций по разные стороны мембраны.
