
- •Часть1. (5 семестр. 19 занятий по 2 академических часа. Итоговые занятия: 7, 13, 19)
- •Часть1.
- •5 Семестр.
- •19 Занятий по 2 академических часа. Итоговые занятия: 7, 13, 19 занятие № 1
- •Последовательный процесс поиска модели
- •Литература
- •Дополнительная литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 2
- •Литература
- •Дополнительная литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 3
- •Литература
- •Рекомендуемая дополнительная литература для самостоятельной работы
- •Занятие № 4
- •Литература
- •Занятие № 5
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Правила, используемые при интерпретации спектров ямр
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Занятие № 14-15
- •Открытая ферментативная система с субстратным угнетением
- •Колебания в ферментативных системах Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Термодинамическая вероятность и энтропия
- •Внутренняя энергия и теплосодержание
- •Концентрации натрия и потенциалы внутри и вне клетки (гигантский аксон кальмара в морской воде)
- •Литература
- •Занятие № 18
- •Часть2.
- •6 Семестр.
- •19 Занятий по 3 академических часа. Итоговые занятия: 6, 13, 17 занятие № 1 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 2 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 3 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 4 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 5 (лабораторная работа)
- •Литература
- •Занятие № 6
- •Занятие № 7
- •Литература
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Литература
- •Занятие № 12
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Занятие № 14
- •Литература
- •Занятие № 15
- •Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Методы определения молекулярных масс биомакромолекул: осмометрия, гельхроматография, электрофорез, рассеяние света, вискозиметрия, седиментация.
- •Часть3.
- •7 Семестр.
- •18 Занятий по 3,5 академических часа. Итоговые занятия: 6, 13, 17 занятие № 1
- •Литература
- •Занятие № 2
- •Литература
- •Занятие № 3
- •Литература
- •Занятие № 4
- •Литература
- •Занятие № 5-6
- •Литература
- •Занятие № 7
- •Литература
- •Занятие № 8
- •Литература
- •Занятие № 9
- •Литература
- •Занятие № 10
- •Литература
- •Занятие № 11
- •Занятие № 12
- •Литература
- •Занятие № 13
- •Литература
- •Занятие № 14
- •Литература
- •Занятие № 15
- •Литература
- •Занятие № 16
- •Литература
- •Занятие № 17
- •Литература
- •Занятие № 18
- •Оглавление
Литература
-
Губанов Н.И. Медицинская биофизика. – М., 1978, стр. 197-230
Занятие № 16
ТЕМА: Биофизика процессов гормональной рецепции. Взаимодействие лигандов с рецепторами
Цель: Цель занятия
Вопросы для рассмотрения на занятии:
-
Типы рецепторов. Общие закономерности рецепции (доставка – связывание – узнавание – преображение).
-
Одностадийный и двухстадийный механизмы диффузии лигандов.
-
Связывание лиганд с рецептором. Общее выражение для отношения свободных и связанных лигандов.
-
Связывание одного лиганда с одним центром связывания.
-
Связывание одного лиганда с двумя центрами связывания.
-
Связывание конкурирующих лигандов с одним центром связывания.
-
Общий подход при решении задач с порядком выше второго.
Самостоятельная работа
Смоделируйте эксперименты позволяющие решить следующие задачи: узнать число рецепторов в одной клетке, число центров связывания в одном рецепторе, эффективную концентрацию при которой второй лиганд вытеснить на 50% первый.
Литература
-
Рубин А.Б. Биофизика. Т.2. с.258.
Занятие № 17
ТЕМА: Биофизика процессов гормональной рецепции. Механизмы преобразования сигналов
Цель: Цель занятия
Вопросы для рассмотрения на занятии:
-
Латеральная диффузия. Метод ВФФ.
-
Перколяционная диффузия.
-
Скорости диффузионно-контролируемых реакций. Скорости второго порядка в объеме и на плоскости.
-
Кинетические особенности системы регуляции внутриклеточными посредниками.
Литература
-
Рубин А.Б. Биофизика. Т.2. с.258.
Занятие № 18
ИТОГОВОЕ ЗАНЯТИЕ: Электрокинетические процессы. Гормональная рецепция
Контрольные вопросы:
-
Электрограммы. Задачи электрографии. Электрокардиография. Распространение волн возбуждения.
-
Принцип эквивалентного генератора, схема, требования. Диполь, параметры.
-
Потенциалы электрического поля униполя.
-
Потенциалы электрического поля диполя.
-
Модель Эйнтховена, постулаты. Карта электрических потенциалов на поверхности тела.
-
Дипольный эквивалентный электрический генератор сердца.
-
Электрокардиограмма.
-
Векторэлектрокардиография.
-
Многодипольные эквивалентные электрические генераторы сердца. Модель Миллера и Гезелувитца.
-
Колебательные процессы в природе. Свободные, вынужденные, автоколебания.
-
Механизмы возникновения колебаний на клеточном и внутриклеточном уровнях: автоколебания в биохимических системах.
-
Механизмы возникновения колебаний на клеточном и внутриклеточном уровнях: механизм возникновения колебаний на мембранах.
-
Активная среда, автоволны, их отличие от колебаний механических и электромагнитных волн. Механизм распространения нервного импульса.
-
Распространение автоволн в однородной среде. τ – модель Винера и Роземблюта.
-
Основные свойства автоволн. Однородные, неоднородные среды.
-
Условия возникновения циркуляции автоволн.
-
Трансформация ритма в неоднородной среде.
-
Ревербератор в среде с отверстием.
-
Возникновение ревербераций в неоднородных средах
-
Свойства ревербератора. Условия возникновения мерцательной аритмии.
-
Электрическая активность коры больших полушарий головного мозга. Активность пирамидных нейронов.
-
Электрическая активность коры больших полушарий головного мозга. Импульсный разряд, тормозные и возбуждающие постсинаптические потенциалы.
-
Генерация соматического и дендритного диполя.
-
Зависимость падения потенциала от частоты электрического поля.
-
Характеристики электрического поля коры головного мозга. Альфа, бета гамма сигма и тетта ритмы. Стандартное отклонение.
-
Общие закономерности возникновения внешнего электрического поля. Положительная корелляция активности пирамидных нейронов. Связь между стандартным отклонением дипольного момента нейронов и коры головного мозга.
-
Карты распределения электрического поля мозга.
-
Возникновение электрокинетического потенциала. Структура двойного электрического слоя. Факторы влияющие на строение двойного электрического слоя.
-
Электрофорез. ζ – потенциал эритроцитов, лейкоцитов, бактериальных клеток.
-
Электроосмос.
-
Ионофорез.
-
Потенциалы течения и оседания.
-
Электрический потенциал и агглютинация.
-
Электропроводность клеток и тканей для постоянного тока.
-
Виды поляризации. Электронная поляризация. Макроструктурная поляризация.
-
Виды поляризации. Ионная поляризация. Поверхностная поляризация.
-
Виды поляризации. Дипольная (ориентационная) поляризация. Электролитическая поляризация.
-
Электропроводность клеток и тканей для переменного тока.
-
Применение метода измерения электропроводности в биологических и медицинских исследованиях.
-
Типы рецепторов. Общие закономерности рецепции (доставка – связывание – узнавание – преображение).
-
Одностадийный и двухстадийный механизмы диффузии лигандов.
-
Связывание лиганд с рецептором. Общее выражение для отношения свободных и связанных лигандов.
-
Связывание одного лиганда с одним центром связывания.
-
Связывание одного лиганда с двумя центрами связывания.
-
Связывание конкурирующих лигандов с одним центром связывания.
-
Общий подход при решении задач с порядком выше второго.
-
Латеральная диффузия. Метод ВФФ.
-
Перколяционная диффузия.
-
Скорости диффузионно-контролируемых реакций. Скорости второго порядка в объеме и на плоскости.
-
Кинетические особенности системы регуляции внутриклеточными посредниками.
ЭКЗАМЕНАЦИОННЫЕ ВОПРОСЫ
-
Токсические и аллергические эффекты ультрафиолетового излучения. Дозовые зависимости фототоксических и фотоаллергических процессов.
-
Способы оценки спектров действия ультрафиолетового излучения. Особенности развития эритемы А, В и С.
-
Механизм прямой пигментации кожи. Механизм непрямой пигментации кожи.
-
Фотоканцерогенез. Дозовая зависимость. Синергизм действия ультрафиолета и химических канцерогенов.
-
Фототоксические эффекты ультрафиолета на примере протопорфиринов. Фотореактивирующие ферменты.
-
Реактивация ферментов под действием света. ПУФА-терапия.
-
Общие закономерности работы органов чувств.
-
Теории восприятия вкуса.
-
Теория обоняния.
-
Теории восприятия звука.
-
Строение и функции палочек. Зависимость поглощения света от ориентации молекул. Дихроизм поглощения.
-
Спектры действия скотопического и фотопического зрения, кривая видности.
-
Метод импульсного фотолиза и кинетической спектрофотометрии в исследованиях быстрых фотопревращений зрительных пигментов. Цис-транс–фотоизимеризация ретиналя.
-
Цепь фотопревращений родопсина. Механизм фотопревращения родопсина в батородопсин.
-
Рецепторные потенциалы. Цветовое зрение.
-
Биомеханические модели тканей. Чисто упругий элемент, его свойства. Вязкостный элемент, его свойства.
-
Биомеханические модели тканей. Тело Фойгта. Тело Максвелла.
-
Биомеханические модели тканей. Cочетания упругих и вязкостных элементов.
-
Механические свойства костей.
-
Вязкостные и упругие свойства гладких мышц.
-
Вязкостные и упругие свойства скелетных мышц.
-
Механические процессы в легких. Силы, определяющие упругие свойства легких. Уравнение Лапласа. P-V – диаграммы.
-
Механические процессы в легких. Гистерезис сжатия растяжения. Работа выдоха.
-
Взаимосвязи между механическими и энергетическими параметрами мышечного сокращения в стационарном режиме сокращения. Уравнения Хилла.
-
Дифракционная картина малоуглового рассеяния рентгеновских лучей при замыкании мостиков.
-
Модель Дещеревского. Смысл параметров. Связь параметров модели Дещеревского с параметрами уравнений Хилла.
-
Нестационарные режимы сокращения. Фазы изменения напряжения при одноступеньчатом укорочении. Изменения напряжения при многоступеньчатом укорочении. Фазы сокращения, соответствующие модели Войта.
-
Модели мостика, генерирующего силу. Модель Хаксли и Симмонса. Модель Айзенберга и Хилла.
-
Молекулярный мотор мышцы. Трехмерная структура субфрагмента 1 миозина. Молекулярная модель рабочего цикла мостика.
-
Продольная и тангенциальная деформация стенок сосудов. Уравнение Ламе.
-
Зависимость просвета сосуда от давления. Уравнения деформации при высоком модуле упругости.
-
Динамический модуль упругости. Соотношение между динамическим и статическим модулем упругости (на основании вязко-упругих свойств коллагеново-эластиновых тканей).
-
Молекулярное строение жидкости. Вязкость жидкости, формула Ньютона. Ньютоновские и неньютоновские жидкости.
-
Ламинарное и турбулентное течения. Число Рейнольдса. Закон Пуазейля. Неразрывность струи. Закон Бернулли.
-
Реологические свойства крови. Профиль скорости для ньютоновских жидкостей и для крови. Зависимость вязкости от концентрации частиц. Вязкость при высоких и низких скоростях сдвига. Формула Кессона.
-
Пульсовая волна, её характеристики: амплитуда в различных участках сосудистого русла, скорость распространения, длина волны.
-
Кинетика кровотока. Модель Франка. Аналогия гидравлических и электрических параметров.
-
Резистивная модель периферического кровотока.
-
Фильтрационно-реадсорбционная модель периферического кровотока.
-
Токовая природа внешних электрических полей тканей и органов. Клетки как токовые электрические генераторы.
-
Потенциалы электрического поля униполя. Потенциалы электрического поля диполя.
-
Модель Эйнтховена, постулаты. Карта электрических потенциалов на поверхности тела.
-
Многодипольные эквивалентные электрические генераторы сердца. Модель Миллера и Гезелувитца.
-
Активная среда, автоволны, их отличие от колебаний механических и электромагнитных волн. Механизм распространения нервного импульса.
-
Распространение автоволн в однородной среде. τ – модель Винера и Роземблюта. Основные свойства автоволн. Однородные, неоднородные среды.
-
Условия возникновения циркуляции автоволн. Ревербератор в среде с отверстием.
-
Трансформация ритма в неоднородной среде. Возникновение ревербераций в неоднородных средах.
-
Электропроводность клеток и тканей для постоянного тока. Виды поляризации.
-
Электропроводность клеток и тканей для переменного тока. Импенданс.
-
Электроосмос. Ионофорез.
-
Потенциалы течения и оседания. Электрический потенциал и агглютинация.
-
Применение метода измерения электропроводности в биологических и медицинских исследованиях.
-
Клеточный механизм генеза ЭКГ; определение дипольных моментов различных участков миокарда по данным проведения возбуждения и потенциалов действия его клеток. Компьютерный расчет ЭКГ в норме и при патологических состояниях в различных отведениях.
-
Электрическая активность пирамидных нейронов новой коры как источник генеза электроэнцефалограмм. Импульсная и градуальная электрическая активность пирамидных нейронов новой коры.
-
Формирование токовых двухполюсных и четырехполюсных (квадрупольных) генераторов в пирамидных нейронах. Структура экстраклеточного электрического поля пирамидных нейронов при различных видах электрической активности.
-
Элементы теории случайных процессов (случайных функций) и ее использование для описания генеза ЭЭГ. Общая формула для дисперсии ЭЭГ; коэффициент взаимной попарной корреляции электрической активности нейронов. Значение ориентации пирамидных нейронов в новой коре и синхронизации их электрической активности для генеза ЭЭГ.
-
Механизм формирования физиологического эффекта при воздействии внешних электромагнитных полей различной частоты.
-
Электрокинетические явления. Механизм формирования потенциала макромолекул и клеток. Зависимость потенциала от условий среды.
-
Типы рецепторов. Общие закономерности рецепции (доставка – связывание – узнавание – преобразование сигнала).
-
Одностадийный и двухстадийный механизмы диффузии лигандов.
-
Связывание одного лиганда с одним центром связывания. Уравнение Скетчарда. Связывание одного лиганда с двумя центрами связывания.
-
Конкурентное связывание лигандов с рецептором.
-
Латеральная диффузия в мембранах. Методы изучения.
ОСНОВНОЙ СПИСОК РЕКОМЕНДУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
-
Антонов В.Ф. Биофизика. – М., 1999
-
Владимиров Ю.А. Потапенко А.Я. Физико-химические основы фотобиологических процессов. – М., 1989
-
Рощупкин Д.И., Артюхов В.Г. Основы фотобиофизики. – Воронеж, 1997
-
Владимиров Ю.А. Биофизика. – М., 1983
-
Губанов Н.И. Медицинская биофизика. – М., 1978
-
Рубин А.Б. Биофизика. – М., 2000
-
Рубин А.Б. Лекции по биофизике. – М., 1998
-
Рубин А.Б. Современные методы биофизических исследований. Практикум по биофизике. – М., 1988
-
Скоупс Р. Методы очистки белков. – М., 1985
-
Фрайфелдер Д. Физическая биохимия. – М., 1980
-
Финкельштейн А.В. Введение в физику белка. Курс лекций 1999-2000
-
Волькенштеин М.В. Биофизика. – М., 1988
-
Чанг Р. Физическая химия с приложениями к биологическим системам. – М., 1980
-
Досон Р Элиот Д. Справочник биохимика. – М., 1991
-
Биофизика: Учеб. для студ. биол. спец,. В 2т. : Т.1:Теоретическая биофизика.-1999.-448с.:ил,- Т.2:Биофизика клеточных процеесов.-2000.-467с.:ил.- / А. В. Рубин. - М.: Кн. дом "Университет", 1999-2000.
-
Биофизика: Учеб.для студ. высш. учеб. заведений / Антонов В. Ф., Черныш А. М., Пасечник В. И., Вознесенский С. А., Козлова Е. К. - М: Гуманит.изд.центр ВЛАДОС, 1999. - 200 с.
-
Биофизика: Учебник / Под ред.Ю.А.Владимирова. - М: Медицина, 1983. - 272 с.:ил
-
Медицинская биофизика: Учебник / В. О. Самойлов. - СПб: СпецЛит, 2004. - 496с.:ил.
Дополнительная литература
-
Рубин А.Б. Лекции по биофизике.
-
Фершт Э. Структура и механизм действия ферментов.- М., 1980
-
Волькенштейн М.В. Биофизика.- М., 1988
-
Владимиров Ю.А., Потапенко А.Я. Физико-химические основы фотобиологических процессов. М., Высшая школа, 1989.
-
Рощупкин Д.И., Артюхов В.Г. Основы фотобиофизики.- М., 1997
-
Скоупс Р. Методы очистки белков.– «Мир»: М., 1985.
-
Фрайфелдер Д. Физическая биохимия. – «Мир»: М., 1980.
-
Остерман Л.А. Хроматография белков и нуклеиновых кислот. Наука: М., 1985
-
Каро К., Педли Т., Шротер Р., Сид У. Механика кровообращения. М., Мир, 1981, (раздел V.3, V.5).