- •Методическая разработка
- •2 Курса фпсзс по биологической химии
- •Тема: Белки 5. Биосинтез белка. Регуляция биосинтеза. Патология белкового обмена.
- •1. Принципиальное отличие биосинтеза белка от биосинтеза других молекул. Общая схема биосинтеза белка - необходимые предпосылки:
- •1.2. Пластический поток - механизм активации аминокислот, строение тРнк, характеристика арс-аз - кодаз.
- •1.3. Энергетический поток. Роль макроэргов атф, гтф и др. В биосинтезе белка.
- •2.1. Инициация, факторы инициации. Образование инициаторного комплекса.
- •2.2. Элонгация, факторы элонгации.
- •2.3. Терминация.
- •3. Виды и механизмы посттрансляционной модификации (процессинга) пробелков:
- •3.1. Химическая модификация (виды, примеры);
- •3.2. Ограниченный протеолиз;
- •3.3. Самосборка белка.
- •4.1. Избирательная транскрипция.
- •4.2. Альтернативный сплайсинг иРнк.
- •4.3. Модификация гистоновых и негистоновых белков.
- •5. Строение иммуноглобулинов (Ig). Характеристика основных классов Ig - (IgA, IgD, IgE, IgG, IgM). Регуляция экспрессии генов Ig и причины их разнообразия.
5. Строение иммуноглобулинов (Ig). Характеристика основных классов Ig - (IgA, IgD, IgE, IgG, IgM). Регуляция экспрессии генов Ig и причины их разнообразия.
Все молекулы иммуноглобулинов состоят из 2 идентичных легких (L) цепей (молекулярная масса 23000) и 2 идентичных тяжелых (H) цепей (молекулярная масса 53,000-75,000) связанных в форме тетрамера (L2H2) дисульфидными мостиками.
Строение иммуноглобулинов (Ig).
В каждой цепи можно выделить специфические домены, или области, характеризующиеся структурными и функциональными особенностями. Аминокислотная последовательность С-концевого отдела цепи легкой цепи (108-214 аминокислотный остаток) постоянная (константная) –СL-область. N-концевой отдел легких цепей (1-107 –й аминокислотный остаток) вариабельная (меняющаяся ) VL-область цепи. Одна четверть тяжелых (H) цепей (около 120 аминокислот) со стороны N -концевой аминокислоты названа переменной (вариабельной) областью (VH), а остальная часть тяжелой цепи (свыше 300 аминокислот) состоит из нескольких константных областей (CH1, CH2, CH3). N-концевые вариабельные участки легких (VL) и тяжелых(VH) цепей молекулы иммуноглобулина формируют домен молекулы, который связывает специфический антиген – активный центр антитела.
Характеристика основных классов Ig - (IgA, IgD, IgE, IgG, IgM).
Исследования аминокислотного состава СН областей тяжелых цепей у людей позволило выделить пять типов тяжелых цепей обозначенных -, -, - ,- и , имеющих молекулярную массу от 50 000 до 70 000. Тип Н цепей определяет класс иммуноглобулина и его функциональные особенности. Выделяют 5 классов иммуноглобулинов: IgG, IgA, IgM, IgD и IgЕ. Структурные особенности СН областей тяжелых цепей позволяет в каждом классе выделить отдельные подклассы иммуноглобулинов.
Регуляция экспрессии генов Ig и причины их разнообразия.
Каждый человек способен к образованию антител, направленных против возможно более миллиона различных антигенов. Порождение такого огромного разнообразия антител зависит от комбинаций различных структурных генов, способствующих формированию каждой цепочки иммуноглобулина и высокой частоты соматических мутационных событий в перестраиваемых генах VН и VL.
Рассмотрим этот вопрос на примере рекомбинации генов, кодирующих тяжелые цепи. В ДНК лимфоцитов содержаться гены константных областей пяти классов и гены вариабельных областей трех типов: 300-400 разных генов V, около 20 разных генов D и 4 разных гена J. Эти группы генов расположены в разных участках ДНК. В результате транспозиции происходит объединение трех разных генов V, D и J в полный ген вариабельной области цепи Н. При этом выбор каждого гена из группы соответствующих генов происходит случайно: любой ген Vi из сотен генов V может оказаться объединенным с любыми генами Di и Ji из групп соответственно D и J. Далее, также путем транспозиции, полный ген вариабельной области может объединиться с любым из генов константной области, в результате получается полный ген соответствующей Н-цепи. Общее число вариантов полного гена Н-цепи равно примерно 4000. Сходным путем образуются и гены легких цепей; их тоже может быть около 4000 вариантов. При образовании иммуноглобулинов цепи Н и L могут соединяться в разных сочетаниях, поэтому общее число разных иммуноглобулинов достигает порядка 107 (4000*4000=1,6*107).
Поскольку распределение генов при транспозиции имеет случайный характер, в разных лимфоцитах образуются разные сочетания генов V, D, J и С в полном гене иммуноглобулиновой цепи, т.е. происходит дифференциация лимфоцитов и образование клонов, различающихся генотипически. Соответственно, они различаются и фенотипически – по способности синтезировать антитела определенной специфичности.
Регуляция экспрессии генов Ig:
Для многих регуляторных белков биосинтез ограничен клетками строго определенных типов. Например, октамерсвязывающий белок Oct-2 , участвующий в активации экспрессии генов иммуноглобулинов в B-лимфоцитах, обнаруживают только в клетках, синтезирующих иммуноглобулины. Экспрессия рекомбинантного гена, кодирующего Oct-2, в клетках HeLa приводит к активации экспрессии генов иммуноглобулинов на уровне транскрипции. Таким образом, для осуществления тканеспецифической регуляции экспрессии генов в этом примере необходим тканеспецифический синтез белка-активатора транскрипции.
6. Патология белкового обмена. Нарушение переваривания и всасывания, последствия ахилии. Белковое голодание, квашиоркор, их последствия и основные проявления. Биосинтез дефектных белков. Первично - и вторично-дефектные белки. Относительно патологические белки. Поврежденные белки.
Патология белкового обмена.
В организме практически нет депо белков. Источником аминокислот для их синтеза служат компоненты пищи. При нарушении переваривания и всасывания белков развивается алиментарная белковая недостаточность. Нарушения белкового обмена возможны на всех этапах, начиная с всасывания и заканчивая выведением из организма конечных продуктов обмена. Кроме того, при повреждении генетического аппарата изменяется синтез белков или синтезируются белки с измененной структурой.
Нарушение переваривания и всасывания, последствия ахилии.
При заболеваниях пищевода и кишечника (рак пищевода, непроходимость пищевода или кишечника и т.д.) возникает проблема введения белков в организм. Введение белков парэнтерально, т.е. минуя желудочно-кишечный тракт, вызывает сенсибилизацию организма, а при повторном введении может развиться анафилаксия. Для предотвращения указанных реакций принято вводить парэнтерально (минуя ЖКТ) смеси аминокислот, которые не обладают специфичностью и их можно долго применять без значительных осложнений.
Кроме того проблемы с пищеварением белков могут возникнуть на стадии переваривания в желудке из-за уменьшения секреции либо отсутствия секреции соляной кислоты. Ахилия (Achylia) - отсутствие секреции HCl. Данный термин применяется обычно по отношению к желудку, не вырабатывающему желудочный сок - желудочная ахилия (achylia gastrica), вследствие атрофии его слизистой оболочки. Отсутствие HCl может обуславливать процессы бактериального гниения в кишечнике, в результате чего иногда возникает диарея.
Из-за хронического энтерита (хроническое воспалительное заболевание тонкой кишки) развивается гипопротеинемия. Ее наличие объясняется не только нарушением гидролиза белков и всасывания аминокислот кишечной стенкой, но и повышенной экссудацией белков, в основном альбуминов, в просвет кишки при ее воспалительных поражениях.
Белковое голодание, квашиоркор, их последствия и основные проявления.
В настоящее время идентифицировано более 200 различных белков в плазме клеток крови, биологических жидкостей и тканей. Это позволяет понять, почему дефицит белка дает многочисленные дефекты.
Следствием белкового голодания является белковая недостаточность, которая может быть следствием не только дефицита белка, но и ряда заболевания, на фоне достаточного поступления белка с пищей. Белковая недостаточность развивается как при наличии, и при частичном голодании, а также при приеме однообразного белкового питания, когда в диете преобладают белки растительного происхождения. Результатом этого является развитие гипоальбуминемии, нарушение осмотического давления (вследствие дефицита альбуминов, которые связывают воду). Осмотическое давление при этом падает, и жидкость уходит в ткани, вызывая отеки. Такой формой пищевой дистрофии при белковой патологии является квашиоркор. Заболевание распространенно в развивающихся странах. Причина квашиоркора - дефицит белков в пище. Новорожденный ребенок до 3-х летнего возраста вскармливается только молоком матери, потом потребляет низкобелковую диету (вода, рис, фрукты). В результате уровень поступающего в организм белка снижен, снижается соответственно уровень и активность протеаз, вследствии этого белок плохо усваивается. Белки необходимы организму как главные пластические элементы, поэтому при квашиоркоре наблюдается остановка роста, атония мышц, нарушения репарации и регенерации почки, почка имеет вид красной корочки, как после ожога.
Т.к. белки необходимы для образования транспортных форм липидов (ЛП), то их дефицит приводит к дефициту синтеза ЛП и нейтральный жир (ТГ) накапливается в ткани, вызывая жировую дегенерацию.
Белок необходим для синтеза гемоглобина, и дефицит белка проявляется в виде анемии.
Белки необходимы для иммунологической защиты, их дефицит приводит к развитию вторичного иммунодефицита.
Одним из более ранних нарушений азотистого обмена при белковой недостаточности является резкое снижение интенсивности дезаминирования, трансаминирования и биосинтеза аминокислот, а также биосинтеза мочевины. Эти нарушения обусловлены недостаточным синтезом белковой части ферментов, катализирующих эти реакции. Исключение составляет аргиназа, активность которой не нарушается. Следствием этих нарушений является увеличение концентрации а/к в крови (до 10-25%, в норме 1-2%) и уменьшении концентрации мочевины.
При белковой недостаточности отмечены также специфические изменения обмена отдельных а/к. В частности нарушения обмена ТРП (триптофана) сопровождается накоплением ксантуреновой кислоты, которая оказывает токсическое действие на бета-клетки островков Лангерганса pancreas, являясь тем самым одним из этиологических факторов диабета.
Биосинтез дефектных белков.
Измененный синтез белков может быть результатом
нарушений в работе белоксинтезирующей системы – аппарата трансляции или посттрансляционной модификации молекул. С увеличением частоты ошибок трансляции в процессе жизни связывают старение организма.
дефекта регуляции; на клеточном уровне – это воздействие метаболитов, на уровне организма – гормоны и нервная система.
Первично - и вторично-дефектные белки.
Все патологические белки делятся на 2 группы.
Первично – патологические синтезированы за счет дефектного генома:
фенилкетонурия;
болезнь Леха-Нихана;
серповидно-клеточная анемия (нарушение синтеза Hb)
болезнь Вильсона-Коновалова (проявляется в 10-12 лет; причина - отсутствие церулоплазмина-Cu-переносящего белка; Cu накапливается в печени, роговице, почках, узлах нервной системы, вызывая дегенерацию).
Вторично – патологические: возникают благодаря постороннему воздействию:
введение антибиотиков на этапе трансляции белка;
нарушение процессинга коллагена при гиповитаминозе С;
извращение процессинга при воздействии токсических веществ (например, возникновение гликозилированного Hb при сахарном диабете обусловлено тем, что альдегидная группа глюкозы взаимодействует с аминогруппой глобина).
Кроме дефектов белков - ферментов могут возникать дефекты белков неферментной природы: индивидуальных белков плазмы ( альбуминов, ЛП), белков системы свертывания крови, Hb, Ig, белков комплемента, калликреин-кининовой системы.
4. ПРАКТИЧЕСКАЯ ЧАСТЬ ЗАНЯТИЯ
Лабораторная работа:
№1. Определение общего белка сыворотки крови рефрактометрическим методом.
Грицук А.И. Практическая биохимия: Учебное пособие. ч.1. – Гомель, 2002. – С. 88–93.
5. ХОД ЗАНЯТИЯ.
5.1 Проведение устного теоретического опроса.
5.2 Проведение письменного контроля по теоретическим знаниям.
5.3 Выполнение лабораторной работы.
5.4 Выводы по лабораторной работе. Подведение итогов.
Лабораторная работа №1: Определение общего белка сыворотки крови рефрактометрическим методом.
ПРИНЦИП МЕТОДА: В основе рефрактометрии лежит различная преломляющая способность жидких сред, количественно выражаемая коэффициентом преломления (отношение синуса угла падения () к синусу угла преломления ():
Sin
n = ,
Sin
который в сыворотке крови обусловлен в основном количеством, качеством растворенного белка и температурой. Влияние других компонентам сыворотки крови на коэффициент преломления значительно меньше. Определение коэффициента преломления проводят с помощью рефрактометров.
Содержание белка (%) в плазме (сыворотке) крови
Коэффициент преломления |
Содержание белка (%) |
Коэффициент преломления |
Содержание белка (%) |
1,33705 |
0,63 |
1,34575 |
3,68 |
1,33743 |
0,86 |
1,34612 |
5,90 |
1,33781 |
1,08 |
1,34650 |
6,12 |
1,33820 |
1,30 |
1,34687 |
6,34 |
1,33858 |
1,52 |
1,34724 |
6,55 |
1,33896 |
1,74 |
1,34761 |
6,77 |
1,33934 |
1,96 |
1,34798 |
6,98 |
1,33972 |
2,18 |
1,34836 |
7,20 |
1,34000 |
2,40 |
1,34873 |
7,42 |
1,34048 |
2,62 |
1,34910 |
7,63 |
1,34086 |
2,84 |
1,34947 |
7,85 |
1,34124 |
3,06 |
1,34984 |
8,06 |
1,34162 |
3,28 |
1,35021 |
8,28 |
1,34199 |
3,50 |
1,35058 |
8,49 |
1,34237 |
3,72 |
1,35095 |
8,71 |
1,34275 |
3,94 |
1,35132 |
8,92 |
1,34313 |
4,16 |
1,35169 |
9,14 |
1,34350 |
4,38 |
1,35205 |
9,35 |
1,34388 |
4,60 |
1,35242 |
9,57 |
1,3442 |
4,81 |
1,35279 |
9,78 |
1,34463 |
5,03 |
1,35316 |
9,99 |
1,34500 |
5,25 |
1,35352 |
10,20 |
1,34537 |
5,47 |
1,35388 |
10,41 |
РАСЧЕТ: Определив показатель преломления по таблице, вычисляют процент содержания белка в сыворотке крови; для перехода к единицам системы СИ (г/л) результат следует умножить на 10.
НОРМА: содержание общего белка в плазме (сыворотке) крови здорового человека составляет 6.5-8.5 % или 65-85 г/л.
6. ВОПРОСЫ ДЛЯ САМОКОНТРОЛЯ ЗНАНИЙ
1 Активация аминокислот происходит с помощью фермента:
а) лигазы; б) фосфатазы; в) РНК-азы; г) пептидазы; д) синтетазы; е) лиазы?
2 Аминокислоты в белках ковалентно связаны:
а) силами Ван-дер-Ваальса; |
г) фосфоэфирными связями; |
б) пептидными связями; |
д) водородными связями; |
в) гидрофобными связями; |
е) координационными связями? |
3 Какие белки узнают терминирующие кодоны мРНК:
а) факторы освобождения; |
в) факторы элонгации; |
б) ферменты рестрикции; |
г) CAP-связанные белки? |
4 Характерной чертой рибосом эукариот является:
а) наличие двух субъединиц – 30 и 50 S; |
г) присутствие ДНК; |
б) наличие двух субъединиц – 40 и 60 S; |
д) наличие фосфолипидов; |
в) высокая АТФазная активность; |
е) наличие гистонов? |
5 Точковая мутация мРНК будет наиболее вероятной причиной:
а) распада мРНК; б) инактивации рибосом; в) изменения первичной структуры белка; г) незавершенной транскрипции; д) подавления сплайсинга?
6 Внутривенное введение радиоактивной меченой аминокислоты взрослому животному приводит:
а) к инкорпорации эквивалентных количеств меченой аминокислоты во все белки организма; б) инкорпорации различных количеств меченой аминокислоты в отдельные белки организма; в) меченая аминокислота не инкорпорируется в белок; г) быстрой и полной экскреции меченой аминокислоты; д) вытеснению и экскреции равного количества немеченной аминокислоты?
7 Белки синтезируются:
а) от N-конца к С-концу; |
г) с матрицы иРНК; |
б) от С-конца к N-концу; |
д) от 3’-конца к 5’-концу РНК; |
в) с матрицы рРНК; |
е) от 5’-конца к 3’-концу РНК? |
8 Основные каталитические функции в рибосоме осуществляют:
а) факторы инициации; б) факторы элонгации; в) факторы терминации; г) р-РНК; д) синтетазы; е) рибосомальные белки?
9 Каждая рибосома в полисоме:
а) движется по мРНК в направлении 3` 5`; б) движется по мРНК в направлении 5` 3`; в) синтезирует многие полипептидные цепи; г) синтезирует только одну полипептидную цепь; д) диссоциирует по окончании синтеза; е) подавляется актиномицином D?
10 Укажите основной фермент, ответственный за реализацию информации генома ретровирусов:
а) ДНК-лигаза; б) ДНК-полимераза; в) обратная транскриптаза (ревертаза); г) РНК-полимеразы; д) АРС-аза?
11 Какая из нуклеиновых кислот в животной клетке отличается большей стабильностью:
а) мРНК; б) рРНК; в) ДНК; г) мяРНК; д) предшественники тРНК; е) гяРНК?
12 Денатурированная ДНК лимфоцитов человека не будет гибридизироваться:
а) с рРНК лимфоцитов; |
в) денатурированной ДНК митохондрий; |
б) тРНК почки; |
г) мРНК мозга? |
13 Дифтерийный токсин подавляет биосинтез белка на этапе и путем:
а) инициации; б) элонгации; в) терминации; г) процессинга иРНК; д) сплайсинга иРНК; е) рибозилирования ФЭ-2; ж) ограниченного протеолиза; з) аденилирования белка; и) метилирования белка; к) фосфорилирования белка?
7. ЛИТЕРАТУРА
Основная
Материал лекций.
Биологическая химия: учебник/ В.К Кухта., Т.С.Морозкина, и др ; под ред. А.Д.Тагановича.- Минск: Асар, М.: Издательство БИНОМ, 2008. С. 387-418
Березов Т. Т., Коровкин Б. Ф. Биологическая химия. М.: Медицина, 1990. С. 354–364; 1998. С. 509–544.
Николаев А. Я. Биологическая химия. М.: Высшая школа, 1989. С. 92–156.
Дополнительная
Марри Р. и др. Биохимия человека. М.: Мир, 1993. Т. 2, С. 94–126, 321–325.
Филиппович Ю. Б. Основы биохимии. М.: Высшая школа, 1993. С. 272–297.
Албертс Б. и др. Молекулярная биология клетки. М.: Мир, 1994. Т. 2. С. 176–253.
Ленинджер А. Основы биохимии. М.: Мир, 1985. Т. 3. С. 926–994.
Троицкий В. Г. Дефектные белки – постсинтетическая модификация. Киев: Наукова думка, 1991. С. 48–226.
Методическая разработка составлена асс. каф. биохимии Громыко М.В.