
- •Предисловие
- •Глава 1. Аминокислоты и белки
- •1.1 Общая характеристика
- •1.2 Классификация аминокислот
- •1.3 Модификация аминокислот
- •1.4 Ионизация аминокислот
- •1.5 Пептидная связь
- •1.6 Пептиды и белки
- •1.7 Функции белков
- •1.8 Уровни структурной организации белков
- •А Первичная структура белка
- •Б Вторичная структура белка
- •В Третичная структура белка
- •Д Четвертичная структура белка
- •1.9 Глобулярные и фибриллярные белки
- •А Кератин
- •1.10 Простые и сложные белки
- •1.11 Денатурация и ренатурация белков
- •1.12 Методы работы с белками
- •А Очистка и выделение белка
- •Б Высаливание
- •В Диализ
- •Д Аналитические методы работы с белками
- •Термины
- •Вопросы к семинарскому занятию (1-я часть)
- •Вопросы к семинарскому занятию (2-я часть)
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Аминокислоты
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 2. Ферменты
- •2.1 Общая характеристика
- •2.2 Номенклатура ферментов
- •2.3 Свойства ферментов
- •2.4 Строение фермента
- •2.5 Специфичность ферментов
- •А Модель «ключ-замок»
- •Б Модель индуцированного соответствия
- •2.7 Термодинамика ферментативных реакций
- •2.8 Кинетика ферментативных реакций
- •А Вывод уравнения Михаэлиса-Ментен (по Бергу)
- •В Уравнение Лайнуивера-Берка
- •2.9 Механизмы ферментативного катализа
- •2.10 Влияние факторов среды на скорость протекания ферментативной реакции
- •А Концентрация субстрата
- •2.12 Мультисубстратные реакции
- •А Последовательный механизм
- •Б Механизм «пинг-понг»
- •2.13 Ингибирование ферментов
- •Б Бесконкурентные ингибиторы
- •В Неконкурентные ингибиторы
- •2.14 Кооперативные взаимодействия внутри молекул ферментов
- •А Параллельная модель
- •2.15 Аллостерическая регуляция активности ферментов
- •2.16 Регуляция активности ферментов с помощью ковалентной модификации
- •2.17 Анти-, мульти- и изоферменты
- •2.18 Ферменты в медицине
- •А Энзимодиагностика
- •Термины
- •Вопросы к занятию (1-я часть)
- •Вопросы к занятию (2-я часть)
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 3. Нуклеиновые кислоты
- •3.1 Общая характеристика
- •3.2 Строение нуклеотида
- •3.3 Первичная структура ДНК
- •3.4 Вторичная структура ДНК
- •3.5 Денатурация и ренатурация ДНК
- •3.6 Третичная структура ДНК
- •3.7 Четвертичная структура ДНК
- •3.8 Виды РНК и их функции
- •3.9 Первичная структура РНК
- •3.10 Вторичная структура РНК
- •3.11 Третичная структура РНК
- •3.12 Четвертичная структура РНК
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 4. Репликация
- •4.1 Общая характеристика
- •4.2 Инициация репликации у прокариот
- •4.3 Элонгация репликации у прокариот
- •Б Механизм ферментативной реакции
- •4.4 Терминация репликации у прокариот
- •4.5 Репликация у эукариот
- •4.6 Проблемы репликации
- •Б Проблема высокой точности процесса
- •4.7 Плазмиды
- •В Типы плазмид
- •Д Механизмы репликации кольцевых плазмид
- •4.8 Репликация вирусов
- •Б Репликация генома РНК-вирусов
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 5. Транскрипция
- •5.1 Организация генетической информации
- •5.2 Общая характеристика транскрипции
- •5.3 Гипотеза Жакоба и Моно
- •5.4 Строение РНК-полимераз
- •5.5 Инициация транскрипции у прокариот
- •5.6 Элонгация транскрипции у прокариот
- •5.7 Терминация транскрипции у прокариот
- •5.8 Инициация транскрипции у эукариот
- •5.9 Элонгация транскрипции у эукариот
- •5.10 Терминация транскрипции у эукариот
- •А Кэпирование
- •Б Полиаденилирование
- •В Сплайсинг
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 6. Трансляция
- •6.1 Общая характеристика
- •6.2 Свойства генетического кода
- •6.3 Основные этапы биосинтеза белка
- •А Этап 1. Активация аминокислот
- •Д Этап 5. Фолдинг и посттрансляционная модификация
- •6.4 Рибосомы
- •6.5 Инициация у прокариот
- •6.6 Инициация у эукариот
- •6.7 Элонгация у прокариот
- •6.8 Элонгация у эукариот
- •6.9 Терминация у прокариот
- •6.10 Терминация у эукариот
- •6.11 Гипотеза «качания»
- •6.12 Фолдинг и посттрансляционная модификация белков
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 7. Регуляция биосинтеза белка
- •7.1 Регуляция экспрессии генов у прокариот
- •В Катаболическая репрессия. Лактозный оперон
- •Д Аттенуация. Триптофановый оперон
- •Е «Сильные» и «слабые» промоторы
- •Ж σ-Субъединица РНК-полимеразы
- •7.2 Регуляция экспрессии генов у эукариот
- •Хроматин-перестраивающие комплексы
- •Архитектурные белки высокомобильной группы
- •Ковалентная модификация гистонов
- •Метилирование ДНК
- •В Регуляция с помощью факторов транскрипции
- •7.3 Регуляция на уровне трансляции у про- и эукариот
- •А Дискриминация мРНК
- •Б Трансляционная репрессия
- •7.4 Другие механизмы регуляции у эукариот
- •Б РНК-интерференция
- •Интерференция с помощью малых интерферирующих РНК
- •Интерференция с помощью микроРНК
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- • Регуляция на уровне транскрипции (прокариоты)
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 8. Мутации и репарация
- •8.1 Мутации
- •8.2 Классификация мутаций по вызвавшим их причинам
- •8.3 Классификация мутаций по степени изменений генома
- •8.4 Классическая классификация
- •8.5 Репарация
- •А Прямая репарация
- •8.6 Эксцизионная репарация оснований (BER)
- •8.7 Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER)
- •8.8 Мисметч репарация
- •8.9 Репарация двунитевых разрывов
- •8.10 Негомологичное соединение цепей ДНК при двунитевых разрывах
- •8.11 SOS-репарация (SOS-ответ)
- •8.12 Рекомбинационная репарация
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 9. Иммунитет и антитела
- •9.1 Иммунитет: его виды и элементы
- •9.2 Врожденный (неспецифический) иммунитет
- •В Химические медиаторы врожденного иимунитета
- •Е Классический путь активации комплемента
- •Ж Альтернативный путь активации комплемента
- •З Активация терминальных компонентов комплемента
- •И Как фагоциты отличают чужеродные клетки от «своих»?
- •9.3 Приобретенный (специфический) иммунитет
- •А T-лимфоциты
- •В Антитела
- •Е Вторичный иммунный ответ
- •Ж Активация гуморального иммунитета
- •9.4 Группы крови
- •9.5 Трансфузионные реакции
- •9.6 Правила переливания
- •9.7 Резус-фактор (Rh)
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 10. Биологические мембраны
- •10.1 Строение биомембран
- •В Липиды биомембран
- •10.2 Функции мембран
- •10.3 Мембранный транспорт
- •10.4 Эндо- и экзоцитоз
- •10.5 Трансмембранная передача сигнала
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 11. Энергетический обмен
- •11.1 Энергия в клетке
- •11.2 Дыхательная цепь митохондрий
- •11.3 Сопряжение дыхания и окислительного фосфорилирования
- •11.4 Разобщение дыхания и окислительного фосфорилирования
- •Термины
- •Вопросы к занятию
- •Дополнительные вопросы и ключевые слова
- •Вопросы для самопроверки
- •Глава 12. Введение в метаболизм
- •12.1 Общая характеристика
- •А Метаболические пути
- •Б Метаболиты
- •В Гомеостаз
- •12.2 Функции метаболических путей
- •А Образование энергии
- •Б Катаболизм органических соединений
- •Переваривание
- •Гликолиз
- •Окисление жирных кислот
- •Катаболизм аминокислот
- •В Синтез органических соединений и предшественников макромолекул
- •Глюконеогенез: синтез глюкозы
- •Синтез жирных кислот
- •Синтез гема
- •Креатинфосфат
- •Гликоген
- •Жиры или триацилглицеролы
- •Д Выведение потенциально опасных соединений
- •Цикл мочевины
- •Синтез желчных кислот
- •Катаболизм гема
- •Е Образование регуляторных молекул
- •12.3 Ключевые положения всех метаболических путей
- •А АТФ — донор энергии для синтеза
- •В Эссенциальные органические соединения
- •Д Взаимосвязи метаболических путей
- •Е Нелинейность метаболических путей
- •Ж Локализация метаболических путей в клетке
- •З Тканеспецифичность метаболических путей
- •И Метаболизм при голодании
- •12.4 Интеграция метаболизма
- •Состояние насыщения
- •Состояние голодания
- •Б Интеграция метаболизма в различных физиологических состояниях
- •Состояние голодания
- •Продолжительное голодание
- •Состояние насыщения
- •Физические нагрузки
- •В Регуляция метаболизма
- •Инсулин
- •Глюкагон
- •Адреналин
- •Гидрокортизон
- •Адипоцитокины
- •Рекомендуемая литература
- •Приложение 1. Аминокислоты и белки
- •Классификация аминокислот
- •Приложение 2. Ферменты
- •Строение химотрипсина
- •Приложение 3. Нуклеиновые кислоты
- •Приложение 4. Репликация
- •Приложение 5. Транскрипция
- •Приложение 6. Трансляция
- •Приложение 7. Регуляция биосинтеза белка
- •Приложение 8. Мутации и репарация
- •Приложение 9. Иммунитет и антитела
- •Приложение 10. Биологические мембраны
- •Приложение 11. Энергетический обмен
- •Оглавление

71
Глава 3. Нуклеиновые кислоты
3.1 Общая характеристика
ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) и РНК (рибонуклеиновая кислота) — виды нуклеиновых кислот. ДНК — это молекула, отвечающая за наследственную информацию у про- и эукариотических организмов. Её функция — хранение, передача и реализация наследственной информации. У вирусов эту функцию может выполнять как ДНК, так и РНК. По химическому строению они представляют собой полимеры, состоящие из мономеров — нуклеотидных остатков — связанных между собой 3’– 5’ фосфодиэфирными связями.
3.2 Строение нуклеотида
Нуклеозиды — это органические соединения, состоящие из пятиуглеродного сахара и азотистого основания, связанных с помощью N-гликозидной связи.
Нуклеотиды представляют собой фосфорные эфиры нуклеозидов, т.е. нуклеозиды, содержащие ещё и остаток фосфорной кислоты (см. Рис. 47 ▼). Таким образом,
нуклеотиды состоят из остатка фосфорной кислоты, азотистого основания (аденина,
гуанина, цитозина и тимина, который отсутствует в РНК; вместо тимина в РНК присутствует урацил) и пятиуглеродного сахара (пентозы) — дезоксирибозы (в ДНК) или рибозы (в РНК) (см. Рис. 48 ▼):
|
Таблица 7 |
|
Номенклатура оснований, нуклеозидов и нуклеотидов |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Азотистое |
|
Рибонуклеозид |
|
Рибонуклеотид |
|
|
основание |
|
(основание + рибоза) |
|
(5’-монофосфат) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Аденин |
|
Аденозин |
|
Аденозин 5’-монофосфат (АМФ); |
|
|
|
|
аденилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Гуанин |
|
Гуанозин |
|
Гуанозин 5’-монофосфат (ГМФ); |
|
|
|
|
гуанилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Цитозин |
|
Цитидин |
|
Цитидин 5’-монофосфат (ЦМФ); |
|
|
|
|
цитидилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Урацил |
|
Уридин |
|
Уридин 5’-монофосфат (УМФ); |
|
|
|
|
уридилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Азотистое |
|
Дезоксирибонуклеозид |
|
Дезоксирибонуклеотид |
|
|
основание |
|
(основание + дезоксирибоза) |
|
(5’-монофосфат) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Аденин |
|
Аденозин |
|
Дезоксиаденозин 5’-монофосфат (АМФ); |
|
|
|
|
дезоксиаденилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Гуанин |
|
Гуанозин |
|
Дезоксигуанозин 5’-монофосфат (ГМФ); |
|
|
|
|
дезоксигуанилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Цитозин |
|
Цитидин |
|
Дезоксицитидин 5’-монофосфат (ЦМФ); |
|
|
|
|
дезоксицитидилат |
|
||
|
|
|
|
|
|

72 Глава 3 Нуклеиновые кислоты
|
Таблица 7 |
|
Номенклатура оснований, нуклеозидов и нуклеотидов |
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
Азотистое |
|
Рибонуклеозид |
|
Рибонуклеотид |
|
|
основание |
|
(основание + рибоза) |
|
(5’-монофосфат) |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Тимин |
|
Тимидин |
|
Дезокситимидин 5’-монофосфат (ТМФ); |
|
|
|
|
дезокситимидилат или тимидилат |
|
||
|
|
|
|
|
|
Рис. 47. Структурные формулы дезоксирибонуклеотидов.
Рис. 48. Структурные формулы двух пентоз, входящих в состав нуклеиновых кислот: рибоза содержится в рибонуклеотидах (РНК), а дезоксирибоза — в дезоксирибонуклеотидах (ДНК).

Первичная структура ДНК 73
3.3Первичная структура ДНК
В1865 году Фредерик Мишер впервые выделил ДНК, полученную из гноя. Поначалу учёные решили, что ДНК является клеточной формой запасания неорганического фосфата, что и определило низкий интерес к ней. Однако в 1953 году Фрэнсис Крик и Джеймс Уотсон опубликовали в журнале Nature результаты своей работы над структурой ДНК: на основании правил Чаргаффа и рентгенограммы Розалинды Франклин и Мориса Уилкинса они построили двухспиральную модель ДНК. Спустя 9 лет Крик и его соавторы заявили, что ДНК играет ключевую роль в хранении и передаче наследственной информации, а также предложили свойства генетического кода.
Вначале 20 века были определены азотистые основания, входящие в состав ДНК. Их разделили на 2 группы по химической структуре: пуриновые (аденин и гуанин) и пиримидиновые (цитозин и тимин).
Первичная структура ДНК — это последовательность нуклеотидов в полинуклеотидной цепи, кодирующая наследственную информацию. ДНК имеет сахарофосфатный остов, с которым связаны азотистые основания: аденин (А), цитозин (Ц), гуанин (Г), тимин (Т). Нуклеотиды связаны между собой с помощью фосфодиэфирных связей. В их образовании участвуют 3’-гидроксильные группы пентоз одного нуклеотида и 5’-фосфатные группы другого (см. Рис. 49 ▼).
У цепи ДНК есть 5’-конец (свободный остаток фосфорной кислоты) и 3’-конец (гидроксильная группа, связанная с 3’-атомом углерода дезоксирибозы).
Последовательность нуклеотидов в ДНК обычно записывается с помощью букв, обозначающих азотистые основания. Например: 5’ -А-Ц-Т-Г- 3’.
73

74 |
Глава 3 |
Нуклеиновые кислоты |
Рис. 49. Первичная структура ДНК: остатки нуклеотидов, связанные между собой фос-
фодиэфирными связями.