- •Введение
- •Литературный обзор
- •Методы анализа
- •Common arc
- •Постановка задачи
- •Эксперименты
- •Выбор программной среды и языка программирования
- •ПО для обработки изображений
- •Общая схема программы
- •Вычисление общей дуги
- •Подготовка данных
- •Поиск общих дуг и построение корреляционного графа
- •Выделение корневой структуры
- •Поиск неизвестных абсолютных ориентаций
- •Итерационное восстановление фазы
- •Визуализация
- •Полученные результаты
- •Заключение
2.Постановка задачи
Врамках данной работы поставлена задача по реализации алгоритма для восстановления пространственной структуры молекулы.
Перед студентом были поставлены следующие задачи:
1.Применить метод Common Arc для определения относительных пространственных ориентаций дифракционных паттернов.
2.Предложить метод для определения самосогласующейся структуры абсолютных пространственных ориентаций дифракционных паттернов.
3.Оценить эффективность предложенного метода и сравнить его с друими известными методами, решающими аналогичную задачу.
4.Предложить методы для параллельной оптимизации всех производимых вычислений.
5.Оценить эффективность предложенных методов оптимизации и прирост вычислительной производительности.
6.Исследовать методы восстановления структуры прямого пространства Phase retrieval и сравнить их по объективным критерям.
7.Реализовать визуализационную среду для полученной структуры в трехмерном пространстве.
11
Критериями успешности выполнения работы являются:
1.Работоспособность алгоритма для обработки стека изображений.
2.Подробный разбор всех этапов работы программного комплекса.
3.Оптимизация алгоритмов и приведение вычислений к распределенной схеме.
4.Проверка алгоритма на смоделированных данных.
5.Визуализация полученной структуры.
6.Схожесть полученной визуализации с изначальными модельными данными.
12