Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
Скачиваний:
5
Добавлен:
06.06.2015
Размер:
1.38 Mб
Скачать

Глава 7

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Структура гена

Рисунок 7.62

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

à

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

1

3

5

7 9 11

2

4 6

8

10 12

 

13

14

IES 1

IES2

 

3 4 5 6

 

7 8 9

IES 10 IES 11 IES 12

 

 

IES 13

 

IES

IES

 

IES IES

 

 

 

IES IES

 

 

IES

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MDS 14

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3’ TAS

 

 

 

IES 13

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

IES 7

 

 

 

MDS 4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MDS 3 IES 2

IES 8

 

MDS 13

 

 

 

 

MDS 2

 

IES 1MDS 1

 

 

 

 

 

 

 

IES 12

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MDS 5

MDS 6

MDS 12

 

IES 6

 

 

 

 

 

 

IES 3

 

 

 

 

 

 

 

5’ TAS

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MDS 11

 

 

 

 

 

MDS 7

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

IES 4

IES 9

 

 

 

 

IES 11

 

IES 5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MDS 9

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

MDS 8

 

 

 

 

 

MDS 10

 

IES 10

 

 

 

 

IES 1 - IES 11

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(369 ï.í.)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

IES 12 (37 ï.í.)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

IES 13 (58 ï.í.)

â

1

 

2

3 4

5

67

8

9 11

 

 

13

 

14

 

 

 

 

 

 

 

 

1012

 

 

 

 

 

ã

1

 

2

3 4

5

67

8

9 11

 

 

13

 

14

 

 

 

 

 

 

 

 

1012

 

 

 

 

 

теломера ATG

 

 

кодирующий сегмент (1539 п.н.)

TGA

теломера

Схема “созревания” гена aТВР у Oxitricha nova. а - микронуклеарный вариант гена, содержащего

14 экзоноподобных элементов (последовательностей, предназначенных для макронуклеуса -

MDS) и 13 интроноподобных (внутренних элиминируемых последовательностей - IES). б -

Возможная картина образования ДНК-петель для считывания последовательных ППМ; в -

последовательность ППМ после созревания макронуклеуса; г - зрелый ген с добавленными

теломерами (Из: Prescott, 1992).

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3.РНК-полимеразаосвобождаетсяотДНК.

 

одинаковыемутациивозникаютводинаковых

Литература к разделу 7.7.6.

 

 

генах.

 

 

 

 

 

Молекулярно-генетические данные

Russell, P.J. Genetics Fifth edition. Addison Wesley

 

свидетельствуют о значительной гомологии

Longman,Ins,MenloPark,California, 388,1998.

генов домашнего хозяйства (гены гистонов,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

рибосомныхРНК),белковтепловогошока.

7.8. Гомология генов

 

 

 

 

 

 

Вомногихслучаяхгомологиейобладают

Огомологиигеновсвидетельствуетзакон

 

отдельные домены, например гомеодомен,

гомологических рядов Н.И. Вавилова:

 

хромодоменит.д.

192

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Структура гена

 

 

 

 

Глава 7

Рисунок 7.63

 

Рисунок 7.64

 

 

 

 

R

R R

B S

R

 

Ген куколочного

 

 

 

sina

 

кутикулярного белка

 

 

 

47 ò.ï.í.

0.9 ò.ï.í.

 

 

 

Rh4

 

 

 

 

3’ ïîëè-À

5’

Расположение гена sina в интроне

3’ ïîëè-À

17 ò.ï.í.

гена Rh4 дрозофилы. Вверху -

 

 

Экзон-интронная карта гена Gart и расположенного в его

рестрикционная карта района (Из:

интроне гена куколочного кутикулярного белка дрозофилы

Carthew, Rubin, 1990, в кн. Жимулев,

(Из: Henikoff et al., 1986, в кн.: Жимулев, 1994, стр. 147).

1994, ñòð. 148).

 

 

7.9. Псевдогены

Иногда в геномах встречаются т.н. псевдогены. Они имеют все необходимые черты генов, т.е. полный набор экзонов, характерных для каких-то генов, поли-А/Т хвостыикороткиепрямыеповторыдлиной1020 п.н. (как у мобильных элементов) в ДНК мишени, однако остаются функционально неактивными.Существуют2типапсевдогенов: 1.Традиционныепсевдогены(семействогенов глобинов–см.раздел7.10).Онивозникаютза счетдупликацийопределенныхгенов,которые затем выключаются в результате делеций и точковых мутаций. 2. Процессированные

псевдогены.Унихнетинтронов,ноестьостатки поли-А-тракта. По флангам псевдогена чаще всего находят прямые повторы. Этот вид псевдогенов часто встречается у млекопитающих,иредко–удрожжей.

У дрозофилы псевдогены встречаются редко,чащеэтогенытранспортныхилималых ядерных РНК (тРНК, snRNA). Еще один известный пример - псевдоген личиночного кутикулярного белка и псевдоген Adh у D. mulleri,онисохраняютсвоиинтроны.Пример процессированного псевдогена (т.е. без интронов)описандлягенаAdhуD.teissieriиD. yakuba.

Рисунок 7.65

 

 

 

 

 

 

 

Литература к

 

à

 

 

 

 

 

 

 

 

разделу 7.9.

 

á

 

0.9

 

 

 

 

 

1 2

Ashburner M. Drosophila. A

â

-100

-90

-80

 

-70

 

-60

-50

laboratoryhandbook.ColdSpring

 

 

 

Harbor. Cold Spring Harbor

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

LaboratoryPress,86-100,1989.

 

 

 

Notch

Sgs-4

sam

 

 

 

Lewin B. Genes V. Oxford

ã

 

 

 

 

 

 

 

 

University Press. Oxford, New

 

 

 

 

 

 

 

 

York,Tokyo, 1051-1055,1994.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

6 7 8 910.12 .2 3 4 5 6 1 2 3 4 5

 

 

7.10. Расположение

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

генов в

 

â

-50

-40

0 20

 

30

 

40

50

хромосомах

 

á

 

 

 

 

 

 

 

 

эукариот

 

1 2 Pig-1 Sgs-4

2.7 indnc

3

4

5 67

8-13

 

 

 

 

 

 

Ó

эукариот

íå

à

ATG

 

 

 

 

 

Stop

 

 

 

 

 

 

 

 

 

распространен оперонный

 

 

 

 

ATG

 

 

Stop

 

 

 

 

 

 

 

 

типрасположениягенов,т.е.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

sam

 

 

 

объединениевблокигенов,

 

 

 

 

 

 

 

 

находящихся под общим

Структура гена dnc у D. melanogaster (Из: Davis, Dauwalder, 1990, в

кн. Жимулев, 1994, стр. 149); а - карта интронов и экзонов гена

контролем.

Ãåíû,

dunce; б - карта других генов, расположенных в интронах гена

контролирующие даже

dunce; в - физическая карта ДНК в районе хромосомы 3С; г -

ï î ñ ë å ä î â à ò å ë ü í û å

участок хромосомы 3С6 - 3Е5.

 

 

 

 

 

биохимические реакции,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

193

Глава 7

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Структура гена

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Рисунок 7.66

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Матрица

5’

CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTTTTTGAACAAAA 3’

(ÄÍÊ)

3’

GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAAAAAACTTGTTTT 5’

Транскрипт

5’ CCCAGCCCGCCUAAUGAGCGGGCUUUUUUUU-OH 3’

(ÐÍÊ)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

U

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Мутации

U

 

 

 

 

 

 

 

 

 

G

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C

A

 

 

 

 

Мутации

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A, U

 

 

 

 

 

C-G

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Транскрипт

 

A

 

 

 

 

 

G-C

 

 

 

A

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

U

 

 

 

 

 

C-G

 

 

 

 

 

 

A, U, C

 

 

 

образует

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C-G

 

 

 

 

 

 

A, U

 

 

 

терминирующую

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C-G

 

 

 

 

 

 

шпильку

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

G-C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5’ CCCA-UUUUUUUU-OH 3’

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Делеция

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

G

 

Последовательность нуклеотидов в ρ -независимом терминаторе транскрипции и структура терминируемой РНК. Мутации в затемненных участках полностью предотвращают терминацию (Из: Russell, 1998, p. 388).

расположенывразличныхрайонаххромосомы

èдажевразличныххромосомах.Например,у дрозофилыгены,кодирующиеферменты,под контролемкоторыхпроисходитпревращение триптофана в бурый глазной пигмент, разбросаны во множестве участков генома.

Вместе с тем, известны некоторые примеры кластерной организации генов. У человека известно несколько типов гемоглобинов. Каждыйиз них синтезируется

в определенном органе и на определенной стадии развития. Например, гемоглобины ζ и ε синтезируются в клетках эмбрионального желточногомешканараннихэтапахразвития.

В это время молекула белка состоит из двух цепей ζ -подобного α -гемоглобина и двух цепей ε (β− подобный). К концу третьего месяца развития синтез гемоглобина этого типа заканчивается и начинается синтез фетального (утробного) гемоглобина в

клетках печени и селезенки. Фетальный гемоглобин состоит из двух α -полипептидов

èäâóõ γ (β− подобных): двух γ A или двух γ G. Во время постэмбрионального развития

гемоглобинсинтезируетсявклеткахкостного мозга и состоит из α , β полипептидов и некоторого количества β -подобного δ полипептидов. Большая часть гемоглобина в

крови взрослого человека состоит из тетрамера α 2β 2 (Hb-A).

В геноме человека гены гемоглобина расположеныдвумякластерами:вхромосоме 16 расположены все α− подобные гены, в то времякаквсеβ− подобныегенырасположены в хромосоме 11 (Рис. 7.67). В каждом кластере есть псевдогены.

Интересно,чтогенырасположенывтом порядке, вдоль по хромосоме, в какой очередности они включаются в работу в ходе онтогенеза. Однако, каких-либо данных, свидетельствующих об их функциональной сцепленности или общем контроле по принципуопероннойорганизации,неполучено. Тотфакт,чтоэтигеныфункционируютвразных тканях и на разных этапах онтогенеза, скорее свидетельствует о независимом контроле экспрессииэтихгенов.

Гены транспортной РНК у дрозофилы расположенывомногихрайонахпо1-2генав каждом. Однако, в одном из районов 16 генов занимаютнебольшойучастокдлиной50т.п.н. (Рис. 7.68), хотя их транскрипция не контролируетсяоднимпромотором.

Организациягенов18Sи28SрРНКувсех эукариот в общих чертах одинаковая. Последовательности генов 18S, 5.8S и 28S рРНК,лидернойпоследовательности,атакже

194

Структура гена

 

 

 

 

Глава 7

 

 

транскрибируемого и нетранскрибируемого

спейсера, не кодирующая 5.8S РНК,

спейсеровсоставляютединицудлинойоколо11

деградируютдонуклеотидов.

т.п.н.(Рис.7.69),котораяповторенанесколько

Транскрибируемыеединицыразделяются

сотраз.Какправило,числокопийварьируетв

участком

ÄÍÊ,

называемым

пределахот100до1000:удрожжей-140единиц

нетранскрибируемым спейсером (НТС). Его

повторенности, у дрозофилы - 200-250, ó

длинаварьируетвширокихпределах:от1750

человека- 1250. Лидернаяпоследовательность

п.н. у дрожжей до 30000 п.н. у мыши, у

расположена перед геном 18S, и с не¸

дрозофилы он имеет длину 3750-6450 п.н. В

начинается транскрипция. Каждая единица

самомНТСобнаружиливнутренниеповторы,

повтора генов рРНК считывается РНК-

которые, в частности у дрозофилы, играют

полимеразойIотлидернойпоследовательности

существенную

ðîëü

в мейотическом

доконцагена28SрРНКввидеодногоцистрона.

спариванииХиYхромосом.Существеннаячасть

Участок ДНК между генами 18S и 28S

генов28SрРНКсодержитинсерции(Рис.7.69).

транскрибируется вместе с этими генами и

Каждая из единиц повтора может

называется транскрибируемым спейсером. В

функционироватьнезависимоотдругих.Если

í¸ì

расположены

короткие

один из повторов заключить в P-элемент и с

последовательности, которые выделяются из

помощью трансформации ввести его опять в

общеготранскриптавходепроцесингаРНК.У

геном дрозофилы, в участке встраивания

млекопитающихиамфибийвкороткомспейсере

транспозона образуется маленькое ядрышко,

формируется5.8SРНК-небольшаямолекула,

возникшее в результате транскрипционной

образующая водородную связь с 28S рРНК в

активностиэтогоповтора.

рибосоме.

 

 

Удрозофилыгены,кодирующие5SрРНК,

 

ТранскрипционнаяединицарРНКсамая

представлены блоком, состоящим из 160-200

короткаяубактерий,укоторыхприобщейдлине

идентичныхпоследовательностейдлиной385

транскрипта 6 т.п.н. 80% приходится на

п.н.каждая.Общаядлинакластерасоставляет

кодирующую часть. У эукариот длина

60-80т.п.н.Повторяющаясяединицасостоитиз

транскрипта варьирует от 7 до 8 т.п.н. и

кодирующейчасти(~135п.н.)испейсера(250

кодирующая часть составляет 70-80%. В ходе

п.н.). Отдельные гены или группы генов в

созревания

ðÐÍÊ

лидирующая

пределах кластера

транскрибируются

последовательностьичастьтранскрибируемого

независимодруготдруга:делециичастигенов

Рисунок 7.67

 

 

 

-подобный ген в 16-й хромосоме человека

 

 

Интроны

 

Экзоны

Зародыш

Псевдогены

От утробного

 

 

развития до

 

взрослого состояния

-подобный ген в 11-й хромосоме человека

 

Зародыш

Утробное развитие

От рождения до

 

 

 

взрослого состояния

Кластеры глобиновых генов в хромосомах 16 и 11 человека и стадии развития, на которых

они экспрессируются (Из: Russell, 1998, p. 562).

 

 

 

 

 

195

Глава 7

 

 

 

 

 

 

 

Структура гена

Рисунок 7.68

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Asn Asn

 

Arg

Lys Arg

Ile Lys Lys Lys Asn Arg

 

Asn Asn Asn

Lys Arg

 

-20

-15

-10

-5

0

5

10

15

20

25

30

Расположение генов транспортной РНК в районе 42А 2R хромосомы D. melanogaster (Из:

Kubli, 1982, в кн. Жимулев, 1994, стр. 117 ). Цифрами под горизонтальной линией обозначены

размеры фрагмента ДНК (в т.п.н.).

 

 

 

 

 

 

 

Рисунок 7.69

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5.8S

 

 

 

 

Нетранскрибируемый

 

 

18S

2S

28S

 

Инсерция R1

28S

спейсер

18S

 

 

Dm103

4.3 ò.ï.í.

 

 

 

 

 

 

 

Dm103A1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5.6 ò.ï.í.

 

 

 

 

 

Dm103B

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

0.9 ò.ï.í.

 

 

Dm103C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5.8 ò.ï.í.

 

Dm103D

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

0.25 ò.ï.í.

Dm103E

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

0.27 ò.ï.í.

Dm103A2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

EcoRI

HindIII

 

 

 

 

 

 

 

 

Схема организации повторяющейся единицы в кластере генов 18S и 28S рРНК у дрозофилы (Из:

Peacock et al., 1981, в кн. Жимулев, 1994, стр. 394) Единица повторенности содержит гены 18S и 28S

рибосомной РНК, транскрибируемый (занятый последовательностью 5.8S) и нетранскрибируемый

(НТС) спейсеры. Значительная часть (до 48%) генов 28S рРНК содержит инсерции мобильного (R1)

элемента. EcoRI и HindIII - сайты рестрикции EcoRI и HindIII.

 

 

 

не предотвращают активности остальных. Клоныгенов5SрРНК,выделенныеизразных частейкластера,нормальнотранскрибируются вмолекулы5SрРНКвсистемеооцитаксенопуса (Xenopus).Такимобразом,последовательности ДНК не составляют единицу транскрипции и функционируютнезависимооднаотдругой.

Общаядлинакластерагистоновыхгенов у дрозофилы составляет примерно 500 т.п.н. (100 повторов единицы около 5 т.п.н. с пятью генамивкаждой).Отдельныегенывпределах повторенной единицы транскрибируются в противоположныхнаправлениях(т.е.сразных цепей ДНК), что свидетельствует о независимостиихфункционирования(Рис.7.70).

Удругоговиданасекомых-хирономуса (Chironomus thummi) эти же пять гистоновых генов составляют кластер длиной 6262 п.н., однако, и у этого вида гены, расположенные в кластере,могутсчитыватьсясразныхцепей(см. Рис. 7.70).

Иногда в кластеры объединяются и неповторенныегены.Семьгенов,кодирующих белки теплового шока (см. раздел 12), располагаются во фрагменте ДНК длиной 12 т.п.н.,картируемомспомощьюгибридизацииin situвпуфетепловогошока67В.Длягеновэтого районатакжехарактернаразнаянаправленность транскрипции(см.Раздел13).

Гены,контролирующиеразвитиекрупных частей тела (гомейозисные гены) дрозофилы, собранывкластеры.Ихназываюткомплексами. Головная капсула дрозофилы формируется в результате активности генов комплекса Antennapedia(Antp-C),брюшнаячасть-генами комплексаBithorax (BX-C) (Рис.7.71).

Литература к разделу 7.10.

Жимулев И.Ф. Хромомерная организация политенныххромосом.Новосибирск,Наука, 122-124, 1994.

196

Структура гена

 

 

 

 

 

 

 

Глава 7

Рисунок 7.70

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4.8 ò.ï.í.

 

 

 

 

 

 

à

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Инсерция

 

 

 

 

 

 

á

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H1

H3

H4

H2a

H2b

 

 

H1

 

 

 

A-T богатый

 

Повторенная

 

1 ò.ï.í.

 

 

 

район

последовательность

 

 

 

 

 

 

5

 

10

 

 

 

15

ò.ï.í.

â

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

S

Ctt500-7

E

X

B

K

P E

X

 

B Sac S

ã

 

 

TFB1 H3 H4 H2a H2b

H1 TFB1 H3 H4 H2a H2b

 

 

 

Схема организации генов, кодирующих гистоны в повторяющейся единице у D. melanogaster

(а-б) и Chirinomus thummi (в-г) (Из: Lifton et al., 1978; Hankeln, Schmidt, 1990, в кн. Жимулев,

1994, стр. 124); а - рестрикционная карта клона cDm500. Вертикальными линиями разной

высоты обозначены слева направо BglII, BamHI, HindIII, HpaI, SstI; б - расположение генов

(стрелками указано направление транскрипции), в - расстояния на карте; г - сайты

рестрикции и локализация генов, TFB1 - мобильный элемент.

 

 

 

Lewin B. Genes. Oxford, New York, Tokyo; Oxford

UniversityPress,726-728,1994.

Russell,P.J.GeneticsFifthedition.MenloPark,California,

AddisonWesleyLongmanInñ, 400-408,1998.

Рисунок 7.71

 

 

lab

pb

Dfd Scr Antp

Ubx abd

Abd-B

Кластеры генов, контролирующих развитие

головной (lab - Antp) и брюшной (Ubx - Abd-

B) частей тела дрозофилы (Из: Жимулев,

1994, ñòð. 141).

 

 

197

Соседние файлы в папке Генетика (Жимулев)